人类肠道是复杂多样的微生物群落的家园，有助于宿主的整体内稳态。越来越多的人认识到肠道菌群在人类疾病中扮演着重要的角色，特别是在许多病因不明的消化系统疾病中，如营养不良(包括营养不良的程度和程度)、非酒精性脂肪肝疾病(NAFLD)、炎症性肠病(IBD)和结肠直肠癌(CRC)。直到最近，我们对胃肠道微生物的复杂性和多样性的了解，大部分都依赖于对微生物培养的观察。然而，基于高度保守的细菌16S核糖体RNA基因，利用非培养分子方法展开宏基因组学，以及平行大规模深度测序技术的进展，使得对消化道疾病肠道菌群的研究更加深入。

最近的研究利用高通量测序技术，探索了肠道微生物群的组成变化，并从某些消化系统疾病，特别是IBD和NAFLD的候选细菌物种中识别出潜在的致病成分。研究也试图阐明粪便微生物群移植和调节治疗胃肠道和其他器官系统疾病的效用。从肠道微生物群的宏基因组学角度来看，未来的研究有望促进我们对病因和发病机理的理解，并为包括某些难治性消化疾病在内的各种人类疾病开发新的治疗策略。

在本期特刊中，我们将介绍肠道微生物群在胃肠道和肝脏疾病中的最新研究进展。对肠道微生物群进行宏基因组学和功能分析，以阐明流行病学、遗传学、基因组学、表观基因组学、转录组学和蛋白质组学，这将是本期特刊的一大特色。

我们邀请研究人员撰写针对患者和动物模型中的肠道微生物群和消化系统疾病的原创研究文章和综述文章。

可能的主题包括但不限于:

• 在全球不同人群中的流行病学
• 肠道微生物群的宏基因组学分析
• 潜在致病细菌种类的功能分析
• 表观基因组学，转录组学和蛋白质组分析
• 试图调节肠道菌群的新治疗策略
• 元基因组学和功能分析的方法开发