一种罕见的复发,新创14 q32.2q32.31 Microdeletion 1.1 Mb的20岁的女性患者母亲乌利希期刊指南(14)式表型和智力残疾

文摘

我们提出一个20岁的女病人从印度尼西亚与智力残疾(ID),比例的身材矮小,电机延时,喂养问题,头小畸型,面部先天性畸形,和性早熟以前正常的常规核型分析,筛选脆性X测试和subtelomeric MLPA分析。随后的基因组DNA进行广泛分析血液和显示1.1 Mb删除14 q32.2q32.31 (chr14:100,388,343 - 101506214;hg19)。后续的航母测试在父母数组显示删除发生新创的病人和她的14问等位基因被删除。删除区域包含了DLK1 / GTL2印迹基因簇是符合产妇乌利希期刊指南(14)同病人的表型。这种罕见,反复microdeletion最近不是由低拷贝重复,而是通过扩大TGG重复,侧翼14 q32.2q32.21删除边界,小说反复基因组重排机理。这是另一个例子如何高分辨率基因组广泛测试的应用程序提供了一个精确的基因诊断,从而提高家庭的照顾病人和优化咨询。

1。介绍

高分辨率的应用基因组广泛分析提供了一个精确的基因诊断在许多患者ID和/或先天性异常基因失衡造成的。这项技术的使用导致的发现几个小说microdeletion和microduplication综合症。虽然几个患者报告了一个终端14问删除,一个患者在terstitial microdeletion 14问地区似乎是罕见的。据我们所知,只有两个患者的间隙1.1 Mb删除q32.2q32.31曾被报道(1,2]。

人类染色体的临界区是14 q32.2单亲的二体性染色体14(乌利希期刊指南(14))印迹基因表型,因为它带有一个集群,包括父亲一般地表达基因(挂钩)等DLK1&RTL1和母亲般地表达基因(mb)等GTL2(也称为MEG3),RTL1as(RTL1反义),MEG8。删除这个地区的父亲的等位基因会导致乌利希期刊指南(14)mat-like表型(3]。单性生殖的二体性(乌利希期刊指南)发生在一对染色体的两个副本只继承一个父(4]。14号染色体的孕产妇乌利希期刊指南(乌利希期刊指南(14)垫)预处理和产后生长迟缓,肌张力减退、喂养问题,电机延时,身材矮小,青春期早发性,和小变形特性的脸,手和脚(5]。七的十一乌利希期刊指南(14)mat-like病例没有乌利希期刊指南已报告14 q32.2地区进行删除(2,3,6- - - - - -9]。

我们在这里报告一个额外的女性患者的1.1 Mb删除q32.2q32.31地区14号染色体被高分辨率全基因组SNP数组分析。

2。病例报告

一名20岁的女性印尼爪哇的病人面对极薄,身材矮小,头小畸型,电机延时,张力减退,轻度智力障碍,平面,平坦的人中,薄薄的嘴唇,手指逐渐减少,右边第五根手指指弯曲,夜总会双脚脚趾,喂养问题,性早熟(图1)。她出生在怀孕32周的低出生体重1800克(p5-10)健康的第二个孩子,父母无关。在她出生的时候,她的母亲是24岁,她的父亲是33岁。没有智力障碍的家族病史。后天,她发现喂养问题,电机延时,张力减退、性早熟。她能走在三年的年龄和能说两岁。当她检查在20岁的时候,她的身体高度是130厘米(),她的体重是18公斤(),她的臂展是125厘米。她比身高臂展是0.96厘米,因此显示比例的身材矮小。她有头小畸型的枕额周长(OFC) 50厘米()。此前,基因测试,包括常规核型分析,subtelomeric MLPA,和脆性X测试,所有这一切都显示正常的结果(10]。取得知情同意发布结果和照片从病人的父母。

我们进行基因组DNA广泛分析血液使用Affymetrix CytoScan高清阵列平台(Affymetrix公司,圣克拉拉、钙、美国)制造商的协议后,显示在14 q32.2q32.31 (1.1 Mb删除chr14:100,388,343 - 101506214;hg19)如图2(一个)。后续的航母测试相同的在父母透露,删除数组平台发生新创在病人(图2 (b)),她的14问等位基因被删除。可能存在一个平衡染色体重排和/或马赛克失衡的父亲后来研究了荧光原位杂交(FISH)分析使用鱼探针(rp11 m6 - 123;BlueGnome有限公司、英国剑桥)14 q32.2q32.31地区所特有的。这些鱼结果表明,父亲没有携带一个平衡的重排和/或马赛克失衡(图3)。

3所示。讨论

我们在这里报告一个额外的罕见患者,复发,新创14 q32.2q32.31 microdeletion 1.1 Mb。另外两个(女)病人已报告在文献中类似的1.1 Mb microdeletion 14 q32.2q32.31 [1,2]。与我们的病人,它担心新创失去父亲的14问等位基因的患者,表现出临床特征与乌利希期刊指南相一致——(14)垫(hg 19基因组坐标和临床特征如表所示1)。

这个删除区域包括snoRNA, microRNA集群的一部分,和15个蛋白编码基因,包含一个集群的印迹基因,包括父亲一般地表达基因DLK1&RTL1和母亲般地表达基因GTL2(也称为MEG3),RTL1as,和MEG8。被删除的14问等位基因引起孕产妇乌利希期刊指南(14)式表型(3]。另10基因不是印(EVL、DEGS2 YY1、SLC25A29 c14orf68,战争,WDR25,启动,c14orf70,和3 'endEML1)。

除了前和产后生长迟缓,性早熟,和喂养问题,兼容的乌利希期刊指南(14)垫表型,病人报告这里也体现智力障碍(ID)没有或很少观察到患者的乌利希期刊指南(14)垫。考虑到1.1 Mb 14问删除还包括许多nonimprinted基因,很可能这个病人是由于haploinsufficiency ID的一个或多个dosage-sensitive基因。例如,启动(brain-enriched鸟苷kinase-associated蛋白质)的基因是一个好的候选人基于本地化的神经突触(11]。最近报道YY1基因疾病被认为是一个ID基因外显子组测序的基础上在一个无法解释的ID在他错义突变患者c。1138 g > T p与蛋白质水平变化。Asp380Tyr被发现(12]。这个基因影响染色质重塑作为其主要功能通过编码转录因子表达的无所不在地阴阳1和导演组蛋白乙酰基转移酶和组蛋白乙酰转移酶。老鼠实验Yy1击倒导致生长迟缓,神经胚形成缺陷,和大脑异常(13]。

大多数复发性基因重组是由于非等位的同源重组(NAHR)之间的偏差低拷贝重复导致microdeletion或microduplication [14]。然而,最近的一篇论文希伯来文名字et al。1]报道有关机制的观察复发14 q32.2删除这里描述。他们发现大(TGG) n串联重复序列的约500个基点在边界的删除(chr14:100,394,091 - 100394594和chr14:101,504,592 - 101505016;hg19)。TGG重复是最长的三胞胎主题类型和高度形成G4 DNA的能力。一些理论可以解释如何将这些三联体重复会导致基因组重排。首先,扩大三联体重复将提供一个严重的基质基因组重排通过NAHR机制(15,16]。第二,扩大三个一组重复的倾向形成分子内二次结构称为鸟嘌呤四重的或G4 DNA从而促进双链染色体断裂(17]。因此,建议这复发14 q32.2 microdeletion是由扩展TGG重复,小说反复基因组重排机理不显示由低拷贝重复。

总之,我们很少能够检测确定14 q32.2 microdeletion利用高分辨率基因组广泛分析患者的基因型和表现型一致与之前报道两名患者在文献中。这个病例报告演示了应用价值的高分辨率全基因组检测准确基因诊断,可以帮助改善照顾病人和优化家庭的辅导。

利益冲突

作者宣称没有利益冲突有关的出版。

确认

这个研究在一定程度上由局的优秀奖学金计划和国际合作,国家教育部,印度尼西亚政府,与内梅亨大学医学中心的合作(内梅亨联电)在奈梅亨,荷兰。作者感谢家庭的合作,同意发表这篇论文。他们也感谢美国人类遗传学的实验室工作人员,内梅亨联电,奈梅亨,荷兰,和CEBIOR,医学院,Diponegoro大学,一直以来,印度尼西亚。

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