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体积 16. |文章ID. 182058 | https://doi.org/10.3233/spr-2008-0243.

吉张,气塘高,海王 从时间课程基因表达数据中发现基因特异性局部共规则“,科学规划 卷。16. 文章ID.182058 17. 页面 2008年 https://doi.org/10.3233/spr-2008-0243.

从时间课程基因表达数据中发现基因特异性局部共规则

抽象的

发现基因共同调节关系是DNA微阵列数据分析中最重要的研究之一。特异性共调节发现的基因问题是,对于感兴趣的特定基因(称为靶基因),鉴定观察到靶基因的强基因共规则的病症子集及其在这些条件子集中的共调节基因。共规定是局部的意义,即它们在一些完整的实验条件的子集中发生。对该问题的研究可以有助于在所涉及的生物活性期间更好地理解和表征靶基因。在本文中,我们提出了一种使用遗传算法(GA)来查找基因特异性共规的创新方法。滑动窗员用于限制基因共规的允许的允许条件长度和特别指定在每个窗口位置执行称为渐进Ga的Ga,以找到具有高适合度的那些条件子集。它被称为渐进性,因为窗口位置中的Ga的初始群体继承了在其前面的窗口位置中获得的顶级个体,使得GA能够实现比非渐进算法更好的精度。K.NN查找表用于大大加速GA的健身评估。具有现实生命基因表达数据的实验结果证明了我们在发现基因特异性共规则方面的技术的效率和有效性。

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