研究文章|开放获取
Rayyan阿扎姆汗,诺曼·Naseer Sajid萨利姆,Nauman哈立德库雷希,大学生马吉德这,穆罕默德Jawad汗, ”fNIRS皮质Tasks-Based最佳过滤器选择:一个研究”,医疗保健工程, 卷。2020年, 文章的ID9152369, 15 页面, 2020年。 https://doi.org/10.1155/2020/9152369
fNIRS皮质Tasks-Based最佳过滤器选择:一个研究
文摘
功能近红外光谱(fNIRS)是一种最新的非侵入式脑功能测量技术已经用于脑-机接口(BCI)的目的。在本文中,我们比较和分析的影响(即六个最常用的过滤技术。,高斯,黄油worth, Kalman, hemodynamic response filter (hrf), Wiener, and finite impulse response) on classification accuracies of fNIRS-BCI. To conclude with the best optimal filter for a specific cortical task owing to a specific cortical region, we divided our experimental tasks according to the three main cortical regions: prefrontal, motor, and visual cortex. Three different experiments were performed for prefrontal and motor execution tasks while one for visual stimuli. The tasks performed for prefrontal include rest (R) vs mental arithmetic (MA), R vs object rotation (OB), and OB vs MA. Similarly, for motor execution, R vs left finger tapping (LFT), R vs right finger tapping (RFT), and LFT vs RFT. Likewise, for the visual cortex, R vs visual stimuli (VS) task. These experiments were performed for ten trials with five subjects. For consistency among extracted data, six statistical features were evaluated using oxygenated hemoglobin, namely, slope, mean, peak, kurtosis, skewness, and variance. Combination of these six features was used to classify data by the nonlinear support vector machine (SVM). The classification accuracies obtained from SVM by using hrf and Gaussian were significantly higher for R vs MA, R vs OB, R vs RFT, and R vs VS and Wiener filter for OB vs MA. Similarly, for R vs LFT and LFT vs RFT, hrf was found to be significant 。这些结果显示使用的可行性hrf fNIRS的有效去除噪声数据。
1。介绍
脑机接口(BCI)也称为人机界面(HMI)或脑机接口(BMI)提供用户和外部设备之间的通信的意思是通过硬件和软件系统的结合(1- - - - - -3]。这些系统被训练来生成控制命令基于一组特定的大脑信号模式(4]。
大脑信号采集分类之间的侵入性和非侵入性技术。然而,由于手术风险和有限访问皮质区,非侵入性技术在实践中是很常见的(5]。非侵入性方法包括核磁共振(fMRI)干扰,功能近红外光谱(fNIRS) [6)、脑电图(EEG) [4]。fNIRS是一种相对新的形态,具有更好的空间分辨率和较低的工件,成本,和可移植性4,7]。到目前为止,有前景的结果显示了fNIRS-BCI [8- - - - - -10]。获得大脑信号为一个特定的任务可能包含可以污染信号和噪音影响信息数据。这些声音分类之间生理噪声,噪声实验,仪器噪声(8,11]。fNIRS的实验噪音被改变之前的原始信号,它的大小通过修改后的比尔-朗伯定律8,12,13]。由于硬件或被周围的噪音产生已知仪器噪音。这些声音通常可以使用低通滤波器去除高频;此外,保持隔绝外部如光源可以减少这种类型的噪音。实验噪声包括运动的构件(如头部运动信号采集时,可引起的位错装置从指定的位置,从而生成一个特殊噪声由于光照强度的变化。各种研究[13- - - - - -15)利用一般发展过滤技术随机噪声去除。然而,获得的信号可以被不同类型的噪声会影响进一步分析。噪音可以产生生理上由于迈耶波(∼0.1赫兹),呼吸(0.2∼0.5赫兹),和心跳(1∼1.5赫兹),主要是由于血压的波动8,16- - - - - -19]。这些声音可以删除使用自适应或带通滤波(20.,21]。预处理后,提取有用的信息从过滤数据之后使用不同的分类器分类主要为线性判别分析(LDA),支持向量机(SVM),二次判别分析(QDA)和朴素贝叶斯(NB) [22)来生成控制命令,从而完成了BCI的循环。先前的研究[13,14,23)表明,一个合适的滤波器对数据的正确性的关键是实现更精确的结果。
在这项研究中,我们假设找到常用皮质任务的最优滤波器,由于特定的皮层区域。因此,我们比较六个常用过滤器去除前面讨论的声音。这些过滤器包括离散卡尔曼(24],时变维纳[25),4th巴特沃斯,血流动力学响应滤波器(hrf),高斯(26,窗口有限脉冲响应(杉木)[27]。表示目的,皮质数据获得从大脑的三个主要区域,即前额叶(PFC)、运动(MC)和视觉皮层(VC)。由于数据从PFC与思维获得的任务(28- - - - - -31日),因此算法和对象旋转任务执行这个皮质区域(32- - - - - -34]。同样,任务与运动相关的四肢或手指运动皮层(35];因此,手指敲击任务执行所需的数据采集(36- - - - - -38]。同样,闪烁的视觉皮层的检查框进行数据39]。保持视图的目标最优滤波器为一个特定的皮层区域,一个先前的研究(22报告统计特性的不同组合。因此,对于提取的数据的一致性,统计特性都保持相同的实验任务,因此使六个功能的组合,即信号的意思是(SM)、信号斜率(SS)信号峰值(SP),信号偏态(SK),信号峰度(KR)和信号方差(SV)。分类,许多研究[22,40,41]报道非线性支持向量机分类器对相对更好的精度,因此所有的实验任务是使用非线性支持向量机分类器分类。因此,这项工作的主要贡献是(1)分析影响的六个最常用的过滤技术和(2)提出最优之一最经常讨论噪音消除技术。上述实验中,我们选择三个主要的皮质区域:前额叶、电机、和视觉皮层有七个不同的范式。规范化血流动力学响应滤波器(hrf) [26)进行整体最佳选择技术。这些系统和明确的基础上分析,可以看出,选择一个最优滤波器的一个重要的角色在提高精度。因此,这些观察结果可以作为一个标准的指导其他测试fNIRS噪声校正算法对实验的影响,因此可以选择一个重要的方法。
2。材料和方法
2.1。实验装置
获得实验数据,七范式由于三个主要的皮质区域的设计,显式地使用一个动态执行近红外光学断层扫描(dynot - 232;美国纽约NIRx医疗技术)设备釜山国立大学。它作用于两个760和830纳米波长的信号采集采样频率为1.81赫兹。视力正常或corrected-to-normal的五个健康受试者参加试验前用口头同意实验。所有受试者右手的年龄26±3。右撇子”受试者选择减少血流动力学响应变化由于半球的差异。实验参与者没有酗酒史,精神病,神经,和视觉障碍、心血管和呼吸道疾病,精神疾病,或任何运动障碍。此外,三个小时之前开始的研究中,参与者被要求避免含咖啡因的饮料。如前所述在文献[28,30.,31日,35,37,38),对于thinking-related任务,从PFC获得的信号是,同样为电动机执行任务的初级运动皮层(PMC),从VC和视觉刺激的任务。执行实验根据最新的赫尔辛基宣言。
2.2。实验范式
按照文献[35,39),受试者坐在舒适的椅子上,被要求休息和限制运动,这样血流动力学反应激活由于之前的活动是可以避免的。因此,每一个范式与PFC, MC, VC开始休息20年代时期建立基线条件。作为文献[42- - - - - -45]显示,(10∼12)的任务是足够获得血流动力学反应的大脑活动,因此20年代最初的休息是紧随其后的是10年代任务,这又反过来被另一个20多岁的休息期间允许信号返回基线值在开始下一个审判模式的范式(a)。(b), 20年代后休息10 s task 1又紧随其后的是10 s task 2。20年代其他两个10年代任务添加到通过基线值区分两类。图1描述范式(a)和范式(b)。最优滤波器的选择、任务选择PFC有关特定的皮层区域,这样,三个不同的实验,其他(R)和心算(MA), R和对象旋转(OB)和OB和马的任务。同样,MC, R和左手手指敲击(融通),R和正确的手指敲击(RFT)和融通vs RFT。同样,对于风投,R和视觉刺激(vs)的任务。
(一)
(b)
2.2.1。前额叶的任务
(1)心算。根据先前的研究44,46,47马),R和任务,受试者被要求执行一系列的算术计算10年代基于伪随机顺序,这样减去随机两位数(10至20)先后从之前的三位数减法的结果出现在屏幕上(如400 - 11、389 - 17日和372 - 14)。之后,屏幕变黑,这样主题不超出10年代的任务。
(2)对象的旋转。对象的旋转任务,受试者被要求想象一个立方体旋转10年代任务而“对象旋转”字在屏幕上出现十年代约为2米的距离(48- - - - - -50]。
(3)心算vs对象旋转。在这个协议中,受试者被要求马执行上述任务和OB在20年代的休息来区分两个任务。实验范式是描绘在图1 (b)。
2.2.2。电动机的任务
(1)手指敲击。根据文献[8,17,19,23,31日,37,38,51),受试者被要求利用自学的一只手食指10之后的20年代执行其他任务允许信号返回他们的参考价值。另外,重复10次如图1(一)。类似的试验进行了另一方面,融通与RFT任务时,20多岁的休息是在两个任务之间进行信号的恢复到基线水平,如图1 (b)。
2.2.3。视觉任务
(1)检查框闪烁。在这个实验中(4,18,39],面前的屏幕上被研究对象的距离大约2米,以及受试者在实验要求避免眼神闪烁。十年代任务执行的检查框闪烁4赫兹其次是20年代的黑屏。生成的声音也在休息和任务之间的过渡。视觉刺激的范式遵循图所示1(一)。
2.3。实验装置
自心理意象任务激活PFC (34,43),总11近红外(NI)光装置放在PFC, 3的探测器和8是源按照文献[46,47]。同样,对于电机执行任务,初级运动皮层(PMC)被激活37,43),因此15装置放在PMC的8是源和7是探测器。为融通中提取数据,装置被放置在右半球,而在左半球(RFT43]。同样的,视觉刺激的任务数据采集的视觉皮层(4,18,39),11个装置被放置在八个来源和三个探测器。源和探测器之间的距离是3厘米。Optode位置和通道配置MC, VC, PFC如图2。
(一)
(b)
(c)
2.3.1。信号采集
按照文献[6,8,29日),原始的光密度信号转化为氧合血红蛋白( )和去氧血红蛋白( )集中使用修改后的比尔-朗伯定律(MBLL)如在以下方程: 在哪里是HbX消光系数在吗 , 是微分曲线路径的路径长度因素(毫米)探测器和发射器距离(毫米),然后呢的吸光度不同波长光发射器的 。
2.4。信号处理
获得原始信号的大脑包含各种噪声可以分为生理、实验和仪器噪声(8,52]。fNIRS的仪器和实验噪音被改变之前的原始信号,它的大小通过MBLL [8,12,14]。
2.4.1。乐器的声音
周围噪音产生由于硬件或分类下仪器噪音。这些声音通常有高频率使用低通滤波器可以删除;此外,保持隔绝外部如光源可以减少这种类型的噪音(8]。
2.4.2。实验噪音
这些错误包含运动构件由于无意识的肢体动作像头部运动信号采集。它可能导致装置的位错从分配的特殊位置,导致噪音由于光照强度的变化。过滤器如卡尔曼滤波和维纳可以用来消除这种类型的噪音(12- - - - - -15]。
2.4.3。生理上的噪音
这些声音产生由于迈耶波(∼0.1赫兹),心跳呼吸(∼0.5赫兹),(1∼1.5赫兹)发生由于血压的波动16- - - - - -19]。这些声音可以删除使用自适应或带通滤波(8,20.,38]。
2.5。数据分析
NIRS-SPM fNIRS工具箱用于数据分析。信号处理,它提供了常用的过滤技术,即巴特沃斯,高斯,hrf [26]。比较数据分析是由使用NIRS-SPM工具箱实现高斯和hrf过滤,而其他技术MATLAB®2017 b。广义数学模型提供必要的细节如下。
2.5.1。高斯滤波
高斯滤波器是用于各种形式取决于信号的性质。一般来说,一个高斯滤波器是基于高斯函数定义或数据噪声的概率分布。它也可以被用作一个平滑算子。高斯内核用于平滑的信号被替换为每个值本身和周边值的加权平均14,21,26]。二维高斯滤波器的一个简单的表示可以定义在以下方程 在哪里和到原点的距离在水平和垂直轴σ是已知分布的标准偏差。
2.5.2。血流动力学响应滤波器(hrf)
hrf基于血流动力学响应函数的规范化表示(hrf)和用于fNIRS的时间平滑时间序列信号。在NIRS-SPM,给定的功能数据使用最小二乘估计与理想HRF平和。hrf和高斯滤波器模型细节按照文献[26]。
2.5.3。巴特沃斯滤波器
巴特沃斯滤波器是一种基于模型的带通滤波器,执行使用高频率衰减和低通滤波器。过滤值不仅取决于过滤的加权平均时间序列,还递归前值的过滤时间序列。这个过滤器的目的是在所需的通带平坦的频率响应(26]。4th阶巴特沃斯滤波器的带通(0.01∼0.1)赫兹在图书馆应用通过MATLAB®构建所需的实验。
2.5.4。有限脉冲响应滤波器
冷杉找到设计的滤波器系数和过滤器的顺序,执行输入信号之间的互相关和反向脉冲响应的时间;因此,通过采样脉冲波形,系数的滤波器设计14]。冷杉过滤器的顺序N可以被定义为以下方程: 在哪里是输入信号,是输出信号,是过滤订单,吗脉冲响应的价值在哪里实例。在这里,4th阶FIR滤波器的低通带0.1赫兹利用。使用最小二乘估计的系数估计。然而,时变维纳滤波器,基于短时傅里叶级数,是实现为在25,53]。
2.5.5。卡尔曼滤波器
卡尔曼滤波器输入信号包含统计和其他由线性二次估计噪声。估计未知变量基于贝叶斯推理和联合概率分布往往是更准确的13,14]。它的简单的模型中可以看到以下方程: 在哪里状态转换模型应用于以前的状态吗 , 是控制输入模型应用于控制向量 ,和噪音是一个过程。离散卡尔曼模型实施按照[24]。
2.6。特征选择
所有范例中提取数据之间的一致性,六个统计特性(SV、KR、SS、SM、SK和SP)被用来提取信息数据(28,43,46,54,55]。SM是下列方程计算 在哪里输入信号,这样吗和是观察的总数。信号方差计算方程(6), 在哪里是输入信号,从方程(意思是发现6),样品的数量,标准偏差。基米-雷克南,计算是由以下方程: 在哪里是输入信号的期望值 。
SK的不对称值意味着相对于正态分布,因此计算以下方程:
MATLAB®函数的所有输入数据点,因此用来计算党卫军。同样的,函数是用来计算SP。统计特征是新在0和1之间使用以下方程: 在哪里新特性和吗指的是原始特征值。散点图的所有六个统计特性的OB和马的任务1所示图3。
2.7。支持向量机
统计学意义的准确性进行了分析选择最优滤波器为一个特定的皮质区域;因此,为了提高分类性能,使用非线性支持向量机(35,38]。它可以重新调节高维数据和可以控制错误明确由两个或多个类之间的利润最大化创造超平面称为支持向量(40,41,56]。
是最大化的成本函数的支持向量机分类器训练数据之间的相关性和超平面方程的定义(10)和(11),分别 在哪里 , 是积极的正则化参数,训练误差的测量,是第n的类标签样本。在这里,三度多项式核函数 和10倍交叉验证应用分类精度的估计(53]。
3所示。结果与讨论
3.1。结果
在这项研究中,选择一个最优滤波器基于皮层的任务。活动是基于PFC等三个主要地区分类,MC, VC。信号是使用六个过滤器过滤。数据4- - - - - -6显示平均过滤信号试验的前额,电动机执行,视觉刺激的任务。三个不同的信号显示各种范式对于每一个大脑区域,在水平轴与一个完整的事件。过滤的图像分析反应表明,使用4th阶巴特沃斯变化数据形式完全离散卡尔曼滤波和维纳滤波的信号,但仍有一些噪音在输出响应,而规范hrf和高斯平滑响应比任何其他技术。此外,先前的研究通常利用巴特沃斯对信号处理,同时获得视觉相比没有任何明显的改善迹象。同样,高斯滤波器也利用各种研究获得的数据正态分布假设;因此,它认为高斯函数定义或数据噪声的概率分布。它也可以被用作一个平滑算子。高斯内核用于平滑的信号被替换为每个值本身及其邻近值的加权平均。然而,hrf过滤器认为理想的血流动力学响应作为参考平滑的数据卡方分布密切相关。由于这一事实,hrf优于任何其他技术。
提取信息,对一致性分类精度得到在6个统计特性。在这些特性获得的精度如表所示1。双尾独立t以及进行检查统计显著性与Holm-Bonferroni过滤器的多重比较。结果在表2显示意义使用hrf或高斯滤波器对马和R vs OB OB vs马任务时,没有发现显著的过滤器;然而,时变维纳滤波器优于他人。同样,在电动机执行任务,hrf被发现显著的R与融通,同样为R vs RFT hrf和高斯。此外,对融通vs RFT, hrf过滤器显示了更好的性能。在VS任务,hrf和高斯是重要的。此外,我们把过滤器的平均精度对皮质区域如图7。高斯和规范hrf所有三个皮层区域始终表现的更好。然而,相对使用hrf只取得了更好的精度。统计结果验证我们的假设的最优滤波器选择保证hrf fNIRS-based研究通常有更好的性能,它是按照一项研究[53]。
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3.2。讨论
尽管fNIRS的事实提供了可移植性,低成本、减轻设备的设置,仍然是一个挑战,消除噪音像系统的生理(迈耶波,肌肉活动、血压、呼吸和心率)和工件(17,57],fNIRS信号被高度污染的测量噪声和基于生理系统干扰(58]。一些研究提出的方法,可以消除噪音强劲。在[59),时间过滤使用0.6赫兹截止频率的低通滤波器和规范血流动力学响应函数与4 s半宽度。在[60),指数移动平均线和切比雪夫滤波器被用于将工件从fNIRS的数据。同样,在61年),只有低通滤波器0.14 Hz截止应用于去除fNIRS生理噪声信号。Aqil et al。62年递归最小平方估计用于在线成像。这种适应性的方法提供了一个较低的空间滤波和高通,消除长期趋势,基线校正。同样的,搜索引擎优化等。63年)评估技术的效用的生理噪声在fMRI数据通过减少残差的方差基线fMRI信号通过检测信号的模型。同样,在64年),自适应过滤使用的仿射投影算法加速收敛和有色噪声,但它会增加计算成本。在[65年基于5],一个带通滤波器th巴特沃斯滤波器是用来过滤电机执行顺序基于EEG信号。在文献[52),fNIRS-based走路信号和步行信号而说话。这些信号预处理使用有限脉冲响应滤波器的低通,虽然说任务结果在低烈度工件相同频率的血流动力学反应,因此它可能会影响大脑皮层活动(57]。在[66年),多个过滤器是申请脑电图,ECG-based信号预处理如运动工件的去除,潜油电泵的中值滤波,去除系统组件、一个二阶Chebychev 2型过滤器,高通滤波器对信号漂移、1圣血压信号阶低通巴特沃斯滤波器,4th心电图应用阶巴特沃斯带通滤波器,使用太多的过滤器的每一个方面都可能导致成本计算。在[8节),前面提到的方面2。4简要讨论。去除这种噪声方法,像MBLL eigen-based向量方法(19),介绍了带通滤波器在基于matlab的图形用户基于接口的程序中,荷马。然而,则没有这种统计学意义比较通用的任务。在文献[14,15),取消运动构件使用维纳和离散卡尔曼滤波器进行了讨论;与此同时,t测试执行与卡尔曼比较显示出更好的性能。同样,在12,13),四个技术,即卡尔曼、主成分分析、小波分析、样条插值,比较去除工件检测数据。结果表明,脊椎插值和小波分析是重要的删除等噪声。在[67年),系统噪声被使用小波最小描述长度消除趋势方法和工件使用移动的标准差和样条插值。Eggenberger et al。68年]删除运动构件通过目视检查,和迈耶波是避免使用平均块。在[69年),生理噪声被低通滤波器,和滑动窗口申请运动工件被拒绝。霍尔兹et al。70年结合独立分量分析和主成分分析,去除噪声和信号漂移。在[70年- - - - - -77年),信号是低通滤波截止频率为0.14赫兹,和在78年),截止频率为0.2赫兹,(78年),一套低通滤波器在0.67赫兹,与此同时移动平均滤波器的宽度4 s被用来抚平信号。在[79年),高斯平滑的半最大值处全宽度2 s应用,而运动工件被使用小波最小描述长度趋势分离算法。在[80年),带通滤波器(0.01 - -1.25赫兹)应用到信号。同样,在[81年),带通滤波器(0.01 - -0.2赫兹)应用而运动工件被拒绝通过主成分分析和飙升。同样,在82年),数据带通滤波(0.01赫兹到0.14赫兹),在小波滤波器和correlation-based信号改进应用于去除运动构件。在[83年),数据过滤与0.01 Hz高通滤波器和一个5.0秒移动平均滤波器和主成分分析应用于减少生理噪声。Metzger et al。84年]删除频道大型运动或技术工件。较小的工件与correlation-based信号修正改进方法,而一个低通滤波器,5.0年代应用移动平均滤波器。在[85年- - - - - -87年),分析了信号与SPM99(统计参数映射软件;康的认知神经学、英国伦敦)。在[88年),移动标准deviation-based工件去除(移动工件减少算法:马拉)阈值为0.45为哈佛商业评论HbO和0.18应用和信号是线性去趋势和低通滤波在0.1赫兹。
保持视图中的讨论文学,工件采用各种方法去除而系统的生理噪声,主要是高和低通滤波器。因此,利用最好的最优滤波器为一个特定的皮质的任务,我们执行一个明确和系统分析,找到主要的过滤基于统计学意义fNIRS皮质任务研究应用程序使用。结果表明,hrf优于讨论技术因为它认为理想的血流动力学反应分布平滑数据。保持这个观点,我们未来的工作包括设计一个自适应滤波器的技术,考虑不同的数据分布和噪声。因此,选择更准确数据的分离。
4所示。结论
我们所知,这是第一个研究提出滤波器选择常用皮质的任务功能近红外光谱(fNIRS)工件和系统的生理噪声污染。六个过滤器,即高斯、血流动力学响应滤波器(hrf),巴特沃斯,时变维纳,离散卡尔曼,和基于窗口的有限脉冲响应测试。获得的结果已经验证的总体统计显著性hrf前额叶、电机、和视觉皮层的任务。此外,从不同的皮质区域获得的信号可能包含不同类型的噪声。因此,本研究的主要目的是提出一个最优滤波器为一个特定的任务,由于特定的皮层区域,进一步的研究可以达到最大精度通过可靠地改善血流动力学响应函数中恢复过来。本研究的结果显示,有重大影响的过滤器选择机密数据的准确性,因此促进用户避免分析复杂信号的技术。
数据可用性
使用的数据来支持本研究的发现可以从相应的作者。
的利益冲突
作者宣称没有利益冲突有关的出版。
确认
作者要感谢教授Keum-Shik香港从釜山国立大学为他们提供一个机会参观他的实验室,并使用在他的实验室设备进行数据采集。
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