资源的转录签名善意和分析他们的胚胎滋养层干细胞持久性

比较基因表达分析显示候选人TSC标记基因。(a)全基因组表达分析差异表达基因的五个数据集生成结果从不同的实验设置如图3。(1)第一组包含监管基因经过3天的分化FACS-enriched tsc相比无差异tsc。(2)第二组代表不同监管基因后3天加工功能丧失,基因缺失在tsc (LOF)。(3)第三组包括基因显示显著增加或减少值表达式tsc与mES细胞,(4、5)和第四、五组差异表达基因的诱导表达后2天Cdx2或加工,分别。条形图显示的数量为每个基因的差异表达基因。(罪犯)维恩图表示组相交,差异表达基因。导致群体的基因在下表中列出了每个维恩图。(b)对比300年最强烈表达下调基因分化FACS-enriched tsc, 189个基因表达下调加工删除,最高的300个基因表达tsc和mES细胞之间的比率。值得注意的是,Cdx2,加工,Elf5在TSC分化表达水平降低。的损失加工函数不显著降低Cdx23 d后表达。在(c)的一组不同的调节基因加工基因缺失是交换与调节后的498个基因Cdx2在mES细胞感应。(d)基因引起的加工或Cdx2表达式在mES细胞相比,300个基因表达率最高的tsc与mES细胞。请注意,加工既不是明显上调Elf5也不Cdx2表达式。数量的差异基因中列出(a)和(罪犯)源于基因具有多个记录但相同的基因符号。所选截止基因被包括在标准数据集是一个积极或消极的褶皱变化≥1.5,对治疗的反应值≤0.05。基因选择进一步分析以蓝色突出显示,TSC积极的反馈回路的核心基因红色,和基因以前TSC用橙色标记。