量的新一代测序技术是微生物科学革新的实践提供了一个前所未有的对微生物多样性。当前测序技术允许我们深入研究复杂的微生物生态系统,如人类胃肠道(GI)微生物群,由300万多个基因主要是革兰氏阳性细菌。

不同细菌的基因组比较属物种有助于揭示毒性和利基市场规范的进化起源。不同菌株的基因组比较分析编译相同或不同物种的所谓“pan-genome”——显示内容在整个物种或基因属更比一个应变或物种。此外,这类研究辅助的理解背后的显性遗传力细菌进化,即微生物之间的横向基因转移的概念。

稳定的测序技术的进步使得光棚在微生物的基因相互作用,例如,通过比较宏基因组和metatranscriptomic分析细菌社区。宏基因组最快速增长的领域之一。宏基因组方法提供了一个非凡的观点在不同的环境,不同的微生物世界如人类和动物体内的网站、海洋等水体、土壤和空气中。宏基因组和metatranscriptomic分析细菌社区可以阐明微生物相互作用的基因和被研究人员广泛使用在许多学科如生态、能源、农业、生物技术、医学。作为一个快速增长的领域,比较基因组学、宏基因组也带来了很多挑战,需要解决。

这个特殊的问题旨在提供一个洞察这个比较/宏基因组研究。研究人员邀请提交原始的研究论文和评论文章的研究不同的微生物环境和系统使用比较基因组学、宏基因组方法。提交关于小说计算/统计方法/算法处理比较或宏基因组数据也受到欢迎。

潜在的主题包括但不限于以下:

• 比较/ pan-genomics各种细菌物种
• 功能基因组学的共生体和致病菌
• 微生物宏基因组和metatranscriptomics
• 肠道微生物基因组学和宏基因组
• Viromics——病毒宏基因组
• 基因组学和宏基因组在微生物生态学
• 新一代测序数据分析的计算方法