国际基因组学杂志

中草药对是中草药单味药和多味药之间的桥梁，为复杂的中药方剂提供理论依据。中草药组合作为膳食补充剂的一种策略，其有效性和合理性已被广泛应用。然而，由于个别和组合的植物化学的复杂性，很难从分子或系统的角度揭示它们的有效和协同机制。为了解决这个问题，我们使用UPLC-Q-TOF/MS分析和系统药理学工具来探索其作用机制。Paeoniae基数阿尔巴)及甘草(甘草)的膳食补充剂。从芍药和甘草中分离鉴定了16种化学成分，它们与73个肝脏保护相关靶点相互作用。然后进行基因本体论和《京都基因与基因组百科全书》(KEGG)途径富集分析，并进行网络分析。结果表明，白芍和甘草的协同作用机制与胆汁分泌和ABC转运途径的协同调节有关。此外，甘草对药物和异种代谢途径有特异性反应，而白牡丹对toll样受体信号、c型凝集素受体信号、IL-17信号、TNF信号通路有特异性反应，可预防肝细胞凋亡，减轻免疫和炎症介导的肝损伤。这些发现表明，白芍和甘草对补品通过互补和协同机制具有保护肝脏的作用。该方法为探索中药膳食补充剂的配伍性提供了一条新的途径。

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我们采用了一种综合策略来呈现减法和比较代谢和基于基因组的治疗靶点的发现链球菌parauberis。我们不仅首次根据基因组和蛋白质组数据库分析确定了潜在的靶点，而且还推荐了一种治疗橄榄牙鲆的新型抗菌药物(Paralichthys olivaceus)感染美国parauberis。为此，我们从计算比较代谢和基因组数据库中提取了102条注释的该菌株的代谢途径。从DrugBank数据库的这些代谢途径中鉴定出6种可用药蛋白，分别为mtnN、penA、pbp2、murB,墙A、coaA和fni从112个重要的非同源蛋白中分离出来。其中，26个跨膜蛋白和77个胞质蛋白被分别作为潜在的疫苗和药物靶点。从美国食品和药物管理局的药物库，头孢噻呋是选择防止抗生素耐药性，因为它抑制我们选定的确定的目标。氟苯尼考用于治疗美国parauberis感染比目鱼，并被选为比较药物。所有测试的鱼类菌株都是用美国parauberis是否对头孢噻弗和氟苯尼考敏感，最低抑菌浓度(MIC)为0.0039-1μ8 g / mL和0.5μg / mL, IC₅₀0.001 - -0.5的μ克/毫升-2.7和0.7μg/mL，最小生物膜清除浓度(MBEC)为2-256μg / mL和4 - 64μ分别g / mL。类似的易感性的头孢噻菌素和氟苯尼考被发现，与头孢噻菌素作为一种有效和有效的抗菌药物，对浮游和生物膜形成菌株的鱼病原体链球菌parauberis，并可应用于水产养殖业。因此，我们的预测方法不仅显示了新的治疗药物，而且还表明，市场上的药物也应该测试对这一重要的鱼类病原体的新识别目标的有效性。

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在本研究中，我们探讨了黄芩汤的药理机制;并通过基因表达谱为HQT在溃疡性结肠炎中的潜在作用提供了依据。采用三硝基苯磺酸-乙醇复合法制备UC大鼠模型。治疗10天后，从大鼠结肠段进行微阵列分析。基于差异表达基因(DEG)丰富生物功能和特异性信号通路，并通过独创性途径分析(IPA)构建相应的基因网络。通过网络，我们筛选了潜在的“候选目标”，如ITGB1、FN1、CASP3、ITGA5、FABP1、ABCB1、FABP2、SLC51B。这些潜在的候选靶点在功能上与免疫反应、炎症和代谢有关。HQT显著降低血清促炎因子一氧化氮(NO)、促炎因子白细胞介素(IL-) 17、前列腺素E2 (PGE2)水平。模型组结肠组织HE染色严重，HQT组结肠组织HE染色明显减少。HQT通过抑制炎症反应，对结肠损伤具有保护作用。

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的目标是。这项研究的目的是识别子宫颈癌的预后特征。主要方法。宫颈癌和正常宫颈组织的基因表达数据和临床信息来源于肿瘤基因组图谱和基因表达综合数据库的三个数据集。采用DESeq2和Limma筛选差异表达基因(DEGs)。所有数据集之间的重叠数据集被认为是最终数据集。然后进行功能富集分析。此外，还进行了Cox比例风险回归，以建立DEGs的预后特征。应用Kaplan-Meier法对模型进行检验。采用卡方检验分析宫颈癌患者年龄、HPV状态、组织学、分期、淋巴结转移等临床病理参数与基因表达的关系。通过cBioPortal评估这些预后基因的体细胞突变。另外两个独立的验证队列验证了模型的鲁棒性。重要发现。与正常宫颈组织相比，宫颈癌共发现169个重叠上调基因和29个重叠下调基因。功能富集分析表明，DEGs主要富集于DNA复制、细胞周期和p53信号通路。最后，我们建立了一个基于5基因(ITM2A、DSG2、SPP1、EFNA1和MMP1)的预后信号。根据该模型，每个患者被给予一个与预后相关的风险值。Kaplan-Meier分析显示，更高的风险与较差的宫颈癌总体生存相关，在15年的接收方操作特征曲线下面积为0.811。该模型在宫颈癌预后预测中的有效性在另外两个独立的数据集中得到了验证。此外，我们的研究还发现ITM2A的低表达与宫颈腺癌相关。有趣的是，DSG2与宫颈癌的HPV状态相关。意义。我们的研究构建了宫颈癌的预后模型，并发现了两个新的基因，ITM2A和DSG2，与宫颈癌的发生和生存相关。

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免疫血小板减少症(ITP)是由于免疫介导的抗血小板破坏和无效的血栓形成而导致的一种获得性出血疾病。尽管ITP的病因尚不清楚，但人们认为遗传变异使个体易于患ITP。一些候选基因分析已经确定了几个增加ITP易感性的位点，但是在全基因组范围内还没有系统的遗传分析。为了扩展ITP的遗传证据和识别新的候选ITP，我们对200例ITP病例和200例中国汉族对照(CHP)进行了由illuminahumanomnizhonhua -8联合途径分析(pathway analysis, GWAS)的池化全基因组关联研究(pooling genome-wide association study, GWAS)。结果表明，4个新位点(rs117503120、rs5998634、rs4483616、rs16866133)与ITP ( )。除rs4483616外，其余三个位点通过TaqMan探针基因分型试验( )另一组包括250例ITP病例和250例对照。rs5998634等位基因对ITP患者糖皮质激素更敏感( , )。此外，我们还确定了三种过度表达的信号通路，包括神经活性配体-受体相互作用、癌症中的通路以及参与ITP病因学的JAK-STAT通路。综上所述，我们的研究结果揭示了与ITP相关的4个新的位点和3条通路，为探索ITP的发病机制提供了新的线索。

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本研究的目的是研究原位树突同源盒1 (OTX11例汉族患者基因多态性与特发性癫痫的关系。我们对147例特发性癫痫患者和150例健康对照进行了病例对照研究。从1 ml经乙二胺四乙酸(EDTA)处理的血液中分离得到基因组DNA。的OTX1将编码序列分为三部分，用PCR扩增，用Sanger测序法对产物进行基因分型。所有OTX1编码序列除位于第5外显子上的rs17850223外，其余均保守。CC、CG、GG基因型的频率在特发性癫痫患者和对照组之间无统计学差异。rs17850223等位基因在特发性癫痫患者和对照组中的分布也很相似。有趣的是，GG基因型的频率在全身性癫痫患者中明显高于对照组(12.2%比2%， ),rs17850223等位基因在全身性癫痫患者中的分布也高于对照组(18.3%比10%， )。rs17850223可能在中国特发性癫痫合并广泛性发作的患者中起重要作用。

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