TY -的A2 -康德,拉维盟-侯赛因。Tofazzal盟——彭、阴非盟-冯Shengzhong AU -魏,实证PY - 2020 DA - 2020/06/01 TI - FcircSEC: R包完整circRNA序列提取和分类SP - 9084901六世- 2020 AB -圆形rna (circRNAs)是由加入3 ” 和5 ” RNA分子的末端。环状rna的鉴定是环状rna研究的重要组成部分。circRNA预测方法可以预测染色体中具有起始和结束位置的circRNA，但不能识别全长circRNA序列。我们提出了一个R包FcircSEC (Full Length circRNA Sequence Extraction and Classification)，用于基于基因注释和输出任何circRNA预测工具的输出来提取全长circRNA序列，这些工具的输出具有染色体、起始和结束位置以及每个circRNA的一条链。为了验证FcircSEC，我们使用了三个数据库，circbase, circRNAdb和plantcircbase。以每个circRNA的染色体和链等信息作为输入，FcircSEC所识别的序列与数据库一致。FcircSEC的新颖之处在于它可以将最先进的circRNA预测工具的输出作为输入，适用于人类和其他物种。我们还将环状rna分为外显子、内含子和其他类型。R包FcircSEC是免费提供的。SN - 2314-436X UR - https://doi.org/10.1155/2020/9084901 DO - 10.1155/2020/9084901