病例报告|开放获取
F. Malvestiti, C. Agrati, S. Chinetti, A. Di Meco, S. Cirrincione, M. Oggionni, B. Grimi, F. Maggi, G. Simoni, F. R. Grati, "1例慢性髓系白血病中涉及染色体9、12和22的费城易位复杂变异",遗传学病例报告, 卷。2014, 文章的ID691630., 4 页面, 2014. https://doi.org/10.1155/2014/691630
1例慢性髓系白血病中涉及染色体9、12和22的费城易位复杂变异
摘要
慢性髓性白血病(CML)是肌酚肿瘤的更广泛诊断类别中包括的造血干细胞障碍,与染色体22Q111111中的BCR基因与染色体9 Q34的ABL1基因相关联的血清诊断类别相关联,其形成费城(pH)染色体。在2-10%的CML病例中,融合基因与变体易位有关,涉及染色体9,22和一种或多种不同的染色体;因此,可以在复杂的染色体重排中掩盖pH染色体。在具有变体pH易位的情况下,可以比在古典一体的情况下更频繁地观察到DAR(9)上的删除。在此,我们描述了一种具有复杂变体pH易位的CML的新案例,涉及染色体9,12和22.我们在伊马替尼处理后呈现血液学反应和细胞遗传学反应。我们还推测了发起染色体重排的机制。
1.介绍
慢性髓系白血病(CML)是一种造血干细胞疾病,属于骨髓增生性肿瘤的更广泛诊断类别[1以肿瘤过度产生主要是粒细胞为特征。CML始终与断点簇区基因的染色体易位的融合相关(BCR)与Abelson基因(ABL1)染色体9q34。这种融合基因BCR/ABL1编码一种癌蛋白(P210,更罕见的是P190或P230),具有强烈的构成激活酪氨酸激酶活性,诱导若干下游信号,导致造血干细胞的转化[2].t(9;22)易位可以通过常规核型检测到,如Philadelphia (Ph)染色体,但2-10%的病例中,融合基因来自变异易位[3.].人们已经认识到两个变异亚群:在9号染色体以外的染色体上有22q片段易位的简单变异群和包括染色体9,22和一个或更多额外染色体/秒的复杂变异群。因此,Ph值染色体可能被掩盖在一个复杂的染色体重排。虽然所有的染色体都可能参与这些变异易位,但有一个明显的聚集到特定的染色体带,表明特定的区域特别容易断裂。此外,在变异病例中der(9)上的缺失可能比经典Ph易位的病例更频繁(40%对14%)[4].在有限数量的CML病例中尝试了不同复杂变异的预后评估,得出了有争议和不确定的结果[5].在这里,我们描述了一个新的CML病例与复杂的变异Ph易位涉及染色体9,12和22。我们评估了对伊马替尼治疗的反应,并推测了这种染色体重排背后的分子事件。
2.案例报告
患者为72岁女性,有免疫介导的血小板减少症的临床病史。在常规实验室分析中,发现白血球计数(WBC)意外增加,并怀疑有CML。实验室检测白细胞计数39.2 × 103./mcL, 60%的中性粒细胞,21%的淋巴细胞,10%的单核细胞,2%的嗜酸性粒细胞,2%的嗜碱性粒细胞,4%的髓细胞,1%的亚髓细胞。血红蛋白13.5 g/dL在正常范围内,血小板计数较低(101 × 10)3./制程)。进行骨髓细胞遗传学分析和外周血RT-PCR检测。常规的细胞遗传学分析在未刺激的24小时和48小时的骨髓培养中进行。细胞经标准方法培养和处理[6],染色体经qfq显带染色。根据意大利和欧洲获得性细胞遗传学和ESMO(欧洲医学肿瘤学会)临床实践指南进行分析[7- - - - - -9].FISH分析使用BCR/ABL1 t(9;22)三色双融合探针和亚端粒9qter探针(Kreatech Diagnostics Vlierweg 20, 1032 LG Amsterdam, Netherlands),按照制造商的程序完成。核型结果根据ISCN 2013描述[10].采用基于TaqMan技术的Philadelphia p210 Q-PCR Alert kit (Nanogen Inc., San Diego, CA, USA)对外周血中嵌合BCR-ABL1转录本进行逆转录定量聚合酶链反应(RT-PCR)。RNA提取和RT-PCR按照插入试剂盒说明书进行(Nanogen Inc., San Diego, CA, USA)。P210的cDNA测量归一化为ABL1基因的cDNA。传统的骨髓细胞遗传学分析显示,在22个中期有一个涉及12和22的长臂染色体t(12;22)的相互易位,而不涉及9号染色体(图)1(一)).RT-PCR检测到BCR/ABL1融合转录本的存在,然后用间期FISH分析骨髓。外周血BCR/ABL1的定量RT-PCR检测显示主要的嵌合转录本,BCR-ABL1(P210)/ABL1比值为14.95%(国际标准)。采用BCR/ABL1 t(9;22)三色双融合探针FISH分析t(12;22)易位特征,检测融合基因的定位。探针组是红色标记的ASS-ABL1探针和BCR探针的混合物,近端BCR区域标记为蓝色,远端BCR区域标记为绿色。鱼在200年中期和核显示如下:(i)一个紫色(蓝/红)融合信号代表融合基因(BCR / ABL1) der(22),(2)一个绿色的信号3 ' BCR序列参与易位染色体12 t(12、22),(3)一个绿色/蓝色信号正常染色体22日(iv)和一个红色信号正常染色体9(数字1 (b)和1 (c)).未检测到ABL1/BCR信号的互融合。利用亚端粒9qter探针对200个细胞核和中期进行FISH分析,以进一步研究9号染色体参与复杂重排:它显示正常的信号模式。综上所述,FISH在der(9)上发现了包括ASS基因在内的5 ' ABL1序列的缺失,并绘制出了BCR基因远端序列内t(12;22)的断点。BCR探针分别在der(22)和der(12)上发出分裂信号。ISCN核型为46,XX,der(9)del(9)(q34q34)ins(22;9)(q11.2;q34q34),der(12)t(12;22)(q13;q11.2),der(22)ins(22;9)t(12;22)[22]。所有这些结果与CML诊断一致,患者开始使用甲磺酸伊马替尼(Glivec)治疗。治疗3个月后,白细胞计数为5.1 × 103./mcL,中性粒细胞占49.7%,淋巴细胞占37.8%,单核细胞占7.6%,嗜酸性粒细胞占4.3%,嗜碱性粒细胞占0.6%,血红蛋白浓度为12.4 g/dL,血小板计数211 × 103./制程。在治疗4和6个月后,用间期FISH对200个细胞核进行分子细胞遗传学随访,显示正常的信号模式,而6个月时的染色体分析显示,在8和9三体(48,XX,+8,+9)的样本中,5% (FISH分析的5个中期有2个,200个间期核有10个)中发现了一个新的异常克隆。
(一)
(b)
(c)
3.讨论
我们描述了一名CML患者与一种新的隐性复杂变异t(9;22)相关,除9和22号染色体外,还包括12号染色体,通过RT-PCR和FISH分析发现了其特征。与ESMO临床实践指南一致,本病例报告证明了这些分子方法在检测某些类型的Ph和der(9)染色体隐藏的变异易位中的隐融合基因的作用。如前所述,复杂变异t(9;22)的断点位置是非随机的,在特定的染色体带上有明显的聚类,表明某些区域更容易发生断裂。这一发现可以用一个特定的基因组结构来解释。确实,高CG含量区域、Alu重复、LINE、基因和miRNA的显著聚类解释了重组热点的存在[11,12].在我们的病例中涉及的12q13染色体区域由Costa等人描述[13[与复杂的费城易位和在某些情况下的三向易位有关t(9;22) [11].此外,该区域涉及其他染色体易位,源于梅西尔曼等人报道的白血病不同亚型的嵌合基因。[14]和癌症数据库中的染色体的地图集[15[脆弱的位点,FRA12A,这是由DIP2B基因的5- PRIME未翻译区域中的膨胀CGG重复引起的(OMIM611379) [16].结合所有这些数据我们可以推测,在12Q13中的特定基因组基序如CGG重复,可能导致在我们患者中观察到的变体T(9; 22)。据我们所知,这是CML患者在CML患者中这种类型变体易位的情况。
我们还可以假设,这种染色体重排是由至少4个同时断裂和关节的一步机制产生的,因为(i)在诊断时,我们没有检测到额外的克隆异常,(ii)在(22)只发生了一个断点,它位于BCR基因内,同时起源于融合基因和t(12;22)。相反,其他病例显示同一患者同时存在标准易位和复杂易位,提示两个或两个以上连续易位导致复杂变异型易位的形成[4].
关于含有复合成分易位的癌症的预后数据是矛盾的,并且该组一些患者的差的预后结果是通过增加持续缺失的频率(9)而不是染色体重新排列的类型[5].我们的患者已经接受伊马替尼治疗,在3个月的治疗中,尽管在der(9)上存在缺失,但她获得了血液和细胞遗传学应答,而在6个月的治疗中,她开发了一个具有8和9三体的克隆。这些三体在慢性粒细胞白血病中没有明显的预后意义。详细三倍体8干扰素和/或伊马替尼治疗后可能出现未知的意义和三倍体9被认为代表一个功能机制对p24 9日JAK2基因编码的JAK2激酶没有预后影响的后续研究有限样本大小(17].
到目前为止,我们的患者对伊马替尼治疗表现出良好的反应,但需要进一步的研究来证实这一发现。
利益冲突
作者声明本文的发表不存在利益冲突。
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