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干细胞国际/2011年/文章
特殊的问题

干细胞和核重编程

把这个特殊的问题

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体积 2011年 |文章的ID 201371年 | https://doi.org/10.4061/2011/201371

乍得m . Teven邢Liu Ning,倪,斯蒂芬妮·h·金,黄Enyi Ke,李老师,Jian-Li高,刘红,瑞恩•b•纳塔尔Gaurav路德,清罗,临王,杨Bi,理查德·拉美西斯罗金庸,色调h .灾区,雷克斯·c·海顿,拉塞尔·r·里德Tong-Chuan他, 间充质干细胞的表观遗传调控:关注成骨的和脂肪形成的分化”,干细胞国际, 卷。2011年, 文章的ID201371年, 18 页面, 2011年 https://doi.org/10.4061/2011/201371

间充质干细胞的表观遗传调控:关注成骨的和脂肪形成的分化

学术编辑器:乔治•a . Presicce
收到了 2011年3月21日
接受 2011年4月27日
发表 2011年7月11日

文摘

干细胞具有自我更新能力和晚期分化成多种细胞类型。体细胞或成体干细胞有一个有限的自我更新能力和谱系限制性。成体干细胞用于治疗目的的使用一直是最近感兴趣的主题的伦理性考量与胚胎干细胞(ES)细胞。间充质干细胞(msc)成体干细胞可以分化成成骨、脂肪形成的,chondrogenic或肌原性的血统。由于其易于分离和独特的特点,msc被广泛认为是潜在的候选人组织工程和维修。虽然各种信号分子重要MSC分化已确定,这个过程缺乏完整的理解。最近的调查集中在角色lineage-specific分化的表观遗传调控MSC显示独特的DNA甲基化和组蛋白修饰模式中扮演重要角色的诱导MSC分化向特定的血统。然而,MSC表观遗传资料反映了更多的限制比胚胎干细胞分化潜能。这里,我们审查的影响表观遗传修饰MSC multipotency和分化成骨的关注和脂肪形成的分化。我们也强调MSC表观遗传学的临床应用和核重编程。

1。介绍

两个特征区分从其他细胞类型:干细胞自我更新和分化成多个血统。胚胎干细胞(ES)细胞多能性细胞来源于胚胎早期囊胚的内细胞团(1,2]。胚胎干细胞独特的能力形成人体所有细胞类型和无限自我更新,因此都进行了广泛的调查在再生医学的领域,因为他们的隔离30年前(1,2]。然而,道德考虑,技术挑战和政府法规阻碍了它们的使用(3]。因此,体细胞或成人干细胞的研究,不生成相同的伦理问题,大大增加了。

不同于胚胎干细胞,成体干细胞的特点是一个受限制的分化潜能和有限的自我更新。成体干细胞已本地化的许多组织包括间质(4,神经5),胃肠道(6),肝7],性腺的[8,9),和造血10]。间充质干细胞(msc)分化为成骨细胞的多能成体干细胞,chondrogenic,肌原性的,脂肪形成的血统11- - - - - -13]。msc在大量成年人,主要在骨髓和脂肪组织和广泛调查的潜在作用在治疗人类的疾病。尽管已经获得有关知识的特点和临床应用msc (14),我们理解他们的行为仍然是有限的。鉴于MSC的治疗潜力的各种条件,包括骨头和软骨缺陷、缺血性心脏病、脑缺血,重要的是,我们继续阐明的精确机制直接MSC的命运。

尽管干细胞行为在很大程度上是由DNA序列,有多个层次的监管除了包括转录后的基因蓝图,平移,转译后的和表观遗传管理流程。表观遗传调控是基于遗传的基因表达模式的改变没有发生改变的主要核苷酸序列(15]。这些变化保持细胞分裂mitotically和减数通常持续几代人。一个基本的例子,表观遗传调控是细胞分化晚期。例如,终末分化上皮细胞同样的DNA序列的ES细胞的前体。然而,这两种细胞类型显著行为和功能的不同,和一些监管过程或过程必须是这种表型变化的基础。在这种情况下,表观遗传机制在很大程度上是负责特定基因的激活和镇压的变量在特定时间点细胞的寿命期间,允许为终末分化表型。大型哺乳动物的表观遗传机制包括DNA甲基化和组蛋白修饰,这两个一直紧密与基因调控和其他细胞过程包括部门和生存16,17]。

近年来,表观遗传调控也成为一个重要的干细胞分化的调制器18]。此外,中断与人类疾病相关的表观遗传调控一直是(19]。一个例子发生在:Angelman综合征患者或二氏综合征,而15 q11 - 13区段的印迹基因的表观遗传在放松管制在父系或母系等位基因位点,分别产生相关的表型(20.,21]。表观遗传放松管制也被牵连在许多恶性肿瘤,包括MSC-derived肿瘤(22- - - - - -28]。鉴于其与各种疾病状态,表观遗传调控已成为一个重要的潜在疗法的焦点。许多抗癌药物的作用机制包括DNA甲基化模式的改变或组蛋白修饰的蛋白质(29日]。表观遗传操纵的治疗潜力并不局限于药物治疗,然而。也正在调查作为一种治疗方式,因为它涉及到细胞重新编程的过程。

调查的表观遗传调控细胞命运决定在很大程度上集中在胚胎干细胞。最近的研究也阐明表观遗传状态负责lineage-specific成体干细胞的分化。而DNA甲基化模式是ES细胞分化的关键,组蛋白修饰和其他chromatin-based机制可能为更大的作用在MSC分化能力30.]。有趣的是,DNA甲基化的msc表明,与胚胎干细胞相比,msc分化潜能(有限31日]。目前,尚不确定是否解开msc将导致小说的表观遗传景观策略来提高他们的分化能力。似是而非,遗传基因表达的重组细胞可以增强控制操纵的表观遗传变化。在这篇文章中,我们总结我们目前的理解表观遗传的msc、特别强调相关签名multipotency和分化成成骨、脂肪形成的血统。我们也关注MSC的重组和MSC表观基因组的改变是否能增强他们的治疗潜力。

2。主要表观遗传机制

表观遗传机制发挥核心作用促进适当的转录途径在胚胎发育和成年组织维护。调节基因表达的表观遗传水平通过修改的染色质结构发生改变的基因转录因子的可访问性和其他调节器。具体地说,这些修改调节基因的表达,促进开放DNA(常染色质)允许转录或冷凝的DNA(异染色质)来抑制转录。发展和分化过程中损失的染色质的修改与胚胎杀伤力[有关32- - - - - -34]。我们将简要总结表观遗传调控的主要机制是他们在别的地方有详细的综述35,36]。

2.1。DNA甲基化

哺乳动物基因组的DNA甲基化不均匀分散在多模式描述为全球甲基化(36]。DNA甲基化是由添加的位置5甲基胞嘧啶(m5C)在cytosine-phosphate-guanine (CpG)二核苷酸和对称发生DNA链。地区密集的CpG二核苷酸,称为CpG岛,是许多人类基因的启动子附近发现37]。一般来说,启动子DNA甲基化与相应基因的镇压(38,39]。然而,这种关联并不总是直截了当。与methylation-free CpG岛通常保持沉默而相关的基因的甲基化的基因启动子偶尔进行转录。这种关系可能取决于启动子CpG二核苷酸的内容,高含量的甲基化CpG发起人通常抑制转录,而低含量CpG甲基化促进剂可以激活或抑制转录(40]。偶尔,DNA甲基化可能需要额外的表观遗传事件发生与此同时对转录的影响41]。

DNA甲基转移酶(DNMTs)催化论文认定的甲基化。种能阻碍DNMT3b两个DNMTs DNMT3a和负责新创DNA甲基化在胚胎发育和细胞分化[42]。在细胞分裂过程中,三分之一DNMT DNMT1,承认hemimethylated DNA甲基化,确保档案富达的催化其相应的女儿链的甲基化43]。DNA甲基化是至关重要的许多过程包括长期基因沉默(41,44),适当发展(45- - - - - -48),X染色体失活(49),和基因组印记50- - - - - -53]。

虽然DNA甲基化发生在所有细胞,独特的甲基化模式根据不同细胞类型(54]。Bibikova等(55]调查超过1500的DNA甲基化状态CpG网站14个人类ES细胞系,相比38 non-ES细胞的甲基化状态。使用珠阵列和集群分析和methylation-specific聚合酶链反应(PCR),作者报道,基于甲基化图谱,人类ES细胞包含一个独特的表观遗传签名(55]。这一发现可能会对胚胎干细胞多能性的影响和发展潜力。我们最近开始发现甲基化模式独特的msc(见下文)56,57]。

目前,“金本位”方法来分析DNA甲基化模式是亚硫酸氢基因组测序(58]。这种方法包括bisulfite-mediated化学转化unmethylated胞嘧啶的CpG二核苷酸尿嘧啶,而甲基胞核嘧啶保持免受化学转化(59]。PCR然后替代品尿嘧啶与胸苷和后续的测序显示了原始序列的甲基化状态。甲基化程度的定量评估可以评估细菌克隆PCR产品。

2.2。组蛋白修饰

染色质的DNA和蛋白质组成的,指的是在这些DNA和蛋白质是打包在真核细胞细胞核。如上所述,染色质可以作为常染色质包装松散,促进基因转录,或严格为异染色质,促进基因镇压。核小体是染色质的基本结构单位,由2单元每个四个核心的组蛋白蛋白质(H2A、H2B H3, H4)约147个碱基对的DNA被包装。组蛋白是小基本蛋白质本质上主要是球状的,除了他们的非结构化的氨基端“尾巴”。后续组蛋白蛋白质翻译、氨基端尾巴可以在众多共价修改方法来调节基因的表达(35]。最彻底调查组蛋白乙酰化和甲基化的修改。

组蛋白的代码假设表明“不同的修改,在一个或多个反面,行动顺序或结合在一起形成一个“组蛋白密码”阅读的其他蛋白质带来截然不同的下游事件”(65年- - - - - -67年]。组蛋白密码可以瞬态或稳定;如果稳定,这些代码构成表观遗传调控意味着遗传(67年,68年]。表观遗传调控由组蛋白修饰在本质上是动态的和固有的复杂。例如,组蛋白赖氨酸残基的甲基化,催化由组蛋白甲基转移酶(hmt),可以与转录激活和镇压69年]。Trimethylation赖氨酸4组蛋白H3 (H3K4me3)标志着常染色质和基因的激活。相比之下,H3K27me3和H3K9me3信号异染色质和基因镇压。H3K27me3标志被认为是至关重要的干细胞的“具备干细胞”(70年,71年],H3K27脱甲基作用触发细胞分化[72年- - - - - -74年]。组蛋白的化学修饰进一步增加了复杂性的影响,甲醇hmt的H3K9为了转录沉默往往取决于相邻的赖氨酸残基上的甲基化状态H3 (18,75年]。hmt和组蛋白demethylases (hdm)协同工作来确定组蛋白赖氨酸甲基化水平在一个细胞(76年]。

组蛋白乙酰化组蛋白的化学修饰也是一个广泛研究。的反对活动组蛋白乙酰转移酶(帽子),组蛋白acetyl-deacetylases (hdac)负责细胞组蛋白乙酰化水平(76年]。一般来说,组蛋白赖氨酸残基的乙酰化与转录激活,而组蛋白赖氨酸脱乙酰作用沉默基因转录。H3K9的乙酰化作用(H3K9ac)和乙酰化H4K16 (H4K16ac)是常见的标志基因附近的常染色质积极被转录(56]。尽管组蛋白修饰主要是通过改变染色质结构,具体的修改(例如,H3K4me3和H3K9ac)还通过招聘和拘束调解基因调控转录调节器染色质(77年- - - - - -81年]。

染色质免疫沉淀反应(芯片)化验,最初旨在研究RNA聚合酶II行为(82年- - - - - -85年),允许研究人员绘制定位中的组蛋白修饰基因组或到个人推广者(86年]。一个特定的组蛋白修饰可以免疫沉淀反应,以便与之相关的DNA序列可以通过PCR鉴定(86年]。研究人员也可以鉴定出组蛋白相关蛋白与基因组的特定区域使用芯片。

各种证据表明染色质内未分化的胚胎干细胞通常不紧凑,因此更“transcription-permissive”,而分化细胞(87年]。例如,pericentric异染色质逐渐集群作为人类和小鼠ES细胞分化[88年,89年]。此外,使用荧光光漂白后恢复(收紧),技术措施的汇率chromatin-associated蛋白(90年],Meshorer和同事[91年]表明,ES细胞含有高动力性的染色质蛋白质松散地绑定到染色质。ES细胞开始分化,这些高动力性的蛋白质成为固定化染色质信号血统的承诺这些细胞(91年]。事实上,宽松的染色质协会和其结构蛋白可能是细胞多能性的一个重要标志。少定义是特定组蛋白修饰的协会MSC细胞的命运。阿胶et al。56)所描述的二价组蛋白标记(H3K4me3和H3K27me3)在未分化的msc lineage-specific推动者来源于脂肪组织。这一发现,除了证据表明这些lineage-specific推动者hypomethylated(见下文),可能表明脂肪形成的启动子在msc是刺激脂肪形成的预排程序的56]。

研究人员调查组蛋白修饰模式差异的表皮干细胞和终末分化细胞表皮血统发现myc诱发成人干细胞的分化与众多染色质的修改(92年]。具体来说,静止的表皮干细胞被发现含有高水平的H3K9me3 H4K20me3和低水平的H4乙酰化H4K20me1(修改通常与基因激活)92年]。Myc-treated干细胞进行了分化,相应增加H4乙酰化以及沉默H3K9me2和H4K20me2标志92年]。这些数据表明,单个转录因子能够引起广泛的染色质状态的变化,尽管目前尚不清楚myc诱发如何分化的表皮干细胞诱导增加染色质修饰与基因激活和基因沉默。更重要的是,改变染色质结构,主要由表观遗传现象,可能是许多机制,促进细胞分化的基础。节约途径来操作这样的现象,我们可以提高我们的能力减弱相关病理组织变性,指导细胞的命运。

3所示。间充质干细胞:表观遗传特征和力量

虽然msc吸引了大量关注潜在的再生组织,我们尚未确定细胞标记特定于msc。为了促进一个更一致的方法研究MSC生物学、冷冻疗法的国际社会已经提出,人类的MSC符合下列条件:(1)塑料坚持培养细胞的标准培养条件;(2)CD105的表达、CD73 CD90和缺乏的CD34的表达,CD45, CD14或CD11b CD79α或CD19 HLA-DR表面分子;(3)能力分化为成骨细胞,脂肪细胞,体外(内层93年]。人口的多功能细胞来源于脂肪组织,骨髓,骨骼肌都发现体外(为了满足这些定义的标准94年- - - - - -98年]。不足为奇的是,这些不同的人群的msc在各种能力密切相关。例如,msc来源于脂肪组织(adipocyte-derived干细胞;对asc),以及来自骨髓msc(骨髓msc;BMMSCs),表达了类似的基因表达谱(99年- - - - - -101年),表面标记(94年,98年),并分享相似的分化潜能(98年,102年]。索伦森et al。103年)报道称,DNA甲基化概要文件msc隔绝人类脂肪组织之间,骨髓,和肌肉也相似。相比之下,MSC启动子甲基化概要文件不同于其他类型的细胞,包括人类胚胎干细胞、多能的ES细胞来源间充质细胞,造血干细胞(hsc) [103年,104年]。

表型,转录组、功能以及现在,表观遗传证据表明msc与各种组织有关,它是合理的,msc起源于一个共同的起源112年]。为此,周,被隔离在中胚层组织包括脂肪、骨和肌肉,被发现含有几个特征msc (113年- - - - - -115年]。因此,作者推测,MSC人口可能追溯到pericytic起源(112年,113年]。

3.1。msc的表观遗传档案文化

在过去的二十年里,msc被孤立的从许多动物116年- - - - - -122年和人体组织123年- - - - - -131年]。兴奋关于他们使用用于组织工程在一定程度上源自于发现msc驶向受伤组织(132年),被认为是MHC II -细胞,缺乏co-stimulatory分子CD40, CD80和CD86 [133年]。因此,他们可以allogeneically移植接受者的兴趣而不需要免疫抑制。事实上,MSC-based治疗的治疗潜力已经展示了人类的各种条件(60- - - - - -64年,134年- - - - - -140年]。具体地说,调查人员评估其功效治疗临界骨缺损大小,软骨退化,骨代谢疾病,缺血性心脏病和脑缺血(表1)。然而,障碍的广泛使用msc有限。一般来说,已经被证实很难收获大量的msc在许多组织,特别是骨髓(4]。因此,msc必须扩大体外隔离后用于治疗目的。对于这种策略一个潜在的担忧,然而,源于发现msc增殖和分化能力显示变量在文化141年]。相比early-passage msc、late-passage msc分化潜能(减少142年]。此外,msc在体外可能发生恶变,但这一发现是有争议的143年- - - - - -145年]。研究解决此类问题记录,late-passage msc显示正常分析(146年- - - - - -148年和基因组的稳定性149年),但他们的行为变化的文化意味着改变的某些方面的监管。


作者 一年 指示 结果

爆炸等。60] 2005年 脑缺血 缺血性中风后功能恢复MSC-treated病人相比,控制患者的改善
莳萝et al。61年] 2009年 胆道 冠脉内MSC政府改善STEMI后LVF
霍维茨et al。62年] 2002年 骨代谢疾病 5 6 OI患者显示加速骨骼生长速度静脉输液后同种异体msc
Marcacci et al。63年] 2007年 临界骨缺损大小 植入HA支架的播种与msc骨干缺陷导致植入骨头和主机之间的融合
Wakitani et al。64年] 2007年 软骨缺损 直接网站msc移植到关节软骨缺陷导致临床症状的改善和缺陷修复

MSC:间充质干细胞;IDH:缺血性心脏病;LVF:左心室功能;STEMI: st段抬高心肌梗死;OI:成骨不全症;第四:静脉注射;HA:羟磷灰石。

偶尔nonmesenchymal-derived细胞的表观遗传资料显示不稳定在文化157年- - - - - -159年]。评估如果发生类似的现象在msc、达尔和他的同事们(57)检查CpG甲基化模式在人类BMMSC文化170年的细胞周期和癌症相关的推动者。近90%的这些基因保持早期和晚期通道之间的甲基化形象,表明骨髓MSC文化源于有一个稳定的体外CpG甲基化状态。此外,对asc的甲基化状况保持一致至少4通道体外,对应于20人口从一个细胞倍增160年]。还需要进一步的研究来评估的甲基化状态对asc更长时间后(即文化。,after 15 passages), but it appears unlikely that alterations of promoter DNA methylation are responsible for the reduced differentiation capacity seen in late-passage MSCs [150年]。

相比之下,组蛋白修饰模式变量涉及细胞行为文化。在正常情况下,脂肪形成的对asc和肌原性的启动子区域与组蛋白修饰的双价组合相关联。具体地说,是富含H3K4me3启动子区域和H3K27me3,而缺乏H3K9me3和H3K9ac [161年,162年]。早段的区分也有相应的上升H3K9乙酰化和H3K27脱甲基作用,从而缓解H3K4me3 / H3K27me3 bivalency。相比之下,late-passage msc与H3K27me3维护和最小H3K9乙酰化作用[161年]。还有全球upregulation Polycomb阻遏复杂蛋白质ExH2 H3K27(一种酶,这种酶催化甲基化)和全球增长H3K9脱乙酰作用在长期培养的msc (161年]。从这些数据看来,组蛋白modification-mediated表观遗传改变late-passage msc可以负责一个已故的区分能力培养的msc的年龄。然而,还需要进一步的研究来更充分地描述这种表观遗传变化在全球范围内。

3.2。msc多能从表观遗传的角度看吗?

多能细胞有能力成为所有血统的细胞在体内而多功能细胞分化成各种细胞类型从一个血统。msc通常被称为多功能考虑到他们倾向形成中胚层血统内的细胞类型。最近,Jaenisch和年轻163年)指出,目前尚不清楚真正的多能干细胞可以从成年动物分离。然而,分析表明,某些人群的msc可以分化成细胞类型从所有3胚芽层(164年- - - - - -169年]。江et al。170年局部细胞在人类BMMSC文化,刺激,可以分化为间充质,neuroectodermal,内胚层的171年)和内皮组织(172年,173年]。后注入早期胚泡,作者报道,msc的人口导致大多数或所有成人细胞类型,从而表明多能性(170年]。D 'Ippolito和他的同事们(174年]也孤立的人类骨髓基质细胞的一个独特的族群,称为marrow-isolated成人multilineage诱导(迈阿密)细胞,可以分化成成熟细胞的3胚芽层。然而,msc多能性尚未满足更严格的标准,包括生殖系贡献或四倍体互补(163年]。

目前,人们普遍认为msc是局限在中胚层的血统,但在一定条件下可以分化成大多数或所有组织。这个概念lineage-restriction一直支持的表观遗传研究实验室的阿胶et al。103年,112年,160年,175年]。MSC lineage-specific倡导者大多hypomethylated MSC。相比之下,内皮细胞启动子CD31对asc和BMMSCs完全甲基化,与缺乏CD31表达在msc。此外,使用甲基化DNA免疫沉淀反应(MeDIP),发现hypermethylated msc的基因往往是与监管的发展,转录,信号和代谢功能。有趣的是,许多基因的启动子表达nonmesodermal派生细胞保持hypomethylated msc、即使msc一般不会分化成细胞表达这些基因。因此,阿胶等人实验室提出了强大的血统规范和发展推动者的甲基化可能限制MSC分化能力;然而,hypomethylation lineage-specification推动者是没有预测价值的差异化能力(112年]。这是符合lineage-priming MSC分化能力的分子模型,假定,MSC表达基因的一个子集对应分化途径他们可以提交176年]。此外,在胚胎干细胞中,甲基化发生在pluripotency-associated位点作为多能细胞失去(即。,在分化)[159年,177年]。综上所述,表观遗传数据支持这一概念,msc是归类为多功能比多能。

4所示。表观遗传MSC细胞命运的控制

问题是一个细胞的表观遗传状态如何影响命运的决心主要专注于胚胎干细胞。在ES细胞,例如,lineage-specific推动者与终端分化往往DNA甲基化相关(178年]。这可能阻碍不当或过早向特定的谱系分化,从而维持多能性。最近,研究发现,这些相同的启动子区域unmethylated msc (112年),这表明胚胎干细胞的表观遗传状态变化,因为它们分化成msc。然而,无论这些表观遗传改变的原因或结果ES细胞命运的决定仍不清楚。此外,MSC分化的机制对一个特定的细胞类型中胚层的血统中尚未完全阐明。在这里,我们审查相关的表观遗传调控成骨分化(表2)和脂肪形成的差异(表3msc),这些途径一直是最广泛的调查。


表观遗传调控 目标 发现 参考

DNA甲基化 OC 减少启动子DNA甲基化与成骨分化有关 Villagra et al。105年]
DNA甲基化 OPN 机械诱导启动子DNA脱甲基与加速成骨分化有关 Arnsdorf et al。106年]
DNA甲基化 Brachyury 启动子DNA甲基化与成骨分化有关 Dansranjavin et al。107年]
DNA甲基化 Trip10 启动子DNA甲基化与加速成骨分化有关 萧et al。108年]
组蛋白修饰 OC 乙酰化作用的H3和H4与OC表达和成骨分化有关 沈et al。109年]
组蛋白修饰 HOXA10 HOXA10-mediated染色质乙酰化和H3K4甲基化促进成骨的基因的转录 哈桑et al。110年]
组蛋白修饰 AP-2α H3K4甲基化和H3K36与美联社有关- - - - - -2α表达和随后的成骨分化。突变demethylation-related蛋白(如BCOR)与OFCD综合症有关 风扇等。111年]

OC:骨钙素;OPN:骨桥蛋白;Trip10:甲状腺激素受体interactor-10;BCOR: BCL-6辅阻遏物;OFCD: oculo-facial-cardio-dental。

表观遗传调控 目标 发现 参考

DNA甲基化 PPARγ2,地蜡,fabp4,lpl 发起人对asc hypomethylated这些4脂肪形成的基因 诺尔et al。150年]
DNA甲基化 PPARγ PPAR的表达γ是由启动子DNA甲基化。启动子甲基化对应于一个PPAR的表达下降γ和减少脂肪形成的分化 Fujiki et al。151年]
DNA甲基化 Glut4 启动子DNA脱甲基作用是细胞进行脂肪形成的分化 Yokomori et al。152年]
DNA甲基化 地蜡 地蜡启动子区域高度甲基化在preadipocytes但unmethylated终末分化脂肪细胞 Melzner et al。234年]
DNA甲基化 Genistein-mediated逆转录转座子上游的DNA甲基化与减少肥胖 Dolinoy et al。153年]
组蛋白修饰 ApM1 H3 hyperacetylation和H3K4me3apM1启动子区域与脂肪形成的早期分化有关。抑制H3K4甲基化导致减少apM1表达和减少脂肪生成 穆斯里et al。154年]
组蛋白修饰 多个基因启动子 所需的hdac是Downregulation脂肪形成的分化 Yoo et al。155年]
组蛋白修饰 PPARγ基因的目标 磷酸化RB新兵HDAC3的倡导者PPARγ基因的目标,减少脂肪形成的分化。抑制HDAC3活动的结果PPARγ激活和随后的脂肪形成 Fajas et al。156年]

PPARγ:过氧物酶体proliferator-activated receptor-gamma;地蜡:瘦素;fabp4:脂肪酸结合蛋白4;lpl:脂蛋白脂肪酶;ASC:脂肪干细胞;Glut4:葡萄糖转运体类型4;ApM1:脂联素;H3K4me3: Trimethylation赖氨酸4组蛋白3;HDAC:组蛋白脱乙酰酶;RB:视网膜母细胞瘤。
4.1。成骨分化

成骨分化的msc是一个复杂的过程,是由众多信号通路和严格控制转录因子(11]。Runt-related转录因子2 (Runx2)被认为是主调节器的成骨分化和表达许多骨骼发育和成熟阶段179年- - - - - -181年]。Runx2转录活动本身就是受到强劲的规定,证明了其与许多辅活化因子和辅阻遏物(181年- - - - - -184年]。越来越清楚的是,表观遗传调控也是Runx2的关键活动,因此成骨分化。表观遗传调控染色质通常导致结构性变化改变Runx2的结合能力和其他转录因子成骨的启动子区域。最彻底的研究成骨的血统是启动子的启动子骨钙素(OC),它包含许多因素的结合位点osteoblast-specific基因的激活的关键包括Runx2 [105年,109年,185年- - - - - -188年]。乙酰化组蛋白H3和H4,以及DNA甲基化水平降低,增加的可访问性OC启动子osteo-inductive转录因子(105年,109年,185年]。此外,HOXA10-mediated染色质hyperacetylation和H3K4 Trimethylation引起染色质结构的变化,促进Runx2-mediated激活的基因编码OC和其他成骨细胞的表型标记(110年]。此外,CreMM / CHD9,最近冠心病染色质重塑家庭成员特征(189年- - - - - -191年),在msc附近检测到新成立的成人骨(192年]。CReMM / CHD9结合为两个启动子Runx2OC在成骨的基因表达。尽管CReMM / CHD9被认为通过依赖dna的atp酶活性,改变染色质结构的表观遗传机制连接CReMM / CHD9成骨分化是未知的192年]。

骨骼加载和loading-induced动态流体也成骨分化的关键调节因素(193年- - - - - -199年]。最近的一项调查解决这些监管机构法案是否通过表观遗传修饰(106年]。机械诱导分化与启动子的DNA甲基化水平降低骨桥蛋白(OPN;骨重建的一个重要因素)以及增加OPN表达和成骨分化。同样,biologically-induced成骨分化的msc(使用增长媒体补充β-glycerolphosphate、抗坏血酸和地塞米松)与降低OPN启动子甲基化以及增加OPN表达(106年]。

毫不奇怪,修改基因的表观遗传调控成骨分化发生在msc成为成骨细胞的关键。然而,最近的证据表明,表观遗传调控的变化可能发生在全球范围内,msc分化向骨。例如,在启动子区域甲基化中胚层的转录因子Brachyury沉默brachyury表达式,它是伴随着osteo-induction msc (107年]。此外,萧和他的同事们(108年)报道,甲状腺激素受体interactor-10 (Trip10),一个适配器蛋白质参与多种细胞功能,是人类BMMSC分化期间epigenetically修改。作者选为调查是否变化Trip10表观遗传调控可能会改变MSC分化模式,因为它与H3K27me3标志。有趣的是,msc在vitro-methylated转染后Trip10启动子DNA, msc接受进步内生的胞嘧啶甲基化Trip10启动子,导致减少Trip10表达式和加速MSC分化成骨和神经细胞系(108年]。除了证明Trip10表达水平与成骨分化相关,本研究说明了操纵MSC表观基因组的方式不同于经典核重编程(见下文)可以用作治疗方法。然而,进一步的研究关于这种类型的长期影响的表观遗传操作是必要的,才能广泛应用于人类。

支持作用的表观遗传调控MSC成骨分化也来自骨发育异常的报告。Oculo-facial-cardio-dental (OFCD)综合征的特点是牙齿太长根和颅面,眼睛和心脏异常(200年- - - - - -204年]。这个x连锁显性综合症相关的基因研究突变的BCL-6辅阻遏物(BCOR)蛋白质204年]。在正常情况下,BCOR的镇压行动是由染色质的修改通过交互与hdac hdm, H2A泛素连接酶(205年- - - - - -207年]。从牙科和颅面组织msc被孤立208年- - - - - -210年),导致风扇等。111年]调查是否BCOR突变增强骨的/ dentinogenic msc的潜力。使用增益功能丧失化验,作者证明了AP-2α专制BCOR的目标基因,主要是负责骨的/ dentinogenic msc的能力。H3K4甲基化和H3K36在AP-2α启动子与基因激活(211年,212年]。BCOR通常催化的脱甲基H3K4me3和H3K36me2213年,214年突变(时),但不能这样做111年]。的合成甲基化阻碍绑定BCL-6阻遏蛋白的AP-2α子,导致失控AP-2α表达式。因此,BCOR突变削弱其脱甲基活动许可控制骨的/ dentinogenic的msc分化OFCD综合症(111年]。

4.2。脂肪形成的分化

在脂肪形成的脂肪细胞分化的发展msc发生在两个阶段(131年,215年]。第一阶段,决心,msc的承诺是脂肪形成的血统,这意味着失去分化成另一个血统的能力。第二阶段,在msc开始发生分化,表达成熟脂肪细胞的表型特征。类似于成骨分化,脂肪生成是一个高度协调的过程,涉及众多转录因子在不同时间点执行特定功能(216年- - - - - -218年]。正如Runx2充当主调节器的成骨分化,核激素受体的过氧物酶体proliferator-activated receptor-gamma (PPAR -γ在去()有一个重要的角色219年,220年]。此外,许多coregulators和转录因子脂肪生成chromatin-modifying活动中心(221年- - - - - -223年),支持的角色在骨髓间充质脂肪细胞分化的表观遗传调控。

诺尔等(160年]研究了DNA甲基化的脂肪形成的和对asc nonadipogenic基因在人类使用亚硫酸氢基因组测序。四脂肪形成的基因的启动子PPARγ2,瘦素(地蜡),脂肪酸结合蛋白4 (fabp4),脂蛋白脂肪酶(lpl)已经发现在刚收获的人类对asc hypomethylated [160年]。有趣的是,和在捐助者之间的CpG甲基化概要文件被描述为马赛克(即。,他们不统一)160年),这是符合干细胞发现身体其它部位的224年,225年]。值得注意的是,马赛克CpG甲基化被认为源于随机使甲基化事件在不同的CpG网站由于环境,健康,和与年龄相关的因素(226年- - - - - -229年]。诺尔和他的同事们(160年)还指出,等看家基因的启动子区域GAPDH和LMNB1 unmethylated而nonadipogenic lineage-specification基因启动子(Myogenin肌原性的;CD31 / PECAM1CD144 / CDH5,hypermethylated内皮)。这些研究表明,骨髓间充质脂肪形成的血统可能的承诺反映在一个特定的表观遗传签名hypomethylated而nonadipogenic脂肪形成的基因启动子的启动子甲基化。体外分析相关的各种脂肪形成的促进剂的脱甲基,包括PPARγ在小鼠细胞系,脂肪形成的分化(151年,230年,231年]。然而,对asc的启动子DNA甲基化模式并不总是与蛋白表达(101年,160年]。这表明额外的脂肪形成的差异化监管层是必要的。

具体histone-mediated染色质结构的修改被记录为多功能msc成为“preadipocytes”的决心232年]。H3K4me2,一个活跃转录的标志,在脂肪形成的基因的启动子包括已被确认脂联素(apM1),glut4,地蜡在测定(154年]承诺在脂肪细胞前体分化细胞进展,进一步描述了表观遗传标志特征。除了启动子DNA脱甲基作用glut4地蜡(152年,233年,234年),这些启动子也接受H3K9脱甲基,H3乙酰化和H3K4 Trimethylation [154年,232年),都是表观遗传标记基因的激活。的差别此外,对这些基因的细胞在分化hdac似乎促进脂肪形成的家族承诺,而其过度变弱(155年]。有趣的是,蛋白质磷酸化视网膜母细胞瘤(Rb)新兵HDAC3的倡导者PPARγ靶基因,从而抑制相关基因的转录,从而抑制脂肪形成的分化(156年,235年]。

MSC分化需要适当的组织开发和修复,但它可以是有害的,当它发生过。肥胖症的例子是目前困扰美国和全球236年]。随着表观遗传调控变得日益认识到编程因子在脂肪生成的过程中,它可以遵循,表观遗传放松管制在肥胖的发展。事实上,导致甲基化变化与肥胖小鼠(153年,237年]。它希望进一步研究表观遗传调控脂肪形成的分化将提供洞察潜在治疗肥胖和代谢紊乱有关。

5。核重编程的间充质干细胞

直接表观遗传操作(例如,通过甲基化DNA转染)尚未广泛应用于人类,因为这种疗法的长期影响是未知的。细胞的表观遗传程序可以更改在其他方面,然而。几个策略用来重组体细胞多能胚胎状态。我们将简要总结这些策略被广泛回顾之前(163年,238年,239年]。

体细胞核转移(SCNT),也称为核移植(NT)的过程是体细胞的核供体细胞引入一个无核的卵母细胞。SCNT被用来产生克隆动物克隆绵羊多莉(包括240年]。SCNT也介导基因匹配的替代细胞的创建。因此,SCNT是对医学的兴趣,因为它有可能规避免疫不相容与细胞捐赠从源以外的病人。此外,核重编程的msc被最广泛研究SCNT的上下文中。另一种细胞重新编程策略由融合体细胞胚胎干细胞产生混合,演示了精原特性包括多能性。然而,这种方法的缺点是合成重组四倍性细胞。第三个策略包括瞬态孵化体细胞胚胎干细胞的提取没有核。这种方法被用来提高体细胞体外没有创建细胞多能性4套染色体。最后,高桥和山中设计了一个开创性的核重编程策略的创建2006年诱导多能干细胞(iPS)细胞(241年]。作者成功地重组了老鼠胚胎/成人成纤维细胞多能精原干细胞(iPS细胞)通过引入转录因子Oct4、Sox2,原癌基因,并通过viral-mediated Klf4成分化细胞转导(242年,243年]。在感染细胞的异位表达重组因子启动内源性基因的表观遗传事件序列的关键维护ES细胞多能性和血统规范,从而激活“诱导多能性”细胞的多能状态(76年,163年,241年,244年]。使用类似的组合因素,作者也孤立的“诱导多能性”细胞从人类成纤维细胞(242年,245年,246年]。然而,发现老鼠通常来源于“诱导多能性”细胞恶性肿瘤发展已经大大阻碍了这一技术的应用(247年]。有趣的是,致癌基因转录因子可能不是必要的原癌基因重组的细胞,但它促进了快速和高效的重编程过程(246年,248年,249年]。必不可少的因素或组合因素重组仍不清楚,具体分子电路一样潜在的多能性。然而,因为核重编程有潜力创造特定的细胞允许定制的治疗,目前许多研究者极大的兴趣。

在过去的几年里,研究显示特殊的表观遗传变化时产生的分化与重组的过程。例如,ES细胞致力于特定的谱系,转录因子Oct4,这被认为是必要维护ES细胞多能性,迅速的沉默。Epigenetically,Oct4沉默与损失有关的基因活动标志(H3K4me3、H3K7ac H3K9ac),以及增加了基因沉默(H3K9me3和DNA甲基化)Oct4启动子(163年,250年]。为了从体细胞生成“诱导多能性”细胞,这些沉默是必须逐渐远离Oct4启动子。此外,必须压抑为了lineage-specification基因去分化细胞重编程过程中。“诱导多能性”细胞显示染色质的修改,阻止转录的基因编码发展监管机构,从而维持多能性的抑制分化(163年,251年,252年]。多能性监管机构的发起人也表现出减少DNA甲基化模式在iPS细胞(247年,251年,252年]。综上所述,这些数据表明,表观遗传改造是一个重要的元素的核重编程体细胞。

尽管已经取得了进展领域的核重编程,其治疗应用仍有局限。例如,SCNT本质上是一种低效率的过程。大多数克隆植入或出生后不久死亡严重畸形由于错误的重新编程253年,254年]。一些作者猜测,终末分化细胞相比,低分化细胞可能会增加SCNT效率,因为他们可能更容易重新编程。Faast和他的同事们(255年)检查如果msc可以提高SCNT效率相比终末分化成纤维细胞在猪模型。使用msc没有增加卵裂率相比,成人成纤维细胞获得相同的动物,但发达囊胚阶段的胚胎的百分比是几乎翻了一倍(255年]。这些发现与早期的研究一致,证明了改进SCNT效率使用胚胎干细胞分化的体细胞(相比256年- - - - - -260年]。金等。261年)也报告说,与胎儿成纤维细胞相比,猪msc具有更大的供体细胞的潜力。相比之下,其他调查人员指出,之间不存在显著差异的msc的数量达到囊胚阶段SCNT(后成纤维细胞相比262年,263年]。最近,Brero et al(264年)评估核重编程的效率SCNT msc和成人成纤维细胞在一只兔子模型中通过监测水平的组蛋白修饰与常染色质转录活跃(H3K4me2/3)或转录镇压兼性异染色质(H3K27me3)。随后SCNT, H3K27me3重组(即被发现。,largely undetectable) in both MSCs and adult fibroblasts, which was consistent with H3K27me3 patterns in control embryos. However, the reprogramming status of the H3K4me2/3 mark largely depended on cell type as it was inconsistent between MSCs, fibroblasts, and control embryos [264年]。基于克隆胚胎囊胚阶段的发展以及重新编程水平的组蛋白修饰,作者报道,msc没有核捐赠者比成人成纤维细胞(264年]。目前尚不清楚为什么报告的区别在于使用捐赠者的细胞克隆效率在不同的发展阶段,但变化方法,技术,和物种可能是负责任的。需要进一步的研究来解决这个问题。

因为SCNT已经被证明是一个低效的过程不管使用核供体,调查人员试图改善SCNT药物。HDAC抑制剂Trichostatin (TSA)被证明能增加SCNT老鼠的效率(265年,266年)、猪(267年,268年)、牛(269年,270年),和兔子271年),尽管这些发现不普遍272年,273年]。TSA可逆地结合,抑制hdac的行为,造成乙酰化组蛋白积累在细胞274年]。TSA也已被证明能够影响DNA甲基化,DNMT表达水平,和异染色质重塑275年- - - - - -277年]。的确,表观遗传因素动态相互作用,中介目标表观遗传机制有多效性的影响。TSA的表观遗传因素进一步评估修改,Martinez-Diaz和他的同事们(278年)评估变化的表观遗传标记在预处理和postimplantation有机体发展SCNT和TSA治疗使用猪骨髓细胞(bmc;假定的msc)和胎儿成纤维细胞。同时TSA治疗增加了immunofluorescent(如果)信号的H3K14ac胚胎来自这两种细胞类型,它不增加如果H3K9me2的信号。作者还报道,TSA治疗加速发展的速度为fibroblast-derived胚胎囊胚阶段而不是胚胎来自bmc。此外,重构胚胎成纤维细胞发达和不使用TSA postimplantation治疗,而TSA BMC-derived胚胎(postimplantation治疗是必要的发展278年]。这项研究部分澄清在SCNT TSA的表观遗传行为治疗。然而,这进一步证明,是否少分化细胞(在这种情况下的bmc)更服从于核重编程进一步分化的细胞类型还有待解决。

6。前景

干细胞为基础的治疗最终可能作为一种潜在的补救许多人类病态以前被认为是不可治愈的。msc尤其承诺等条件要求组织的再生骨和软骨缺陷。然而,这种治疗方法成为现成的之前,我们必须进一步阐明负责干细胞行为的机制。我们已经讨论了,msc许多水平的控制。表观遗传现象最近才被确认为重要的监管机构MSC的命运。无数的表观遗传修饰发生与此同时在成骨的和脂肪形成的msc分化。尽管知识生成关于负责MSC分化的表观遗传修饰,进一步调查为此将增加我们的能力使用MSC治疗。事实上,可想而知,操纵multipotency和多能性相关的表观遗传特征,以及与lineage-specific分化相关的修改,可以直接针对病人的治疗。识别的因素需要重新编程mesenchymal-derived体细胞不分化状态还可以提供洞察MSC命运的调控的决心。

缩写

ApM1: 脂联素
ASC: 脂肪干细胞
BCOR: BCL-6辅阻遏物
BMC: 骨髓细胞
BMMSCs: 骨髓间充质干细胞
芯片: 染色质免疫沉淀反应
CpG: Cytosine-phosphate-guanine
DNMT: DNA甲基转移酶
ES: 胚胎干细胞
fabp4: 脂肪酸结合蛋白4
收紧: 荧光光漂白后恢复
Glut4: 葡萄糖转运体类型4
H3K9ac: 乙酰化组蛋白赖氨酸9的3
H3K4me3: Trimethylation组蛋白的赖氨酸4 3
H3K27me3: Trimethylation组蛋白赖氨酸27的3
帽子: 组蛋白乙酰转移酶
HDAC: 组蛋白acetyl-deacetylase
HDM: 组蛋白demethylase
HMT: 组蛋白甲基转移酶
HSC: 造血干细胞
IDH: Hschemic心脏病
如果: Immunofluorescent
“诱导多能性”: 诱导多能干细胞
地蜡: 瘦素
lpl: 脂蛋白脂肪酶
LVF: 左心室功能
MeDIP: 甲基化DNA免疫沉淀反应
硕士: 间充质干细胞
NT: 核移植
度: Ostecalcin
OFCD: Oculo-facial-cardio-dental
OI: 成骨不全症
OPN 骨桥蛋白
聚合酶链反应: 聚合酶链反应
PPARγ: 过氧物酶体proliferator-activated receptor-gamma
RB: 视网膜母细胞瘤
Runx2: runt-related转录因子2
SCNT: 体细胞核移植
STEMI: st段抬高心肌梗死
Trip10: 甲状腺激素受体interactor-10
运输安全管理局: Trichostatin。

利益冲突

作者宣称没有利益冲突。

确认

原著的作者向调查人员道歉没有引用由于空间的限制。报道工作支持部分由美国国立卫生研究院的研究经费(存款准备金率,HHL、RCH和总胆固醇),以及863年和973年中国科技部的项目(没有。2007 aa2z400也没有。2011 cb707900 j·罗和t . c)。

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