研究文章
饮食变换Pioglitazone对HepaticPAR南锥体重新规范米托昆卓基因表达式
表1
Gene集分析
RNA-Seq数据WTPio处理Pio-un处理鼠控件或HFD
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| Gene集名#Hallmark集 |
描述性 |
重叠 |
传值 |
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| (a) WT小鼠Pio引导控制饮食 |
| ATTY_ACID_METOLISM[158] |
基因编码蛋白与脂肪酸新陈代谢相关 |
51号 |
4.84
-33 |
| ADIPEESESE [200] |
基因二分机分辨时提高调控 |
48号 |
6.52
25 |
| BILE_Act_METOLISM[112] |
Genes新陈代谢bile酸盐 |
30码 |
336
17 |
| CHOLESTEROLHOMESTASE [74] |
基因与胆固醇全息 |
22号 |
7.81
14 |
| OXIDATIVE_PHOSPHORYLATION [200] |
基因编码蛋白质 与氧化化 |
32码 |
9.78
12 |
| PEROXISOME [104] |
Genes编码反毒构件 |
21号 |
738
-10 |
| UV_RESPONSEDN[144] |
基因下调响应紫外线辐射 |
24码 |
1.98
-9 |
| MYC_TARGETSV1[200] |
基因分组MYC版本1 |
28码 |
3.84
-9 |
| INTERFERON_GAMMA_RESPONSE [200] |
Genes调控响应IFNG |
26 |
6.74
8级 |
| Pio向WT小鼠介绍HFD |
|
|
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| ATTY_ACID_METOLISM[158] |
基因编码蛋白与脂肪酸新陈代谢相关 |
32码 |
1.32
28码 |
| OXIDATIVE_PHOSPHORYLATION [200] |
基因编码蛋白质 与氧化化 |
三十三 |
九点三十八分
27 |
| ADIPEESESE [200] |
基因二分机分辨时提高调控 |
32码 |
1.13
25 |
| PEROXISOME [104] |
Genes编码反毒构件 |
20码 |
7.76
18号 |
| BILE_Act_METOLISM[112] |
Genes新陈代谢bile酸盐 |
14 |
533
-10 |
| Glycolyse [200] |
Genes编码与Glucone |
14 |
8.69
7 |
| 被WT小鼠Pio抑制控制饮食 |
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| UV_RESPONSEUP[158] |
Genes对紫外线辐射提高调控 |
35码 |
9.3
16 |
| HEME-METOLISM[200] |
基因新陈代谢Heme和Ryethroblast差分 |
32码 |
1.43
-10 |
| MORTORC1签名 [200] |
gens通过激活MTORC1复合 |
28码 |
3.4
8级 |
| P53_PATHWAY[200] |
Genes参与p53路径和网络 |
28码 |
3.4
8级 |
| APPTOSIS[161] |
Genes通过激活cespases来介送potosis |
24码 |
8.69
8级 |
| HYPOXIA [200] |
基因调控低氧 |
27号 |
8.69
8级 |
| NDS_REPAIR[150] |
基因修复 |
23号 |
8.69
8级 |
| XENOTIONYMETABLISM[2020] |
Genes编码蛋白处理药物和其他二维生物 |
26 |
271
7 |
| UNFOLDED_PROTEIN_RESPONSE [113] |
Genes开发蛋白响应时提高调控 |
19号 |
271
7 |
| MYC_TARGETSV1[200] |
基因分组MYC-版本1 |
25码 |
九点零四分
7 |
| 被WT小鼠PioHFD抑制 |
| 未发现重叠 |
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广学院平台Hallmark基因集平台识别前十大类别
细节见文本)
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