研究文章

Site-Selective人工核糖核酸酶:寡核苷酸轭合物包含多个咪唑残留在催化领域

表1

Oligonucleotide-based人工核糖核酸酶催化部分轴承多个咪唑组:轭合物的结构和效率的特定站点酵母tRNA的乳沟板式换热器

共轭1 数量的Im组 锚定组2 链接器的长度3 反应速率,% / 1 h4 反应 τ5

1 B-Im (2/1) 2 1/2 21 24.8 2小时15/ *
2 B-Im (2/2) 2 2 20. 25.3 2小时5/ *
3 B-Im (4/1) 4 1 41 49.8 1 h 5/
4 B-Im (4/2a) 4 2 29日 16.6 2小时50/
4 b B-Im (4/2b) 4 2 26 5.5 > 12小时
5 B-Im (4/3) 4 3 18/22 ~ 1 - - - - - -6
6 B-Im (8/1) 8 1 41 45.1 1小时15/
7 B-Im (8/2) 8 2 41 29.7 2 h
8 B-Im (8/2 + 1) 8 1 49 31.3 1小时45/
9 B-Im (16/1) 16 1 70年 38.5 2 h 10/
10 B-Im (8/4 + 1) 8 4 23/31/41 29.1 2 h
11 B-Im (12/4 + 2) 12 4 23/31/51 33.8 1小时40/
12 B-Im (24/4 + 2) 24 2 41/79 49.9 1 h
13 B-Im (32/4 + 2) 32 1 41/98 20. 2小时30/

1轭合物的结构如图所示1在补充材料(SM-Figure 1)。
2锚的类型组的配合,如图1(a)。1型:环己醇一半;2:5/-aminothymidine残渣;3:nonnucleotide插入;4:2/修改后的尿苷残渣。
3的简单的碳碳、碳氮或P-O债券之间的5/终端磷酸基的寡核苷酸B和咪唑组RNA-cleaving构造。
4RNA劈理的效率测量tRNA的百分比板式换热器在C乳沟63年——一个64年磷酸二酯键后孵化期间1 h在10μM的共轭。
5时间达到50%的tRNA乳沟在标准条件下(见上图)在轭合物浓度10−5M。
650%的tRNA板式换热器乳沟不是在实验条件下实现。
*描述这些配合在前面的纸(1]。