核酸杂志

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电化学氧化损伤DNA的细胞参比材料

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杂志简介

核酸杂志刊载原始研究文章,以及涵盖所有结构,化学评论文章,以及DNA和RNA研究的功能方面。

编辑焦点

主编,巴苏教授,目前设在康涅狄格大学。他的研究主要集中在测定DNA的抗肿瘤新药,化学致癌物质,氧化或辐射损害的后果。

特殊的问题

你认为有一个新兴的研究领域真的需要强调吗?或者一个现有的研究领域被忽视或将受益于更深入的调查?通过发行一期特刊来提高研究领域的知名度。

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研究论文

我集团的遗传清晰性新策略芽孢杆菌利用纤维蛋白水解酶基因编码一种类似丝氨酸的酶,从发酵食品和饮料中分离出的菌种

纤溶酶基因(fibE)被广泛保存芽孢杆菌属。属于组I物种。这是在编码细胞外培养基中分泌一种丝氨酸样酶(FibE)。此本工作的目的是评估这种新颖的保守管家基因组I中的分子有用芽孢杆菌目的:鉴定和鉴别刚果共和国传统发酵食品和饮料中的相关菌株。首先,利用酪蛋白溶解试验筛选了155株分离株进行酶活性检测。采用特定引物的PCR技术和巢式PCR方法,并与16S RNA测序相关。已经进行了印迹技术与分子方法的深入比较。作为一个结果解淀粉芽孢杆菌(1),地衣芽b (1),枯草芽孢杆菌(1),短小芽孢杆菌(3),b . altitudinis(2),B.萎缩(1)B. safensis(3)已在发酵食品和饮料中发现的155种分离物中特别鉴定。整合到FibE成熟蛋白中的谷胱甘肽s -转移酶(GSTs)的遗传分析及过表达大肠杆菌BL21和TOP10表明通过用FibE野生型一次比较高2倍的酶活性。免疫检测应与之关联但这并不清楚判别芽孢杆菌属于第一组。

研究论文

XPF的失活使癌细胞对吉西他滨敏感

吉西他滨(2',2'-二氟; DFDC)是一种脱氧胞苷类似物和主要用于针对胰腺癌。吉西他滨的细胞毒性是由于DNA复制的抑制。然而,在除去掺入DFDC的的机制主要是未知的。在这份报告中,我们发现在吉西他滨诱导的DNA损伤和失活的修复是核苷酸切除修复蛋白XPF-ERCC1参与的XPF敏感细胞对吉西他滨。进一步的分析,鉴定与在吉西他滨诱导的DNA损伤的修复脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶(APE)XPF-ERCC1功能在一起。我们的研究结果证明DNA修复活动的吉西他滨治疗评估的重要性。

评论文章

导蛋白家族:在蛋白质作用亚型癌症

网肽形成一系列分泌的和膜相关的蛋白质。Netrins通过调节细胞迁移和存活参与轴突引导、形态形成和血管生成的过程。这些过程在肿瘤生物学中具有特殊的意义。从netrin基因中,各种亚型通过选择性剪接进行翻译和调控。在此,我们回顾了netrin家族成员亚型的多样性及其在癌症中的已知和潜在作用。

研究论文

在三阴性乳腺癌中,DNA连接酶IV可防止复制叉停止并促进细胞增殖

DNA损伤是癌症的一个标志,而维持基因组保真度的蛋白质的突变和失调与多种癌症的发生有关。DNA双链断裂被认为是最有害的DNA损伤类型。非同源末端连接(NHEJ)通路是修复DNA双链断裂的一种机制,参与NHEJ的蛋白也可能调节DNA复制。我们之前已经证实,DNA-PKcs,一种NHEJ蛋白,在细胞暴露于复制应激后,可以促进基因组的稳定性和细胞的生存能力;我们想要辨别另一种NHEJ蛋白,DNA连接酶IV (Lig4)是否具有这种表型。我们的研究集中在三阴性乳腺癌细胞上,与非基础乳腺癌相比,LIG4通常被扩增,和增加的基因剂量具有更高LIG4表达相关。我们耗尽LIG4使用siRNA并确认通过qPCR和免疫印迹我们击倒。细胞存活率减少与LIG4枯竭独自一人,这与增加复制叉停滞有关。检查点蛋白质的Chk1激活和去磷酸化在LIG4缺失的细胞没有变化。LIG4枯竭以下羟基脲暴露导致持续的DNA-PKcs的磷酸化。了解基因组复制和复制应激反应LIG4的效果将澄清抑制LIG4活性的生物后果。此外,LIG4是用于引导CRISPR / Cas9介导的修复朝向同源定向修复和从NHEJ远,因此,如何减少LIG4影响细胞生物学至关重要理解一个有吸引力的临床靶。

研究论文

SERPINA1 mRNA治疗α-1抗胰蛋白酶缺乏症

α-1抗胰蛋白酶(AAT)缺乏症是一种遗传性疾病,由于在编码AAT的SERPINA1基因突变产生无活性的/有缺陷的AAT。这种疾病与肺中的AAT的活性和过度缺陷AAT蛋白的沉积减少肝脏中的相关联。目前还没有与AAT缺乏相关的肝脏疾病特异性治疗。AAT肺疾病通常与几个血清蛋白的更新换代产品之一处理;然而,SERPINA1替代疗法的有效性的长期研究不可用,它不降低AAT缺乏肝损害。基因疗法可能同时针对肝脏和AAT缺陷患者的肺部。AAT患者的成纤维细胞和AAT患者成纤维细胞衍生的肝细胞与SERPINA1编码mRNA和细胞培养基中测试了表达SERPINA1转染。我们的数据显示,从治疗的病人AAT成纤维细胞和AAT患者成纤维细胞衍生的肝细胞增加SERPINA1蛋白培养基。在野生型小鼠体内研究表明在肝和肺SERPINA1基因生物分布,以及在有严重影响的AAT缺乏这两种靶器官SERPINA1蛋白的表达。总之,我们的数据表明,SERPINA1基因疗法必须从AAT缺乏症患者受益的潜力。

研究论文

5-羟甲基胞嘧啶表观遗传修饰对VEGF i-Motif和g -四重结构稳定性和分子识别的影响

启动子通常含有不对称的富含G和c的链,其中胞嘧啶容易通过甲基化(5-mC)和5-羟甲基化(5-hmC)进行表观遗传修饰。这些序列也可以形成四链g -四链(G4)或i-motif (iM)二级结构。虽然表观遗传调制和iM/G4形成所必需的序列相似并可能重叠,但它们不太可能共存。尽管5-hmC是5-mC的氧化产物,但两个修饰后的碱基在不同的位点上聚集。本研究的重点是利用血管内皮生长因子(VEGF)基因启动子的CpG位点,研究G4/iM的形成与5-hmC修饰的交集,并检验将5-hmC掺入iM/G4结构是否会对其形成、稳定性或被核苷或阳离子卟啉、TMPyP4识别产生任何物理化学影响。iM和G4结构的形成和稳定性未见明显变化;然而,5-hmC修饰后,核苷或TMPyP4的识别能力发生变化,其中蛋白和与5-hmC修饰的G4s的复合物结合明显减少。VEGF启动子中的G4/iM结构是很有希望的抗血管生成治疗靶点,这项工作有助于全面了解其与潜在的转录控制和靶向相关的调控原则。

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