研究文章
TLR9识别受体激动剂的效果CpG Oligodeoxynucleotides军曹鱼的肠道免疫反应(Rachycentron canadum)
表1
引物名称、顺序、产品尺寸和目标基因信息用于本研究。
| (一)引物用于克隆TLR9识别同种型B |
|
| 引物名称 |
引物序列(5′3′) |
应用程序 |
|
| TLR9F1一个 |
ATCTCAGCCACAATCAGATC |
部分克隆 |
| TLR9R2一个 |
AGTTTGGGAAACATCTCATC |
|
| TLR9B1 RacFb |
CTGTGAATACCCTGAGTCTCAACAGGG |
比赛 |
| TLR9B RacRb |
GTGATGCTGTGAATCAGTACCAGCC |
| 通用引物组合(芬欧蓝) |
长0.2μM CTAATACGACTCACTATAGGGCAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT
短0.4μM-CTAATACGACTCACTATAGGGC |
| 嵌套通用引物组合(NUP) |
AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT |
| TLR9B1-NGSP1 |
GCCTTTATGTCCTGCCCAAAGCACC |
| TLR9B-NGSP2 |
CTTCCTCGTCTGTTCCATCTTGGCTGT |
|
|
| (b)引物用于基因表达研究 |
|
| 引物名称 |
引物序列(5′3′) |
产品尺寸(bp) |
目标基因 |
基因库加入数量 |
应用程序 |
|
| B3-5c |
ACAGACTGTTCCTCCTCCCC |
532年 |
3′UTR |
HM754627 |
互补脱氧核糖核酸质量 |
| B3-2c |
GAAACCTCCAACAGCGGG |
| 英国皇家空军 |
AAGGACCTGTACGCCAACA |
330年 |
β-Actin-3 |
HM754627 |
| RB1 |
TGGCGTCTCGCATCGTTT |
|
| TLR9A-RC F |
TCTGTTCCATCTTGGCTGTG |
160年 |
TLR9A |
KC180322 |
中存在 |
| TLR9A-RC R |
CTGGTTTCTGGTGTCAAACA |
| TLR9B-RC F |
GCCTTCCTCGTCTGTTCCAT |
178年 |
TLR9B |
JX073035.1 |
| TLR9B-RC R |
ACAGCCTGGTTTCTGGTGTC |
|
| MyD88-F1Q |
GAGGTGTAAGAGGATGGTGGT |
183年 |
MyD88 |
KF018033.1 * |
| MyD88-R2Q |
GGTGGGGAATGGCTTTGTCAT |
| RCIL-1βF1 |
CAGGCAGAACAACCACTGAC |
170年 |
il - 1β |
AY641829 |
| RCIL-1βR2 |
TTCCAAGTCCAGTCCTTTGG |
| RCMxF1 |
TGGACATAGCAACCACAGAG |
157年 |
Mx |
AY834185 |
| RCMxR2 |
TTCTTCAGGTGGATGACCTC |
| RCIgM-F1 |
AGACAGCCTGCAGGGAAAAG |
182年 |
IgM |
JX025102 |
| RCIgM-R2 |
TGTTCCTTTCCCCCAGTAGT |
| CC1eF |
ATTACAATAAGAACCCTGTGC |
185年 |
CC |
JF975593 |
| CC1eR |
TCTTTCCTGGGATGGATTTG |
| β肌动蛋白RC-F |
ACAGACTGTTCCTCCTCCCC |
160年 |
β-Actin-3 |
HM754627 |
| β肌动蛋白RC-R |
AAAATCCTGAGTCAAGCGCC |
|
|
部分引物序列。
b着陆引物5′和3′设计从TLR9识别同种型B部分序列。
c设计引物的3′UTR军曹鱼β-actin-3。
*部分序列克隆在这项研究。
|
