文摘
背景。继发性细菌和真菌共感染已报告在生命垂危的冠状病毒disease-19 (COVID-19)患者和与疾病严重度增加发病率和死亡率(MI)率。的目标是。本研究旨在追踪细菌和真菌COVID-19患者合并感染的重症监护室(ICU)和评估这些感染疾病和患者预后的影响结果在约旦。材料和方法。这是一个单中心研究了46名ICU病人诊断为COVID-19。微生物和药敏结果和炎症生物标记数据进行回顾性分析。结果。心肌梗死率归因于细菌和真菌共感染为84.8%,最高速度是70岁以上的病人(66.7%)。心肌梗死率相关细菌合并感染为95.2%,而真菌共感染为4.8%。最常见的血液中分离细菌coagulase-negative葡萄球菌(41%),紧随其后肺炎克雷伯菌鼻咽拭子(34%)鲍曼不动杆菌痰液样本(31%)。假丝酵母真菌的物种的唯一原因合并感染的研究。特别是,白色念珠菌分离菌血症患者的3%,而假丝酵母glabrata是独立于鼻咽拭子的8%。肺炎克雷伯菌被认为是上呼吸道感染的主要原因(34%)。多因子的感染明显增加心肌梗死(值< 0.001)。结论。COVID-19 MI与呼吸道细菌/真菌合并感染有关。的能力来预测细菌和真菌在ICU患者合并感染可能是至关重要的生存和预后。
1。介绍
大部分患者呼吸道病毒感染发生继发细菌或真菌合并感染,导致严重程度和死亡率增加由于微生物发病机理的协同互动和宿主的免疫系统(1]。COVID-19患者死亡的风险增加超过两倍的细菌和真菌的存在合并感染(2]。此外,几项研究已经报道在COVID-19细菌合并感染确诊患者的低利率,是归因于缺乏及时的诊断和管理的广谱抗生素经验性COVID-19病人在医院管理(3]。
的确切机制COVID-19诱发患者对合并感染其他微生物尚未完全了解。然而,有不同的假说来解释这种关系;其中一个是感染呼吸道细胞诱导释放抗炎细胞因子(4];这些细胞因子抑制适应性和先天免疫系统之间的联系,导致延迟或抑制细菌间隙(4]。另一个假设是,生产的病毒神经氨酸酶、唾液酸酶等酶促进细菌和真菌5]。
COVID-19合并感染的患病率在不同情况下不同。合并感染的患病率最高已经检测到免疫抑制住院患者(他们暴露在中央线和机械通风)和患者潜在的糖尿病或其他慢性疾病的历史6,7]。这种感染可能是由于单一微生物或多个微生物(8,9],各种严重肺炎等并发症[8),表皮[迹象10),改变胃肠道微生物(11),菌血症(12),院内细菌感染的重症监护室(ICU) [13]。此外,耐多药细菌的存在创造了一个额外的危机治疗危重COVID-19患者(14]。COVID-19患者合并感染并发症取决于合并感染的病原微生物,病毒载量,“病毒感染的严重程度,”和感染的宿主免疫反应(1]。
计算机断层扫描(CT)扫描起着至关重要的作用在重病COVID-19 ICU的患者,因为它是用于病人的监测、评估病人疾病严重程度及预后,对实验室检测需要通知医生治疗,病人分类到不同的高危人群(15,16]。
几项研究已经报道,临床医生倾向于管理经验广谱抗生素治疗或避免怀疑细菌合并感染(17,18]。反过来,这导致许多负面影响,改变了正常的微生物群落,导致抗药突变(新出现的19]。因此,重要的是开始经验性治疗,确保患者生存,然后应用narrower-spectrum抗生素微生物实验室结果后(20.,21]。因此,本研究旨在探讨孤立的细菌和真菌共感染COVID-19患者在ICU和评估这种合并感染对疾病预后的影响在一个私人医院和患者的结果在安曼,约旦。
2。材料和方法
八十年之间的ICU危重患者承认2020年1月至2021年6月在私人医院在安曼,约旦。他们都被实时评估COVID-19感染逆转录-聚合酶链反应(rt - pcr)。只有56岁被诊断出患有COVID-19,他们包括在这项研究。基于合并感染的定义,即感染发生后48 - 72 h≤住院(22),只有46名患者完成了标准,包括在这项研究。此外,10位病人被排除在研究由于缺失的数据管理和日期的日期(图细菌和真菌的生长1)。
ICU管理时,要求临床、放射学和微生物进行了评估。细菌隔离被确定基于殖民地特点和生化测试用VITEK - 2系统(bioMerieux)®(美国);真菌分离测定菌落形态和菌落特征。半乳甘露聚糖检测检测菌血症引起的曲霉病感染没有执行。收集的数据包括年龄、性别、患者的结果(死亡或生存),提供治疗,合并感染的结果(上呼吸道感染、下呼吸道感染、菌血症和脑膜炎),和药敏结果。此外,炎症生物标记的数据,包括c反应蛋白(C-RP),铁蛋白,肺动脉栓塞,原降钙素(PCT),球蛋白,白细胞计数(WBC),中性粒细胞计数,和淋巴细胞计数,选择要包括在这项研究表明细菌和真菌的影响合并感染由于血液的丢失的数据对其他参数,生化和血清学测试配置文件。
伦理批准获得伦理委员会的科学研究(ECSR) Zarqa大学基于保护人类受试者的要求和相关的研究(没有道德原则。2/8/2021)。数据分析使用IBM SPSS统计(IBM公司公布的2012年。IBM SPSS统计窗口,25.0版。纽约阿蒙克:IBM公司)。卡方检验(χ2)测试执行分类变量和独立样本t以及和Mann-WhitneyU测试连续变量;结果平均值和标准偏差。统计学意义是定义为一个值< 0.05。
3所示。结果
共有46名ICU COVID-19患者纳入本研究。孤立的微生物的类型为每个和病人的人口统计数据(年龄、性别、和病人的结果)展示在表1。主要的孤立的传染性细菌肺炎克雷伯菌,金黄色葡萄球菌,粪肠球菌、粘质沙雷氏菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌,coagulase-negative葡萄球菌,棒状杆菌的细菌,葡萄球菌epidermidis。在孤立的真菌中,只有两种假丝酵母检测:假丝酵母glabrata和白念珠菌。
MI归因于合并感染的细菌和真菌在整个研究人口为84.8%(表2)和更高的男性患者对女性(53.8%比46.2%),比70年(66.7%)。MI由于细菌感染为94.9%,真菌感染为2.6%和2.6%时由于双重细菌和真菌合并感染。此外,细菌合并感染的MI结果是75.7%和24.3%多和monobacterial合并感染,分别为(< 0.001)。基于网站的合并感染、上呼吸道感染的MI是13.0%,24.1%为下呼吸道感染,菌血症为63.0%。此外,血清PCT水平,C-RP,铁蛋白,肺动脉栓塞,白细胞计数、淋巴细胞计数高的患者死亡。
细菌和真菌的模式基础上合并感染的标本类型微生物被隔离在哪里见图2。最大量的细菌类型从血液分离;coagulase-negative葡萄球菌比例最高(41%),紧随其后肺炎克雷伯菌(14%),金黄色葡萄球菌(11%)和葡萄球菌epidermidis(8%)。在痰液,隔离细菌的比例最高鲍曼不动杆菌(31%),紧随其后的是铜绿假单胞菌和肺炎克雷伯菌(23%)。假丝酵母glabrata是唯一引起下呼吸道感染的真菌合并感染,研究人群的患病率为8%。关于鼻咽拭子,肺炎克雷伯菌被认为是主要的孤立的微生物,患病率为34%,紧随其后的是吗金黄色葡萄球菌和粪肠球菌(22%)。
表3显示了基于性微生物分布在不同的标本类型。在女性中,比例最高的孤立的微生物在痰肺炎克雷伯菌、粘质沙雷氏菌、鲍曼不动杆菌,和coagulase-negative葡萄球菌(25%),而coagulase-negative葡萄球菌细菌从血液分离的患病率最高(36.8%)。从鼻咽拭子分离出细菌的比例最高肺炎克雷伯菌,金黄色葡萄球菌,粪肠球菌,以33.3%的比例。然而,白色念珠菌是唯一从脑脊髓液分离的真菌在雄性和雌性。男性的患病率铜绿假单胞菌和鲍曼不动杆菌在痰(33.3%)高,紧随其后的是吗肺炎克雷伯菌(22.2%)。类似于雌性,coagulase-negative葡萄球菌记录在男性患病率最高的细菌从血液分离(47.1%)。然而,更高比例的孤立的鼻咽拭子细菌肺炎克雷伯菌(33.3%)。
4所示。讨论
细菌合并感染是常见的在以前的呼吸道病毒大流行。这是与不良预后相关的病毒性疾病,被认为是死亡的一个危险因素23]。细菌和真菌的MI COVID-19患者合并感染为50%,与更多的关心导致抗药性细菌(3,5]。目前的数据显示,合并感染中COVID-19 ICU导致不同类型的细菌和真菌,确认在其他研究已报告。总体而言,细菌合并感染患者在ICU COVID-19结果(3)、真菌(3),或其他呼吸道病毒(24]。同意我们的发现,席尔瓦et al。(2021)报道,MI COVID-19患者在ICU是50.47%(83.14%被真菌或细菌合并感染)(25]。
此外,目前的结果发现,细菌合并感染的MI结果是94.9%,13.0%为上呼吸道感染、下呼吸道感染占24.1%,63.0%的菌血症。这些结果证实了被休斯报道et al .,即。,that bacteremia is considered a serious complication of bacterial superinfection and a risk factor for mortality in COVID-19 patients [10]。菌血症COVID-19患者据报道全世界各种百分比:1.8%在密歇根州城市(26),6%在纽约27),英国(7.1%10),25%在宾夕法尼亚州28在米兰),37.0% (12),死亡率在9.8%至47.5%之间不等。最坏的情况危重COVID-19患者合并感染的发展幼童腹壁薄弱(17),特别是如果一个细菌耐多药,复杂的多器官功能衰竭的一个重要风险和脓毒性休克8]。细菌合并感染的主要影响COVID-19患者主要归因于败血症,multiorgan失败,败血性休克,呼吸,心脏,肾脏和肝脏功能障碍(27,29日,30.]。
目前研究表明炎症生物标记物的增加,包括PCT、C-RP,肺动脉栓塞,铁蛋白,在患者没有生存,与先前的研究[27)和呼吸衰竭窘迫相关显著,延长机械通风,增加心肌梗死率(31日]。淋巴细胞减少症在我们的参与者可以解释为白介素upregulation导致淋巴细胞凋亡和细胞因子风暴(7,9),被认为是COVID检测19大流行期间合并感染的危险因素(6]。
抗生素耐药性检测中大约一半的患者死亡(51.3%),这将创建额外的挑战在控制患者的治疗效果和预后14]。广谱抗生素的预防性使用这类患者必须考虑,以避免长期滥用广谱抗生素的缺点[28]。协议对广谱抗生素的使用是不同的在国家层面;例如,中国卫生研究院不建议使用广谱抗生素即使没有细菌合并感染的危重病人(17),而在荷兰,经验性抗生素推荐给所有ICU机械通气患者(32]。
在这项研究的优势,本研究是第一次在约旦,包括准确地识别细菌和真菌隔离导致ICU COVID-19患者合并感染,这是第一个研究临床描述ICU COVID-19病人在中东和北非地区(MENA)。此外,样本来自不同类型的标本。间限制,这是一项单中心研究,目前的研究结果应该谨慎考虑。小样本大小是归因于人口研究的性质,即ICU病人。
总之,细菌/真菌共感染伤危重COVID-19患者预后和可能导致严重疾病,增加心肌梗死。及时预测细菌和真菌合并感染的重症加护病房的病人通过监测炎症生物标记物在微生物培养和抗生素敏感性结果可能发挥重要作用在改善患者预后,提高存活率。
数据可用性
数据库分析了当前的研究可从相应的作者在合理的请求。
伦理批准
研究方案是遵循赫尔辛基宣言的原则在2000年修订。伦理批准这项研究得到伦理委员会的科学研究(ECSR) Zarqa大学保护人类受试者的要求和相关的研究(没有道德原则。2/8/2021)。
的利益冲突
作者宣称没有利益冲突。
作者的贡献
所有的作者都对整个内容负责并授权其提交的手稿。
确认
我们要感谢乔丹医院医疗团队和经理促进数据收集。