全球普遍存在yersinia eNteCoolitica.在胃肠炎病例中:系统回顾和荟萃分析

摘要

普遍存在yersinia eNteCoolitica.在胃肠炎中经常被低估。它与世界各地的发病率和医疗费用有相当大的关系。了解肠胃炎的病因有助于作出适当的治疗决定。我们系统搜索了PubMed、Science Direct、Embase和Scopus，以确定2000年1月1日至2019年12月31日期间发表的所有研究，以评估患病率Y.肠道罗密亚肠胃炎患者。确定总共5039篇文章，导致其中47人提取数据。共同流行的Y.肠道罗密亚在培养方法中估计胃肠炎的病例估计为1.97％（1.32-2.74％），分子法中的2.41％（1.07-4.22％）。在生物型中Y.肠道罗密亚，1A（62.48％）和1B（2.14％）分别具有最多，最少的患病率。血清型O3Y.肠道罗密亚39.46％的含量最高，0.0％的胃肠炎病例患病率最低。总之，这个系统审查的结果表明Y.肠道罗密亚在所有年龄段的肠胃炎中普遍存在。血清型O3和O9Y.肠道罗密亚患病率最高，o5,27在腹泻患者中患病率最低。普遍存在Y.肠道罗密亚两种性别和不同的季节都是相似的。应该注意，为了确定生物体的作用，需要更多的研究，特别是在食物传播的疾病中。

1.背景

耶尔森菌病是由革兰氏阴性菌引起的yersinia eNteCoolitica.（Y.肠道罗密亚） 和Y.Psudotuberculosis.．虽然Y.肠道罗密亚是人类感染的一个常见原因，特别是在温带发达国家，Y.Psudotuberculosis.人类感染是罕见的[1]．它主要引起人类的胃肠道感染。此外，Y.肠道罗密亚会导致其他临床表现，包括肠系膜淋巴结炎，心内膜炎，主要是感染儿童[2]．耶尔森菌病是欧洲联盟继弯曲菌病和沙门氏菌病之后第三种须呈报的人畜共患细菌性疾病[3.]．Y.肠道罗密亚是一种能在0到44°C的温度下复制的冷养生物。因此，这种微生物可以在冰箱中复制，并在冷冻食品和液体中长时间存活。鳞周鞭毛引起的运动y enterocolitica。动力是温度依赖性，因为细菌在25℃下的动机，但是当它在37℃下生长时是不动的动机。发病机制Y.肠道罗密亚也取决于温度。侵入性蛋白质Y.肠道罗密亚在37℃下在酸性条件下产生小于28°C的环境温度。感染所必需的毒力因子的表达通过宿主内的温度逐渐增加来引发[2]．引起的感染Y.肠道罗密亚致病菌株不属于特定年龄组，但临床表现多见于儿童和青少年。成年人可能是无症状的感染携带者[4.]．发烧，腹痛和腹泻是儿童Yersiniosis的常见症状[2]．细菌是从国内和野生动物中分离的。猪被认为是病原体的储层[5.]但是在家畜中的抗Yersinia抗体的高滴度，如牛，山羊和羊，揭示了其他可能的来源[6.]．人体感染的主要方法是通过污染的食物消耗，尤其是生还是未煮熟的食物[2尽管饮用受污染的水、与宠物近距离接触以及输血也被提及[2那7.]．Y.肠道罗密亚有几个生物型和血清型。毒力株Y.肠道罗密亚归因于某些生物型和血清型。在已知的6种生物型(1A、1B、2、3、4和5)中，1A在健康人群中被报道为非致病生物型。Y.肠道罗密亚血清型为O3, O8, O9和O5。从大多数人类耶尔森菌病病例中分离出27例[2]．最严重的疾病是由血清型O8引起的，胃肠道广泛溃疡，有时患者死亡[8.]．

患者大便Y.肠道罗密亚在康复后的90天内，这表明及早发现细菌对预防传播和可能爆发的疫情十分重要[9.]．为了检测Y.肠道罗密亚中，培养方法和分子测定法开发的。常规的培养方法是耗时的，并且具有假阴性结果，而PCR不仅是敏感和特异的检测方法，而且能够识别病原分离物和菌株的进一步表征[4.]．由于疾病的临床表现为胃肠炎，因此疾病的临床介绍，因此诊断和治疗主要取决于临床医生而且没有关于临床医生而不是微生物培养的临床介绍，存在有限的信息。本研究的目的是估算胃肠炎病例中yersiniosis的全球患病率。此外，确定主要生物型和血清型。通过系统文献综述和META分析合成现有数据和知识。

2.方法

2．1.搜索策略与学习选择

在PubMed，Science Direct，EMBASE和SCOPUS中进行了系统审查，以确定2000年1月1日至2019年12月31日之间的所有已发布的研究，其中“胃肠炎”的搜索关键词“yersinia eNteCoolitica.”和‘耶尔森氏鼠疫’和相关术语没有任何语言限制。在搜索的关键字是从医学主题词词库中提取。检索策略是在补充文件中提出的。标题和去除重复之后，相关原创文章摘要是由两个独立的评审（TZ和EA）筛选。所包含的文章的参考文献手工检索了额外的引用。灰色文献是通过使用谷歌学术搜索。PRISMA准则被用于进行系统评价。

通过以下标准进行研究：初级研究研究，包括原始文章出版或印刷品;横截面设计的研究;案例组病例对照研究;研究包括检测Y.肠道罗密亚基于培养物或PCR的样品;患有胃肠炎症状的患者;在特定地区或国家进行的研究;具有已知数量的样品大小;和可用的全文的研究。令人困惑的文本或难以理解的分析没有报告样本量和数量或阳性案件的百分比的研究Y.肠道罗密亚被排除在外。没有原始数据的评论，字母或编辑文章也被排除在外。

2.2。数据提取与偏见评估风险

在Excel软件中设计了标准的专用数据提取表格。两位作者(TZ和SMR)独立提取数据。如果提供，从每个研究中提取以下数据:文献的特点，包括第一作者，出版年，开始和研究结束的一年，研究设计（横截面或病例对照）和国家（收入，HDI和WHO区域）;人口特征，包括受试者年龄(平均值±标准差，最小值和最大值)、性别、检测患者总数;方法论的信息，包括诊断方法，患者数量为阳性Y.肠道罗密亚分别在培养和PCR中，采样季节、生物型和一些流行的病原血清型分离Y.肠道罗密亚和地理位置（纬度和经度）。我们包括两个样品Y.肠道罗密亚检测到另一种病原体(例如，大肠杆菌或病毒）。

根据诊断方法和年龄对资料进行分层。在年龄方面，数据被分为四类:6岁以下、6 - 18岁、18 - 59岁和60岁以上。作为发展和流行病学背景的指标，收入、卫生组织区域和人类发展指数被用来根据进行研究的国家对数据进行分类。根据乔安娜·布里格斯研究所(Joanna Briggs Institute)的说法，合格的研究是由两位作者(TZ和EA)独立鉴定的。10.]．

２.３.统计分析

在目前的研究中，随机效应模型用于估计汇集流行率和95％置信区间（95％CI）。MetapRop命令用于Stata软件。使用Freeman-Tukey双弧度转换计算汇总流行[11.那12.]．研究之间的异质性通过一世²在美国，科克伦的Q. I2指数在0到100%之间一世² ˃ 70% was considered heterogeneous [13.那14.]．在随机效应模型中的森林图应用到显示汇集流行。亚组分析和荟萃回归，都是为确定异质性的来源[15.]．单变量性均衡分析用于评估出版年份，人类发展指数，地理位置（经度/纬度）和质量分数对普遍存在的影响Y.肠道罗密亚．在亚组分析中，我们估计了普遍存在Y.肠道罗密亚在不同年龄组、诊断方法类型、研究类型、收入和世卫组织区域。没有对发表偏倚进行检查，因为该研究的目的不是确定暴露与结果之间的关系[15.]．所有分析中，显着性水平被认为是0.05。所有分析都是通过使用Stata 13（Stata Corp.，College Station，Texas）进行的。在metareborcess，由于较小的流行范围，值<0.1被认为是一个显着的水平Y.肠道罗密亚和生物体的罕见性质。

3.结果

3．1.研究特点

鉴定了共有5039篇文章，其中4845个未重复。根据标题和摘要，包含202条文章并通过全文评估资格（图1）.由此，49篇文章通过了质量评估，数据从其中47中提取。最终提取的数据包括来自所有世卫组织地区的25个国家（来自美洲的八个来自欧洲，来自东部地中海的十名，来自非洲的五个，来自非洲五位，来自西太平洋的七个）除非东南亚地区。从这47项研究中，患病率Y.肠道罗密亚通过培养方法诊断胃肠炎的病例估计为1.97% (95% CI 1.32-2.74;一世² = 99.19%; 测试异质性)(图2（a））.然而，通过PCR方法估计汇总普遍存在Y.肠道罗密亚为2.41 (95% CI 1.07-4.22;一世²= 98.39%; 测试异质性)(图2 (b)）.纳入的研究之间存在显著的异质性。桌子1显示了共同流行的Y.肠道罗密亚根据国家的培养和PCR方法。普遍存在Y.肠道罗密亚在培养和PCR方法中在马达加斯加（16.56％）。最低的流行率Y.肠道罗密亚在培养和PCR方法中，分别在澳大利亚（0.00％）和巴西（0.00％）。桌子2显示纳入研究的主要特点。

３．２．亚组分析

研究类型没有改变合并流行率Y.肠道罗密亚如在培养方法中，横截面和病例对照研究中的汇总患病率分别为2.20和1.22（无均相随机测试 ）（数字3（a））.共同流行的Y.肠道罗密亚通过PCR方法在横截面和病例对照研究中分别为2.28和4.44 （数字3（b））.共同流行的Y.肠道罗密亚随着国家收入的增加而下降 ．共同流行的Y.肠道罗密亚在低收入和高收入国家的文化中是7.17和1.35 （数字4(一)PCR方法16.56和0.36 （数字4（b）),分别。纳入研究的异质性来源是收入。按年龄划分，6岁以下、6 - 18岁、18-59岁患病率差异无统计学意义(1.75%;0.96 - -2.54; 文化和1.84％;0.49-3.19; 对于PCR;一世² = 0.0%) (Figure5（a））.通过参与者和抽样季节的性别，流行相似（ 和 那分别地）（图5（a））.根据生物型Y.肠道罗密亚隔离、1 (62.48%;95% CI 27.56-91.77)和1B (2.14%;95% CI 0.04-6.14)的患病率分别最高和最低。在调查的血清型中Y.肠道罗密亚分离株，o3含有39.46％，具有0.0％的最高和O5,27患病率最低（图5（b））.

3.3。弥漫

根据图6（a）和6（b），通过出版年度的增加，流行率没有任何重大变化（ 文化和文化 PCR)。人类发展指数较高的国家的艾滋病发病率较低Y.肠道罗密亚（ 文化和文化 对于PCR）（数字6（c）和6（d））.经度对患病率无显著影响Y.肠道罗密亚（ 文化和文化 对于PCR）（数字6（e）和6（f））.普遍存在Y.肠道罗密亚随纬度升高略有增加，但无统计学显著 在培养方法中;相比之下，随着PCR方法中的纬度越来越多地降低了其流行率 (数据6（g）和6（h））.对质量评估和患病率进行了元回归，没有观察到相关性( 文化和文化 PCR)。

4.讨论

在目前的荟萃分析中，我们提供了胃肠炎病例中盐生素insins的全球患病率的第一个估计。基于培养孤立Y.肠道罗密亚，非洲[1那26.那39.那40那44.]和东部地中海[17.那22.那42.那46.那48.那53.那56.-58.] WHO区域具有细菌的发生率的所述第一和第二等级，而欧洲[4.那16.那19.那21.那24.-26.那28.那29.那33.-36.那38.那45.那49.那50.那54.]患有最少的普遍性Y.肠道罗密亚在胃肠炎病例中。yersiniosis病有全球性普遍性，是一些国家的可报告疾病，如丹麦，挪威和美国的38个州[59.那60.]．据PCR检测，非洲和西太平洋[3.那9.那18.那23.那27.那37.的数量最多，而美洲[20.那30.-32.那41.那51.那52.那55.]患有最少的普遍性Y.肠道罗密亚．在目前的研究中，发病率最高的是Y.肠道罗密亚在培养和PCR方法中在马达加斯加（16.56％）。最低的流行率Y.肠道罗密亚分别在澳大利亚(0.00%)和巴西(0.00%)进行。Bublitz等(2014)报道Y.肠道罗密亚马达加斯加和谢谢等人是16.56％。（2014）报道，在巴西是0.0％。在美国（美国），鉴别症于1996年至2012年，在1996年至2012年，在2012年的一般人群中，yersinia感染了0.33人，2012年[61.]．在丹麦，Y.肠道罗密亚被报告为细菌性腹泻的常见病因，2016年每10万居民中有4.9例病例[62.]．在发达国家中，大多数欧洲国家的食源性耶尔森菌病发病率高于美国[63.那64.]．普遍存在Y.肠道罗密亚胃肠炎患者高于一般健康人口。在本研究中，收入是包括研究中的异质性的起源。就在低收入国家，Y.肠道罗密亚比高收入更普遍。这可能与考虑卫生原则有关。人体iniensiniosis通常是由Y.肠道罗密亚[59.]．yersiniosis引起自我限制的腹泻，有时可能是小于4岁的儿童血腥。然而，在老年儿童和成人中报告了腹泻和/或呕吐的发热和腹痛[9.]．胃肠道疾病的临床表现可以基于主机的年龄和免疫状态是不同的[2]．通过从人粪或血液中分离微生物或缺少附录后，通过分离微生物来完成yersiniosis的诊断，或者误解了附录[59.，虽然细菌培养不是大多数医院胃肠道病人的常规程序，这可能导致低估耶尔森菌病[59.]．

年龄不是关于通过肠胃炎引起显著因素Y.肠道罗密亚在目前的研究中。一些研究报告说，年轻的儿童更容易受到腹泻造成的影响Y.肠道罗密亚[9.那27.那39.那40]．Al Jarousha等人。报告较高孤立Y.肠道罗密亚从腹泻的儿童达到一到六年的孩子，比一年不到一年，超过6年[48.]．Y.肠道罗密亚有不同的生物型和血清型。年龄的微不足道效果可能是由于儿童，成人和老年人感染不同的血清型，这可能不一定会对其他血清型产生免疫力[65.]．此外，对年龄较大的年龄进行了有限的研究。目前的研究中没有看到性别差异。男女在yersiniosis中没有显示出不同的症状[40那49.]．本研究未见季节性变化。一些研究报告了在较冷的季节期间的案例[46.那66.]但根据欧洲疾病预防控制中心的报告，yersiniosis没有观察到季节性模式的三年[67.]．其他一些研究还没有报告季节之间的显着差异[9.那47.那68.]，这可能支持通过全年持续消耗的食品传播感染的假设，例如肉类和肉类产品[65.]．

在六种生物型中Y.肠道罗密亚，1A是最普遍的生物型。作为生物型1A是非病原生物型主要是在环境中发现的，它在大多数研究中发病率较高，以及来自于人类，动物和胃肠炎[分离49.那50.那69.]．在毒性的生物型中，生物型II和III分别具有33.06％和12.89％的患病率。在目前的研究中，血清型O3和O9具有最流行的。他们在其他研究中报道为主要血清型Y.肠道罗密亚在腹泻患者中[4.那39.那43.]．O8血清型是本研究中胃肠炎患者的第三血清型。它被观察为1B生物型中最具致病性的血清型，与美国6次食物中毒爆发中的4次有关[41.]．共有18％的患者感染致病性Y.肠道罗密亚[49.]．0.6%的急性腹泻病例是由于Y.肠道罗密亚所有这些都是血清型O3 [54.]．在尼日利亚，Y.肠道罗密亚生物血清型2/O9是在人类样本中唯一分离的病原。Bioserotype 4 / O3Y.肠道罗密亚来自全球人类的主要孤立[63.在一些欧洲国家，包括丹麦、意大利、比利时、西班牙、芬兰和瑞典，被孤立[50.那64.]．根据斯蒂芬等人。，生物型II和IV仅在腹泻患者中被诊断出来，但从无症状和腹泻患者中分离出生物型1A的菌株，其显示生物型1A不是胃肠炎的病因症[45.]．Y.肠道罗密亚血清型O3通常从儿童分离，而Y.肠道罗密亚血清型O9频繁与成人隔离（≥40岁）。儿童接触Y.肠道罗密亚O3可以可以想象，由于它们的生命期间，由于相同的血清型，但不一定来自其他血清型[65.]．根据人类发展指数，艾滋病的流行Y.肠道罗密亚随着这些国家的卫生标准较高的HDI减少而增加。在目前的研究中，纬度对患病率产生了不同的影响Y.肠道罗密亚在培养和分子诊断中。Y.肠道罗密亚是一种冷养细菌，可以在较冷的气候中复制[59.]．SEROPREPLALENG的研究Y.肠道罗密亚在野生公猪中表明，寒冷气候中的患病率较高[70]．在猪中看到类似的结果[71.]．在培养方法中检测到可行的生物，但在PCR中，也检测到不可行的方法，这可能是患病率较高的原因Y.肠道罗密亚在温带的分子诊断相比于培养。在目前的研究中，患病率的范围较窄，这可能是由于在培养和PCR方法上观察结果不同的原因，但在培养上并不显著。

4．1.优势和局限性

这是第一次系统审查和荟萃分析，以获得全球普遍存在Y.肠道罗密亚肠胃炎患者。我们考虑了微生物的培养和PCR分离。这些研究的异质性较高，尤其是由于收入的关系，但亚组分析和元回归的应用大多降低了异质性。此外，本研究也有一些必须承认的局限性:首先，在一些分析中，纳入研究的数量较低，特别是在老年(如>60岁);二是风险因素评估的相关研究不足;第三，在一些被纳入的研究中，参与者的年龄没有被清楚地报告。第四，本研究未报道该病菌的传播方式。然而，估计全球流行率Y.肠道罗密亚由于大多数研究在住院患者的胃肠道症状患者中进行了挑战性。我们鼓励进一步的研究，特别是在西太平洋和东南部的地区生产和分享有关yersiniosis的局部数据。由于附加数据的可用性，应更新我们的研究。

结论

总之，这个系统审查的结果表明Y.肠道罗密亚在所有年龄段的肠胃炎中普遍存在。Y.肠道罗密亚在高收入国家和具有较高HDI值的国家没有普遍存在。血清型O3和O9Y.肠道罗密亚患病率最高，o5,27在腹泻患者中患病率最低。普遍存在Y.肠道罗密亚两种性别和不同的季节都是相似的。应该注意，为了确定生物体的作用，需要更多的研究，特别是在食物传播的疾病中。

缩写

Y.肠道罗密亚：	yersinia eNteCoolitica.
PRISMA：	首选系统评价和荟萃分析的报告项目
TZ：	Tayebeh Zeinali.
SMR：	Seyed Mohamad Riahi.
ea：	ehsan ahmadi
HDI：	人类发展指数
WHO：	世界卫生组织
SD：	标准偏差
PCR：	聚合酶链反应
无花果：	数字
美国：	美利坚合众国。

数据可用性

数据可以从相应的作者提供合理的请求。

伦理批准

该研究得到了Birjand医学大学的伦理委员会（Ir.bums.rec.1399.176）批准。

的利益冲突

作者宣布，目前研究结果没有利益冲突。

作者的贡献

SMR、EA和TZ设计了这项研究。SMR、EA和TZ进行了元分析并起草了手稿。SMR和TZ分析了数据。SMR, EA和TZ对手稿进行了修改。所有的作者阅读并批准了最终的手稿。

致谢

作者承认Birjand医学院的研究和技术副副副局长为这项研究（Grant No.5434）。

补充材料

搜索策略提出的补充材料。（补充材料）

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