研究文章
FcircSEC: R包完整circRNA序列提取和分类
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| 方法 |
预测工具的输出作为输入 |
需要是RNA-seq数据? |
分类circRNAs吗? |
限制 |
适用性 |
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| CIRI-full |
CIRI |
是的 |
没有 |
不适用于读取长度不均的RNA-seq在人造石铺地面数据和注释的文件格式 |
适用于CIRI的用户 |
| 福克斯 |
DCC |
是的 |
没有 |
不适用于短读和不能提供完整的circRNA直接序列 |
适用于DCC的用户 |
| circtools |
DCC |
是的 |
没有 |
不适用于短读和不能提供完整的circRNA直接序列 |
适用于DCC的用户 |
| CircPrimer |
最先进的circRNA预测工具 |
没有 |
没有 |
不适用于非人类circRNAs和不屈服任何信息在circRNA序列拼接的站点 |
只适用于人类circRNAs |
| FcircSEC |
最先进的circRNA预测工具 |
没有 |
是的 |
不产生任何信息在circRNA序列拼接网站 |
适用于几乎所有的用户circRNA预测工具 |
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