研究文章
Whole-Exome Sequencing-Based突变分析乙肝病毒导致的早期肝癌高发
表2
总结常见的基因突变在8 Sanger测序验证。
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| 基因 |
基因身份证 |
染色体# |
样品标识 |
位置 |
参考基础 |
突变基地 |
蛋白质注释 |
突变类型 |
Sanger-seq验证 |
|
| USH2A |
NM_206933.2 |
chr1 |
患者5 |
216462732 |
T |
一个 |
Lys621 |
Nonsese |
是的 |
| 病人2 |
215844382 |
T |
一个 |
Ile4689Phe |
错义 |
是的 |
|
| TENM4 |
NM_001098816.2 |
chr11 |
患者5 |
78381220 |
T |
一个 |
Tyr2057Phe |
错义 |
是的 |
| 患者4 |
78413375 |
一个 |
T |
Val1428Glu |
错义 |
是的 |
| 患者4 |
78567209 |
一个 |
T |
Phe424Ile |
错义 |
是的 |
|
| UNC79 |
NM_020818.3 |
chr14 |
患者1 |
94004491 |
一个 |
G |
Thr250Ala |
错义 |
是的 |
| 病人2 |
94053131 |
一个 |
T |
Asp793Val |
错义 |
是的 |
|
| DNAH17 |
NM_173628.3 |
chr17 |
患者5 |
76454758 |
一个 |
C |
Leu3289Arg |
错义 |
是的 |
| 患者4 |
76557998 |
T |
一个 |
Tyr545Phe |
错义 |
是的 |
|
| MUC16 |
NM_024690.2 |
chr19 |
患者5 |
9057619 |
一个 |
G |
Ser9943Pro |
错义 |
是的 |
| 病人2 |
9077617 |
T |
一个 |
Met3277Leu |
错义 |
是的 |
|
| PTPN13 |
NM_080685.2 |
chr4 |
患者4 |
87694021 |
T |
一个 |
Tyr1758 |
Nonsese |
是的 |
| 患者1 |
87656828 |
G |
C |
Glu745Gln |
错义 |
是的 |
|
| PCLO |
NM_033026.5 |
chr7 |
患者4 |
82545516 |
T |
一个 |
Gln3929Leu |
错义 |
是的 |
| 患者1 |
82532009 |
T |
一个 |
Arg4496Trp |
错义 |
是的 |
|
| PDE1C |
NM_001191058.1 |
chr7 |
患者4 |
31920370 |
C |
一个 |
Asp138Tyr |
错义 |
是的 |
| 病人2 |
32109908 |
C |
T |
Gly33Glu |
错义 |
是的 |
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#坐标指的是人类参考基因组hg19释放(人类基因组参考财团建立37 (GRCh37), 2009年2月);终止密码子。
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