文摘
背景。NLRP3基因位于染色体1和一种pyrin-like蛋白质编码。这个基因的突变与一种autoinflammatory疾病相关联,称为cryopyrin-associated周期性综合症(帽)。案例展示。我们报告一个一岁的男孩从出生就复发性荨麻疹的皮疹,关节疼痛和肿胀。他有一个错义突变c。G1060 T (p.A354S) NLRP3基因的外显子5中检测到的全外显子组测序。结论。小说在NLRP3基因变种被发现,没有被报道了。
1。背景
Cryopyrin-associated周期性综合征(帽)是一种罕见的autoinflammatory疾病遗传作为一个常染色体显性遗传疾病。它包括三个光谱的重叠综合征临床症状的严重程度:(1)家族性寒冷autoinflammatory综合症(fca), (2) Muckle-Wells综合征(多工作站系统),和(3)慢性小儿神经、皮肤、关节综合症(CINCA) [1]。突变NLRP3位于染色体的长臂1是帽因果。它编码一个蛋白质组成pyrin域,nucleotide-binding网站(国家统计局)域和富亮氨酸重复(远程雷达)的主题。inflammasome复杂的蛋白质属于先天免疫的重要作用。这个复杂的由NLRP3, PYCARD, CASP1。为了应对病原体或其他有关信号,NLRP3发起这个复杂的装配。caspase-1激活后,促炎细胞因子分泌IL-1B和地震。大约有100患者NLRP3基因的致病突变帽(2- - - - - -4]。NLRP3突变和这些疾病之间的关系被确定在2000年代早期。
我们发现了一个上限,复发性荨麻疹的皮疹,优质发烧、和慢性关节参与。他的症状没有对治疗的反应,和全外显子组测序报告NLRP3基因的新变种。
全外显子组测序的工具识别基因可以导致疾病。它也用于诊断在诊所。
2。案例展示
一个一岁的男孩被带到我们的诊所在左脚踝关节疼痛和肿胀,双膝超过14天。出生以来他复发性荨麻疹的皮疹,皮疹是不触发冷或其他物理刺激(图1)。他的荨麻疹的皮疹经常提供优质发热。他的父母没有血亲关系。在检查、神经发育评估是正常的,但是他的体重和身高低于3理查德·道金斯百分位的年龄。他明显在双膝滑膜肥大。身体检查的其他部分是正常的。实验结果显示白细胞增多、贫血和血小板增多。胸部x光片和腹部超声是正常的。超声心动图显示正常心室功能和心包积液。由于长期发热、复发性荨麻疹的皮疹、关节炎,并增加在急性期反应物,autoinflammatory障碍的诊断,尤其是帽子给他建议。进行基因测试,全外显子组测序鉴定NLRP3基因的杂合的突变,这是新创突变。
(一)
(b)
3所示。外显子组测序
从外周血基因组DNA提取使用MG血液基因组DNA提取Miniprep (CancerRop)根据制造商的指示,为病人和全外显子组测序进行。图书馆是一个富含安捷伦SureSelect人类所有外显子V6工具包(美国安捷伦科技有限公司)和测序100×报道Novaseq6000平台(美国Illumina公司Inc .)生成150个基点paired-end读取。
通过质量控制后,原始数据一致反对人类参考基因组(BWA hg19 NCBI构建37)(burrows - wheeler对准器)软件(http://www.bio-bwa.sourceforge.net)。皮卡德的话重复利用。变体调用都使用GATK(基因组分析工具箱)(http://www.broadinstitute.org/gatk/),变异注释是由ANNOVAR在线软件(http://www.openbioinformatics.org/annovar/)。
全外显子组测序发现的候选变体被Sanger测序(图确认2)。
4所示。讨论
cryopyrin-associated周期性发热综合征的症状是变量,和他们存在广泛的临床表现。帽通常是常染色体显性遗传。症状的疾病有一个谱在不同的几代人。症状的严重程度随着年龄的增加。例如,在第一代,这种疾病可能存在淀粉样变和肾功能衰竭,但是在年幼的儿童,荨麻疹和发烧可以观察到5- - - - - -8]。
1 q44 NLRP3基因位于染色体上。它有11个外显子和多个或者拼接成绩单变体。该基因编码一个pyrin-like蛋白质。NLRP3属于NLRP3 inflammasome复杂。这种蛋白质是nf -κB信号通路的激活,所以它有一个在炎症和免疫反应中的作用。这个基因的突变与一种autoinflammatory疾病称为帽(cryopyrin-associated周期性综合征)。限制患者的功能获得突变导致活跃cryopyrin inflammasome,增加骨髓细胞衍生促炎细胞因子释放,和系统性和组织炎症导致疾病的症状。大多数突变患者帽都位于外显子3 (9,10]。
NLRP3基因的基因改变之间的关系和限制在2001年首先报道11]。
在这项研究中,我们进行全外显子组测序诊断患者的帽子。结果显示新外显子5变种NLRP3 (nm - 001079821.3: c。G1060 T, p.A354S)。计算机预测的致病性进行功能预测程序,包括BayesDel_addAF,丹,特征,FATHMM-MKL, CADD, MutationTaster。所以,基于美国大学医学遗传学和基因组变异的分类准则,这种变体使用VarSome致病性和InterVar数据库(12]。变体的预测是有害的(CADD得分37)。
病人是杂合的变体。突变是不存在于父母,表明突变是新创或生殖系突变。rs180177503是一个单核苷酸变异会导致c。1060 G >一个错义突变基于NCBI数据库。这项研究是一个c的变体报道。1060 G > T mutation and has not reported yet. Given, prenatal diagnosis was recommended to his parents for next pregnancies. All of the NLRP3 exons were sequenced by Sanger sequencing for this patient and his parents, and there was no other pathogenic or likely pathogenic variant in NLRP3.
5。结论
我们的研究还发现了一个新变种NLRP3基因与帽,增加了这个基因致病变种频谱。同时,更多的功能研究开发新方法治疗帽很重要。
数据可用性
使用的数据来支持本研究的发现可以从相应的作者。
同意
书面知情同意获得病人的父母。
的利益冲突
作者宣称没有利益冲突。
确认
作者要感谢父母给予许可发布的报告。