研究文章
多样化的光谱和分子对接技术,生物物理研究牛血清白蛋白之间的相互作用和Risedronic酸的钠盐,二磷酸盐的骨骼疾病
表6
类型的互动、参与,和他们之间的距离后氨基酸在BSA与工匠们互动三个结合位点的分子对接研究。
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| 结合位点 |
的相互作用 |
氨基acid-RSN原子 |
| 类型 |
距离(一个) |
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| 网站我(花絮) |
传统的氢键 |
2.10 |
参数:256:HE-N1 |
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1.93 |
ILE289: O-H7 |
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2.16 |
ARG217: HE-O7 |
| 范德瓦耳斯 |
- - - - - - |
SER286 |
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- - - - - - |
ILE263 |
|
- - - - - - |
VAL292 |
| 碳氢键 |
3.72 |
LYS221: CE-O7 |
| 不利的正 |
5.24 |
LYS221: NZ-P2 |
| Pi-alkyl |
5.03 |
LEU259:(CG-CD1-D2)芳香环 |
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5.31 |
ILE289:(CB-CG1-CD1)芳香环 |
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4.95 |
ARG256:(CB-CG)芳香环 |
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| 网站二世(iii a) |
传统的氢键 |
2.64 |
ARG409: HE-O7 |
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2.00 |
ASN: OD1-H9 |
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2.37 |
ASN390: HD22-O7 |
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2.80 |
THR448: HG1-N1 |
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2.24 |
TYR410: HH-O6 |
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1.97 |
SER488: OG-H7 |
| 范德瓦耳斯 |
- - - - - - |
PHE402 |
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- - - - - - |
LEU406 |
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- - - - - - |
LEU429 |
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- - - - - - |
LEU456 |
|
- - - - - - |
LEU386 |
|
- - - - - - |
ARG484 |
| 不利的正 |
3.33 |
ARG409: P1-NH2 |
| Pi-alkyl |
5.06 |
LEU452: CG-aromatic环 |
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| 网站III (IB) |
πσ |
3.93 |
VAL432: CG1-aromatic环 |
| 传统的氢键 |
1.96 |
TYR160: HH-O5 |
| 范德瓦耳斯 |
- - - - - - |
LYS136 |
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- - - - - - |
PRO117 |
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- - - - - - |
GLU140 |
| πσ |
3.96 |
LEU115: O1-aromatic环 |
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