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桥螺旋的RNA聚合酶作为中央协调催化纳米机械配电板和基板运动

图1

17 18 N C 17 18 智人 酿酒酵母 Methanocaldococcus jannaschii 硫化叶菌solfataricus 大肠杆菌 水生栖热菌 栖热菌属酸奶 m . jannaschii N C 螺旋结构方面的桥梁。(一)整体桥的位置在RNAP螺旋。桥螺旋显示为绿色卡通结构。还显示DNA模板链(浅蓝色)和新生的成绩单(粉色)。酶的其余部分显示为一个透明的轮廓。基于PDB # 2 e2h [与PyMol[]和可视化]。桥的螺旋(b)的详细视图。桥螺旋显示为绿色卡通结构,和两分子铰链的位置用红色突出显示(BH-H)和蓝色(BH-H)。邻域所示紫色(链接域)或灰色(F-Loop)。核酸底物显示为粘模型(DNA模板链,浅蓝色;新生的成绩单,粉色;rNTP插入网站,深粉红色)。这两个灰色球体代表的镁离子(金属成为和Metal-B)代表了催化部位。基于PDB # 2 e2h [与PyMol[]和可视化]。(c)对齐桥螺旋序列的真核生物(;)、古菌((euryarchaeota);(crenarchaeota))和细菌(,,)。残留是相同的参考生物用于作者的实验室()所示红色。侧翼的数字序列显示的位置桥螺旋完整开放阅读框内的子单元。两个分子铰链区域的近似位置,BH-H和BH-H,用箭头表示。
608385. fig.001a
(一)
608385. fig.001b
(b)
608385. fig.001c
(c)