IFNgr1遗传多态性与Zahedan，伊朗东南肺结核风险的遗传多态性

抽象的

目的。本研究的目的在于找出γ-干扰素之间的可能联系（IFN-γγ.）受体1（IFNGR1）基因多态性以及伊朗人群样本中肺结核（PTB）的风险。方法。多态性IFNGR1.rs1327474（-611 A / G），rs11914（189 T / G），rs7749390（95 C / T），和rs137854905（27-bp的插入/缺失）在173名PTB患者和164名健康受试者确定。结果。我们的研究结果表明，与TT（OR = 0.36,95％CI = 0.21-0.62，和= 0.21-0.62，RS11914 TG基因型降低PTB的风险）。所述rs11914 G等位基因与T等位基因（OR = 0.41，95％CI = 0.25-0.68相比PTB的风险降低，以及）。IFNGR1.rs7749390 CT型，CC型（OR = 0.55，95％CI = 0.32-0.95降低PTB的风险的比较，以及）。没有发现任何重要的关联IFNGR1.rs1327474 A / G多态性与风险/保护PTB的。该rs137854905（27 bp的I / d）的变体是不是在我们的人口多态。结论。我们的研究结果表明，IFNGR1.rs11914和rs7749390变异降低了我国人群中PTB易感性的风险。

1.介绍

结核病是一种传染病，仍然是一个主要的公共卫生问题，也是全世界主要在亚洲和非洲发病和死亡的主要原因[1那2］.根据世界卫生组织的全球TB的年度报告，2012年发生了大约860万个新案件[3.］.据预计，人口的三分之一感染了结核病，而感染者5-10％将在其一生中[发展活动性结核病3.，这表明遗传变异在宿主免疫中的作用。预计遗传因素对结核感染人群表型变异和免疫反应的影响可达71% [4.］.

到目前为止，我们已经显示出宿主遗传多态性和PTB易感性之间关联的证据，包括干扰素-γ（IFNG）[5.]，MIF [6.TLR2 [7.]，IRGM [8.], TIRAP [7.]，和CD209 [9.]在伊朗人口的样本中。

IFNG及其受体（IFNGR1）是先天性和自适应免疫的关键组分，并且已参与各种传染病和炎症性疾病过程。IFNG基因对微生物杀死和潜在有害后果有益的影响[10那11］.IFNG信号通过与IFNGR1的配体绑定介导。IFNGR1表达水平的控制是单元格调制IFNG信令效力的机制之一[12］.IFNG的受体是由α.和β亚基，两者都是整体膜蛋白。这α.亚基（由基因IFNGR1编码）在配体结合，受体运输和信号转导中起着关键作用[13］.IFNG（IFNGR）的人类受体是IFNGR1和IFNGR2的异二聚体。这IFNGR1.基因位于染色体6的长臂上，在23.3（6Q23.3）的位置，其编码干扰素-γ受体的配体结合链（α）。IFNGR1的缺陷已被报告为孟德尔对分枝杆菌病的敏感性的原因，也称为家族性播种的非典型分枝杆菌感染[14］.

几个潜在的功能性单核苷酸多态性（SNPs）已经在人被鉴定IFNGR1.基因。很少有研究调查之间的关联IFNGR1.基因多态性与结核病风险[15-17］.据我们所知，没有关于IFNGR1多态性与伊朗人口的PTB风险的可能关联的任何报告。因此，本研究旨在检查多态性之间的可能关联IFNGR1.伊朗人群样本中PTB基因和易感性的研究

2。材料和方法

2.1。学习人口

此病例对照研究是对173名PTB患者和163名健康受试者完成。注册过程和研究设计在别处之前的描述[6.那9.那18］.简而言之，PTB的诊断基于临床症状，放射性证据和细菌性调查，例如痰酸快速杆菌（AFB）涂片阳性，培养和对抗亚伯氏抗化疗的反应。所有对照受试者都是无关的成年人，通过群体，症状或TB的症状或历史以及来自同一地理来源的患者，作为PTB的患者。

扎德安医科大学的当地伦理委员会批准了该项目，并从研究中包含的所有个人参与者获得知情同意。通过盐洗方法从全血中萃取基因组DNA。

2.2。基因分型

的基因分型IFNGR1.rs1327474，rs11914，和rs7749390多态性，通过PCR-RFLP方法进行。27-bp的I / d的变体，通过PCR的方法进行基因分型。与相应的退火温度和它们的扩增子的大小的引物序列示于表1。

在每个0.20ml PCR反应管中，1 μ.L of genomic DNA (~100 ng/mL), 1 μ.l每个底漆和10个 μ.加入2X总理的Taq预混物（遗传学生物，韩国）和双蒸水适量损益。

SNP的PCR循环条件是在95℃下的初始变性5分钟，然后在95℃和退火温度下进行30次循环30秒（表1）30秒和72℃的延伸，30秒，最终延伸72℃，10分钟。将PCR产物验证到含有0.5的2.5％琼脂糖凝胶上 μ.g / ml溴化乙锭并在紫外线下观察（图1那2那3.,4.）。

2.3。统计分析

使用SPSS 18.0软件进行数据分析。通过Chi-Square测试或独立样品评估变量之间的差异T.- 根据数据。基因型和PTB之间的关联通过计算从逻辑回归分析中的差距（或）和95％置信区间（95％CI）计算。值小于0.05被认为是统计学意义的。

结果

该研究由173分PTB（64名男性和109名女性组成;年龄岁月）患者和164名健康科目（70名男性和94名女性;年龄年）。有关于性别和年龄（组间差异无显著差异）。

基因型和等位基因频率IFNGR1.多态性列于表2。

我们的研究结果表明，与TT相比，rs11914 TG基因型降低了PTB的风险(OR = 0.36, 95% CI = 0.21-0.62, and）。此外，与T等位基因相比，RS11914g等位基因降低了PTB的风险（或= 0.41,95％CI = 0.25-0.68，以及）。关于IFNGR1.RS7749390变体，CT基因型与CC基因型（或= 0.55,95％CI = 0.32-0.95，和）。IFNGR1.rs7749390 T等位基因不与PTB风险。

之间没有观察到任何重大关联IFNGR1.RS1327474 PTB的多态性和风险/保护性。我们发现RS137854905（27-BP I / D）变体在我们的人口中没有多态。

4。讨论

TB感染的临床结果在个体之间显着变化。宿主免疫和遗传因子可能参与易感性或对TB的抵抗力。据信，IFNG在结核病的发病机制中发挥着关键作用[19］.与IFNG介导的免疫的遗传性疾病的个体似乎是特别容易受到结核感染[20.］.有人提出IFNG可以激活小鼠巨噬细胞抑制玉米菌菌增长(21.］.在TB感染期间，IFNG被上调并分泌为主要细胞因子以激活巨噬细胞[22.］.在人类IFNGR1缺陷已被证明是与主导易感性分枝杆菌感染相关联14］.我们之前的研究表明IFNG.+874 t / ptb的多态性和易感性[5.］.在本研究中，我们研究之间的可能联系IFNGR1.伊朗人口样本中基因多态性与PTB的风险我们发现rs11914型TG基因和G等位基因显著降低了PTB的风险。有关IFNGR1.rs7749390多态性，我们发现CT基因型与CC基因型相比降低了PTB的风险。rs1327474 A/G和rs137854905 (27 bp I/D)变异IFNGR1.多态性与PTB的风险/保护性无关(）。

Lü等人。[16]表明，rs2234711，rs1327475，和rs7749390多态性的IFNGR1.基因与结核病风险的改变显著相关。rs2234711和rs7749390多态性降低了结核的风险，而rs1327475变异增加了PTB的风险。他们发现rs3799488和rs9376267多态性与PTB风险之间没有显著关联。

Bulat-Kardum等人。[15]研究IFNGR1.−611 G/A和−56 T/C基因启动子多态性在结核病患者中，并发现这些变异与克罗地亚人群中的结核病风险之间没有显著关联。他等人[17]发现之间的关联显著IFNGR1.rs7749390多态性与中国汉族人群结核的关系

关于影响的研究之间的差异IFNGR1.PTB风险的多态性可能是由于病例和对照，人口遗传因素的表型定义，甚至潜在的全球差异玉米菌菌拉紧。

总之，我们的发现强调了影响IFNGR1.伊朗人口样本中PTB风险的多态性。需要进一步的大样本和不同种族的研究来证实这些发现。

利益冲突

所有作者声明他们没有利益冲突。

致谢

这项研究是由Zahedan医学科学大学的研究基金资助的。作者感谢自愿参与研究的患者和健康受试者。

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