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小跳蚤:病毒的微生物

表2

代表古细菌病毒测序强调病毒粒子结构的多样性。

病毒主机9 病毒的名字 家庭(属)[描述] 类型10 基因组 大小(基因库加入数字) 参考11

(c)Acidianus convivator Acidianus状病毒(酒精) Ampullaviridae (Ampullavirus) 是的 dsDNA线性 23814元(NC_009452) 硫质喷气孔火山水库,波佐利,意大利 彭et al。86年]

(c)Acidianus convivator Acidianus双尾病毒(ATV) Bicaudaviridae (Bicaudavirus)(柠檬形增长之前反面) 是的 dsDNA循环 62730元(NC_007409) 热(87 - 93年°酸性C) (pH值为1.5 2)春天,硫气,波佐利,那不勒斯,意大利 Prangishvili et al。87年]

(c)Acidianus hospitalis Acidianus丝状病毒1 (AFV1) Lipothrixviridae12(Gammalipothrixvirus) 是的 dsDNA线性 20869元(NC_005830) 酸性温泉(85°C、pH值2)陨石坑丘陵地区,YNP13 Bettstetter et al。88年]

(c)Acidianussp。 Acidianus丝状病毒2 (AFV2) Lipothrixviridae (Deltalipothrixvirus) 是的 dsDNA线性 31787元(NC_009884) 在火山口湖,硫质喷气孔火山,波佐利,意大利,与底层温泉(87 - 93年°C, pH值1.5 - 2) 哈林等。89年,90年]

(c)Aeropyrum pernix Aeropyrum pernix杆状的病毒1 (APBV1) Clavaviridae (Clavavirus) 是的 dsDNA循环 5278元(AB537968) Ibusuki城市沿海温泉Yamagawa,日本鹿儿岛。 Mochizuki et al。91年]

(c)Pyrobaculum和Thermoproteus Pyrobaculum球形病毒(埃因霍温) Globuloviridae (Globulovirus) 是的 dsDNA线性 28337元(NC_005872) 生物反应器基于黑曜石池,YNP 哈林等。92年]

(c)硫化叶菌islandicus 硫化叶菌islandicus丝状病毒(SIFV) Lipothrixviridae (Betalipothrixvirus) 是的 dsDNA线性 40900元(NC_003214) 硫气领域、冰岛 阿诺德et al。93年]

(c)硫化叶菌islandicus 硫化叶菌islandicus杆状病毒2 (SIRV2) Rudiviridae
(Rudivirus)
是的 dsDNA线性 35450元(NC_004086) 硫气领域、冰岛 Prangishvili et al。94年]

(c)硫化叶菌neozealandicus 硫化叶菌 droplet-shaped病毒(SNDV) Guttaviridae (Guttavirus) 是的 dsDNA循环 20 kb(不是测序) 孤立的从载体状态15与主机 阿诺德et al。95年]

(c)硫化叶菌 硫化叶菌纺锤状病毒1 (SSV1)17 Fuselloviridae (Fusellovirus) 是的 dsDNA循环 15465元(NC_001338) 溶原性细菌隔绝别府温泉、日本 搬运等。96年];叶芝et al。97年]

(c)硫化叶菌solfataricus 硫化叶菌的二十面体病毒(STIV) 未分类(二十面体,“炮塔”式的预测,周围的脂质,进而围绕病毒DNA) dsDNA循环 17663元(NC_005892) 酸性pH值(2.9 - -3.9)温泉(72 - 92年°C),兔子溪热面积,YNP 大米等。98年]

(c)Thermoproteus tenax Thermoproteus tenax病毒1 (TTV1) Lipothrixviridae (Alphalipothrixvirus) 是的 dsDNA线性 13669元(X14855) 溶原性细菌隔绝泥洞(93°C, pH值6),Krafla、冰岛 Janekovic et al。99年]

(大肠)Haloarcula hispanica His1病毒 [主轴/ lemon-shaped,短的“尾巴”——纤维)(Salterprovirus) 是的 dsDNA线性 14462元(NC_007914) 超咸水,阿瓦隆盐场,Corio湾,维多利亚,澳大利亚 浴和Dyall-SmithOne hundred.]

(大肠)Haloarcula hispanica Halovirus SH1(即连接Haloarcula噬菌体SH1) 未分类(二十面体和含脂质) dsDNA线性 30889元(NC_007217) 高盐度、蛇形湖Rottnest岛,西澳大利亚,澳大利亚 波特et al。101年]

(大肠)Halorubrum coriense Halorubrum噬菌体HF2 Myoviridae[=收缩尾部]( H-like病毒) dsDNA线性 77670元(NC_003345) 盐田,吉朗,维多利亚,澳大利亚 唐et al。102年]

(大肠)Halorubrumsp。 Halorubrum多形性病毒1 (HRPV1) 未分类(lipid-containing病毒粒子) ssDNA循环 7048元(NC_012558) 太阳能盐场,特拉帕尼、西西里、意大利 Pietila et al。103年]

(大肠)甲烷细菌属thermoautotrophicum马尔堡 甲烷细菌属噬菌体 M1 Siphoviridae[=长,尾巴non-contractile] ( M1如病毒) 是的 dsDNA线性 > 26111元18(NC_001902) 实验autodigester(则高达55 -°C) Meile et al。104年];费等。105年]

9(c): Crenarchaeota。(大肠):Euryarchaeota。
10病毒类型的物种。
11额外的引用也咨询了组装,特别是冰镇et al。39)和Krupovic et al。40]。
12家庭成员Lipothrixviridae笼罩,丝状病毒粒子。
13美国黄石国家公园。
14更经常发现硫化叶菌不wzealandicus美国neozealandicus在最初的出版物。
15载体状态可以参考不同的现象包括慢性感染,只有一小部分细菌裂解性感染在文化、或不稳定溶原性(106年),但与古细菌病毒的意义往往是慢性感染的同义词(39]。
16被描述为美国shibataeB12的搬运等。96年),但作为美国acidocaldarius由马丁B12 et al。107年和叶芝等。97年]。
17最初SAV1呼吁美国acidocaldarius病毒(107年]。
18古细菌病毒 M2是一个自发的缺失突变体 M1(至少0.7 kb失踪),我们已经上市 加入M2的基因组长度和数量;在病毒粒子, M1拥有~ 3 kb的循环冗余和审查的费等。105年),”噬菌体粒子已被电子显微镜显示包含30.4 1.0 kb的DNA。”