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特殊的问题

表观遗传调控干细胞的命运

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体积 2020年 |文章的ID 8863539 | https://doi.org/10.1155/2020/8863539

朱真真汉,齐张,烟波,精诚陈、李魏, 核糖体:一个令人兴奋的大道在干细胞研究”,干细胞国际, 卷。2020年, 文章的ID8863539, 12 页面, 2020年 https://doi.org/10.1155/2020/8863539

核糖体:一个令人兴奋的大道在干细胞研究

学术编辑器:shuibin林
收到了 09年4月2020年
修改后的 2020年6月12日
接受 2020年6月16日
发表 06年7月2020年

文摘

干细胞研究都集中在基因组研究。然而,最近的证据表明表观遗传调控的参与在决定干细胞的命运。核糖体在表观遗传调控发挥着至关重要的作用,因此,我们专注于核糖体的作用在干细胞。大多数生物体具有核糖体,参与信使核糖核酸的翻译成蛋白质,促进细胞增殖和分化。核糖体是稳定的分子机器,扮演一个角色在翻译水平变化的RNA。最近的研究表明,特定的核糖体积极调节基因的表达在多种细胞类型,如干细胞。干细胞自我更新和分化的潜力为多个血统,因此,需要高效的翻译。核糖体诱导细胞分化转移和重新编程,中断核糖体合成影响翻译效率,从而阻碍干细胞功能导致细胞死亡和分化。干细胞功能是由ribosome-mediated干细胞特异性基因表达的控制。在本文中,我们提出了一个详细的话语在干细胞核糖体的特点。 Understanding ribosome biology in stem cells will provide insights into the regulation of stem cell function and cellular reprogramming.

1。介绍

核糖体是亚细胞的细胞质核糖体rna和几十个蛋白质组成的生物分子。真核细胞和原核细胞核糖体沉降系数是80年代和70年代,分别。核糖体主要参与翻译,但最近的研究显示他们参与多个生物过程,如细胞增殖、分化,体内平衡和发展的癌症(这些被称为“异构核糖体”)(1,2]。核糖体过滤器假说认为,除了构成翻译机械、核糖体影响选择性的mrna的表达,从而调节细胞功能(不同3]。核糖体合成的效率取决于具体的环境,从而调节各种细胞的功能不同,如干细胞。干细胞的自我更新是一个属性需要转换效率高(4- - - - - -8]。抑制基因转录阻遏物使用翻译会导致减少具备干细胞(4]。造血干细胞也需要大量核糖体活动(9]。细胞可以通过trypsin-activated内化核糖体内吞作用生成细胞集群类似胚胎的身体表达多能性标记(10]。据报道,核糖体调控干细胞分化和胚胎生长11];然而,参与这个过程的机制仍有待理解。本文总结了“抑制核糖体”的特点。

1.1。Ribosome-Mediated信使核糖核酸的翻译

信使核糖核酸的翻译主要包括3个步骤:启动,伸长,和终止12]。和mrna小型和大型的动态交互核糖体亚基,由多个辅助辅助因素在翻译的过程中(13]。核糖体阅读密码子mRNA(遗传密码);每一个密码子对应的氨基酸(14]。开始是一个重要的病原一步翻译(15]。在这一步中,起始因素促进招聘40 s亚基的信使rna 5 最终,扫描的5 翻译区(UTR),起始密码子识别和80年代加入形成elongation-competent核糖体亚基(16- - - - - -18]。mrna拥有监管元素,调节翻译起始的频率,选择开放阅读框(ORF),全球和当地的延伸率,蛋白质折叠(19]。结构化的或过短5 utr [20.,21)和上游开放阅读框架(uORFs) [20.,22)负面影响翻译效率,而内部核糖体进入位点(ires) [23,24),其他地区直接核糖体招聘(25,26),和网站的密码子偏好起始站点(27,28)加强在反应起始核糖体短缺。伸长的效率取决于密码子用法,信使rna二级结构,核糖体密度。最后,翻译终止当核糖体遇到一个终止密码子19]。因此,在mrna cis-elements可用于组合调节核糖体的活动,从而导致选择性基因表达。这给上升到核糖体异质性包括核糖体与微分选择性mRNA子库的子集(2]。

1.2。核糖体的组装

核糖体合成是一个能源密集型的过程,需要复杂的机械设备包括许多蛋白质和rna(图1)[29日]。核糖体的组装大型和小型单元:大型和小型单元主要功能肽键转移和mRNA解码,分别为(30.]。核糖体合成的有四个主要组件:核糖体蛋白质(RPs),装配因素(AFs),核糖体rna (rrna),和小核仁的rna (snorna) [1]。核糖体前体合成的核仁内部结构由三个特征区域:纤维中心(FC),致密纤维组件(DFC)和粒子组件。核糖体rna转录与FC DFC。核糖体rna结合蛋白位于DFC。核糖体rna也裂解、加工和修改的DFC。核糖体的前身是在粒子组装组件(31日]。真核核仁,RNA聚合酶转录rDNA到47个年代preRNA拼接形成5.8 s, 28号,和18 s rRNA [32,33]。真核细胞核,RNA聚合酶III转录5 s rRNA参与60 s亚基的形成与28 s和5.8 s rRNA。40 s亚基由18 s rRNA, 33个奢望,而60 s亚基包含5 s, 5.8年代,28 s rRNA, 47个奢望。

核糖体rna可以修改或处理snorna [34转录的RNA聚合酶II或III或来自pre-mRNA内含子。snorna细胞核中发现并提供直接参与核糖体rna的转录后和信使rna (35]。snorna与蛋白质形成小型核核糖核蛋白(snoRNPs)直接rRNA处理和修改(36]。

有~ 80 rp (37],其中大多数是cotranscribed rRNA [38]。细胞质中的mrna rp的翻译后他们回到细胞核形成核糖体亚基的前体。使有效的蛋白质翻译、核糖体的组装也需要特定的AFs (39]。真核生物拥有超过500 AFs (40]。在特定阶段包括AFs与rRNA rRNA加工和修改,从而促进RP和影响核糖体生物起源的绑定41]。AFs主要由多种酶和蛋白质与已知的蛋白质或rna结合域。特定的AFs如FBL和BYSL在通过促进核糖体生物起源和维持多能性干细胞(42- - - - - -44]。

细胞分化的胚胎干细胞(ES)可以由核糖体数量减少造成的。抑制蛋白质合成的影响许多蛋白半衰期较短。半衰期较短的关键蛋白质的表达取决于多个因素(45]。在人类胚胎干细胞,短暂的Nanog蛋白的表达是不稳定的。Nanog是介导的蛋白质水解ubiquitin-proteasomal通路(46]。小鼠胚胎干细胞(制)可以通过转录抑制剂4 egi-1导致Nanog的蛋白质含量的迅速减少,Esrrb, Tfcp2l1和稳定时间减少的mRNA水平(47]。核糖体生物起源是由五个主要步骤包括转录、加工、修改、核糖体的组装和运输体细胞。精细调度多个步骤的核糖体生物起源进行有效的翻译和维持多能性是至关重要的。

1.3。Ribosome-Induced细胞分化转移

分化转移涉及的体细胞重编程的一个不同的血统不经过中间增生性多能干细胞阶段;这是一个新的方法来生成功能细胞(48- - - - - -50]。麻风杆菌transdifferentiates雪旺细胞成多能细胞的表达下调分化标记(SOX10、合成和我)和移植与中胚层发育相关的基因(Sox2、CD44和CD43) (51]。幽门螺杆菌感染肠道上皮细胞促进CDX1[的表达52]。CDX1诱导多能性因子的表达KLF5 SALL4,从而transdifferentiating胃上皮细胞进入肠道epithelial-like细胞(52,53]。蛋白质沃尔巴克氏体属pipientis,特别是W20,加速哺乳动物细胞“重编程”(54]。乳酸菌(实验室)人类皮肤成纤维细胞(HDFs)转换成多能细胞(55]。LAB-differentiated细胞集群有可能形成三个胚层细胞连同增加的表达多能性的标志,Nanog [55]。因此,细菌促进宿主细胞重新编程,但机制仍有待调查。理解LAB-induced分化转移HDFs,实验室溶解产物被用于治疗使胰蛋白酶化HDFs;的蛋白质分数 获得超滤器溶解产物被发现诱导细胞集群的形成(10]。由于分数的大小,“分化转移因素”推测是核糖体。纯化获得的核糖体超速离心法提升HDF分化转移。这些ribosome-induced细胞集群可以增强多能性因子的表达和给内胚层的崛起,中胚层和外胚层的细胞,但它们不能形成畸胎瘤和嵌合体10]。Ribosome-induced细胞集群需要诱导与胰蛋白酶(56]。因为核糖体的直径是20 nm ~ (57),它可以接受核质穿梭和内化的其他细胞通过内吞作用由endosomal ~ 10的囊泡μ米的大小(58]。核糖体的特点,促进分化转化和表达干细胞标记仍然完全被理解。

1.4。核糖体rna转录效率决定了干细胞的命运

ES细胞的细胞核迅速适应增加的细胞增殖,需要快速的核糖体rna的转录59,60]。促进转录的起始,RNA聚合酶特别是rDNA通过转录因子与启动子结合地区,如上游绑定因子(UBF)和启动子选择性因子(SL1 / TIF-IB) (61年]。核糖体rna转录的效率决定了核糖体生物合成和组装的速度。干细胞大量抄写核糖体rna,但是他们的水平下降,细胞分化[32]。原癌基因的表达,一个重要的干细胞标记,减少在分化(62年]。减少polymerase-associated因素会使rRNA RNA合成的水平(63年],从而诱导细胞分化[64年]。Downregulation的rRNA linage-specific水平增加的相关因素,负责分化成特定的细胞类型(例如,MyoD和myogenin肌发生期间,Runx2骨生成期间,和C / EBP -β,C / EBP -δC / EBP -α在脂肪生成);这些因素阻碍了核糖体rna转录与UBF交互或rDNA发起人(65年]。一个体外实验表明,放线菌素D-mediated抑制核糖体rna转录诱导小鼠造血干细胞(hsc)的分化。因此,人们普遍认为减少核糖体rna转录与细胞分化有关。

在真核生物中,75%的核糖体RNA转录的RNA聚合酶我1]。这种酶复杂包括Udd、TAF1B TAF1C-like因素果蝇。增加了RNA聚合酶的转录抑制细胞分化,而抑制核糖体RNA聚合酶I-mediated转录限制生物起源和促进细胞分化[66年]。FBL混入甲基谷氨酰胺残基的组蛋白H2A RNA聚合酶,刺激我绑定rDNA基因启动子(67年]。

最近的一项研究表明,17 pluripotency-associated因素结合rDNA位点在制32]。此外,沉默rDNA基因和表达下调核糖体生物起源与干细胞衰老小鼠肝星状细胞(68年]。一般来说,干细胞的核糖体rna转录效率比女儿高细胞核糖体rna合成由分化期间phenotype-specific转录因子表达下调。rDNA转录在干细胞和定量监管rDNA转录率影响细胞的命运。除了rDNA转录:许多因素在这一过程中所有步骤似乎发挥干细胞特异性作用。

1.5。核糖体rna加工和干细胞

核糖体rna加工是一种进化保守的现象,对核糖体的组装至关重要。核糖体的组装和pre-rRNA处理密切相关,主要的47个成绩单裂解到20年代和32 s中间体加工成熟的18和5.8/28年代核糖体rna(组件的40年代和60年代核糖体亚基,分别)。干细胞AFs促进rRNA处理来提高核糖体合成的效率。小亚基processome (SSUP) pre-18S处理复杂组成的snoRNA U3和54蛋白质由六个编码基因(Krr1、Ddx47 Ddx52, Nol6, Pdcd11,和Rrp7a)在制4]。这些干细胞SSUP基因过表达,但表达下调期间身体胚状体的形成。耗尽细胞SSUP减少Nanog表达式,同时击出SSUP基因阻碍细胞重新编程。的守恒的酵母同族体Krr1 SSUP [45),促进网站A0 18 s rRNA的乳沟,A1和A2产生40 s亚基(69年]。SSUP刺激多能性提高翻译。ES细胞表现出的upregulation SSUP的子单元,从而提高翻译的速度和调节多能性。

Lrrc34(富亮氨酸repeat-containing 34)是另一个强劲的基因表达在制和分化期间表达下调(70年]。Lrrc34核仁的蛋白质,与nucleophosmin nucleolin调节pluripotency-related基因,如OCT4、和核糖体rna加工和核糖体的形成很重要71年]。Urb2,另一个核仁的蛋白质,扮演一个角色在27个pre-RNA处理和60年代亚基生物起源(72年]。此外,突变Urb2损害HSC发展通过扰乱核糖体亚基的生物起源和核糖体rna在斑马鱼11,72年]。

Nucleostemin在增殖细胞中过表达,如中枢神经系统干细胞,胚胎干细胞,分化期间和癌症细胞系,表达下调。它包含一个氨基端基本域参与核仁的本地化和两个GTP-binding图案,调节其核仁,核浆(之间的运输73年,74年]。通过p53 Nucleostemin调节细胞增殖信号和参与核糖体生物起源,特别是pre-RNA处理。它是一种大蛋白复合物(> 700 kDa)组成五个核糖体亚基(RPS6, RPS8, RPS24、RPL13 RPL14),三个核仁的蛋白质(DDX21、Pes1和EBP2),和一个翻译起始因子(eIF2B1) [75年]。DDX21 DExD / H盒从ATP水解蛋白质,使用能量放松RNA或干扰RNA蛋白质复合物可以改变RNA (76年]。它稳定28 s rRNA,促进了20年代pre-RNA转化为18 s RNA非洲爪蟾蜍和流程的18岁和28 s核糖体rna在人类77年]。Pes1还参与处理12个,36岁和32 s pre-rRNAs在哺乳动物中,从而促进生物起源的60年代核糖体亚基(78年]。EBP2与核糖体蛋白质L36吧,经历了18个;L36重要处理27 sa2 27 sa3, 27 sbl pre-rRNAs [79年]。此外,nucleostemin和60年代的子单元中可以找到相同的分数蔗糖梯度离心后,表明nucleostemin参与核糖体合成(75年]。总之,DDX21之间的交互、Pes1 EBP2, nucleostemin加强pre-RNA处理促进60年代核糖体亚基合成和提高翻译的效率。

Bystin-like (BYSL)在快速增殖检测到有大量的胚胎和癌细胞在真核生物的进化,特别是糖调节核本地化(80年- - - - - -83年]。击出BYSL抑制18 s rRNA的合成,使20 s rRNA前体的积累而不影响28 s rRNA。此外,有一个40 s亚基的细胞质含量下降,暗示的作用Bysl出口40 s亚基(33]。Bysl也是一个关键调节器原癌基因,在干细胞和癌症细胞(84年,85年]。Enp1 Bysl主要是本地化的酵母直接同源核仁。类似于Krr1 Enp1函数在18 s rRNA处理和乳沟的35 s pre-RNA网站A0, A1和A2 (86年]。Enp1已经观察到coimmunoprecipitate与一群蛋白质,包括Nop1(酵母直接同源的FBL) [87年]。Enp1 Nop1与snorna U3交互和U14刺激rRNA处理。

1.6。在干细胞特定rRNA修改

核糖体rna的修改变化根据不同的刺激,疾病,和发展,这导致核糖体的异质性,从而不同调节基因表达(34]。真核核糖体rna拥有91假尿苷(Ψ包含2糖),105 - - - - - -O-methylation (2 - - - - - -嗳哟),10个甲基化基地(88年]。修改主要是在核糖体的功能区域,引起snoRNPs其中snorna补充特定的核糖体rna序列确定甲基化网站(89年,90年]。snorna可分为C / D或H / ACA盒子snorna [91年]。C / D盒snorna主要经历2 - - - - - -我修改,而H / ACA盒snorna进行替换Ψ(92年]。核糖体rna修改改变的二级和三级结构核糖体,核糖体是重要的生物起源和功能(93年]。微分修改特定rRNA网站导致核糖体异质性。

脆性X智力缺陷蛋白(FMRP)是一种rna结合蛋白对神经系统发育和分化很重要。在动物和人类干细胞,FMRP维持多能性,调节细胞命运决定了速度和生成神经元lineage-committed细胞(94年- - - - - -97年]。FMRP已被证明功能主要在细胞质中;然而,最近的证据表明它在细胞核中的作用[98年,99年]。在人类胚胎干细胞的细胞核,FMRP直接与C / D 2盒snorna和结果 - - - - - -我修改rRNA,从而导致核糖体异质性影响核糖体rna折叠和核糖体的组装One hundred.,101年]。在细胞质中,FMRP标识2 - - - - - -O-Me-modified核糖体,使特定的翻译目标mrna (101年,102年]。FMRP促进干细胞细胞内基因的表达途径,如mTOR PI3K Gsk3 ERK和β(103年- - - - - -106年]。

Fibrillarin参与扩散是一种蛋白质,它是(107年,癌症108年),和干细胞分化43]。Fibrillarin浓缩在DFC核仁区域,包含一个n端结构域富含甘氨酸和精氨酸残基(即雀鳝域),一个中央RNP-2-like共识序列组成的rna结合域,和一个高度保守的c端螺旋域,可以作为甲基转移酶(109年,110年]。人类的雀鳝域使fibrillarin-interacting pre-RNAs处理新生47 pre-rRNAs和限定DFC地区。作为C / D的一部分盒snoRNPs FBL催化的2 - - - - - -我的核糖体rna调节核糖体生物起源和翻译(111年,112年]。因此,在pre-rRNA fibrillarin函数处理和修改,从而调节核糖体生物起源。它还可以增强的活性RNA聚合酶i Nop1,酵母fibrillarin同族体,也pre-RNAs过程,尤其是18 s rRNA。Fibrillarin被报道在小鼠胚胎干细胞和维持多能性状态即使没有生活的43]。在干细胞分化和神经发生,fibrillarin表达下调,可能会影响2 - - - - - -我修改的核糖体rna调节核糖体生物起源与修改平移特异性这样IRES-containing mrna(例如,cMYC,FGF1,VEGFA)优先翻译而不是5 - - - - - -封顶成绩单(43,107年,108年]。

1.7。RP异质性的干细胞

RP成分和同种型的差异导致核糖体异质性(113年),使sequence-specific元素或结构的识别在mrna和选择性表达(2,114年,115年]。各种rp表达不同的区段组织发展中老鼠的胚胎(116年]。

定量质谱分析是用来衡量RP丰度和识别异质成分转译活跃的核糖体在制2]。核糖体包含RPS25或RPL10A翻译特定的转录子库,包括信使rna编码关键部件在新陈代谢,细胞周期的过程,和发展,虽然RPL10A并不影响整体的消耗多核糖体资料但降低转换效率与代谢相关的mrna (2]。发现的异构rp SRM位于表面核糖体的重要功能区域包括mRNA隧道出口和L1茎,因此直接与mRNA (117年,118年]。RPL10A直接与忿怒和80年代参与核糖体独立的部分或全部启动因素实现平移mRNA的监管,突出的重要性,顺式元素选择性mRNA翻译(2,119年,120年]。

Diamond-Blackfan贫血是一种特殊的血液疾病。患者存在红细胞前体细胞的数量减少和骨髓祖细胞,是由杂合的丧失突变的18个不同的RP基因(如RPL11 RPS19),从而导致RP haploinsufficiency [121年,122年]。击倒RPL11或RPS19减少IRES-mediated翻译,尤其是Bag1保护GATA1从终端红细胞分化期间caspase-3-mediated乳沟123年- - - - - -125年]。RP突变降低关键lineage-determining造血mRNA转录因子GATA1 Diamond-Blackfan贫血(125年]。

突变RPL21都与干细胞特异性缺陷,如失去体毛(126年]。RPL38突变体胚胎没有改变全球蛋白质合成,但选择性影响同源框的一个子集的翻译mrna (116年]。

总的来说,这些发现表明,rp监管带来一个新图层的特异性基因表达的控制,哺乳动物的发展,干细胞生物学。

1.8。AFs与rp调节干细胞的功能

RP合成其他生物过程密切相关127年]。rp是由先前存在的翻译在细胞质中核糖体后进入核仁和绑定到rRNA核糖体。rp会选择性的角色在真核核糖体细胞体内平衡和发展(114年]。一些直接相互作用和稳定rp AFs,而另一些与DNA刺激转录。UBA52编码融合蛋白的泛素和RPL40对胚胎发育很重要。UBA52 RPL40裂解是重要的蛋白质生物起源和形成一个核糖体复杂与泛素从UBA52裂解。高效的蛋白质合成需要的乳沟RPL40从融合蛋白(128年]。

Bmi1属于polycomb群蛋白质绑定到目标基因的启动子和诱导表观遗传修饰在染色质调节癌症和干细胞生物学129年- - - - - -131年]。Bmi1影响肝星状细胞的增殖和分化以及其他干细胞,如间充质干细胞、神经干细胞(132年,133年]。在K562细胞,Bmi1结合核糖体基因的启动子,等RPL5,RPL1,RPL23,RPS14,RPS19;因此,损失在这个互动会使核糖体蛋白质和导致核糖体生物起源受损,从而减少全球翻译效率(134年,135年]。石头剪刀Bmi1促进转录组蛋白标记包括H3K9ac和H3K4me3通过招募活跃。

Runx1、另一个转录因子结合RP-encoding基因的启动子和rDNA重复调节转录rDNA和核糖体生物起源的公司(65年,136年]。Runx1 Runx1核糖体核心启动子元素形式,GATA2, FLI1影响核糖体生物起源与合作造血转录因子(137年,138年]。Runx1由核糖体生物起源的全球监管机构监管,Myc [139年]。此外,Bmi1直接与RUNX1招募polycomb阻遏复杂1调节核糖体生物起源和组装140年]。

phosphatidylinositol-3-kinase (PI3K / Akt和哺乳动物雷帕霉素靶(mTOR)信号通路(PI3K / Akt / mTOR)是细胞生长和生存的关键141年- - - - - -144年]。可以重新编程细胞激活IGF1 / AKT mTOR信号和增加细胞耗尽的翻译石头剪刀MeCP2(图2)[145年]。mTOR磷酸化下游效应器,包括S6激酶(s6K) [146年)和真核起始因子4 e (eIF4E)结合蛋白1 (4 e - bp1) [147年,148年]。eIF4E抑制翻译,而mTOR-phosphorylated eIF4E缓解转化抑制促进帽依赖翻译(148年]。S6K促进生物起源的磷酸化RpS6 40 s亚基(组件)和翻译(149年,150年]。mTOR对胚胎干细胞的发展很重要,可以由PI3K信号参与ES细胞多能性(151年- - - - - -153年]。

1.9。核糖体的组装和运输干细胞

PDCD2守恒在真核生物蛋白质,存在于小鼠胚胎干细胞和其他快速增殖细胞,如癌症细胞,发现丰富的(如果有的话)在分化或增长缓慢的细胞(154年- - - - - -157年]。Zfrp8 PDCD2的相同器官果蝇维护、功能的肝星状细胞(158年]。PDCD2属于TYPP domain-containing蛋白(TSR4, YwqG、PDCD2L PDCD2),其中TSR4调节rRNA处理和核糖体成熟(159年]。Zfrp8 / PDCD2直接通过RpS2与40 s核糖体亚基相互作用,从而调节细胞质RpS2水平和40 s亚基的稳定性160年]。40 s亚基由30多个RPs结合众多non-RPs规范翻译,亚基组装,核质运输(161年,162年]。因此,Zfrp8 / PDCD2在翻译中起着关键作用;然而,这并不是最重要的在一般翻译(160年]。Zfrp8 / PDCD2可以招募不同的rna结合蛋白,如FMRP / Fmr1和NUFIP1 / Nufip(核FMRP-interacting蛋白质),形成mRNA-RNP复合物结合的专门40 s亚基,和时空调节目标基因表达的163年- - - - - -165年]。Zfrp8 / PDCD2也调节蛋白编码基因的翻译促进核出口的mrna (160年]。因此,在核糖体Zfrp8 / PDCD2重要装配和调节特定mrna的运输维持运转正常干细胞。

2。结论

核糖体是重要的翻译工具在不同种类的细胞。然而,最近的研究表明,它存在于异构形式不同调节基因的表达(2]。核糖体生物起源是一个非常复杂的过程。虽然核糖体合成的基本步骤是守恒的166年),有多种因素调节不同的过程(167年)调节特定基因的翻译效率。这些因素大部分是高度表达干细胞;敲除或突变影响干细胞的功能,导致细胞死亡。核糖体的异质性是当核糖体有不同的成分,如核糖体rna,和AFs,奢望允许mrna的选择性翻译生成适当的类型和数量的蛋白质需要调节细胞功能环境。特定的特性在mrna,比如cis-elements,被专业的核糖体,从而使选择性翻译(2]。更重要的是,信使rna识别和翻译的核糖体是RNA-RP交互的基于组合集;因此,核糖体异质性及其转化控制作用可能主要由RP成分和修改(115年]。我们知道还有很长的路去破译异质性核糖体,和最近的研究发现,干细胞和分化细胞表达不同子集的图示(168年,169年]。

干细胞分化成lineage-committed细胞增殖形成特定的组织、器官和系统在我们的身体中,从而凸显其重要性,修复受损的细胞和组织的理想来源。山中由于大量的干细胞有限,和他的同事们表达了四个具体的基因(OCT4,KLF4,SOX2,CMYC;OSKM)重组分化细胞在诱导多能干细胞(170年]。然而,由于重组是一种无效率的过程,有正在进行的研究的识别因素加速重组(171年,172年]。众多研究表明,长非编码rna的存在(lncRNAs)促进干细胞功能的维护173年]。LncRNAs,比如Peblr20 SNHG14,显著改善重组效率(174年,175年]。本文着重于核糖体的多样性与平移控制干细胞的基因表达和识别的特定识别元素与具备干细胞相关的mrna。AFs干细胞改善核糖体生物起源的效率,促进干细胞相关基因的翻译。因此,使用这些AFs与重组所涉及的因素(lncRNAs、蛋白质等)将促进核糖体合成和重编程效率的提高。然而,核糖体的机制上都需要进一步的研究特别是调节选择性干细胞相关基因的表达。解决这将铺平道路在干细胞研究新方向,将有助于刺激干细胞重新编程,促进干细胞的临床应用。

数据可用性

没有数据被用来支持本研究。

的利益冲突

作者宣称没有利益冲突。

确认

我们要感谢Editage (http://www.editage.cn)英语编辑。发表这篇评论支持由中国国家自然科学基金(批准号81372835和81372835)和中国国家重点研究和发展计划(批准号2018 yfa0106902)。

引用

  1. d . l . j .拉方丹则“非编码rna在真核核糖体生物起源和功能”,《自然结构和分子生物》上,22卷,不。1,11-19,2015页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  2. z Shi, k .藤井裕久k . m . Kovary et al .,“异构核糖体优先翻译不同的子库的信使rna基因组,”分子细胞,卷67,不。1,页71 - 83。e7, 2017年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  3. 诉p·毛罗·g·m·埃德尔曼,“核糖体过滤回来的,”细胞周期》第六卷,没有。18日,第2251 - 2246页,2014年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  4. k . t .你,j .公园,v . n .金”的角色小亚基processome多能干细胞的维护,“基因与发展卷,29号19日,2004 - 2009年,2015页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  5. r·h·j . Lee Gutierrez-Garcia, d . Vilchez“胚胎干细胞:小说范式研究proteostasis ?”2月日报,卷284,不。3、391 - 398年,2017页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  6. a . Noormohammadi a . Khodakarami r . Gutierrez-Garcia et al .,“体增加的CCT8模仿proteostasis人类多能干细胞和延伸秀丽隐杆线虫寿命。”自然通讯,7卷,不。1,第13649条,2016。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  7. l . Garcia-Prat p Sousa-Victor, p . Munoz-Canoves“Proteostatic和代谢控制具备干细胞,”细胞干细胞,20卷,不。5,593 - 608年,2017页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  8. a . Noormohammadi g . Calculli r . Gutierrez-Garcia a . Khodakarami s Koyuncu和d . Vilchez”蛋白质体内平衡机制(proteostasis)保持在哺乳动物的多能干细胞,干细胞的身份”细胞和分子生命科学,卷75,不。2、275 - 290年,2018页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  9. l . Jarzebowski m . le Bouteiller s Coqueran et al .,”老鼠成人造血干细胞积极合成核糖体RNA,”核糖核酸,24卷,不。12日,第1812 - 1803页,2018年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  10. n . Ito k . Katoh h . Kushige et al .,“核糖体并入体细胞促进谱系分化转移向多能——”科学报告,8卷,不。1,p。1634年,2018。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  11. p . Cai x毛、j .赵和l .罗”核糖体蛋白质生物起源Urb2调节造血干细胞发展通过P53通路在斑马鱼,”生物化学和生物物理研究通信,卷497,不。2、776 - 782年,2018页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  12. a·巴斯蒂德和大卫,“核糖体,癌症(缓慢)跳动的心脏细胞(干细胞),“致癌基因,7卷,不。4,34页,2018年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  13. n . e . Shirokikh阿切尔k, t·h·Beilharz d·鲍威尔和t . Preiss,“翻译复杂的测序研究在活的有机体内动力学的mRNA核糖体相互作用在翻译起始,伸长,终止。”自然的协议,12卷,不。4、697 - 731年,2017页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  14. l . f . Lareau d·h·海特·g·j·霍根和p·o·布朗”翻译的不同阶段延伸循环了测序ribosome-protected信使rna片段,”eLife卷,3条e01257, 2014年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  15. y·沙阿丁,m .下g . Kudla和j·b·普罗金“酵母蛋白质翻译、病原反应步骤”细胞,卷153,不。7,1589 - 1601年,2013页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  16. a·g·Hinnebusch“真核翻译起始的扫描机制”年度回顾生物化学,卷83,不。1,第812 - 779页,2014。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  17. a . Marintchev”角色解旋酶的翻译起始:机械论的观点,“Biochimica et Biophysica学报(BBA)——基因调控机制,卷1829,不。8,799 - 809年,2013页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  18. w·c·梅里克“真核蛋白质合成:仍然是个谜,”《生物化学》杂志上,卷285,不。28日,第21201 - 21197页,2010年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  19. m . v .核糖体上,”行动的核糖体:调优的转化效率和蛋白质折叠,”蛋白质科学,25卷,不。8,1390 - 1406年,2016页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  20. m·科扎克》规定的翻译通过信使rna结构在原核生物和真核生物,“基因卷。361年,13-37,2005页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  21. t . v . Pestova和v . g . Kolupaeva”个人真核翻译起始因子的角色在核糖体扫描和起始密码子选择,”基因与发展,16卷,不。22日,第2922 - 2906页,2002年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  22. c . Vilela和j·e·g·麦卡锡“真菌基因表达调节通过短开放阅读框架的信使rna 5 翻译区”,分子微生物学卷,49号4、859 - 867年,2003页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  23. Lozano和e . Martinez-Salas“结构性见解病毒IRES-dependent翻译机制,“当前舆论病毒学》12卷,第120 - 113页,2015年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  24. A . A .柯玛、b . Mazumder和w·c·梅里克“IRES-mediated翻译、新框架的理解”基因,卷502,不。2、75 - 86年,2012页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  25. w·v·吉尔伯特,k, t·k·巴特勒和j·a . Doudna”Cap-independent starvation-induced分化所需的翻译是在酵母中,“科学,卷317,不。5842年,第1227 - 1224页,2007年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  26. n . e . Shirokikh和A . s .顾客:“保利(A)的领导人真核mRNA绕过了依赖的翻译起始因子,”美国国家科学院院刊》上的美利坚合众国,卷105,不。31日,第10743 - 10738页,2008年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  27. m·科扎克”点突变定义一个序列侧翼8月起始密码,调节真核核糖体翻译,“细胞,44卷,不。2、283 - 292年,1986页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  28. m·科扎克“点突变接近8月起始密码鼠preproinsulin影响翻译的效率在活的有机体内”,自然,卷308,不。5956年,第246 - 241页,1984年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  29. h . Lempiainen d岸边,“增长控制和核糖体生物起源。”当前细胞生物学的观点,21卷,不。6,855 - 863年,2009页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  30. t·A·施泰茨“动态核糖体的结构理解机器。”自然评论分子细胞生物学,9卷,不。3、242 - 253年,2008页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  31. s . a . Pirogov诉答:Gvozdev, m . s . Klenov”长非编码rna和核仁应激反应,”细胞,8卷,不。7,668年,页2019。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  32. a . Brombin j·s·乔利,f . Jamen”老狗新把戏:核糖体生源论有助于干细胞体内平衡,”当前在遗传学和发展意见34卷,第70 - 61页,2015年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  33. k .足立c . Soeta-Saneyoshi h . Sagara, y Iwakura,“关键作用的Bysl哺乳动物胚胎植入前的40年代核糖体生物起源发展不可或缺的因素,”分子和细胞生物学,27卷,不。6,2202 - 2214年,2007页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  34. k·e·斯隆,a . s . Warda沙玛,k·d·Entian d l . j .拉方丹则和m . t . Bohnsack“调优核糖体:核糖体rna修改对真核核糖体生物起源和功能的影响,“RNA生物,14卷,不。9日,第1152 - 1138页,2017年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  35. g·t·威廉姆斯和f . Farzaneh snoRNA和snoRNA宿主基因新玩家在癌症吗?”自然评论癌症,12卷,不。2、84 - 88年,2012页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  36. a . k . Henras C丢,y亨利,“RNA结构和功能在C / D和H / ACA s rnp(没有),“当前结构生物学的观点,14卷,不。3、335 - 343年,2004页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  37. s . w . Wang唠叨,x张et al .,“核糖体蛋白质和人类疾病发病机理、分子机制、和治疗意义,”药用研究评论,35卷,不。2、225 - 285年,2015页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  38. j . de la Cruz k . Karbstein和j·l·伍尔福德Jr .)”功能,核糖体蛋白在真核核糖体的组装体内,”年度回顾生物化学,卷84,不。1,第129 - 93页,2015。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  39. d . Kressler大肠伤害,j . Bassler“驾驶核糖体的组装,Biochimica et Biophysica学报(BBA)——分子细胞研究,卷1803,不。6,673 - 683年,2010页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  40. Tafforeau L。zorba C。,Langhendries J. -L. et al., “The complexity of human ribosome biogenesis revealed by systematic nucleolar screening of pre-rrna processing factors,”分子细胞,51卷,不。4、539 - 551年,2013页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  41. b . s .斯特伦克和k . Karbstein”,推动通过核糖体的组装”,核糖核酸,15卷,不。12日,第2104 - 2083页,2009年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  42. w·h . Wang,问:周et al .,“Bystin-like nucleologenesis所需蛋白质调节肝细胞癌,癌症细胞增殖,”细胞研究,19卷,不。10日,1150 - 1164年,2009页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  43. 高田k Watanabe-Susaki, h,榎本失败k . et al .,“生物合成核糖体RNA的核仁调节多能干细胞的多能性和分化能力,”干细胞,32卷,不。12日,第3111 - 3099页,2014年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  44. k .牛顿大肠Petfalski、d . Tollervey和j·f·卡塞雷斯,“Fibrillarin早期发展是至关重要的,需要积累intron-encoded小核仁的RNA的老鼠,”分子和细胞Boilogy,23卷,不。23日,第8527 - 8519页,2003年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  45. 郑,p .局域网、刘x和k .你们“Krr1核糖体装配因素之间的相互作用和Faf1小核糖体亚基形成的酵母是至关重要的,”《生物化学》杂志上,卷289,不。33岁,22692 - 22703年,2014页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  46. 室利罗摩克里希纳,苏雷什,K.-H。Lim et al .,“害虫主题序列调节人力NANOG蛋白酶体降解,”干细胞与发展,20卷,不。9日,第1519 - 1511页,2011年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  47. n . j . Moerke h . Aktas h . Chen等人“小分子抑制翻译起始因子之间的交互eIF4E如果,”细胞,卷128,不。2、257 - 267年,2007页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  48. c . Mollinari j .赵l . Lupacchini e . Garaci d·梅洛,和g .贝聿铭“分化转移:神经退行性疾病的新承诺,“细胞死亡和疾病,9卷,不。8,830年,页2018。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  49. 谢x、y .傅和j .刘“化学重组和分化转移。”当前在遗传学和发展意见,46卷,第113 - 104页,2017年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  50. s·m·钱伯斯和l .、“细胞命运即插即用:直接重编程和诱导多能性,”细胞,卷145,不。6,827 - 830年,2011页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  51. t .正树、瞿j . j . Cholewa-Waclaw k .毛刺r . Raaum和a . Rambukkana”重组成人雪旺细胞的干细胞的细胞由麻风杆菌促进传播感染,”细胞,卷152,不。1 - 2日,51 - 67,2013页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  52. n .伊藤和k .研究员合作,“人类体细胞由细菌的重组,”开发、生长和分化卷,57号4、305 - 312年,2015页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  53. 铃木y藤井裕久k . Yoshihashi h . et al .,“CDX1授予肠道表型在胃上皮细胞通过诱导stemness-associated重组因子SALL4 KLF5,”美国国家科学院院刊》上的美利坚合众国,卷109,不。50岁,20584 - 20589年,2012页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  54. t . Ikeda中山教授,m . Iwasaki et al .,“人工加速细菌蛋白的哺乳动物细胞“重编程”,“基因对细胞,22卷,不。10日,918 - 928年,2017页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  55. k .研究员合作,r .【和n .伊藤“乳酸菌人类成纤维细胞转化成多功能细胞,”《公共科学图书馆•综合》,7卷,不。12篇文章e51866 2012。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  56. m·w·舍伍德中情局前,s . g . Voronina et al .,”的胰蛋白酶原激活胰腺腺泡细胞内吞作用的大液泡,”美国国家科学院院刊》上的美利坚合众国,卷104,不。13日,5674 - 5679年,2007页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  57. h·斯塔克,f·穆勒,e . v .奥尔et al .,“70年代大肠杆菌核糖体在23日一项决议:配件核糖体RNA。”结构,3卷,不。8,815 - 821年,1995页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  58. m . Kaksonen和a . Roux clathrin-mediated机制内吞作用,”自然评论分子细胞生物学,19卷,不。5,313 - 326年,2018页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  59. e . Meshorer d . Yellajoshula e·乔治p . j .懒散地闲荡,d·t·布朗和t . Misteli”高动力性的多能胚胎干细胞可塑性的染色质蛋白质,”细胞发育,10卷,不。1,第116 - 105页,2006。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  60. k . Nakamoto a . Ito k Watabe et al .,“增加表达的核仁的Nop5 / Sik家庭成员在转移性黑色素瘤细胞:证据在核仁的大小和功能的作用,“美国病理学杂志》上,卷159,不。4、1363 - 1374年,2001页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  61. 即Grummt”,自己的一颗行星上的生命:调控转录的RNA聚合酶在核仁,”基因与发展,17卷,不。14日,第1702 - 1691页,2003年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  62. g . Poortinga k m·汉纳h s et al .,“MAD1和原癌基因转录调节UBF和rDNA粒细胞分化期间,“在EMBO杂志,23卷,不。16,3325 - 3335年,2004页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  63. g . Poortinga m .墙,大肠Sanij et al .,”原癌基因协调控制核糖体基因染色质重塑和波尔我可用性粒细胞分化期间,“核酸的研究,39卷,不。8,3267 - 3281年,2011页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  64. y Hayashi, t .黑田,岸本h . c, a . Iwama k .木村,“Downregulation核糖体rna转录触发细胞分化。”《公共科学图书馆•综合》,9卷,不。5篇文章e98586 2014。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  65. 答:阿里,s . k .扎伊迪c . s . Dacwag et al .,“表型细胞生长控制转录因子epigenetically调解。”美国国家科学院院刊》上的美利坚合众国,卷105,不。18日,第6637 - 6632页,2008年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  66. 问:张:a .青年外交官访华团,m . Buszczak”核糖体rna转录变化影响干细胞谱系内增殖和细胞的命运,”科学,卷343,不。6168年,第301 - 298页,2014年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  67. p . Tessarz h . Santos-Rosa s c·罗布森et al .,“谷氨酰胺甲基化在组蛋白H2A RNA-polymerase-I-dedicated修改,“自然,卷505,不。7484年,第568 - 564页,2014年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  68. j . Flach s t,他m . Mohrin et al .,“复制功能衰退的压力是一个强有力的司机在衰老造血干细胞,”自然,卷512,不。7513年,第202 - 198页,2014年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  69. r . Gromadka和j . Rytka”KRR1 18 s rRNA所需基因编码一种蛋白质合成和40 s核糖体亚基组装在酿酒酵母中,“Acta Biochimica Polonica卷,47号4、993 - 1005年,2000页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  70. 迈耶,j .诺尔特l . Opitz g . Salinas-Riester和w·恩格尔,“多能胚胎干细胞和多功能成人揭示生殖系干细胞相似的转录组包括pluripotency-related基因,”人类生殖的分子,16卷,不。11日,第855 - 846页,2010年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  71. s . Luhrig Siamishi, m . Tesmer-Wolf Zechner, w·恩格尔和j·诺尔特,“Lrrc34,小说核仁的蛋白质,与npm1和NCL对多能干细胞产生影响,”干细胞与发展,23卷,不。23日,第2874 - 2862页,2014年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  72. ,即诉Rosado, c .丢在美国Lebaron提示我们m . Caizergues-Ferrer y亨利,和j . de la Cruz”表征的酿酒酵母Npa2p (Urb2p)显示一个包含Dbp6p low-molecular-mass复杂,Npa1p (Urb1p) Nop8p,和Rsa3p参与60年代核糖体亚基生物起源的早期步骤,”分子和细胞生物学,27卷,不。4、1207 - 1221年,2007页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  73. r . y . l .蔡r·d·g·麦凯,“一个多步,GTP-driven机制控制的动态循环nucleostemin,”《细胞生物学》杂志上,卷168,不。2、179 - 184年,2005页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  74. r . y . l .蔡r·d·g·麦凯,”一个核仁的机制控制细胞增殖干细胞和癌症细胞,”基因与发展,16卷,不。23日,第3003 - 2991页,2002年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  75. l . Romanova a .大l . Zhang et al .,“nucleostemin pre-rRNA处理的关键作用,”《生物化学》杂志上,卷284,不。8,4968 - 4977年,2009页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  76. f . v . Fuller-Pace“DExD / H盒RNA解旋酶:多功能蛋白质与转录调节的重要角色,”核酸的研究,34卷,不。15日,第4215 - 4206页,2006年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  77. d·亨宁·r·b·r·金,l·f·刘,和b·c·瓦尔迪兹号”沉默RNA解旋酶II /顾α能抑制哺乳动物的核糖体RNA生产。”《生物化学》杂志上,卷278,不。52岁,52307 - 52314年,2003页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  78. y . r . Lapik c·j·费尔南德斯·l·f·刘,和d . g . Pestov”物理和功能之间的交互Pes1 Bop1哺乳动物核糖体生物起源,”分子细胞,15卷,不。1、17 - 29,2004页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  79. k . Wan y城市,k . Mizuta”Ebp2和核糖体蛋白的角色L36在酿酒酵母的核糖体生物起源,”当前的遗传学,卷61,不。1,31-41,2015页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  80. j .鲁斯j·m·鲁兹s Centoducati r . Sternglanz和w·j . Lennarz”ENP1一个重要基因编码一个高度保守的核内蛋白从酵母到人类,”基因,卷185,不。1,第146 - 137页,1997。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  81. w·陈,j . Bucaria d . a .乐队,a·萨顿和r . Sternglanz”Enp1,酵母蛋白与U3和U14 snorna, pre-rRNA需要处理和40 s亚基合成、”核酸的研究没有,卷。31日。2、690 - 699年,2003页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  82. m·j·斯图尔特和e . k . Nordquist果蝇的是核并显示动态的组织表达在开发期间,“发展基因与进化,卷215,不。2、97 - 102年,2005页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  83. j .盛s .杨许l . et al .,“Bystin作为小说的标志反应性星形胶质细胞在成年鼠大脑受伤后,“欧洲神经科学杂志》上,20卷,不。4、873 - 884年,2004页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  84. m . n .福田m .三好,d . Nadano”的角色bystin在胚胎植入和核糖体生物起源,”细胞和分子生命科学,卷65,不。1,第99 - 92页,2008。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  85. j . van Riggelen a Yetil, d . w . Felsher”MYC核糖体生物起源的调节器和蛋白质合成,“自然评论癌症,10卷,不。4、301 - 309年,2010页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  86. t·佐佐木a Toh-E y .菊池,“酵母Krr1p身体上和功能上与小说基本Kri1p,和所需的蛋白质都是40年代核糖体生物起源的核仁,”分子和细胞生物学,20卷,不。21日,第7979 - 7971页,2000年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  87. A.-C。加文,m . Bosche r . Krause et al .,“功能性组织酵母蛋白质组的系统分析的蛋白质复合物,”自然,卷415,不。6868年,第147 - 141页,2002年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  88. d . Piekna-Przybylska p . Przybylski a . Baudin-Baillieu j . p . Rousset和m·j·弗尔涅”核糖体丰富的集群性能增强的假网站的手指地区的大亚基,”《生物化学》杂志上,卷283,不。38岁,26026 - 26036年,2008页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  89. s Galardi a . Fatica a . Bachi a . Scaloni C . Presutti和i Bozzoni净化箱C / D snoRNPs能够重现特定场地2 -O-methylation靶RNA体外。”分子和细胞生物学,22卷,不。19日,6663 - 6668年,2002页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  90. n·j·沃特金斯和m . t . Bohnsack盒子C / D和H / ACA snoRNPs:关键球员的修改、加工和核糖体RNA的动态折叠,”威利跨学科评论RNA,3卷,不。3、397 - 414年,2012页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  91. w·a·迪凯特和m·j·弗尔涅”,核糖体rna的修改和核糖体功能”,生化科学趋势,27卷,不。7,344 - 351年,2002页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  92. e·a·卡顿·e·k·凯利,r . Kamalampeta和Kothe,“有效的RNA pseudouridylation真核H / ACA核糖核蛋白需要高亲和力绑定和指导RNA的正确定位,“核酸的研究,46卷,不。2、905 - 916年,2018页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  93. r . j . Ontiveros j . Stoute和k·f·刘,“RNA的化学多样性的修改,生物化学杂志,卷476,不。8,1227 - 1245年,2019页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  94. m . r .澳网,s·m·布雷和s t·沃伦”脆性X综合征的分子机制:20年的角度来看,“年度回顾的病理,7卷,不。1,第245 - 219页,2012。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  95. X y和李赵”,简洁的评论:脆性X蛋白干细胞维护和分化,“干细胞,32卷,不。7,1724 - 1733年,2014页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  96. 郭y罗,g, w . et al .,“脆性x智力缺陷蛋白调节成人神经干细胞/祖细胞的增殖和分化,“公共科学图书馆遗传学》第六卷,没有。4篇文章e1000898 2010。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  97. m . telia m·西格尔,d . Ben-Yosef”脆性X的神经分化人类胚胎干细胞显示异常模式的发展尽管成功的神经发生,”发育生物学,卷374,不。1,32-45,2013页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  98. m·金·m·贝里尼,s . Ceman”脆性X智力缺陷蛋白FMRP结合mrna在细胞核,”分子和细胞生物学卷,29号1,第228 - 214页,2009。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  99. m . s . Taha, k .努里·l·g·Milroy et al .,”亚细胞分离和本地化研究揭示出脆性X智力缺陷的直接相互作用蛋白FMRP与nucleolin,”《公共科学图书馆•综合》,9卷,不。第三条e91465, 2014年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  100. 沙玛和d . l . j .拉方丹则”,“从一座桥”:修改真核核糖体rna基地,提供一个新的视角”生化科学趋势,40卷,不。10日,560 - 575年,2015页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  101. m . n . D’索萨n . k . C .高达诉女子et al .,“FMRP与C / D盒snoRNA在细胞核和调节核糖体核糖核酸甲基化,“iScience9卷,第411 - 399页,2018年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  102. e . Chen m·r·沙玛X Shi, r·k·Agrawal,约瑟夫,”脆性X智力缺陷直接绑定到核糖体蛋白调节翻译,“分子细胞,54卷,不。3、407 - 417年,2014页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  103. 沙玛,c . a . Hoeffer y Takayasu指出et al .,“失调mTOR信号在脆性X综合征”,《神经科学杂志》上,30卷,不。2、694 - 702年,2010页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  104. n .翁j·维勒,烟灰墨,e . Berry-Kravis和w·t·格里诺,“早期阶段ERK激活代谢状态的生物标志物在脆性X综合征,”美国医学遗传学杂志B部分:神经遗传学,147 b卷,不。7,1253 - 1257年,2008页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  105. t . g . Lohith e . k . Osterweil m . Fujita k . j . Jenko m·f·贝尔和r·b·英尼斯”metabotropic谷氨酸受体5调节在前额叶皮层在脆性X综合征?”分子自闭症,4卷,不。1,p。2013。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  106. c·格罗斯,m . Nakamoto X姚明et al .,“过剩磷酸肌醇3-kinase亚基合成和活动作为小说在脆性X综合征的治疗目标,“《神经科学杂志》上,30卷,不。32岁,10624 - 10638年,2010页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  107. a·g·赫利,j . Jouralet Brombin et al .,“斑马鱼中脑slow-amplifying祖细胞表现出高水平的成绩单核苷酸和核糖体生物起源”发展,卷140,不。24日,第4869 - 4860页,2013年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  108. 诉烫发,s e . Ghayad s贝林et al .,“p53充当维护平移控制通过调节fibrillarin rRNA甲基化在癌症,”癌症细胞,24卷,不。3、318 - 330年,2013页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  109. R.-W。徐姚,g . y,王et al .,“新生pre-rRNA排序通过相分离驱动人类细胞核致密纤维组件的装配,”分子细胞,卷76,不。5,页767 - 783。e11, 2019年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  110. k·d·h . Wang Boisvert k金,r·金和s . h .金正日“晶体结构fibrillarin同系物的产甲烷球菌属jannaschii,超嗜热菌,分辨率1.6,“在EMBO杂志,19卷,不。3、317 - 323年,2000页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  111. m . y . Shubina y . r . Musinova, e . v . Sheval”扩散、癌症和aging-novel功能核仁的甲基转移酶fibrillarin ?”细胞生物学国际,42卷,不。11日,第1466 - 1463页,2018年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  112. m . y . Shubina y . r . Musinova, e . v . Sheval“核仁的甲基转移酶fibrillarin:结构和功能的进化,”生物化学Biokhimiia,卷81,不。9日,第950 - 941页,2016年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  113. 美国Ramagopal”,盘基网柄菌核糖体:生物化学、分子生物学、和发展的规定,“生物化学和细胞生物学,卷70,不。9日,第750 - 738页,1992年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  114. z史,Barna m。”翻译基因组在时间和空间:专业核糖体RNA调节子,和RNA结合蛋白,”细胞和发育生物学的年度审查没有,卷。31日。1,31-54,2015页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  115. j . e . Gerst“皮条客我的核糖体,核糖体蛋白假字指定平移控制,”遗传学趋势,34卷,不。11日,第845 - 832页,2018年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  116. n . Kondrashov a . Pusic c . r . Stumpf et al .,“Ribosome-mediated特异性Hox mRNA翻译和脊椎动物组织模式,”细胞,卷145,不。3、383 - 397年,2011页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  117. d·勃林格,r . Thermann a . Ostareck-Lederer j·d·刘易斯和h·斯塔克,”结构的C型肝炎病毒IRES绑定到80年代人类核糖体:HCV IRES的改造,“结构,13卷,不。11日,第1706 - 1695页,2005年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  118. c . m . t . Spahn e .简答:穆德,r . a . Grassucci p . Sarnow和j·弗兰克,“低温电子显微镜的可视化病毒内部核糖体进入网站绑定到人类核糖体:IRES函数作为RNA-based翻译因素,”细胞,卷118,不。4、465 - 475年,2004页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  119. i s费尔南德斯x c呗,g . Murshudov s h·w·谢尔和诉Ramakrishnan,“翻译的起始板球麻痹病毒IRES需要易位的核糖体,”细胞,卷157,不。4、823 - 831年,2014页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  120. j . s . Kieft“病毒IRES核糖体RNA结构和交互,”生化科学趋势,33卷,不。6,274 - 283年,2008页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  121. d·伊斯坎德尔b . Psaila g·杰拉德et al .,“说明Diamond-Blackfan贫血的EP缺陷特征和潜在人类EPs的隔离,”,卷125,不。16,2553 - 2557年,2015页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  122. l . Mirabello p p . Khincha s·r·埃利斯et al .,“小说和已知的核糖体Diamond-Blackfan贫血的原因通过综合确定基因组描述,“医学遗传学杂志,54卷,不。6,417 - 425年,2017页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  123. r . horo h . IJspeert d Pospisilova et al .,“核糖体Diamond-Blackfan贫血影响翻译的缺陷记录小鼠和人成红血球细胞分化的关键,”,卷119,不。1,第272 - 262页,2012。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  124. j . a . Ribeil y Zermati, j . Vandekerckhove et al .,“Hsp70调节红细胞生成通过防止caspase-3-mediated GATA-1乳沟,”自然,卷445,不。7123年,第105 - 102页,2007年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  125. v . g . Sankaran r . Ghazvinian, r . et al .,“外显子组测序识别GATA1突变导致Diamond-Blackfan贫血,”《临床研究杂志》上,卷122,不。7,2439 - 2443年,2012页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  126. c, d .藏y金et al .,“核糖体蛋白的突变L21构成遗传口渴单工,”人类基因突变,32卷,不。7,710 - 714年,2011页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  127. c·g·桑切斯·k .特谢拉b .捷克et al .,“监管核糖体生物起源和蛋白质合成控制生殖系干细胞分化,“细胞干细胞,18卷,不。2、276 - 290年,2016页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  128. m .小林,大岛渚,c . Maeyashiki et al .,“泛素混合基因UBA52调节核糖体的泛素化和维持胚胎发育。”科学报告》第六卷,没有。1,第36780条,2016。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  129. m . e . Valk-Lingbeek s w·m·布莱格曼和m .万。娄伊泽,“干细胞和癌症:polycomb连接”,细胞,卷118,不。4、409 - 418年,2004页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  130. a . Sparmann和m .万。娄伊泽”Polycomb消音器控制细胞的命运,发展和癌症,”自然评论癌症》第六卷,没有。11日,第856 - 846页,2006年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  131. a . p和k和蕨类植物、“Polycomb组蛋白质:航海家传承途径引入歧途的癌症,”自然评论癌症,9卷,不。11日,第784 - 773页,2009年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  132. y荣格和j . a . Nolta BMI1监管人类间充质干细胞的自我更新和multipotency”目前干细胞研究和治疗,11卷,不。2、131 - 140年,2016页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  133. m . Ganapathi n . c, c . Charniga et al .,“Bmi1过表达对基因表达的影响在成人和胚胎小鼠神经干细胞,”科学报告,8卷,不。1,第7464条,2018。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  134. r·高,陈,m .小林et al .,“Bmi1促进红细胞通过调节核糖体生物起源、发展”干细胞,33卷,不。3、925 - 938年,2015页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  135. p . Jaako j . Flygare k·奥尔森et al .,”老鼠核糖体蛋白S19缺乏开发Diamond-Blackfan贫血患者骨髓衰竭和症状,”,卷118,不。23日,第6096 - 6087页,2011年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  136. d . w .年轻,m .问:哈桑,j·普拉塔普et al .,“有丝分裂入住率和lineage-specific转录控制核糖体rna基因由Runx2。”自然,卷445,不。7126年,第446 - 442页,2007年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  137. g . Juban g . Giraud b平顶山et al .,“Spi-1和共同目标Fli-1直接激活基因参与朋友erythroleukemic核糖体生物起源细胞,”分子和细胞生物学卷,29号10日,2852 - 2864年,2009页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  138. d·贝克j . a . i托马斯·d·佩雷拉et al .,“全基因组转录监管机构在人力公司的分析揭示了一个密集的互联网络编码和非编码基因,”,卷122,不。14日,pp. e12-e22, 2013年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  139. c . v .见鬼。”MYC道路上的癌症,”细胞,卷149,不。1,22-35,2012页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  140. 黄m . Yu t . Mazor h . et al .,“直接招聘polycomb专制复杂的1到染色质核心结合转录因子,”分子细胞,45卷,不。3、330 - 343年,2012页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  141. a•萨瑟和r . Nawroth针对mTOR / PI3K / AKT通路在膀胱癌,”分子生物学方法卷,1655年,第350 - 335页,2018年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  142. 李x c .吴n . Chen等人“mTOR / PI3K / Akt信号通路和胶质母细胞瘤的靶向治疗,”Oncotarget,7卷,不。22日,第33450 - 33440页,2016年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  143. a . s . Alzahrani”PI3K / Akt / mTOR癌症:在板凳上和床头,“在癌症生物学研讨会59卷,第132 - 125页,2019年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  144. 马特利l . m .内里,a . Cani a . m . et al .,“针对mTOR / PI3K / Akt信号通路在B-precursor急性淋巴细胞白血病及其治疗的潜力,”白血病,28卷,不。4、739 - 748年,2014页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  145. w·张,g .冯·l·王et al .,“MeCP2缺乏促进细胞重编程通过刺激IGF1 / AKT / mTOR信号和激活核糖体protein-mediated细胞周期基因翻译,“分子细胞生物学杂志》上,10卷,不。6,515 - 526年,2018页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  146. h . Nojima c . Tokunaga s江et al .,“哺乳动物雷帕霉素靶(mTOR)伙伴,猛禽,将mTOR基质p70 S6激酶和4 e - bp1通过TOR信号(TOS)主题,“《生物化学》杂志上,卷278,不。18日,第15464 - 15461页,2003年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  147. n席迪圭和n . Sonenberg”信号eIF4E癌症。”生化社会事务,43卷,不。5,763 - 772年,2015页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  148. 张秦x、b .江和y,“4 e - bp1,多因素调控多功能蛋白质,”细胞周期,15卷,不。6,781 - 786年,2016页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  149. b . Magnuson b Ekim, d . c . Fingar”监管和核糖体蛋白S6激酶功能(S6K) mTOR信号网络,”生物化学杂志,卷441,不。1、21、2012页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  150. m·r·塔瓦雷斯。c . b .孔雀舞,c·l·阿马拉尔l . Meneguello公元Luchessi,和f . m . Simabuco”S6K蛋白家族在健康和疾病,”生命科学卷,131年,页1 - 10,2015。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  151. Maeda m .村上t . Ichisaka m . et al .,“mTOR是至关重要的对经济增长和扩散早期小鼠胚胎,胚胎干细胞”分子和细胞生物学,24卷,不。15日,第6718 - 6710页,2004年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  152. k .高桥、m .村上春树和美国Yamanaka”的角色磷酸肌醇3-kinase途径在小鼠胚胎干细胞(ES)细胞,”生化社会事务,33卷,不。6,1522 - 1525年,2005页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  153. a . Bulut-Karslioglu s Biechele h·金et al .,“抑制mTOR诱发暂停多能状态,”自然,卷540,不。7631年,第123 - 119页,2016年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  154. t·c·j . Granier w . Wang曾荫权et al .,“有条件的失活PDCD2诱发p53活化和细胞周期阻滞,”开放杂志,3卷,不。9日,第831 - 821页,2014年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  155. w .μ,r·j·门罗a·k·巴克和j·c . Schimenti”PDCD2内细胞团发展是至关重要的,胚胎干细胞的维护,“发育生物学,卷347,不。2、279 - 288年,2010页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  156. j·克莱默,c . j . Granier美国戴维斯et al .,“PDCD2控制造血干细胞分化在开发期间,“干细胞与发展,22卷,不。1,58 - 72、2013页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  157. n .客观的s . Minakhina d·j·梅迪纳et al .,“PDCD2在癌症细胞增殖和功能预测复发白血病,”癌症生物学和治疗,14卷,不。6,546 - 555年,2014页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  158. Minakhina和r .管家,“造血干细胞在果蝇。”发展,卷137,不。1,第27 - 31页,2009。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  159. a . m . Burroughs和l . Aravind”分析小说的两个域RNA加工活动点明了核糖体RNA生物起源的复杂演变,“遗传学前沿,5卷,p。424年,2014年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  160. s . Minakhina t . Naryshkina n . Changela w . Tan和r .管家,“Zfrp8 / PDCD2与RpS2连接核糖体成熟和gene-specific翻译,“《公共科学图书馆•综合》,11卷,不。1,文章e0147631, 2016。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  161. j . Rabl m . Leibundgut s . f . Ataide a . Haag和联合国禁令,“40年代真核核糖体亚基的晶体结构复杂的起始因子1,“科学,卷331,不。6018年,第736 - 730页,2011年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  162. b·s·斯特伦克c·r·劳克斯·m·苏et al .,“核糖体装配因素防止过早翻译起始到40年代组装中间体,”科学,卷333,不。6048年,第1453 - 1449页,2011年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  163. l . Wan t . c . Dockendorff t . a . Jongens和g .更有“dFMR1表征,黑腹果蝇同族体脆性X智力迟钝的蛋白质,”分子和细胞生物学,20卷,不。22日,第8547 - 8536页,2000年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  164. w . Tan c . Schauder t . Naryshkina s Minakhina r .管家,“Zfrp8与脆性x智力缺陷形成一个复杂的蛋白质和调节它的定位和功能,“发育生物学,卷410,不。2、202 - 212年,2016页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  165. b . Bardoni r . Willemsen i j·维勒et al .,“NUFIP1(核FMRP相互作用蛋白1)是核质穿梭与活跃synaptoneurosomes相关蛋白质,”实验细胞研究,卷289,不。1,第107 - 95页,2003。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  166. S.-T。Mullineux和d . l . j .拉方丹则映射在哺乳动物pre-rRNAs乳沟网站:我们处在什么位置?”Biochimie,卷94,不。7,1521 - 1532年,2012页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  167. o . Esakova和a . s . Krasilnikov”的蛋白质和RNA:核糖核酸酶P / MRP的家庭,”核糖核酸,16卷,不。9日,第1747 - 1725页,2010年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  168. h . Gingold d . Tehler n . r . Christoffersen et al .,“双重计划翻译调节细胞增殖和分化,“细胞,卷158,不。6,1281 - 1292年,2014页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  169. 即Topisirovic和n . Sonenberg”独特的tRNA体验增殖与分化细胞,”细胞,卷158,不。6,1238 - 1239年,2014页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  170. k .高桥和美国Yamanaka”诱导多能干细胞从小鼠胚胎和成年纤维母细胞的文化因素,定义”细胞,卷126,不。4、663 - 676年,2006页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  171. m . Stadtfeld k . Hochedlinger,“诱导多能性:历史、机制和应用,“基因与发展,24卷,不。20日,第2263 - 2239页,2010年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  172. t·马·m·谢·t·劳伦,叮,“进步体细胞重编程的,”循环研究,卷112,不。3、562 - 574年,2013页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  173. 美国胡锦涛和g .山”LncRNAs干细胞。”干细胞国际卷,2016篇文章ID 2681925、8页,2016。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  174. l . s . Zhang y Wang贾et al .,“分析长非编码RNA相互作用网络监管元素的目标基因染色质原位反转录测序,”基因组研究卷,29号9日,第1532 - 1521页,2019年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  175. l . c . Wang, y王et al .,“全基因组交互目标分析揭示了一个novelPeblr20-eRNA激活通路控制干细胞多能性,”开展,10卷,不。1,第370 - 353页,2020。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索

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