的重量HLA-DPA1 rs3077单核苷酸多态性在前列腺癌多中心研究

文摘

前列腺癌(PCa)几乎最高的基因传播,模仿一个常染色体显性遗传的癌症在一些家庭模式。其发病率在阿拉伯国家稳步增加。目的。确定的相关性HLA-DPA1 rs3077 (A / G)单核苷酸多态性与前列腺癌的风险和/或严重程度。对象和方法。四十PCa患者和40岁与良性前列腺增生(BPH)患者作为对照组,进行这项研究。血清尿素、肌酐、总前列腺特异性抗原(PSA)和自由PSA测定。PSA比值确定。基因分型的HLA-DPA1 rs3077 (A / G) SNP是使用实时聚合酶链反应完成的。结果。实验室测量参数,除了免费的PSA,病人要显著高于PCa相比,控制( )。此外,PSA比值显著高PCa患者( )。HLA-DPA1 rs3077 GG基因型在PCa更频繁的患者和相关或为2.546 ( ),AA基因型频率在对照组和相关的或者是0.145 ( )。PCa患者G等位基因频率高于对照组,而等位基因频率明显下降( )(保护等位基因)。在多变量分析,之间没有显著相关性发现HLA-DPA1 rs3077 SNP和PSA比值(或= 4.5,95% CI -17.4 = 1.2, )。结论。HLA-DPA1 rs3077 G等位基因可能是前列腺癌的危险因素。然而,HLA-DPA1 rs3077 SNP PCa严重程度没有关系。

1。背景

前列腺癌(PCa)被认为是成年男性(最常见的肿瘤之一1]。诊断通常是在晚期转移和治疗耐药肿瘤细胞的出现反过来带来高死亡率(2]。

PCa的发病机制是多因素包括遗传、激素和环境因素(3]。在这种背景下,全基因组关联研究(GWAS)已经确定了几个主成分分析在7 . 3和18 p11.22易感基因。这些基因多态性可以解释部分的遗传病因PCa (1]。

人类白细胞抗原(HLA)等位基因发挥关键性的作用,激活免疫细胞,负责清除肿瘤细胞。它可能是一个重要遗传主机属性(4,5]。伟大的变化在HLA基因鼓励研究人员研究HLA基因变异的作用在许多疾病4- - - - - -6]。我们已经对HLA单核苷酸多态性之间的关系进行研究和不同的疾病,如乳腺癌(BC),乙型肝炎病毒(HBV)和丙型肝炎病毒(HCV) (6- - - - - -8]。结果是有争议的,我们发现重大关联HLA-DP1 rs3077公元前AA基因型和风险(或= 4.5,95% CI -17.4 = 1.2, ),并没有发现协会之间的hla dq rs3920和公元前6]。然而,HLA单核苷酸多态性的相关性和PCa尚不清楚。因此,本研究旨在确定的意义HLA-DPA1 rs3077 (A / G)单核苷酸多态性与前列腺癌的风险和/或严重程度。

2。参与者和方法

2.1。研究设计

这个病例对照多中心研究招收了80名参与者参加泌尿科,王子Mutaab本医院作为礼尚往来,Sakakah, Kafrelsheikh大学医院。参与者被分为2组:第1组包括40病理确诊的恶性肿瘤患者的PCa和组2包括40良性前列腺增生(BPH)患者作为对照组。排除标准包括二级PCa、肝代谢失调,肾功能衰竭。

2.2。样品收集

5毫升血液样本被收集在平原管(3毫升血清分离)和EDTA管(2毫升的DNA提取)。

2.3。临床评价

登记患者临床评估由历史考试,包括直肠指诊(DRE)和国际前列腺评分系统(入侵)。病人PSA高于4 ng / ml受到经直肠超声(TRUS)和活组织检查使用标准的6芯。此外,TRUS有助于实现前列腺体积。分级的病理结果阐述了利用格里森评分分数(9]。

2.4。生化研究

血清尿素、肌酐、总前列腺特异性抗原(PSA)和自由为所有参与者PSA测定。PSA比值(free-to-total PSA)决定。

2.5。基因分型的HLA-DPA1 rs3077 SNP (A / G)

DNA提取血液样本在EDTA管使用QIAamp-spin列(QIAamp DNA血液迷你工具,应用生物系统公司,生活技术,加利福尼亚,美国)根据制造商的指示。评估后DNA纯度和浓度使用nanodrop光谱仪,样本进行PCR的歧视HLA-DPA1 rs3077 (A / G)基因型,使用实时PCR (StepOne®实时PCR、应用生物系统,生活技术,卡尔斯巴德,加利福尼亚,美国)。聚合酶链反应管,2μ1.25 l基因组DNAμl TaqMan SNP基因分型检测,12.5μl TaqMan PCR大师混合,和9.25μl DNase-free水混合(8]。反应体积25岁μ热循环仪l和条件调整为95°C 10分钟,40 92°C的周期15秒,1分钟60°C, 72°C,持续30秒,然后最后一个在72°C扩展了7分钟。结果分析是根据维克染料的增加意味着野生等位基因的纯合性(HLA-DPA1 rs3077 AA),增加FAM染料表明突变等位基因的纯合性(HLA-DPA1 rs3077 GG),如果这两种荧光信号增加,这表明杂合性(HLA-DPA1 rs3077 AG) (8]。

2.6。数据的统计分析

数据被喂以计算机和分析使用IBM SPSS软件包版本20.0(纽约阿蒙克:IBM公司)。Kolmogorov-Smirnov正常测试用于检查是否正态分布变量。对比组为分类变量使用卡方检验进行评估。学生的t以及被用来比较两组正态分布定量变量,Mann-Whitney测试是用于异常分布的定量变量;研究了两组之间的比较,优势比(或)是用来计算的几率和95%置信区间的比例风险事件发生在一个集团的可能性发生在nonrisk集团哈迪温伯格。的人口研究样本研究发现其与哈迪温伯格平衡方程。结果的意义被认为在5%的水平。

3所示。结果

3.1。人口统计学和临床资料

受试者的人口和临床数据表中所示1。没有关于年龄研究组之间的任何统计上的显著差异( )。然而,PCa患者前列腺体积明显增加与良性前列腺增生相比对照组( )。

主成分分析病人的病史显示,82.5%的病人没有遭受任何慢性疾病,7.5%是高血压,糖尿病,2.5% 2.5%的肝纤维化,5%有肾病。而对于对照组,82.5%是正常的,10%是高血压,7.5%有肾病。没有任何统计差异研究组织( )。

外科PCa病人的历史显示,87.5%的患者正常,手术去除尿石10%,2.5%有心内直视手术。而对于对照组,95%是正常的,5%有石头手术。没有任何统计差异研究组织( )。

3.2。生化研究

的平均血清尿素、肌酐、总PSA, PSA比值(free-to-total PSA)显著增加PCa患者相比,对照组( )(表1)。格里森评分的PCa患者澄清,35.1%是年级的我,8.1%是二级,13.5%是三级,32.4%是四年级,10.8%是年级V。

3.3。HLA-DPA1 rs3077 SNP (A / G)

HWE做是为了检查任何可能的偏差内所有参与者在研究基因型频率和没有观察到的偏差( )。

等位基因歧视的HLA-DPA1 rs3077 SNP澄清,GG基因型的频率更高的PCa患者与对照组相比(42.5% vs . 22.5%; )和优势比(或;95% CI)为2.546 (0.964 - -6.726)。然而,AA基因型的频率明显高于对照组与PCa相比,患者(15% vs . 2.5%; )和优势比(或;95% CI)为0.145 (0.017 - -1.268)。比较基于等位基因显示PCa患者G等位基因频率显著高于对照组(70%比53.8%; )和更高的频率等位基因与PCa相比对照组患者(46.3% vs . 30%; )。因此,有统计上显著的增加HLA-DPA1 rs3077 G等位基因PCa患者和一个等位基因控制( )(表2)。

相关分析PSA比值和PCa组不同基因型之间没有任何明显的协会( )(表3)。

4所示。讨论

前列腺癌被声明的最高程度的基因传播与建议来模仿一个常染色体显性遗传模式在一些家庭10]。

在阿拉伯世界,PCa发病率在黎巴嫩的范围在5.5%在沙特阿拉伯和39.2%之间(11]。然而,据报道发病率和死亡率稳步增加由于知识和态度差PCa检查和筛选方法。

GWAS四种群进行了解遗传变异的贡献在PCa外显率(1]。他们报告说,一些SNP-SNP互动参与癌症恶化通过调节基因的表达或附近的基因的蛋白质。因此,存在多种风险等位基因预测比一个等位基因。另一项研究报道,单核苷酸多态性赋予PCa的风险累积发展(12]。

此外,众所周知,肿瘤免疫监视失败时出现和HLA系统中扮演着重要的角色在这个监视通过激活辅助细胞和细胞毒性T淋巴细胞(CTL)对肿瘤抗原(13,14]。据报道,HLA二类分子的改变相关癌症和转移进程的发展。人继承高度多态的特定等位基因HLA二类(DP、DQ或DRB)基因增加了患癌症的风险,子宫颈(5和乳房6,15),由于改变免疫监视。然而,他们在PCa的角色还不清楚。

HLA-DPA1 rs3077 SNP位于(3′UTR)的3′端非翻译区基因。因此,它没有HLA-DPA1蛋白质结构和功能的作用。然而,这个SNP可能影响转录、加工,稳定,或翻译HLA-DPA1信使rna,它可能影响转录、加工、稳定,或翻译HLA-DPA1 mRNA (16]。

目前的研究旨在评价的相关性HLA-DPA1 rs3077 (A / G) SNP PCa和/或严重风险。结果阐明,HLA-DPA1 rs3077在GG基因型频率PCa患者和相关或为2.546(0.964 - -6.726),表明人携带这种基因型在2.5开发PCa风险更高。这是确认在基因层面上为G等位基因的频率PCa患者高于对照组,而等位基因频率明显降低PCa患者( )(保护等位基因)。相关分析PSA比值和PCa组不同基因型之间没有任何明显的联系这个SNP的PCa和严重程度( )。同意这项研究中,江et al。5)基因分型HLA-DP (rs3077和rs9277535)和hla dq (rs2856718和rs7453920) SNP,发现一致关系HLA-DP rs3077和宫颈癌的风险。他们报道HLA-DP rs3077作为候选人的宫颈癌易感性标记的中国女性。

这些结果符合许多研究人员发现统计上显著的癌症风险之间的联系和HLA-DP rs3077多态性(5,6,17- - - - - -19]。HLA-DP rs3077和rs9277535报道作为中国女性宫颈癌易感性标记(5]。Ghazy et al。6)发现重大关联HLA-DP1 rs3077 AA基因型和乳腺癌的风险。Zhang et al。17)调查之间的关系HLA-DP rs3077和对肝细胞癌(HCC)乙型肝炎病毒感染的患者。他们注意到重要的协会与肝癌易感性rs3077亚洲人口。贾et al。18)认为,人类白细胞抗原(HLA)可能是宫颈癌易感性的等位基因可能会导致女性感染人乳头瘤病毒(HPV)。他们发现HLA-DP rs3077 SNP与子宫颈癌的风险显著相关(或= 1.37,95% CI -1.80 = 1.04)。曹et al。19)调查之间的关系HLA-DP / DQ SNP和急性髓系白血病(AML)的风险。他们有基因分型HLA-DP (rs3077 G和rs9277535 G > >)和hla dq (rs2856718 > G和rs7453920 G >)在使用实时PCR病例对照研究。他们发现重要的AML风险增加之间的关联和HLA-DP (rs3077和rs9277535) SNP。他们建议HLA-DP敏感性和hla dq基因座等位基因在AML汉族。

另一方面,一些研究人员发现了一个重要的乳腺癌之间缺乏联系和南部HLA-DQA1台湾女性(4]。廖et al。20.)进行荟萃分析评价HLA-DP / DQ SNP和肝癌之间的关系发展。然而,没有发现肝癌发展协会(主导模式、rs3077或= 0.86,95% CI -1.18 = 0.62)。程等人报道,HLA-DP rs3077 SNP与子宫颈癌的风险没有显著相关性在中国人口21]。

这些差异结果可能归因于全球PCa异质性(12],SNP的位置[22)或研究人口的种族,种族起源与遗传因素密切相关的主成分分析(9,12]。限制我们的研究是小样本大小,这是由于较低的疾病负担在我们的位置。

5。结论

HLA-DPA1 rs3077 G等位基因可能是一个风险因素PCa等位基因时保护的发展。然而,HLA-DPA1 rs3077 SNP PCa严重程度没有关系。进一步验证研究大规模不同种族的生物功能的分析是必要的。

数据可用性

所有的数据是可用的通讯作者。

伦理批准

这项研究符合伦理指南1975年赫尔辛基宣言。协议是医学院伦理委员会批准,Kafrelsheikh大学埃及。没有风险的参与者和所有签署了知情同意写的。

的利益冲突

作者都没有任何利益冲突声明。

作者的贡献

Amany和默罕默德计划研究。默罕默德和Diaa收集样品和病人的临床评价。Amany表现实验室工作。所有作者都在统计分析、写作和修改手稿。

确认

作者展示他们伟大的升值EPCRS卓越中心(根据ISO 9001认证、ISO 14001和18001年纪录)和植物病理学和生物技术实验室(根据ISO 17025认证),埃及农业Kafrelsheikh大学系。中心给他们访问执行实时PCR在那里工作。

引用

1. 李j .沈z z的歌,j . Chen和y .史,“全基因组two-locus交互分析确定多个上位SNP对带来的风险前列腺癌:cross-population的一项研究中,“国际癌症杂志》上,卷140,不。9日,第2084 - 2075页,2017年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
2. m·阿彻:多格拉人,n .基普里亚努”炎症前列腺癌转移的司机和治疗抵抗,“癌症,12卷,不。10,2984年,页2020。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
3. d . p .阮、j·李和a·k·特瓦芮“炎症和前列腺癌:白介素6 (il - 6)的作用,”国际现代泌尿外科杂志,卷113,不。6,986 - 992年,2014页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
4. p c . Chen e·m·蔡t . k .呃,s . j . Chang和b·h·陈,“HLA-DQA1和-DQB1等位基因类型在台湾南部妇女患有乳腺癌,”临床化学和实验室医学,45卷,不。5,611 - 614年,2007页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
5. j .江:李,y沈et al .,“在HLA-DP / DQ基因变异导致子宫颈癌的风险:一个两阶段的研究在中国女性,”妇科肿瘤,卷129,不。2、401 - 405年,2013页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
6. 答:a . Ghazy n·m·El-Etreby, r . r . Abdelwahed”的角色HLA-DP / DQ单核苷酸多态性在乳腺癌,”磁共振成像杂志》上21卷,1 - 8,2014页。视图:谷歌学术搜索
7. a . Ghazy a . El-Sheredy k . Al-Din m . Khatab z .任,“IP-10水平的影响和HLA-DP / DQ多态性在应对核苷/核苷酸类似物治疗埃及乙肝患者,”英国微生物学研究杂志,13卷,不。4、1 - 11,2016页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
8. a . a . Ghazy t Haydara, d . Farooq e·h·Nadwa h·a·Ghazy和阿米尔,“关系HLA-DP / DQ多态性,血清IP-10和响应之间的直接作用抗病毒治疗丙肝病毒感染的病人,”埃及免疫学杂志,27卷,不。1,第185 - 177页,2020。视图:谷歌学术搜索
9. l . Egevad m·b·阿明Delahunt b . j . r . Srigley p·a·汉弗莱和分级委员会,“2014年国际泌尿病理学协会(ISUP)前列腺癌的共识会议格里森评分:分级的定义模式和建议一个新的评分系统,”美国外科病理学杂志》上,40卷,不。2、244 - 252年,2016页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
10. h·t·林奇,o . Kosoko-Lasaki s . w . Leslie et al .,“家族和遗传筛查前列腺癌,”国际癌症杂志》上,卷138,不。11日,第2591 - 2579页,2016年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
11. m·a·Arafa和d . m . Rabah”,增加前列腺癌的趋势在沙特阿拉伯和阿拉伯世界:我们应该开始筛查项目?”世界临床肿瘤学杂志》上,8卷,不。6,447 - 449年,2017页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
12. d .曹c .顾d .你们戴,和y朱,“PCA3 rs544190G >和前列腺癌的风险在一个中国东部的人口,”巴西国际泌尿学杂志》上,44卷,不。3、500 - 505年,2018页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
13. a . Hamai h . Benlalam f . Meslin et al .,“人类癌症的免疫监视:如果细胞毒性t淋巴球玩音乐,tumoral系统发号施令吗?”组织抗原,卷75,不。1,1 - 8,2010页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
14. s . k .不丹人、s . k . Mallick和t . k . Maiti“肿瘤逃逸机制及其治疗影响肿瘤治疗相结合,“细胞生物学国际,34卷,不。5,553 - 563年,2010页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
15. 杨x x, z h .锅,p . y .李et al .,“中国乳腺癌患者HLA II级变异,”亚洲太平洋癌症预防杂志》:APJCP,12卷,不。11日,第3079 - 3075页,2011年。视图:谷歌学术搜索
16. t·r·奥布莱恩Kohaar, r·m·普费弗et al。”慢性乙型肝炎与降低相关联的风险等位基因mRNA的表达HLA-DPA1 HLA-DPB1在正常的人类肝脏,”基因和免疫,12卷,不。6,428 - 433年,2011页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
17. 周x张c .郑z h . et al .,“关系HLA-DP基因多态性与肝细胞癌的风险:一个荟萃分析,“遗传学和分子研究,14卷,不。4、15553 - 15563年,2015页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
18. m·贾j .汉d挂et al .,“HLA-DP是女性宫颈癌易感性位点被高危人乳头瘤病毒感染:人类papillomavirus-positive女性的潜在含义分流,”肿瘤生物学,37卷,不。6,8019 - 8025年,2016页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
19. 曹,吴y、x钱和h·马”在HLA-DP / DQ基因变异导致急性髓系白血病的风险:一项病例对照研究,“Pathology-Research和实践,卷216,不。3,p。152829年,2020年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
20. 廖y, b . Cai, y李et al .,”协会HLA-DP / DQ和STAT4多态性与乙型肝炎病毒感染的结果和一个迷你荟萃分析,“《公共科学图书馆•综合》,9卷,不。11日文章ID e111677, 2014。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
21. y l . Cheng郭、美国詹·夏”HLA-DP基因多态性与宫颈癌风险:一个荟萃分析,“生物医学研究的国际卷。2018年,1-13,2018页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
22. y钱,l, m . Cai et al .,“前列腺癌风险变异rs55958994调节多个基因表达通过极端远程染色质交互控制肿瘤进展,”科学的进步,5卷,不。7篇文章ID eaaw6710 2019。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索

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