文摘
肝细胞癌(HCC)是最常见的恶性肿瘤之一,造成严重的经济负担。本研究旨在调查潜在的机制导致肝癌和识别核心生物标志物。肝细胞癌基因表达谱GSE41804挑出分析差异表达基因(度)。基因本体论(去)和基因和基因组的京都百科全书(KEGG)进行了分析使用大卫。我们建造了一个(PPI)蛋白质间交互作用网络可视化交互度的。这些中心的生存分析基因对肝癌进行评估其潜在的影响。在这个分析中,503度被抓获(360和143年调节基因表达下调基因)。与此同时,15个中心基因被确定。去分析表明,氧化应激的度主要是丰富,细胞周期,细胞外结构。KEGG分析建议吸收富集度,新陈代谢和细胞周期通路。 PPI network disclosed that the top3 modules were mainly enriched in cell cycle, oxidative stress, and liver detoxification. In conclusion, our analysis uncovered that the alterations of oxidative stress and cell cycle are two major signatures of HCC. TOP2A, CCNB1, and KIF4A might promote the development of HCC, especially in proliferation and differentiation, which could be novel biomarkers and targets for diagnosis and treatment of HCC.
1。介绍
原发性肝癌,第六个最常见的癌症,导致癌症死亡的第二大数量世界各地。肝细胞癌(HCC)是一个主要的原发性肝癌,占大约90%的所有类型的原发性肝脏恶性肿瘤和引发重大国际公共卫生问题1]。肝癌的发病机制是一个多步过程涉及的渐进积累基因改变,确定各种细胞和分子事件包括氧化应激、内质网应激、细胞周期异常(2]。氧化应激,例如,活性氮物种的增加产量(RNS)或活性氧(ROS),除了降低抗氧化防御,可以加速肝细胞癌的进展。更具体地说,氧化应激损伤影响的基因表达的细胞生存的产品可以促进正常细胞的增殖和分化,最终导致细胞凋亡的减少甚至肿瘤细胞的形成(3]。
伟大的研究披露,肝细胞癌的肿瘤发生和发展涉及的突变和异常表达和基因,包括表皮生长因子受体(EGFR) [4),细胞周期蛋白D1 (CCND1) [5],FoxQ1 [6),原癌基因(7),以及一些肿瘤抑制基因的突变。然而,在诊所,血清检测甲胎蛋白(AFP)、磁共振成像(MRI),或动态计算机断层扫描(CT)扫描的传统方法是肝细胞癌的诊断和治疗。缺乏辅助检查的特异性生物标志物,因此医生很难实现尽早准确的肝细胞癌的诊断和治疗,有些患者错过了最佳手术的机会,从而增加死亡的风险(8]。因此,识别特定的和敏感的生物标志物可以美国助理确认患者以更低或更高的风险死于肝癌具有重要意义,不仅对更精确的诊断,优化治疗,和更好的预后,也为全面了解参与致癌作用的细胞和分子机制。
最近采用的高通量基因微阵列分析肿瘤和正常的病人和健康人样本让我们分享和探索全球分子肿瘤在不同层次的景观从体细胞突变和拷贝数改变基因组水平的基因表达在转录组水平,以及表观遗传变化(9- - - - - -11]。然而,微阵列在临床上的应用在很大程度上是有限的,因为无数的基因识别的基因分析,缺乏独立的验证和可重复性,以及复杂的统计分析。把这些表达谱尽快在临床实践中,有必要确定一个合适的基因和开发一个适当的方法可以由常规化验。
在这项研究中,我们从基因表达综合下载GSE41804(地理,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/),并利用GEO2R在线工具,全面识别差异表达基因(度)。随后,我们建立了蛋白质相互作用(PPI)网络的度和选择了前15名中心基因高度连接性。此外,我们分析了基因本体包括生物过程(BP)、分子功能(MF),细胞组件(CC)和KEGG度的途径。此外,我们构建的三个模块和验证他们的强化途径。与此同时,前15名的总生存期(OS)分析中心的基因进行了基于基因表达分析交互式分析在线数据库(http://gepia.cancer-pku.cn/)。最后,我们选择3基因进一步确定相关通过比较3基因及其蛋白表达水平在肿瘤和正常组织基于人类的蛋白质图谱数据库(http://www.proteinatlas.org)。
2。材料和方法
2.1。微阵列数据
我们下载的基因表达谱GSE41804从GEO数据库,这是一个自由和公开的数据库。GSE41804数据集共有40个样本,包含20名肝癌样本和20名正常肝组织,这是基于安捷伦GPL570平台(2.0 [HG-U133_Plus_2] Affymetrix人类基因组U133 +数组)两翼et al。我们也下载了系列的GSE41804矩阵文件地理数据库。
2.2。屏幕上的差异表达的基因
肝癌样本之间的差异表达基因(度)和正常肝脏样本分析使用GEO2R (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/),一个交互式的在线分析工具对于地理数据库,基于R语言。我们度定义为差异表达 (调节基因)或 (表达下调的基因),根据描述的标准(12,13]。的调整值< 0.05被认为具有统计学意义,用来降低假阳性率。然后,503度被发现,其中包括360年调节基因和143个表达下调基因,我们选择了前15基因与高度的连接枢纽基因。
此外,我们使用视觉层次聚类分析显示两组的热图和火山情节ImageGP (http://www.ehbio.com/ImageGP/index.php/Home/Index/index.html后的相对原始数据TXT文件被下载。
2.3。基因本体论和KEGG度的途径分析
基因本体论(去)分析可以注释基因和他们的产品涉及细胞的功能组件,分子功能,以及生物学途径(14]。基因和基因组的京都百科全书(KEGG)是一家集数据库能够处理基因组和生物通路相关的疾病和药物。KEGG本质上是资源的全面了解生物系统和一些高级的基因组功能信息15]。数据库的注释,可视化和综合发现(大卫,http://david.ncifcrf.gov)(6.7版)是一个在线生物信息数据库,集成了大量的生物数据和相应的分析工具,从而提供系统全面的生物功能注释信息高通量基因表达(16]。 被视为与统计截止标准不同。可视化的关键分子功能,生物过程,细胞组件,以及度的途径,生物分析是由大卫在线数据库。
2.4。PPI网络和模块分析
检索的搜索工具相互作用基因(字符串)是一个在线工具,旨在评估和整合(PPI)蛋白质间交互作用的信息,如物理和功能关联。到目前为止,共有9643763个蛋白质从2031年生物覆盖在字符串版本10.0 (17)来评估这些度的相互影响的关系,我们首先吸引度的软件构建一个字符串,然后利用Cytoscape PPI网络。与此同时,我们设置的最大数量 和信心 切断标准。此外,复杂的分子检测(MCODE)应用程序也被用来选择模块的PPI网络Cytoscape根据节点评分 、学位 ,马克斯。 , 。基因的途径分析的三个模块进行了基于大卫,分别。同时,15个中心基因映射到字符串根据的信心 和最大数量的 。我们也使用和KEGG通路分析调查他们潜在的信息。
2.5。比较基因表达水平的中心
GEPIA (http://gepia.cancer-pku.cn/index.html)是一种新开发的交互式web服务器设计的Zefang Tang Chenwei李和张勃喜康实验室,北京大学,旨在分析RNA序列表达数据9736肿瘤和8587 TCGA正常样本和GTEx项目,使用一个标准的处理管道。GEPIA提供可定制的功能,比如肿瘤/正常的微分表达式分析,分析根据癌症或病理阶段,患者生存分析,类似的基因检测,相关分析和降维分析(18]。在我们的研究中,我们主要使用箱线图形象化的表达基因在肝细胞癌和正常肝组织中心。然后我们选择两个可疑的基因在散点图中分析其相关性。人类的蛋白质图谱(HPA,https://www.proteinatlas.org/)是一个瑞典项目发起于2003年,目的是将所有的人类蛋白质在细胞,组织和器官使用集成的各种组学技术,包括免疫抗体成像质量spectrometry-based蛋白质组学、转录组和系统生物学(19]。通过收购或没有HCC患者免疫组织化学数据HPA的基础上,我们进一步验证这些中心基因的表达。
2.6。生存分析中心的基因
无复发和总生存信息是基于GEPIA数据库。的风险比(人力资源)和95%的置信区间和logrank值计算并显示在图。 被认为是具有统计学意义。
2.7。基因集富集分析
20 GSE41804肝癌样本分为两组(高与低)根据CCNB2的表达水平,和中值表达式值被认为是分界点。为了调查CCNB2的势函数,GSEA (http://software.broadinstitute.org/gsea/index.jsp)两组之间进行。c2.cp.kegg带注释的基因集。v5.2.symbols。日格林尼治时间c2.cp.bp集。v5.2.symbols。日格林尼治时间c2.cp.mf集。v5.2.symbols。格林尼治时间,c2.cp.cc集。v5.2.symbols。格林尼治时间被选为参考基因集。 ,|浓缩的分数 和基因 被认为是截止条件。
2.8。Reidentification肝细胞的氧化应激
进一步验证在肝细胞氧化应激的至关重要的作用,我们发现一些典型的水平标记在癌组织和邻近组织获得6肝癌患者。超氧化物歧化酶(SOD)、丙二醛(MDA)、谷胱甘肽过氧化物酶(氧化酶)测定使用分析工具(Beyotime,中国)根据标准操作流程。与此同时,NADPH的mRNA水平P67和gp91也以癌组织和邻近组织。此外,SOD的蛋白表达,4-hydroxynonenal (4-HNE),用免疫印迹和p65也量化。免疫组织化学染色法进一步验证4-HNE在癌组织的表达和邻近组织。这项研究是按照法律的要求和支持武汉大学人民医院的伦理委员会。
2.9。统计分析
所有值的 。所有通过SPSS 19.0软件进行统计分析。的差异 被认为是具有统计学意义。
3所示。结果
3.1。度和中心基因的识别
有20个HCC 20样本和正常样本的研究。GEO2R在线分析工具应用于探测度,使用调整值< 0.05和 或 截止条件。503度分析GSE41804被捕后,143年360个表达下调的基因而调节(图1 (b))。前50名的表达水平与褶皱变化度2(图中显示1(一))。此外,15个中心基因被确定根据他们的程度从高到低(表连接1)。
(一)
(b)
3.2。函数和KEGG通路富集分析
为了获得一个更全面和深入了解的选择度,函数和KEGG通路富集分析通过大卫了。导入所有大卫的度软件后,我们发现调节度和度使之抑制的去分析。更具体地说,这些度主要富集在生物过程(BP),涉及epoxygenase P450通路;氧化还原过程;细胞反应锌离子;监管负增长;,差别和外源性药物分解过程对这些有丝分裂核分裂,细胞分裂,姐妹染色单体凝聚力,染色体分离,蛋白质定位为upregulation着丝粒。至于函数(MF),表达下调度主要是涉及氧化还原酶活动(根据配对捐助者、合并或减少氧气分子),氧气绑定,铁离子结合,单氧酶活性和氧化还原酶活动(作用于成对捐赠者,与公司或减少分子氧,减少黄素或黄素蛋白作为供体,和一个氧原子结合)。调节度主要是负责蛋白质绑定,微管马达活动,微管绑定,染色质绑定,和细胞周期蛋白依赖性蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性。此外,细胞组件(CC)分析发现,表达下调度主要富集在细胞外区域,细胞外空间,细胞器膜,质膜的整体组成部分,基底和等离子体膜,而调节度主要富集在中间体,着丝粒,凝聚着丝粒染色体,染色体着丝粒区域,以及驱动蛋白复合体(表2)。
表3显示最重要的丰富KEGG通路的调节和表达下调度。这些表达下调度是富含矿物质的吸收,视黄醇新陈代谢,咖啡因的代谢,药物metabolism-Cytochrome P450,和化学致癌作用,虽然在细胞周期调节度是丰富,p53信号通路,progesterone-mediated的卵母细胞成熟,卵母细胞减数分裂。数据2(一个)- - - - - -2 (c)给去KEGG通路富集HCC的阴谋。
(一)
(b)
(c)
(d)
3.3。筛选从PPI网络中心基因和模块
基于字符串的信息查询蛋白质从公共数据库,我们构建了PPI网络的前15名中心基因根据程度的连接(图2 (d))。前15名中心与更高程度的基因连接如下:TOP2A, CDK1, CCNB1, BUB1, CENPF, CCNB2, TTK, KIF2C, HMMR, MELK, CENPE, KIF20A, KIF4A PBK, DLGAP5。kaplan meier绘图仪,我们发现总共有14个中心除了CCNB2基因导致了糟糕的总体生存状况。再次,基于函数,KEGG通路分析,生存分析,我们公布了CCNB1, CDK1, BUB1, TTK浓缩在细胞周期。
为了检测在PPI网络最重要的模块,我们采用MCODE插件。选择前三模块(图3)。KEGG通路分析透露,前三模块主要是与细胞周期有关,氧化应激和肝脏解毒(表4)。
(一)
(b)
(c)
3.4。kaplan meier绘图机和中心基因的表达水平
我们获得了基因在前15名的预后信息中心http://gepia.cancer-pku.cn/。这是证明TOP2A (HR的表情 ,logrank )与更糟糕的HCC患者的总生存期(OS),以及CDK1(人力资源 ,logrank ),CCNB1(人力资源 ,logrank ),BUB1(人力资源 ,logrank ),CENPF(人力资源 ,logrank ),TTK(人力资源 ,logrank ),KIF2C(人力资源 ,logrank ),HMMR(人力资源 ,logrank 克雷姆斯),梅尔克这两个(人力资源 ,logrank ),CENPE(人力资源 ,logrank ),KIF20A(人力资源 ,logrank ),KIF4A(人力资源 ,logrank )和DLGAP5(人力资源 ,Logrank )。只有CCNB2水平( ,logrank )没有明显的差异在肝细胞癌患者的生存曲线(图4)。
(一)
(b)
(c)
(d)
(e)
(f)
(g)
(h)
(我)
(j)
(k)
(左)
(m)
(n)
(o)
然后,我们选择4中心基因根据KEGG通路(表5)的前15个基因验证表达水平在肝组织中使用GEPIA HCC和健康人之间,和数字5(一个)- - - - - -5 (d)显示,与正常组相比,TOP2A的表达水平,CCNB1, KIF4A, CCNB2 HCC患者显著升高。有趣的是,CCNB2事实上没有影响肝癌患者的预后。随后,我们搜查了免疫组织化学HPA网站中的数据。(CCNB2的蛋白表达在HPA缺席。)CCNB1,染色图片证明了TOP2A和KIF4A HCC患者表现出较高的表达水平与健康人群相比,这也进一步验证了从GEPIA箱线图(图的结果5 (e))。
(一)
(b)
(c)
(d)
(e)
(f)
最后,我们选择两个最可疑的基因(CCNB1和CDK1)基于KEGG前15名的分析中心的基因。CCNB1和CDK1两个基因与细胞周期,progesterone-mediated卵母细胞成熟,和p53信号通路(表5)。使用GEPIA中的相关分析,我们发现CCNB1和CDK1显然是呈正相关(值= 0, )(图5 (f))。
3.5。基因集富集分析
获得进一步的了解中心的功能基因,GSEA映射到去进行分析和KEGG数据库路径。截止条件下 ,|浓缩的分数 ,基因 ,共有6个功能基因集富集,这主要集中在通路与细胞增殖和分化有关。六个途径是“纺锤体组装”、“轴”,“负调控有丝分裂的核分裂,”“纺锤体微管”,“细胞骨架相关的胞质分裂,”和“硫代谢过程的调节”(图6)。
(一)
(b)
(c)
(d)
(e)
(f)
3.6。在肝细胞氧化应激激活
符合我们所预测的那样,氧化应激水平显著增强在癌组织与邻近组织。详细,SOD的活性,一个典型的抗氧化酶,减少在癌组织在氧化酶的活性以及在癌组织中MDA的水平增加(图7(一))。与此同时,NADPH的mRNA水平P67和gp91也显著调节肝细胞癌组织(图7 (b))。免疫印迹和免疫组织化学染色的结果进一步确定这些生物标记与氧化应激相关的蛋白质水平(数字7 (c)- - - - - -7 (e))。综上所述,我们的实验表明,氧化应激激活的肝细胞癌,从生物信息学这进一步证明了我们的假设。
(一)
(b)
(c)
(d)
(e)
4所示。讨论
HCC死亡率升高的趋势在最近几十年在世界范围内。虽然诊断和治疗方法已经开发出很多最近,肝细胞癌的预后仍然是可怜的(20.]。因此,特定的敏感生物标记肝癌迫切需要选择。高通量研究有助于深入探索导致肝癌的重要机制。我们的研究系统地关注表达分析从微阵列研究肝癌。我们的分析包括20肝癌样本和20 GSE41804的正常样本地理数据库。503度被抓获360名调节基因和143个表达下调基因。更好地探索这些度,我们进行了功能和KEGG通路分析这些度。
4.1。氧化应激是肝细胞癌的致癌作用的关键
尽管许多机制已经披露导致肝癌的进展,主要与肿瘤发生机制涉及仍然是有争议的,这让一些困难HCC的诊断和治疗。基因本体论和PPI分析在我们的研究表明,表达下调度主要是参与氧化应激。我们的实验结果在癌组织和邻近组织进一步确定氧化应激在HCC的至关重要的作用。
据我们所知,氧化应激是公认的扮演一个至关重要的部分在致癌作用的启动和推广,因为它可以发生,过量的活性氧和RNS通过内源性或外源性侮辱(21]。一方面,因为多形核中性粒细胞(中性粒细胞)活性氧的主要来源在肝脏发炎,氧化应激作为核心球员在慢性肝脏疾病的发病机理和癌前病变感染乙型肝炎病毒(HBV)和丙型肝炎病毒(HCV) (22]。在另一方面,nonparenchymal细胞包括巨噬细胞和枯否细胞,它可以释放细胞因子,是另一种刺激肝细胞活性氧的生产(23]。更具体地说,长时间或调节活性氧的生产与修改,在肝细胞癌突变基因的表达。特别是未修理的损害引起的氧化应激的DNA可能产生突变,鉴于修改基地的修复就会晚于细胞复制。除了核DNA氧化损伤,形成线粒体DNA损伤或突变以及改变线粒体基因组的功能也已公布了诱发致癌作用的发生(3,24]。因此,氧化应激可能是一个有前途的预测水平在肝细胞癌的诊断和治疗。
此外,我们的基因本体分析表明,表达下调度主要是与细胞外结构的改变,包括细胞外空间,细胞器膜,质膜的整体组成部分,基底和等离子体膜。增加细胞外基质重塑也已被证明是与人类肝细胞癌肿瘤恶化有关。例如,矩阵metalloproteinase-2 (MMP-2)是一种重要的酶在细胞外基质重塑的过程中涉及与肿瘤的浸润和转移。超表达与肝癌相关的MMP2似乎明显因为MMP2肿瘤主要负责纤维发生(25]。报道,肝星状细胞,作为主要在肝脏结缔组织细胞,可以通过氧化应激激活然后产生细胞外基质是至关重要的正常生长和分化的细胞在肝损伤(26]。我们的结果表明,氧化应激在HCC不仅直接影响肝癌的进展,但也与其他活动调节肝细胞癌。
更重要的是,KEGG分析表明,调节度与p53信号有牵连。我们的数据从免疫印迹还发现了P-p53在肝癌组织的表达显著高于相邻的组织。据我们所知,p53基因是一个敏感的氧化还原转录因子可以调节通过提高其转化速度和转译后的修改时,DNA在细胞受到氧化应激。在细胞氧化应激的转译后的修改,如磷酸化、泛素化,sumoylation,乙酰化、甲基化,可能会导致p53的构象和区位变化,然后影响其下游目标(27,28]。综上所述,策略来抑制氧化应激的改变或调节各种p53转录后的修改通过氧化应激和细胞外基质的形成有助于开发治疗肝癌的药物。
4.2。针对细胞周期可能是肝癌的潜在治疗策略
细胞cycle-mediated细胞特异表达转换和控制细胞生长的恶性肿瘤的基本生物学特征。扩增的细胞周期蛋白基因、细胞周期蛋白D和E,特别是是一个至关重要的事件过程,发生在肝细胞癌(29日,30.]。正树等人发现,在Long-Evans肉桂(LEC)大鼠肝细胞癌的进展,细胞周期蛋白D1-related激酶活动显著增强,特别是细胞周期蛋白D1-related酶活性。相反,丽江的活动是相对较低的LEC老鼠以及在控制大鼠(31日]。前15名中心与更高程度的基因连接在我们的分析展示了细胞周期的意义在肝细胞癌的进展。这些中心基因包括CDK1 [32],CENPF [33],CCNB2 [34克雷姆斯),梅尔克这两个(35],CENPE [36],KIF20A [37],KIF4A [38],PBK [39],DLGAP5 [40)已被证明cycle-associated负责细胞增殖和分化的肿瘤。此外,去度分析表明,所有参与细胞周期调节度也包括有丝分裂核分裂,细胞分裂,姐妹染色单体凝聚力,中间体,着丝粒蛋白定位,和微管绑定,这表明改变至关重要的基因在肝细胞癌的表达应该与细胞周期有关。KEGG通路分析进一步验证了假设下调度与细胞周期和p53信号通路有关。综上所述,从我们的角度来看基于去KEGG分析、药物靶向肿瘤细胞的细胞周期可能是肝癌的潜在治疗策略。
4.3。改变细胞周期,细胞色素P450的障碍,受损的肝脏解毒效应是肝癌3典型的模块在PPI网络
PPI被定义为两个或两个以上的过程种蛋白质分子共价结合形成蛋白质复合体。PPI网络可以为更好的理解提供一个可见的框架的功能组织蛋白质组(41]。丰富通路的前三模块,我们发现,蛋白质之间的相互作用在肝癌主要集中在通路与细胞周期,细胞色素P450,肝脏解毒。
细胞色素P450酶是一个大家庭的本地化内质网和线粒体膜,施加各种重要角色在代谢的过程中内源性和外源性分子,特别是一些药物(42]。之前的研究表明,细胞色素P450基因多态性与肝细胞癌的风险表现出一定的联系病人携带慢性乙型肝炎(43]。在肝细胞癌患者中,一些细胞色素P450的水平改变与肝癌的进展。CYP2J2,细胞色素P450家族一员,被发现有关键作用的扩散和抵抗抗癌药物(阿霉素)HepG2细胞减少的比率伯灵顿/ Bcl622比率和升降pro62caspase623水平(44]。遗传多态性的细胞色素P450酶,如CYP2D610日,已被证明对酶活性的影响。在肝细胞癌患者中,CYP2D610等位基因频率明显不同与控制个人(45]。与这些研究结果一致,模块2显示,肿瘤组和正常组的PPI许多成员参与细胞色素P450,如CYP3A4, CYP4A11, CYP2B6, CYP2C8, CYP26A1,体内CYP2A6基因表现,和CYP1A2,表明一些关键的细胞色素P450酶在肝细胞基本功能。
此外,金属硫蛋白还参与肿瘤细胞的分化和增殖。金属硫蛋白和肿瘤之间的关系主要集中在金属硫蛋白和肿瘤发生,ant-tumor药物有毒副作用,以及耐药性。金属硫蛋白表达缺陷是癌症的症状之一;因此,深入研究金属硫蛋白和肿瘤之间的关系有望获得目标治疗癌症的药物(46]。金属硫蛋白表达在一个较高的水平,肝组织,主要负责可以显著诱导肝脏解毒和各种药物(47]。达塔等。48在hepatocarcinogenesis]表明,金属硫蛋白的表达明显阻止通过CCAAT / enhancer-binding蛋白质的失活α通过磷脂酰肌醇3-kinase PI3K信号通路,最终导致可怜的肝脏解毒。基于模块3的PPI网络,我们发现网络主要集中在金属硫蛋白,表明金属硫蛋白的重要意义从生物信息学的观点。因此,监测指标与金属硫蛋白具有十分重要的肝细胞癌的诊断和治疗。
4.4。CCNB2之一可能是肝癌的开关,但不能促进肿瘤进展
kaplan meier绘图仪显示,存活曲线显示无显著差异在HCC患者CCNB2的低表达和高表达。有趣的是,在肝细胞癌组和健康组,盒子里CCNB2表现出明显差异的表达图。
据我们所知,CCNB2(细胞周期素B2),这belelongs蛋白质在细胞周期蛋白家族成员之一,在G2 / M过渡的核心作用的肿瘤。CCNB2被发现在许多类型的调节人类肿瘤(49]。在中国非小细胞肺癌(NSCLC)患者中,高CCNB2蛋白质的表达水平与肿瘤大小呈正相关,地位的分化程度,远处转移、淋巴结转移、临床分期(50]。然而,CCNB2的表达水平与肝细胞癌患者的生存条件,而水平CCNB2 HCC患者健康组相比有明显差异,这表明CCNB2可能充当开关启动HCC的发生,但它不产生其他肿瘤肿瘤发生后的影响。事实上,在主肝细胞癌组织标本,CCNB2已经公布了由上游karyopherin亚基-α2,它可以抑制细胞增殖和诱导细胞周期阻滞于G2 / M期(34]。基于GSEA,我们还发现,与细胞cycle-related通路相关的基因集富集在样品FCER1G高度表达肝细胞癌患者。但进一步的研究需要阐明CCNB2转录激活的过程中,CCNB2在细胞周期进程的影响,以及这如何影响肝癌的起始。
总之,我们提供了一个新颖、全面分析,基因表达谱识别度,这可能扮演核心角色的发生,发展,肝细胞癌患者的预后。基因参与氧化应激和细胞周期,细胞色素P450,金属硫蛋白在肝癌患者有显著改变。获得更准确的相关结果,我们以后打算发起后续识别的实验来验证这些预测结果。综上所述,我们衷心希望这种分析将为未来的研究提供有价值的和强大的信息导致肝癌发病的分子机制提供线索,小说诊断生物标记物的发现和治疗策略。
数据可用性
使用的数据来支持本研究的发现可以从相应的作者。
的利益冲突
所有作者宣称他们没有利益冲突。
作者的贡献
李宁和李凌的贡献同样这项工作。
确认
这项工作是支持由中国国家自然科学基金(没有。U1604175)和开放研究基金项目的中国病毒学国家重点实验室(2018 kf005)。