宿主病原体interactome模型说明多个基因/环境相互作用如何直接关注的病原体对不同的通路,流程和疾病。对于任何病原体,免疫和病原体防御通路以及炎症过程将被激活来对抗感染。尽管病原体可以与数以百计的宿主基因和蛋白质相互作用,这些选择取决于病原体的应变,感染的时机和本地化,之前是否存在免疫障碍。反过来,人类元素可供交互将取决于它们的表达式(时间和地点)在他们的功能特性由多态性或突变,等等。这个选择过程,涉及遗传筛和个人交互概率,使类似的interactome选择性,使病原体特别影响不同系列的途径在不同的情况下(说明了人类蛋白质的数量结束他们的路线在一个特定的通路本)。特定通路的微分修正将反过来影响特定的流程和表型,总装构成最终的马赛克的疾病。这个分类,包括人类和病原体的基因和蛋白质,以及环境因素,可以解释同一病原体可能导致预防、或其他各种疾病的影响,取决于遗传因素和一系列的巧合(见文本详情)。