研究文章
证明原则实时病原体隔离媒体诊断:利用激光诱导击穿光谱区分细菌病原体和Antimicrobial-Resistant金黄色葡萄球菌菌株生长在血琼脂
表2
突变检测在MM66和SH1000-1比较基因组测序。
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| 菌株 |
SACOL位点一个 |
基因 |
函数 |
SNP的位置一个 |
氨基酸的变化一个 |
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| SH1000-1 |
基因内 |
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| SACOL0593 |
fusA |
延长因子G |
C617228年
T617228年 |
H457年
Y457年 |
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| SACOL0358 |
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一个371671年
T371671年 |
N36
我36 |
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T317672年
一个371672年 |
N36
我36 |
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G371676年
一个371676年 |
E37
K37 |
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一个371685年
C371685年 |
K40
问40 |
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| MM66-4 |
基因内 |
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| SACOL1883 - |
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假设蛋白质 |
C1938819
T1938819 |
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| TRNA-ser |
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tRNA-ser |
T1938825
一个1938825 |
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| SACOL1947 - |
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假设蛋白质 |
C2010604
T2010604 |
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| SACOL1948 |
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假设蛋白质 |
一个2010605
G2010605 |
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| SACOL2575 - |
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假定的芳香
氨基转移酶 |
一个2638759
T2638759 |
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| SACOL2576 |
crtN |
角鲨烯合酶 |
C2638762
一个2638762 |
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| 基因内 |
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| SACOL1690 |
恰当的 |
腺嘌呤phosphoribosyl -
转移酶 |
C1721075
T1721075 |
一个57
V57 |
| SACOL0020 |
yycG |
感觉盒子组氨酸
激酶 |
一个26449年
G26449年 |
K263年
E263年 |
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SNP:单核苷酸多态性。
基于轨迹数字,核苷酸位置,氨基酸残基在NCBI数据库基因库金黄色葡萄球菌应变坳参考基因组。
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