研究文章
临床意义和NM23在肝细胞癌的遗传因素基于生物信息学分析和全基因组关联研究
图4
协会NM23,STARD3和PSORS1C1在肝细胞癌患者。(一)通路网络分析NM23,STARD3,PSORS1C1在GeneMANIA。(b)散点图mRNA的表达NM23,STARD3,PSORS1C1肝细胞癌和邻近的正常组织之间。NM23和STARD3有一个P< 0.001,但PSORS1C1有一个P= 0.056。(c) mRNA表达之间的相关分析NM23和PSORS1C1,r = -0.163,P =0.001。(d) mRNA表达之间的相关分析NM23和STARD3,r = 0.259,P =3.01×10−8。(e) mRNA表达之间的相关分析PSORS1C1和STARD3,r = -0.230,P= 9.42×10−7。所有的数据都是基因表达的综合(GEO加入:GSE14520)。(f和g) LocusZoom情节分析当地的连锁不平衡(LD)和附近的复合模式PSORS1C1(f)和STARD3(g),约0.5到0.8 Mb。纵轴显示协会P−log10规模价值观,正确的纵轴显示重组率。横轴表示染色体的位置。情节的底部显示了最近的基因。LD(右2)和重组率估计的1000人基因工程ASN数据(March2012、构建GRCh37 / hg19)。Haploview LD的情节PSORS1C1单核苷酸多态性(n = 6) (f)STARD3单核苷酸多态性(n = 2) (g),块代表着高LD snp。更大的强度和颜色值在每个单元对应一个更高层次的LD D '。