杂志的核酸

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杂志的核酸/2011年/文章

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体积 2011年 |文章的ID 521035年 | https://doi.org/10.4061/2011/521035

坦尼娅Zaliznyak马克·鲁金弗朗西斯·约翰逊,卡洛斯·r . de los Santos, 3-Aminobenzanthrone进入2′-Deoxyoligonucleotides及其对双稳定性的影响”,杂志的核酸, 卷。2011年, 文章的ID521035年, 10 页面, 2011年 https://doi.org/10.4061/2011/521035

3-Aminobenzanthrone进入2′-Deoxyoligonucleotides及其对双稳定性的影响

学术编辑器:路易斯·a·挞伐
收到了 08年7月2011年
接受 2011年9月3日
发表 2011年11月17日

文摘

3-Nitrobenzanthrone(3),但是环境污染和有效的诱变剂,通过新陈代谢的反应激活引起DNA损伤形式与环外的氨基嘌呤和鸟嘌呤的8位置。目前的工作描述了制备低聚物的合成方法2′-deoxyribonucleotides包含2 - (2′-deoxyguanosin -N2yl) 3-aminobenzanthrone一半,DNA加合物的一个主要发现在生物组织暴露于3 nba。NMR光谱表明,受损oligodeoxyribonucleotide能够形成一个常规双螺旋结构的聚芳一部分假设一个构象在室温下;光谱表明,3 aba一半位于双小沟的5′端指向修改链。热力学研究表明,总干事(N2)3 aba对受损的双病变有稳定作用,事实和相关生物的长期持久的损害。

1。介绍

Nitroarenes普遍存在的环境污染物中发现香烟,粉煤灰,从柴油和汽油发动机尾气,空气颗粒物(1]。nba 3-Nitrobenzanthrone (3, 3-nitro-7H-benz [de] anthracen-7-one),这类化合物的一员,是一种最有效的已知细菌突变剂日期(2在哺乳动物细胞[]和展品强诱变活动3]。人类成纤维细胞暴露于N-acetoxy-3-aminobenzanthrone 3 nba的活性代谢物,显示优势基地替换突变主要G→T颠换其次是G→A和→G替换(4]。转基因小鼠治疗3 nba表现出突变频率增加肝脏、结肠、膀胱,并与G→T颠换骨髓,主导这一效应(5,6]。分析3 nba-induced突变小鼠成纤维细胞窝藏功能复制人类p53基因也揭示了G→T颠换的优势,其次是腺嘌呤基替换(7]。除了突变,3 nba引起DNA双链断裂和诱发微核的形成在人类细胞系(8,9]。女性F344大鼠治疗3 nba气管内的滴注法显示肺急性和亚急性变化仅几周后治疗和开发鳞状细胞肺癌在9到12个月,根据3 nba的数量管理(10]。一些流行病学证据链接环境3 nba暴露在人类肺癌(11,12]。

像其他环境nitroarenes 3 nba之前亲电反应中间体进行代谢转换结合DNA和发挥其基因毒性效应。的老鼠,老鼠和人类,胞质NAD (P) H:醌氧化还原酶(NQO1)是主要的酶,这种酶可以减少3 nbaN-hydroxy-3-aminobenzanthrone (N-OH-3-ABA),经过第二阶段进一步激活酶(N, O -乙酰转移酶,sulfotransferases)可以与DNA反应形成嘌呤加合物(图1)[13,14]。NADPH:细胞色素P450还原酶也可以激活3 nba活性物种在人类细胞(15),但其参与似乎发生在一个小程度上比NQO1。完全减少3 nba代谢物,即3-aminobenzanthrone (3 aba)已经从人类尿液中恢复过来职业性暴露柴油废气(16]。3 aba可以接受CYP1A1-mediated(或CYP1A2)氧化相同N羟基还原代谢生成的中间,表示进一步激活机制和3 nba的基因毒性17,18]。此外,因为3 nba诱发NQO1和CYP1A1蛋白水平增加大鼠肺和肾脏组织,其基因毒性可能增强autoinduction其代谢途径(14]。

3 nba的活性代谢物,N-OH-3-ABA,可与DNA反应在体外在活的有机体内嘌呤加合物形成。五加合物在啮齿动物样本中检测到利用TLC -32P-postlabeling技术与丁醇萃取浓缩(5,19- - - - - -21]。高效液相色谱的比较这些斑点与综合准备加合物标准22]表明,2 - (2′-deoxyguanosin -N2yl) 3-aminobenzanthrone (dG (N2)3 aba),N- (2′-deoxyguanosin-8-yl) 3-aminobenzanthrone (dG (C8) aba)和2 - (2′-deoxyadenosin -N6yl) 3-aminobenzanthrone (dA (N6)3 aba)市长加合物形成大鼠器官3 nba后管理(21]。虽然上述3 aba加合物的合成及其对应的n -乙酰形式报道(23),他们的公司在oligodeoxyribonucleotides尚未报告。理解3 nba诱变的分子机制以及3 nba-damaged DNA的修复,特定站点的程序合并3 aba病变寡聚2′-deoxyribonucleotides是至关重要的。在本文中,我们提出一个合成方案,允许包含dG的制备寡聚脱氧核糖核酸(N23)aba加合物(图1),DNA损伤的一个主要由NBA在活的有机体内(21]。合成方法是健壮的允许在任何序列加合物的结合上下文。我们还展示了结果表明dG的存在(N2)3 aba增加破坏稳定的双工,发现以前观察到与其他dG (N2)病变,包括N2脱氧鸟苷衍生物的空军联队,2 - (2′-deoxyguanosin -N2yl) 2-acetylaminofluorene [24]。有趣的是,这两种损伤的特点是异常长的持久性鼠组织(21,25),这表明缺乏笨重的病变是一种热力学不稳定的因素,阻碍了识别损伤的核苷酸切除修复(尼珥)通路。

2。材料和方法

2.1。化学物质

一般的化学物质都是购自Sigma-Aldrich(圣路易斯,密苏里州),DNA合成和固相试剂从格伦研究有限公司(弗吉尼亚州英镑)。年代苄thiotetrazole从甲苯结晶和干燥在真空内/ P2O5之前使用。

2.2。质谱(MS)

电喷雾电离质谱(质)和串联女士(MS / MS)实验进行TSQ量子访问(热科学)和LTQ Orbitrap XL(热费希尔科学)光谱仪。50:50:1 v / v混合乙腈:水:三乙胺是用作电喷射溶剂女士决定。高分辨率质谱(,8经)获得在LTQ Orbitrap XL(热费希尔科学)配备一个电喷雾电离(ESI)来源。喷涂电压设置为3.0 kV和毛细管加热的温度维持在300°C。测量是在正离子模式下200 ms的注射时间和注入率在90%乙腈/水3 uL /分钟。

2.3。稳定性研究

双变性档案记录卡里100生物紫外可见分光光度计(瓦里安,Inc .,帕洛阿尔托,加州)。DNA工器被溶解在25毫米磷酸钠缓冲区,pH值6.8,包含150毫米氯化钠和500年μM EDTA。样品吸光度是记录每20年代在10 - 80°C的范围之内。决定进行加热和冷却样品时,使用温度变化速率为0.2°C /分钟。双熔化温度( )获得了一阶导数的方法。热力学参数从1 /分析 与ln ( )土地(范霍夫情节),其斜率和截距收益率ΔHΔS,分别为(26]。

2 - (3′,5′-Bis-O-Tert-Butyldimethylsilyl-O6(2)- 4-Nitrophenylethyl 2′-Deoxyguanosin -N2yl) 3-nitrobenzanthrone(1)
它根据以前公布的合成过程23]。最终材料的结晶纯化甲醇,而不是报道的柱层析方法。的1核磁共振光谱1本质上是相同的,以前公布的(23]。

2 - (O6(2)- 4-Nitrophenylethyl 2′-Deoxyguanosin -N2yl) 3-nitrobenzanthrone(3)
甲烷硅基化的核苷1(255毫克,0.25更易)溶解在3毫升的二甲基甲酰胺:三乙胺trihydrofluoride:三乙胺(6:4:3)混合,加热1小时50°C。乙酸乙酯的混合物倒入50毫升,离心机,乙酸乙酯的残留清洗和干燥在真空内/ P2O5,131毫克(0.19更易,78%)3作为一个好的红色粉末。核磁共振光谱学,样本resuspended在乙酸乙酯中,离心,干燥。1核磁共振(DMSO -d6经颅磁刺激,δ(件分)):9.87 (br。年代。,1H), 9.20 (s. 1H), 8.55 (d, 1H), 8.49 (d, 1H), 8.32 (s, 1H), 8.28 (m, 2 H), 7.99 (t, 1H), 7.92 (d, 2 H, 赫兹),7.83 (t, 1 H), 7.66 (t, 1 H), 7.37 (d, 2 H, 赫兹),6.29 (t, 1 h, 赫兹),5.21 (br年代,1 H), 4.83 (br年代,1 H), 4.66 (br年代,2 H), 4.31 (br年代,1 H), 3.81 (br年代,1 H) 3.50 - -3.46 (m, 3 H), 2.63 - -2.52 (m, 2 H)(补充材料可用在doi: 10.4061 / 2011/521035)。13理化性质(DMSO -d6经颅磁刺激,δ(件分)):128.23,159.00,154.67,153.08,146.17,146.08,139.78,137.86,134.34,133.98,132.60,130.27,129.97,129.56,128.20,127.58,127.32,124.99,124.55,123.82,123.17,123.05,116.37,87.84,83.10,70.66,66.07,61.56,45.60,34.13(补充材料)。,8经:观察( ]+690.1923;690.1943计算。

2 - (5′-O-Dimethoxytriphenylmethyl-O6(2)- 4-Nitrophenylethyl 2′-Deoxyguanosin -N2yl) 3-nitrobenzanthrone(4)
核苷3(120毫克,0.17更易)coevaporated吡啶,再溶解在2毫升干燥的吡啶,与120毫克的混合dimethoxytrityl氯(0.35更易),在室温下,12小时。后失踪的起始物料(估计通过薄层色谱分析),反应混合物稀释了20毫升的乙酸乙酯,提取柠檬酸钠为10% 毫升),与硫酸钠干燥,蒸发了在真空。闪光色谱净化的残渣(5%在二氯甲烷三乙胺)产生了123毫克(0.125更易,73%)4作为一个深红色透明玻璃状固体。1核磁共振(CDCl3经颅磁刺激,δ(件分)):9.93(年代,1 h), 9.21(年代,1 h), 8.68 (d, 1 h, 赫兹),8.50 (d, 1 h, 赫兹),8.49 (d, 1 h, 赫兹),8.39 (d, 1 h, 赫兹),8.12 (d, 2 H, 赫兹),7.98(年代,1 h), 7.90 (t, 1 h, 赫兹),7.8 (t, 1 h, 赫兹),7.63 (t, 1 h, 赫兹),7.47 (d, 2 H, 赫兹),7.38 (d, 2 H, 赫兹),7.28 - -7.26 (m), 6.78 (d, 4 H, 赫兹),6.58 (t, 1 h, z), 4.83 (t 2 H, 赫兹),4.67 (m, 1 H), 4.21 (m, 1 H), 3.76(年代,6 H), 3.44 (m, 1 H), 3.35 - -3.30 (m, 3 H), 2.85 (br年代,1 H), 2.81 - -2.79 (m, 1 H), 2.65 - -2.64 (m, 1 H)(补充材料)。13理化性质(CDCl3经颅磁刺激,δ(件分)):183.2,160.8,158.8,154.0,153.5,152.6,150.4,147.0,145.8,144.6,139.0,135.8,135.7,134.3,134.2,133.2,131.2,130.7,130.3,130.2,130.1,129.3,129.1,128.3,128.2,128.0,127.9,127.6,127.2,125.9,123.9,123.2,117.6,116.2,115.0,114.5,113.5,113.4,87.0,86.9,83.9,72.9,68.1,67.2,56.1,56.0,55.4,52.9,46.0,32.2,25.7(补充材料)。,8经:观察( ]+992.3227,992.3250计算。

2 - (3′- o - (Cyanoethoxydiisopropylaminophosphino) 5′-O-Dimethoxytriphenylmethyl-O6(2)- 4-Nitrophenylethyl 2′-Deoxyguanosin -N2yl) 3-nitrobenzanthrone(5)
核苷4(112毫克,0.11更易)与甲苯coevaporated,溶解在2毫升干燥四氢呋喃在氩,混合着200人μL(二异丙基乙胺,其次是增加104μL(0.37更易)2-cyanoethoxy二异丙基chlorophosphoramidite。混合物在室温下保持6小时。后失踪的起始物料(通过TLC分析化验)混合物溶解在30毫升的乙酸乙酯和10%的碳酸钾(洗 毫升)。有机层与硫酸钠干燥和蒸发在真空。由此产生的粘性油是由反相色谱法纯化使用acetonitrile-water梯度(60 - 100%,超过15分钟)为流动相,屈服5更易(98毫克,0.082,74%)作为一个深红颜色的透明玻璃状固体。的1核磁共振光谱有两组信号,事实上取得了55:45的强度比,与相关的非对映体磷原子。1核磁共振(CDCl3经颅磁刺激,δ(件分),主要成分的化学变化(鉴于当possibe) 9.79(年代,1 H), 9.82(年代,1 H), 8.71 (d, 1 H), 8.52 (d, 1 H), 8.50 (d, 1 H), 8.37 (t, 1 H), 8.10 (t, 1 H), 8.00(年代,1 H), 7.92 (t, 1 H), 7.73 (t, 1 H), 7.63 (t, 1 H), 7.43 - -7.39 (m, 4 H), 7.29 - -7.17 (m), 7.19 (t, 1 H), 7.90 (d, 2 H), 7.60 (d, 2 H), 6日50 (m, 1 H), 4.82 (br t 2 H), 4.72 (m, 1 H), 4.28 (m, 1 H), 3.76(年代,3 H), 3.75 (t, 3 H), 3.66 - -3.43 (m, 4 H), 3.44 - -3.35 (m, 2 H), 3.30 (br t 2 H), 2.86(9月、1 H), 2.71 (m, 1 H), 2.45 (m, 1 H), 1.53 (m, 12 H)(补充材料)。,8经:观察( ]+1192.4365,1192.4328计算。

2.4。Oligodeoxyribonucleotide合成

这是上执行ABI使用UltraMild CE phosphoramidites和DNA合成仪年代-benzylthio-tetrazole活化剂试剂。标准程序被用于修改的oligodeoxyribonucleotides的准备。amidite的4倍摩尔过量使用和耦合时间增加到5分钟的介绍xenonucleotide一半。Oligodeoxyribonucleotide乳沟的坚定支持和后续去一夜之间是通过孵化在室温下用浓氨水。蒸发后在真空内,合成产品被反相色谱纯化。与紫外线净化Gilson高效液相色谱系统进行监测在260和290海里,a (5毫米Zorbax ODS列μ300粒子大小、孔隙大小),使用一个线性乙腈梯度(5到50%,30分钟)在50毫米醋酸triethylammonium, pH值6.5,5毫升/分钟的流量。纯化oligodeoxyribonucleotides冻干,5′dmt组被co-evaporation 80%醋酸溶液。残留是溶解在四丁铵氯2毫升1米,由高效液相色谱纯化使用上述协议,冻干干燥。由此产生的产品是溶解在水中(1毫升)和100年μL 1 M硫化钠是补充道。眼前的颜色从一个橙红色过渡到深紫色的硝基的还原。站在室温1小时后,反应混合物是由高效液相色谱纯化产生所需的oligodeoxyribonucleotide产品,冻干,沉淀在乙醇钠形式和随后脱盐使用交联葡聚糖g10列。

2.5。核磁共振光谱

一和二维1H NMR光谱记录使用瓦里安(Inova)或力量(皇冠)光谱仪操作为9.4,11.75,14.1 T磁场强度。质子化学位移是引用相对于四甲基硅烷(有机溶剂)或钠3 -(三甲基硅烷基)propionate-2, 2, 3, 3 - (水解决方案)在0 ppm。混合相敏NOESY女士(300次)和DQF-COSY光谱收集受损双25°C与样品溶解在50 mM磷酸盐缓冲溶液(pH值6.9)在100% D2o .残余水信号被抑制在重复presaturation 1.5秒的延迟。核磁共振数据处理和分析使用NMRPipe [27和充满活力的28),运行在Linux工作站。数据集是在4096年和256年的复杂的数据点 维度,分别。时域数据乘以一个移位的sine-bell窗口函数和零至4096点。多项式基线校正应用于频域数据。

3所示。结果与讨论

3.1。dG的准备(N23)包含Oligodeoxyribonucleotide aba

修改的一般合成方法介绍dG aminoaryl或半个N-acetylaminoaryl替换(xenonucleotides)是使用2 -脱氧鸟苷(N-trifluoroacetylaminoaryl)在传统phosphoramidite phosphoramidite固相合成(29日]。在这种方法中,关键nitroarene前体通过palladium-mediated缩合得到保护2′脱氧鸟苷与相应的溴nitroarene [30.),其次是去保护,nitro-reduction trifluoroacetylation。尽管它的简单性和通用性,这种方法显示一些缺点在dG (N2)3 aba的情况。首先,直接还原硝基和随后的trifluoroacetylation导致复杂的混合产品,可预防并发症,原则上,通过使用额外的去保护和保护措施。第二,使用trifluoroacetyl保护强加一些限制条件,固相合成和oligodeoxyribonucleotide去减少最终产量。为了克服这些问题,我们决定引入dG (N2)3 nba直接在oligodeoxyribonucleotide加合物的合成和生成氨基postsynthesis治疗。使用标准程序(23,30.),我们随时准备保护dG (N2)3 nba核苷(1)。治疗1与TBAF去除氧保护组织(TBDMS和警2-phenetyl(肺水肿)),产生完全deprotected加合物(2)(计划1)。然而,这种化合物,产生一种复杂的混合物产品在后续合成步骤(数据未显示),这使得一个不合适的中间。一个可能的解释是不受保护的dG (N2nba) 3 (2)在水和有机溶剂溶解性差,阻碍其净化标准治疗包括液液萃取和柱层析法。此外,这种化合物似乎存在于质子化作用的几个州,一个事实很容易被锋利的颜色变化,从深蓝到深紫色适绿色,在过渡到高博士因此,我们决定保持guanine-O6保护小组在phosphoramidite准备和固相合成。治疗(1)茶·3高频:茶:DMF混合删除TBDMS保护离开肺水肿组织完好无损。核苷(3)然后5′-dimethoxytritylated给4,反过来,转化为相应的phosphoramidite (5使用标准协议(方案)1)。耦合的xenonucleotide phosphoramidite显示90 - 95%的效率在固相合成寡核苷酸。

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我们测试了两种可能的方法为postsynthetic去oligodeoxyribonucleotide和硝基的还原。第一个是guanine-O移除6保护治疗组的合成产品,仍然附着在固体支持,1 M DBU / DMF,其次是减少硝基1 M亚硫酸氢钠/柠檬酸钠在pH值7.0。随后集中氨的处理应该删除其他保护团体和裂开的oligodeoxyribonucleotide坚实的支持。然而,在氨治疗我们观察到相当大的颜色变化,表明部分dG的退化(N2)3阿坝一半最终收益率低得不可接受大规模的合成。利用温和去phosphoramidites减少问题,但并没有消除它。因此,我们使用了另一种策略,证明是成功的。固相合成后,治疗集中在室温下氨裂解tritylated oligodeoxyribonucleotide从固体和删除酰基和氰乙基保护团体的支持。溶剂蒸发和净化后通过反相高效液相色谱法,谱证实,主要产品是NPE-protected dG (N2)3 nba含低聚物(6)。后续治疗TBAF肺水肿保护组和添加删除1 M Na2减少了dG的硝基(N2)3 nba dG的相应的氨基酸(N2)3 aba (7)的收益率(计划2)。净化后的反应产品额外的高效液相色谱法,谱分析表明,主要产品是理想的dG (N2)3包含oligodeoxyribonucleotide aba(补充材料)。

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3.2。dG的核磁共振光谱(N23)aba双

二维核磁共振光谱证实3 aba纯化样品的存在,允许转让其芳香质子(图2)。的芳香地区NOESY (300 ms混合时间)光谱在100% D2O磷酸盐缓冲剂,pH值6.9,显示一组相当锋利的质子信号,表明受损的复式假设主要在室温下稳定的构象(图2(一个))。NOE 3 aba质子间的相互作用尤为强劲,很容易区分他们从交叉峰的起源于复式的芳香核苷酸质子(图2 (b))。DQF-COSY光谱相同地区的对角线以来很简单只显示信号的质子标量耦合,特别是cytosine-H6和3 aba质子。因此,3 aba (H1)质子没有DQF-COSY光谱(用一个箭头表示),但表现出很强的一个互动3 aba (H11),在海湾地区的空间非常接近3 aba(图2)。从这里,识别其余3 aba质子是简单,除了H4和编辑的具体作业模棱两可。标签在图23 aba质子的任务列表。

3显示扩展base-H1′糖质子地区相同的300 ms混合时间NOESY谱。每个基地质子(嘌呤(H8)或嘧啶(代替)的双工展出一个交互自己和5′侧翼H1′糖质子,表明3 aba-damaged双采用右手螺旋构象的解决方案。然而,笨重的芳香一半确实引起了一些理想的b形式构象的扰动,就是明证的缺席A11 (H8) A11 (H1′) intraresidue交互(图3空盒子)和弱强度检测A11 (H8) c10 (H1′)和A13 (H8)病人(H1′)交叉峰的。此外,一些质子信号表现出不同寻常的化学位移值,包括C6 (H1′)和A11 (H1′),共鸣在4.43和5.34 ppm,分别,这表明3 aba一半位于双小沟的5′端指向修改链。这些化学位移值让人想起那些观察到工器包含其他笨重的加合物放置在小沟,比如dG (N2之前)空军联队,一个小小的acetylaminofluorene病变特征是我们的实验室24),或者进行了广泛的研究反式dG (N2)- b P加合物(31日,32]。

3.3。dG的稳定性(N23)aba双

紫外线融化曲线的分析表明,自补dG的熔化温度(N2)3 aba双约7.5°C高于未修改的控制样本(图4)。范霍夫受损的热力学参数双显示一个大的熵增加,过度补偿2.6千卡/摩尔焓增加,导致3.0千卡/摩尔吉布斯自由能的减少30°C(表1)。由于双对称,有两个dG (N2)3 aba每双分子加合物,原则上,可以提供独立的吉布斯自由能的减少或显示额外的自己之间的相互作用。自从3 ABA双有四个未损坏的G·C碱基对(显示常规的一个交互)分离受损的核苷酸,ABA半个相距太远(17 b形式DNA)期待任何直接互动。因此,单个dG的双稳定作用(N2)3 aba病变5′-TXC序列上下文是1.5千卡/摩尔在30°C。


,千卡每摩尔 大卡/摩尔·K ,千卡每摩尔 ,千卡每摩尔 ,千卡每摩尔

dG ( 3)ABA双 −1.5
控制双

尽管缺乏提炼dG的三维模型(N2aba) 3双,有趣的是比较稳定的影响不同的dG (N2)小沟病变。我们之前的研究总干事(N2)-AAF-containing双显示acetylaminofluorene相当稳定的双螺旋结构的一部分。疏水芴基驻留在双工的小沟深处,取代水分子和溶剂将只有10%的表面。因此,一个重要的熵增加超过弥补了温和的焓双的不稳定,导致减少1.8千卡/摩尔每个病变(吉布的自由能24),更大的效果观察到这里总干事(N23)aba加合物。类似于空军联队的情况下,总干事(N2)3 aba病变位于双小沟和展品沿着海湾的一个几乎相同的拓扑区域边缘的加合物(图5)。很自然的期待,然而,3 aba一半,比空军联队残留物被笨重,超越边界的小沟,使更大的部分疏水环系统的水,从而减少整体稳定的影响相对于前者。此外,5′lesion-flanking碱基对不同dG (N2)空军联队和dG (N2)3 aba工器及其贡献稳定增加可以略有不同。与空军联队和3 aba病变的情况下,dG的存在(N2)- (反式)B[一]P降低了损坏的热力学稳定双工(33]。在后一种情况下的主要结构差异是病变(图的拓扑5),最重要的是sp3杂交结果的链接碳曝光的一张脸的B P一部分溶剂(31日,32]。此外,不同序列之间的上下文dG (N2)3 aba和dG (N2)- (反式)B[一]P病变也可能扮演一个角色在解释这些加合物的稳定性的影响。

dG的DNA稳定作用(N2)3 aba是共享只有一些笨重的病变,特别是dG (N2)空军联队加合物24),总干事(N7黄曲霉毒素B)和fapy-dG加合物1(34,35]。与空军联队和黄曲霉毒素B1,3-nitrobenzanthrone是一个丰富的环境污染物在发达国家和3-NBA产生病变的性质可能有助于解释随机突变和零星的癌症的发病率。当前模型的核苷酸切除修复(尼珥)通路假定笨重的病变的识别是由传感当地不稳定(36- - - - - -38)或改变构象流动(39引起的加合物。在良好的协议与这些概念,包含dG双螺旋DNA(热力学稳定的增加N2)空军联队加合物与异常相关的长寿命损伤鼠基因组DNA (25]。最近的研究发现,dG (N2)3 aba坚持大鼠DNA在很长一段时间后一个nba滴剂3 (21]。我们的观察,dG (N2)3 aba增加双稳定与采用单一溶液中的构象指向一个机械的解释细胞DNA的持久性。然而,仔细观察dG的识别(N2)3 aba损害由尼珥系统需要在这些想法可以得到确认。这样的调查和NMR结构测定dG (N2)3 aba-containing DNA目前正在进步。

4所示。结论

环境污染物3-nitrobenzanthrone是其中一个最有效的细菌突变剂,在哺乳动物细胞有很强的诱变活性。细胞活化亲电中间体后,它与DNA反应形成嘌呤加合物包括普遍dG (N2)3 aba病变。这里我们报道一个高效的合成方法,将低聚物的DNA的损伤在任何序列情况下,打开门未来定位诱变和DNA修复研究。我们还提交了证据,显示dG (N2)3 aba增加破坏稳定的双工,发现以前观察到与其他dG (N2)损伤和相关联的长余辉加合物在大鼠组织。我们的研究结果表明,缺乏热力学不稳定的DNA是一个关键因素在庞大的识别尼珥通路的病变。

确认

批准号ES017368来自美国国立卫生研究院的支持本研究。作者感谢罗伯特Rieger和蛋白质组功能石溪大学的高分辨率质谱。共享仪器格兰特S10-RR023680-1支持石溪大学蛋白质组功能。他们也感谢Shibani Bhattacharya博士,Kaushik Dutta博士和迈克尔·高格(纽约结构生物学中心)为他们的援助。支持的中心是一个明星中心办公室纽约州科学、技术和学术研究。核磁共振资源由国家卫生研究院P41 GM66354。

补充材料

1H,13C和高分辨率质谱的核苷衍生物3、4和5;高分辨率质谱的总结表相同的化合物和ESI dG的质谱(N2)3 nba和dG (N2)3 aba 14-mer工器是可用的。

  1. 补充材料

引用

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