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研究文章|开放获取
Panpan张通苏、蜀, ”综合分析MEX3A预后价值及其与卵巢癌免疫浸润的关系”,免疫学研究期刊》的研究, 卷。2021年, 文章的ID5574176, 21 页面, 2021年。 https://doi.org/10.1155/2021/5574176
综合分析MEX3A预后价值及其与卵巢癌免疫浸润的关系
文摘
MEX3A是一个关键的rna结合泛素连接酶调节各种类型的癌症。然而,MEX3A与预后的相关性及其在卵巢癌的分子机制(OC)尚不清楚。预后价值,表达水平和MEX3A的遗传变异进行了分析通过基因表达分析交互式分析(GEPIA) Oncomine kaplan meier绘图仪,cBioPortal。我们使用了LinkedOmics数据库调查的功能MEX3A coexpressed基因和执行可视化基因相互作用网络分析GeneMANIA网站。MEX3A和癌症之间相关性免疫渗透分析肿瘤免疫评估资源(计时器)网站和TISIDB数据库。此外,在体外分析评估MEX3A OC细胞的生物功能。我们的研究表明,OC的MEX3A的表达高于正常组织;度最大的预后价值,和强大的物理与PABPC1互动,LAMTOR2, KHDRBS2,和IGF2BP2表示MEX3A和免疫之间的关系渗透。我们还发现MEX3A渗透水平是负相关的几种类型的免疫细胞,包括巨噬细胞、中性粒细胞、树突状细胞(dc), B细胞、CD8 + T细胞。此外,在体外实验表明,MEX3A促进细胞增殖和迁移的OC。综上所述,MEX3A可能影响OC生物功能的细胞通过调节免疫微环境中渗透预后的生物标志物和潜在的治疗目标。
1。介绍
卵巢癌(OC)是一种常见的妇科恶性肿瘤死亡率高。超过70%的OC被诊断为晚期癌症患者(III和IV) [1]。虽然在卵巢癌手术和化疗的发展一直在最近的几十年里,先进的传统治疗的好处是有限的(2]。最近,免疫治疗提供了一种新颖的和有前途的治疗策略。不过,免疫疗法,已迅速发展导致许多领域取得重大突破,不能达到良好的治疗效果,因为一个特殊的肿瘤免疫微环境(3]。像许多其他实体肿瘤,OC是免疫原性,免疫激活和免疫抑制之间的不平衡会导致肿瘤发生和癌症进展。因此,需要选择和确定可靠的几种生物标志物和新颖的免疫治疗策略目标必要的早期诊断OC。
MEX3A Mex3家族是一个重要的组成部分,具有保守地区约70个氨基酸,包括MEX3A MEX3B, MEX3C, MEX3D [4]。MEX3A是一种rna结合蛋白(RBPs)的高度保守的rna结合域和c端无名指域参与转录后的调控机制(5]。最近,MEX3A已经作为一种新型生物标志物促进增殖和迁移等各种癌症的胰腺导管腺癌(PDA)、肝癌和结直肠癌6- - - - - -8];然而,它的作用在OC尚不清楚。
在这项研究中,我们调查了mRNA表达、突变模式,和预后价值的MEX3A OC首次基于大型数据库分析包括Oncomine GEPIA, cBioPortal PrognoScan, kaplan meier绘图仪。我们也探讨coexpression基因的功能与MEX3A澄清去KEGG OC的潜在机制。此外,我们发现MEX3A的表达和免疫之间的潜在关系渗透在通过定时器和TISIDB OC微环境。我们进一步证明MEX3A增强肿瘤体外增殖和迁移。总的来说,我们的研究结果显示MEX3A的重要作用,提供了一种新颖的目标和有价值的洞察底层机制在OC MEX3A和肿瘤免疫之间的相互作用。
2。材料和方法
2.1。Oncomine分析
MEX3A mRNA表达水平进行了分析在OC Oncomine平台(http://www.oncomine.org/),一个公开访问,在线与715年癌症基因芯片数据库数据集和86733个样本,允许一个强大的全基因组表达分析(9]。我们选择一个0.01和2的褶皱变化值作为阈值,和排名前10%的重要基因。
2.2。GEPIA分析
基因表达分析交互式分析(GEPIA)是一个互动网络用于分析RNA序列表达式,包括癌症基因组图谱(TCGA)肿瘤样本信息和Genotype-Tissue表达式(GTEx)正常样本信息。GEPIA提供了一系列关键交互和可定制的功能通过使用一个标准的处理管道(http://gepia.cancer-pku.cn)[10]。
2.3。cBioPortal分析
癌症基因组学cBioPortal (http://cbioportal.org)提供了一个在线资源探索、可视化和分析复杂TCGA癌症基因组学和临床资料数据(11]。在这项研究中,cBioPortal用于访问基因变异在MEX3A(放大、深删除和错义突变),DNA拷贝数的改变,mRNA的表达 - - - - - -分数(RNA Seq V2 RSEM)。OncoPrint的选项卡显示概述MEX3A每个样本的基因改变。此外,coexpression数据集进行分析根据cBioPortal的在线指导,和R包被用于进一步富集分析。
2.4。LinkedOmics
LinkedOmics (http://www.linkedomics.orglogin.php)是一个公开的web工具用于提供multiomics TCGA 32癌症类型的数据(12]。我们使用了linkInterpreter模块获得生物见解coexpressed基因浓缩利用皮尔森相关系数。这些基因在火山情节和热图。
2.5。功能富集分析
进一步探索MEX3A的功能、基因本体论(去)浓缩基因和基因组的分析和京都百科全书(KEGG) R中的富集分析进行统计计算环境。
2.6。GeneMANIA
GeneMANIA (http://www.genemania.org)是一种灵活的、友好的web接口,用于可视化基因相互作用网络和评估基因功能(13]。它使分析的基因列表和重视标志与MEX3A相关基因的功能分析。网络的边缘的来源,这代表以下生物信息学方法,即物理交互,coexpression,主机托管,遗传相互作用,和网站预测,。
2.7。计时器数据库分析
获取MEX3A TCGA MEX3A和免疫细胞间表达和相关数据集,在线分析工具叫做“肿瘤免疫评估资源(时间)”使用。定时器是一个在线数据集用于评估临床协会之间的关系,突变,大会,渗透不同免疫细胞(B细胞、CD4 + T细胞、CD8 + T细胞,中性粒细胞,巨噬细胞、树突细胞)在不同癌症类型(14]。提供的生存模块还显示kaplan meier绘图仪和临床因素的多变量Cox回归分析(年龄、阶段和肿瘤纯度)。一旦所有条件定义,定时器输出显示Cox回归结果,包括风险比率(人力资源),95%可信区间(CI),统计学意义( )自动。
2.8。TISIDB分析
TISIDB (http://cis.hku.hk/TISIDB)是一个用户友好的门户网站,其中包含988年总结的几种抗肿瘤基因30 TCGA癌症类型(15]。基因表达和免疫之间的关联特性,包括淋巴细胞,免疫调制剂,亚型,趋化因子,计算了高通量数据分析。在这项研究中,我们使用TISIDB web分析MEX3A表达之间的相关性及临床阶段,淋巴细胞亚型的免疫调制剂OC。
2.9。kaplan meier绘图机分析
kaplan meier绘图机(http://www.kmplot.com)是一种常见的工具,生物标志物用于评估生存和预后,包括基因表达数据和生存信息的1816 OC患者临床组织样本16]。总生存期(OS)和无进展生存(PFS)的OC患者由分两组(高与低表达式)患者的值。此外,我们进一步研究了操作系统和PFS不同的组织学亚型(endometrioid和浆液性)在使用kaplan meier MEX3A方法。这些数据进行评估与风险比(人力资源),95%可信区间(CI), log-rank价值。
2.10。PrognoScan数据库分析
MEX3A表达与预后的关系分析了OC PrognoScan数据库(http://www.abren.net/PrognoScan/),比如操作系统和PFS [17]。考克斯阈值调整值< 0.05或纠正值< 0.5。
2.11。细胞培养和转染
ES2细胞类型文化集合的获得中国科学院(中国上海)和在杜尔贝科的修改鹰培养基培养(DMEM;HyClone;通用电气医疗集团生命科学)与10%的边后卫在37°C和5%的公司2。ES2细胞融合(70%)被播种在6-well盘子转染MEX3A siRNAs设计并合成了GenePharma(上海,中国),这是使用Lipofectamine 2000(转染到细胞表达载体;热费希尔科学)根据协议表达MEX3A干涉;这些细胞被培养48 h或72 h进行进一步化验。
2.12。细胞计数Kit-8 (CCK-8)测定和集落形成试验
转染细胞被播种在96孔板的密度 细胞/。CCK-8解决方案(10μl;Dojindo实验室、熊本、日本)被添加到每个盘子里。板是2 h的孵化器,孵化和每个波长450 nm的吸光度测量使用自动酶联免疫检测器。
集落形成试验,转染细胞被播种到6-well盘子。一周后,这些细胞被固定用4%多聚甲醛和沾0.5% (/结晶紫。然后,细胞克隆拍摄和计算。这些实验进行了一式三份。
2.13。5-Ethynyl-2-Deoxyuridine (EdU)染色试验
收集细胞被播种24-well板的密度 细胞/好,孵化24 h。根据协议的EdU工具包(BeyoClick™EdU细胞增殖工具包和Alexa萤石488;Beyotime、上海、中国),转染后,EdU添加1:1000细胞中2小时在37°C。细胞和4%多聚甲醛固定15分钟,接受0.3% Triton-X在室温下10分钟。然后,这些细胞被孵化与点击反应30分钟鸡尾酒在黑暗中。核沾染了赫斯特33342年10分钟。照片拍摄于三个随机选择的字段和一个奥林巴斯显微镜(日本东京)分析扩散率。每个实验进行至少三次。
2.14。Transwell化验和伤口愈合试验
细胞( 细胞/)在100年被孵化μl培养基和播种Transwell插入(康宁玻璃作品;美国纽约康宁)8μ米孔决定细胞的迁移能力。一个600μl培养基添加到众议院。48小时后,插入和95%乙醇固定,和0.5% (/)采用结晶紫染色。迁移细胞数在5个不重叠的位置。
分析伤口愈合,我们播种转染细胞6-well盘子。当细胞密度达到80 - 100%,我们刮细胞的底部使用无菌200井μl吸管顶端形成一个线性差距和文化治疗细胞FBS-free DMEM。24小时后,图像的井被倒置荧光显微镜。所有化验都至少重复三次。
2.15。定量实时聚合酶链反应
总RNA提取使用试剂盒试剂(表达载体;热费希尔科学)。根据制造商的指示,总RNA浓度测量使用热费希尔科学NanoDrop nd - 100。互补脱氧核糖核酸合成使用SYBR PrimeScript rt - pcr试剂盒(豆类生物有限公司、日本)。实时PCR进行了使用热循环骰子™实时系统Tp800(豆类生物有限公司)。引物序列为MEX3A而设计的β肌动蛋白如下(5 - - - - - -3 ):TGGAGAACTAGGATGTTTCGGG MEX3A、前进,相反,GAGGCAGAGTTGATCGAGAGC;和β肌动蛋白、前进、CATGTACGTTGCTATCCAGGC CTCCTTAATGTCACGCACGAT和反向。目标基因的mRNA表达进行了分析使用方法。
2.16。西方墨点法
总蛋白从细胞获得使用冰冷的缓冲与蛋白酶抑制剂混合鸡尾酒里帕(罗氏)和浓度由BCA化验分析。50微克的变性蛋白sds - page分离10%,转移到PVDF膜。阻塞后5%的脱脂牛奶1 h在室温条件下,膜被孵化与抗体MEX3A (1: 1000;ab79046;Abcam)一夜之间在4°C,其次是孵化与二次抗体(1:3000;# A0208;Beyotime、北京、中国)在室温下1 h。ECL检测工具是用来检测蛋白质的信号。
2.17。免疫组织化学染色(包含IHC)
MEX3A表达式被包含IHC检测评估,使用先前描述的协议(18]。Anti-MEX3A抗体(ab79046;Abcam)使用1:50稀释在一夜之间在4°C。兔免疫球蛋白G (1: 1000;ab6721;Abcam)作为一种消极的控制。Aperio扫描系统(Aperio集团有限责任公司)是用来扫描幻灯片,和Aperio图像范围软件(版本10.2.2.2317 Aperio技术)被用于进一步的定量分析。
2.18。统计分析
生存分析使用kaplan meier方法进行了分析。去浓缩分析和KEGG浓缩分析R计算环境下进行。统计分析使用GraphPad Prism 7.0(美国GraphPad软件,拉霍亚,CA)。比较被小动物——一张长有学生的表现 - - - - - -测试。值< 0.05被认为是具有统计学意义。数据表示为 (SD)。
3所示。结果
3.1。高表达水平和预后价值MEX3A卵巢癌的生物信息学分析
MEX3A首先,确定差异表达在肿瘤和正常组织,MEX3A mRNA水平在不同的肿瘤和正常组织的各种癌症类型使用Oncomine数据库进行了分析。数据库,共有241个独特的样本MEX3A,总共22癌症,包括大脑和中枢神经系统癌症,乳腺癌、结肠直肠癌、卵巢癌,表明MEX3A mRNA水平显著调节在各种癌症,在OC和MEX3A表达高5(图S1a)。GEPIA分析也显示了类似的结果(图印地)。
接下来,我们发现,OC MEX3A表达显著增加在426 OC的病例和88例正常卵巢组织通过GEPIA(图1(一))。为了澄清结果,OC组织的表达差异(40瑞金医院样本)和正常卵巢组织(25瑞金医院样本)也验证了包含IHC染色(图1 (c))。
(一)
(b)
(c)
(d)
此外,我们调查是否MEX3A在OC与预后相关的患者通过使用kaplan meier绘图仪和PrognoScan。kaplan meier绘图仪和PrognoScan数据库显示,OC MEX3A高表达患者经历了糟糕的操作系统和PFS(数字1 (b)和1 (d)、表1)。为了探索不同组织学的预后价值,数据库显示,高MEX3A表达与短操作系统和PFS endometrioid和浆液性癌症患者(数字S1c-e)。集体,MEX3A可以被视为一个独立的预后生物标志物与OC的可怜的存活率。
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3.2。MEX3A表达式与免疫OC渗透水平
为了更好地理解底层机制MEX3A OC,我们进一步研究了MEX3A和免疫系统之间的关系。肿瘤浸润免疫细胞(TIICs)是肿瘤微环境的重要组成部分,哪些是癌症生存的独立预测指标。目前尚不清楚目标MEX3A可能影响招聘的数量TIICs影响癌症的预后。通过定时器的分析,我们发现,大多数免疫细胞与MEX3A负相关表达式(图2(一个))。MEX3A表达式与B细胞负相关,CD8 + T细胞,中性粒细胞和树突状细胞(dc),和巨噬细胞。然而,MEX3A有弱的表达对CD4 + T细胞在OC。随后,我们使用TISIDB数据库进一步分析MEX3A表达和免疫调控之间的关系。数据2 (b)和2 (c)显示MEX3A表达之间的相关性和尖,这与上面的结果报道。免疫调制剂可以进一步分为immunoinhibitors, immunostimulators,主要组织相容性复合体(MHC)分子。此外,我们评估了相关性MEX3A表达和多样化的免疫调制剂。数据2 (d)和2 (e)表明MEX3A表达之间的相关性和immunostimulators,最大的相关性包括C10orf54(枪兵: , ),TNFRSF18(斯皮尔曼的: , ),TNFRSF14(斯皮尔曼的: , ),和TNFRSF13C(枪兵的: , )。数据2 (f)和2 (g)表明MEX3A水平之间的相关性和immunoinhibitors,最强的包括IL10RB(枪兵: , ),IDO1(斯皮尔曼的: , ),VTCN1(斯皮尔曼的: , ),和HAVCR2(枪兵的: , )。MEX3A表达之间的相关性和MHC分子也探索,和最大的相关性包括B2M(枪兵: , ),HLA-DMA(斯皮尔曼的: , ),HLA-DPA1(斯皮尔曼的: , ),和HLA-DPB1(枪兵的: , )(数据3(h)和3(我))。因此,MEX3A可能参与-免疫调节。
(一)
(b)
(c)
(d)
(e)
(f)
(g)
(h)
(我)
3.3。富集分析Coexpression基因与MEX3A OC
接下来,我们分析了信使rna序列数据从OC TCGA患者通过使用LinkedOmics的功能模块。如火山地块(图所示2(一个)黑暗),2596个基因(红点)与MEX3A显示显著的正相关性,和3050个基因(黑绿点)显示显著负相关性( )。50重要基因集(如ACTBL2 C12orf43 CCDC56, CCL27, CPNE8, FAM78B, KCTD17,和LAMB4)积极和消极与MEX3A热图(数据所示2 (b)和2 (c))。这些结果表明MEX3A在转录组水平的重要影响。除此之外,一项分析表明,高表达基因与MEX3A相关性主要是位于染色质中心体和核染色体的部分,他们大多参与mRNA加工,共价染色质修饰和组蛋白修饰。可怜的表达基因主要位于核内体膜,分泌颗粒膜,和侧膜和参与的几种处理,包括嗜中性粒细胞和淋巴细胞激活T细胞激活和调节(数字4 (d)和4 (e))。KEGG路径分析显示最重要的浓缩的单纯疱疹病毒感染1高表达基因和cytokine-cytokine受体表达基因的交互数据4 (f)和4 (g))。这些数据指出,MEX3A可能促进肿瘤进展通过调节肿瘤微环境中免疫细胞反应。
(一)
(b)
(c)
(d)
(e)
(f)
(g)
3.4。基因改变的MEX3A OC
基于上述分析,MEX3A密切相关,肿瘤免疫学。为了更好地理解MEX3A癌症的潜在的免疫机制,遗传变异TCGA MEX3A检索的数据库(2011年489例,自然)通过使用cBioPortal数据库进行了分析。结果显示mRNA表达变化60例(16%),放大在38例(10%),1例(0.3%)的突变和多个改变19例(5%),其中放大是最常见的类型(图5(一个))。此外,771个基因的表达呈正相关MEX3A和增加MEX3A的放大。在这些基因中,LAMTOR2最频繁的变化(表2)。LAMTOR2至关重要的巨噬细胞和树突细胞(DC)体内平衡通过调节免疫反应(19,20.]。大大丰富了分析表明,这些基因编码的蛋白质,主要是局部cornified信封(数字5 (b)和5 (c))。他们主要是参与免疫球蛋白绑定,免疫球蛋白绑定,绑定和愤怒记者。
(一)
(b)
(c)
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3.5。一个基因基因相互作用网络的建设
进一步探索MEX3A的潜在机制在促进OC进展,我们建造了一个基因基因相互作用网络通过使用GeneMANIA数据库。其功能也进行了分析。MEX3A包围20节点代表基因在很大程度上与家庭相关的物理交互,coexpression,预测,colocalization、通路、基因相互作用,和共享蛋白质域。从结果(图3),我们发现PABPC1,一种蛋白质往返细胞质和细胞核在大多数真核生物,是物理与MEX3A交互。PABPC1是重要的蛋白翻译起始和衰变绑定调控蛋白(21]。此外,KHDRBS2 IGF2BP2和MEX3A蛋白质域共享。KHDRBS2也是一个rna结合蛋白酪氨酸磷酸化的Src在有丝分裂期间(22]。IGF2BP2与STRA6与。进一步的功能分析显示,大多数蛋白质都极大地与骨骼系统开发和生殖器发展。
3.6。MEX3A促进卵巢癌细胞增殖、迁移和入侵在体外
生物功能的进一步评估MEX3A卵巢癌,MEX3A的表达在不同的细胞系进行了测试,和在体外研究(图执行6(一))。ES2细胞系的选择进行进一步的研究。我们沉默MEX3A表达式由核,不属预定目标的核被用作控制。效率被西方墨点法和rt - pcr(数据评估6 (b)和6 (c))。我们首先研究了影响OC增长通过使用CCK8化验,克隆形成试验和EdU化验。与正常对照组相比,MEX3A击倒在一定程度上抑制OC的增殖细胞( ,图6 (d))。同样,殖民地的数量明显小于对照组( ,图6 (e))。EdU是一个胸腺嘧啶核苷类似物,参与DNA复制时针对增殖细胞。ES2细胞的增殖活动可以分析红色/蓝色荧光斑点的数量。图6 (f)显示,与对照组相比,击倒MEX3A显著抑制EdU的吸收速度,这也表明抑制增殖能力。接下来,我们评估的角色MEX3A击倒OC的迁移能力。Transwell化验和伤口愈合进行了分析,结果表明,MEX3A击倒显著抑制细胞迁移在ES2细胞相比,对照组(数字6 (g)和6 (h))。总的来说,这些结果表明,MEX3A可以促进OC细胞的增殖和迁移。
(一)
(b)
(c)
(d)
(e)
(f)
(g)
(h)
4所示。讨论
OC通常是发现在后期阶段;因此,一些病人有资格获得及时的治疗。敏感的和具体的标志物的改善诊断和准确评估预后仍然是一个重要的研究焦点。在这项研究中,我们探索了小说gene-MEX3A-which rna结合蛋白或E3泛素连接酶转录后的调控,与OC的诊断和预后有关。MEX3A在生物过程具有重要作用。其表达与肠道内稳态调节肠道分化、促进肠道干细胞标志物的高表达(LGR5就,BMI1 MSI1) [23,24]。此外,很少有研究评估MEX3A对肿瘤的影响。异常激活MEX3A能促进肿瘤细胞增殖、转移和迁移在胃癌和胰腺导管腺癌,乳腺癌,骨肉瘤(6,25- - - - - -27]。例如,MEX3A可以作为乳腺癌的肿瘤促进剂通过调节PIK3CA。MEX3A也可以把rig - i促进其ubiquitylation和,蛋白酶体依赖降解,有利于肿瘤发生[28]。
然而,MEX3A函数的机制尚未阐明OC。我们所知,这是第一个研究报道的角色MEX3A OC通过公共测序数据的生物信息学分析来指导未来的研究在OC。
首先,预后分析的结果表明,upregulation MEX3A mRNA表达的最伟大的相关性较差的OS和PFS OC的病人。此外,我们进行了一系列体外实验,证明了OC的抑制发展MEX3A击倒。因此,我们推测,MEX3A是极其重要的OC患者的预后指标,可作为预测肿瘤的扩散和转移。这些结果是一致的膀胱癌,肺腺癌,神经胶质瘤(29日- - - - - -31日]。梁等人发现MEX3A可以提高LAMA2 mRNA的不稳定性,促进肺腺癌转移的PI3K / AKT途径。此外,他们报告说,MEX3A施加其诱导神经胶质瘤肿瘤发生泛素化作用。
探索的具体机制MEX3A OC,综合生物信息学分析MEX3A已经执行。基因组拷贝数变异(CNVs)有着更大的意义在人类疾病,特别是癌症,从而导致表型的差异(30.]。我们发现的主要CNV类型MEX3A被放大,这是与短生存有关。此外,邻近基因网络接近MEX3A通常表现出不同程度的放大OC。基因与MEX3A coexpressed受到功能和通路富集分析,结果表明,他们主要是参与免疫反应过程在肿瘤发生和发展的卵巢癌。
我们还构建了一个基因基因相互作用网络。结果表明,MEX3A集中与其他基因相互作用,如PABPC1和LAMTOR2。PABPC1报道绑定mrna的保利(A)反面,调节的稳定性和biofunction lncRNAs,在OC发展具有至关重要的作用[31日,32]。PABPC1可以促进hnRNPLL绑定(等离子体特异性RBP)免疫球蛋白mRNA和规范从开启转向叹息在浆细胞(33]。玉等人报道,PABPC1可能包括先天免疫监视通过调节NK细胞的活性(34]。LAMTOR2,监管机构/ LAMTOR复杂的成员,AKT / mTOR调节树突细胞内稳态(20.]。他们暗示MEX3A可能在免疫结合PABPC1必不可少的作用。因此,这些结果表明,MEX3A及其相关基因共同调控OC进程通过一个复杂的监管网络。
本研究的另一个重要方面是,MEX3A表达与免疫渗透OC。我们的研究结果表明适度的强势MEX3A表达水平之间的关系和浸润的巨噬细胞,中性粒细胞,树突状细胞(dc), B细胞、CD8 + T细胞。此外,免疫细胞激活和免疫调制剂以降低患者死亡率OC。在我们的研究中,我们评估了MEX3A与免疫系统之间的相关性通过定时器和TISIDB数据库,发现MEX3A有最大的相关性淋巴细胞(如B细胞、CD8 + T细胞,中性粒细胞,巨噬细胞和树突状细胞(dc)),免疫抑制剂(如IL10RB IDO1 VTCN1, HAVCR2), immunostimulators(如C10orf54 TNFRSF18 TNFRSF14, TNFRSF13C),和MHC分子(如B2M HLA-DMA HLA-DPA1,和HLA-DPB1)。因此,MEX3A,与这些相关的几种相关基因,可能在免疫治疗提供一个新的目标OC。
目前的研究也有一些局限性。首先,多数结果免疫转录水平可能反映了某些方面的渗透。同时,报告需要确认与更大的临床样品和实验数据使用分子生物学技术。最后,我们计划进一步深化我们理解底层机制相关的免疫调制剂MEX3A在我们未来的工作。
总之,本研究表明,高MEX3A表达与预后不良相关和巨噬细胞的免疫渗透水平增加,中性粒细胞,树突状细胞(dc), B细胞、CD8 + T细胞在OC。我们的研究提供了一个新颖的见解MEX3A作为癌症生物标志物的潜在作用从肿瘤免疫学的角度。
数据可用性
之前报道[RNA-Seq] TCGA数据被用来支持这项研究和可用GEPIA (doi: 10.1093 / nar / gkx247) cBioPortal (doi: 10.1126 / scisignal.2004088) LinkedOmics (doi: 10.1093 / nar / gkx1090)和kaplan meier绘图仪(doi: 10.1530 / erc - 11 - 0329)。这些先前的研究(和数据)是在相关地方引用文本中引用(9- - - - - -11,15]。没有研究数据用于支持本研究。
的利益冲突
作者宣称没有利益冲突。
作者的贡献
Panpan张和通苏贡献同样这项工作。
确认
这项工作得到了国家自然科学基金(ID 81672564张蜀)。
补充材料
图S1: MEX3A mRNA表达水平的各种癌症和预后价值在卵巢癌MEX3A kaplan meier绘图仪。(一)从Oncomine MEX3A在各种癌症的表达。阈值的目的是使用以下参数: 和 。颜色的强度(红色或蓝色)成正比。差别upregulation的显著性水平或对这些(b) MEX3A表达水平在不同的肿瘤类型TCGA数据库由GEPIA决定。(c, d) MEX3A在卵巢浆液性癌的预后意义。(e, f) MEX3A endometrioid癌的预后意义。 , ,和 。(补充材料)
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