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Ecotope-Based昆虫的监测和分子Xenomonitoring耐药疟原虫按蚊向量
图3
的系统发育关系间日疟原虫二氢叶酸还原酶(DHFR)同族体。所有代表的多序列比对DHFR同系物间日疟原虫MDR疟原虫种群进行了核苷酸和氨基酸水平。单的系统发育重建,这是测试1000次使用引导方法,构造了基于最大的吝啬方法通过使用大型版本。5.22 [76年]。DHFR单和haplogroups (G)的地理上的倾向间日疟原虫寄生虫赋予点突变负责抵抗antifols和砜类/磺胺类药补充文件所示S4网上(见补充材料http://dx.doi.org/10.1155/2014/969531)。从基因库基因组数据库,检索所有的核苷酸或氨基酸序列(加入数字)间日疟原虫DHFR同源染色体对应的感染源地理倾向间日疟原虫隔离包括Pvdibbt-1 (KC121333) Pvachtk-1 (KC121334)和Pvachtk-2 (KC121335)。这三个分离株的基因银行文件所示补充文件S1到S3。提交的限定符序列属于国家或地理区域和提交一年使用的系统发育分析。隔离分析来源包括大部分的病人容易地理上的隔离间日疟原虫寄生虫和一个较小的程度上*蚊子隔离和* *实验室的间日疟原虫血液无性阶段。使用标准的国家代码(http://www.eurogofed.org/calendar/codes.htm),国家被指示为DJ来源:吉布提,女友:法属圭亚那,ID::印度、印度尼西亚红外:伊朗,公里:科摩罗,基米-雷克南:韩国,MG:马达加斯加、MM:缅甸、PG:巴布亚新几内亚、PH值:菲律宾、SR:苏里南,SV:萨尔瓦多、TH:泰国、TL:东帝汶VN:越南,VU:瓦努阿图。