文摘

宿主因素如APOBEC3G与hypermutation有关,这可能会干扰乙肝病毒复制。需要评估APOBEC3G多态性的影响在一个肝炎B-infected人口突出了一项研究。因此,我们的研究旨在描述两个APOBEC3G单核苷酸多态性和评估他们的协会在慢性乙肝携带者在布基纳法索。他们招募了三百四十五(345)人,其中包括106 HBsAg阳性和239 HBsAg负面的。APOBEC3G rs6001417和rs8177832 DNA多态性基因分型的特点是TaqMan等位基因歧视。rs600417的小G等位基因频率高于参与者与慢性肝炎b .此外,rs600417与占主导地位的模式 。慢性乙型肝炎的危险因素多变量分析表明,慢性乙型肝炎的风险基因型CG和GG rs6001417似乎明显减少,分别或= 0.25 (95% CI 0.09 - -0.72, )和= 0.08 (95% CI 0.02 - -0.31, )。GG基因型的分析,rs8177832似乎增加了慢性乙型肝炎的风险超过六(6)时代,这是统计学意义或= 6.41 (95% CI 1.74 - -23.55, )。这项研究表明,APOBEC3G可能是慢性乙型肝炎病毒的易感性基因马车在我们的背景。轨迹可能导致主机本地抗乙型肝炎病毒感染的中介。

1。介绍

肝炎病毒感染是一个重要的公共卫生问题。超过2.96亿人生活在慢性乙型肝炎感染。此外,在世界范围内,有超过820000人死亡导致的肝硬化和肝细胞癌(原发性肝癌)1]。在布基纳法索,大约10 - 14%的普通人群感染了乙型肝炎(2]。众所周知,乙肝病毒在非洲是肝癌的主要原因。约40%的男性和15%的女性获得了乙肝病毒位围产期高危的死于肝硬化或肝癌。撒哈拉以南非洲国家支付的最高人数,肝细胞癌患者有一个年轻的形象,是国家的经济和发展的潜在动力(3,4]。乙肝病毒感染的临床结果取决于病毒复制和宿主免疫反应之间的复杂的相互作用。宿主遗传、病毒和环境因素也被认为控制疾病发展,进展,或回归5- - - - - -7]。APOBEC3G(载脂蛋白B messenger-RNA-editing酶,催化peptide-like 3 g) APOBEC3家族的一系列制约因素,单链DNA脱氨酶抑制病毒的复制步骤的逆转录(8]。结果表明:APOBEC3G 3 B, 3 c, 3 f可以抑制乙型肝炎病毒(HBV)复制后不久发现hiv - 1复制抑制相同的蛋白质(9- - - - - -11]。乙型肝炎病毒是一种双链DNA病毒逆转录一步在其复制;APOBEC3G脱氨基与乙肝病毒的新- DNA链(12,13]。此外,APOBEC3G与hypermutation有关,这可能会干扰乙肝病毒复制(14]。APOBEC3G单核苷酸多态性(snp)在这项研究中,调查rs6001417, rs8177832,小G等位基因频率的0.37和0.34,分别在非洲人(15]。在布基纳法索,APOBEC3G多态性等H186R (rs8177832)和rs6001417与易感性有关艾滋病毒合并感染艾滋病毒/乙型肝炎(16,17]。后者的研究强调了需要评估APOBEC3G多态性对肝炎B-infected种群的影响。因此,我们的研究旨在评估协会两个多态性(snp) APOBEC3G在慢性乙肝携带者。

2。方法

2.1。参与者

横向研究进行了345个人,包括106 HBsAg阳性和239 HBsAg负在圣卡米尔医院招募了2012年和2015年之间(河北远洋运输)董事长高彦明和皮特隆安妮冈生物分子研究中心在瓦加杜古(CERBA)。长期性决定基于六个月的记录显示HBsAg阳性测试(18]。

2.2。样本收集、乙肝病毒血清学检测,丙肝病毒/ HBV /艾滋病毒检测,和乙肝病毒血浆病毒载量量化

静脉穿刺获得的血液样本,从干燥管和离心分离血清血浆从EDTA-coated管。血清是首先筛查HBsAg马车使用RDT艾博生物测试。其次,为hiv - 1的屏幕,乙肝病毒和丙肝病毒,DNA和RNA提取血清使用基因组DNA表达工具列(Sacace生物技术,科莫,意大利)根据制造商的指示。然后我们使用丙肝病毒和乙肝病毒/艾滋病毒实时PCR试剂盒(Sacace生物技术,科莫,意大利),检测三种病毒的存在。乙肝病毒载量当时量化乙肝病毒阳性的样品第三,使用genesig乙肝病毒实时定量工具(Primerdesign,南安普顿,英国)。

2.3。DNA提取和APOBEC3G多态性基因分型

为APOBEC3G基因型多态性rs6001417 rs8177832,从全血中提取基因组DNA细胞使用«DNA快速盐析»技术被米勒et al。19]。

TaqMan SNP检测(ABI,培育城市,CA)被用来确定不同基因型的rs6001417和rs8177832根据制造商的指示7500快速实时PCR(美国加州生活技术)。实现实时PCR反应总额的25μL包含5μ(4 ng / L的DNAμL), 12.5μL TaqMan普遍PCR反应混合液(2 x), 6.25μ和1.25 L nuclease-free水μL的SNP (40 x)。PCR扩增条件:一个周期在95°10分钟和四十个周期92°15秒和60 1分钟。不同的多态性为每个单核苷酸多态性rs8177832和rs6001417基因型AA与突变(⟶G)和CC (C⟶G),分别。

2.4。道德的考虑

从所有参与者也获得了知情同意表格。研究协议是卫生研究伦理委员会批准在布基纳法索(审议编号2014-7-086)。参与者和参与者的监护人给他们自由,知情同意。收集到的信息是匿名和保密。

2.5。统计分析

哈迪温伯格平衡决定使用权力标记软件3.25版。SPSS17.0统计软件SPSS,芝加哥,美国)是用于数据分析。计算平均HBV病毒载量在乙肝病毒阳性的人。的基线特征研究人口的性别和年龄范围确定。我们进行了卡方测试发现HBsAg-positive之间的显著差异和消极的人。此外,它也用于确定最好的继承模型。二元逻辑回归分析与估计潜在的混杂因素调整,包括年龄和性别进行了。数据时具有统计学意义 。

2.6。结果

研究人口由232名女性和113名男性。平均年龄为29.68±9.18;年龄小于30岁这个年龄段是最具代表性的HBsAg阳性和阴性,与76.40%和58.2%(表1)。

表1
基线特征。

据意味着HBV病毒载量在慢性乙肝病毒携带者是4.9 10ˆ6 UI /毫升。这两个单核苷酸多态性在哈迪温伯格平衡,如表所示2。单核苷酸多态性基因型频率结合逻辑回归的结果在表2。的基因型多态性rs6001417和rs8177832都寻求在我们的研究人群:rs6001417, 23.2%的野生型基因型CC,杂合的CG的50.1%,和26.7%的GG基因型;关于rs8177832, 27.5%的野生型基因型AA,杂合的AG)的49.3%,和23.2%的次要的等位基因的基因型GG。

表2
根据慢性HBsAg地位APOBEC3G基因型的频率。

小G等位基因的多态性rs6001417频率高于HBsAg-positive人(57.07%)相比,HBsAg-negative人(49.37%),但没有统计学意义,或= 1.36(95%置信区间CI = 0.98 - -1.89; )。CG基因型频率的杂合的个人在HBsAg阳性(55.70%)高于HBsAg负(47.70%)。之间的关联基因型和慢性乙型肝炎马车显著或= 2.07(95%置信区间CI = 1.10 - -3.89; )。此外,纯合子个体的基因型GG HBsAg-positive人之间的频率也更高(29.24%)相比,HBsAg负人,和基因型之间的关系GG与慢性乙型肝炎均有显著或= 2.03(95%置信区间CI = 1.01 - -4.08; )(表2)。

的小G等位基因多态性rs8177832 HBsAg-positive人之间的频率(47.60%)几乎是类似于在HBsAg-negative人(47.91%)。没有小G等位基因之间的联系和慢性乙型肝炎马车当比较两组,或一个= 0.99 (95% CI = 0.72 - -1.37; )(表2)。

我们的研究结果似乎表明,2单核苷酸多态性之间的关系和表面状态,根据添加剂,占主导地位的,和隐性的模型,最重要的基因型遗传模型rs6001417是占主导地位的模式:或= 2.06 (95% CI -3.76 = 1.12, )(表3)。rs8177832似乎没有模型显著。

表3
联系APOBEC3G SNPs和状态根据隐性,显性和隐性的模型。

慢性乙型肝炎的危险因素多变量分析表明,个人30多年几乎三倍有慢性乙肝的风险,或一个= 2.91 (95% CI 1.62 - -5.23, )。此外,它表明,男性慢性肝炎的风险降低,或= 0.22 (95% CI 0.13−0.37 0, )。此外,慢性乙型肝炎的风险基因型CG和GG rs6001417似乎明显减少,分别或= 0.25 (95% CI 0.09 - -0.72, )和= 0.08 (95% CI 0.02 - -0.31, )。在分析、AG)和GG基因型rs8177832似乎增加慢性b型肝炎的风险是具有统计学意义的后者,和分别或= 1.33 (95% CI 0.52 - -3.38, )和= 6.41 (95% CI 1.74 - -23.55, )(表4)。

表4
慢性乙型肝炎的危险因素的多变量分析。

3所示。讨论

我们报告APOBEC3G是慢性乙型肝炎病毒的易感性基因马车,第一个研究APOBEC3G在西非的乙型肝炎病毒感染。我们的研究人口的平均年龄为29.68岁,这类似于平均年龄在慢性乙肝病毒携带者在Wongjarupong等的研究在布基纳法索(20.,21]。研究也是一个重要的乙肝病毒传播位围产期和撒哈拉以南非洲儿童时期特别是在布基纳法索,这可以解释大量的乙肝病毒慢性携带者(18,20.,22,23]。

rs6001417 GG基因型的调整模型显著降低慢性乙型肝炎运输的风险。多态性是乙肝病毒阳性组中最为礼物。这个结果是与孔波雷等人的艾滋病毒/乙肝病毒合并感染个体,主要的GG基因型是保护16]。

杂合的个体与基因型rs6001417 CG似乎慢性乙型肝炎运输的风险增加了原油的两(2)次模型。不过,当调整年龄和性别,CG似乎有保护作用,和基因型之间的关系和慢性乙型肝炎insignificative或= 0.25 (95% CI 0.09 - -0.72, )。虽然在文献中,Qaisar接受et al。24)发现了一个保护作用的CG基因型在非携带者病毒retro-transcription步骤,如艾滋病毒(24]。

在这项研究中,评估相关的两个多态性(SNP) APOBEC3G慢性乙型肝炎、运输女性是最代表的人口。这些结果是不同的比Ezzikouri et al。25),发现在研究APOBEC3G多态性调制乙肝慢性在摩洛哥人395人。这种差异可以用这一事实来解释女性普遍在健康中心在我们的背景下尤其由于产前测试包括乙肝病毒。

我们的结果表明,占主导地位的模型是基于两个位点之间的关系和乙肝病毒状态。占主导地位的模型最重要的基因型rs6001417, G是次要的等位基因。G是一个等位基因的一个副本,然后足以产生影响(26]。

当协会评估SNP基因型的调整模型,年龄和性别,协会的取向变化从风险增加降低慢性肝炎的风险。在调整模型中的rs8177832基因型的情况下,他们的风险增加慢性肝炎六(6)。这是统计学意义,虽然似乎没有联系的时候评估。从这些结果,年龄和性别可能的混杂因素在我们的研究中。胡等人也发现逆协会调整了一些因素在他们的研究(27]。与他的研究et al ., rs8177832多态性似乎与慢性乙型肝炎的风险增加相关28]。这可能是由于种群遗传学的区别29日,30.]。

我们的研究有一定的局限性,如低数量的参与者和与性有关的参数。然而,它允许我们看到一些不同的两组APOBEC3G多态性影响慢性乙型肝炎运输研究,但我们不能进行单体型分析。我们并没有发现rs8177832与乙肝病毒慢性运输原油协会模式。然而,它被发现在调整模型。这些发现可能影响研究APOBEC3G相对于乙型肝炎感染。

4所示。结论

这项研究表明,APOBEC3G基因多态性可能影响慢性乙型肝炎病毒马车在我们的背景。轨迹可能导致主机本地抗乙型肝炎病毒感染的中介。研究结果可以用来对抗乙肝感染的慢性马车的进化状态,因此,肝细胞癌。

数据可用性

数据支持本研究的发现可以要求从相应的作者。由于隐私数据没有公开的或道德的限制。

的利益冲突

作者宣称没有利益冲突。

确认

作者感谢皮特隆安妮冈生物分子研究中心的技术人员与样本收集优秀的技术援助。本研究支持的实验室分子生物学和分子遗传学(LABIOGENE)在这里/ SVT,约瑟夫KI-ZERBO大学生物医学研究实验室(LaReBio /国税局/ CNRST)。