文摘

SARS-CoV-2病毒传播流感在北半球在2019/2020赛季坚持2021/2022赛季。预计cocirculation SARS-CoV-2和流感病毒在意大利在冬天的季节。本研究旨在调查流感病毒和呼吸道合胞病毒的流行在医院观察在维罗纳,意大利医院在过去三个冬季和比较我们的数据与国家和全球监测报告呼吸道病毒的传播在过去的十年。我们的研究结果清楚地展示了极低的流感病毒患病率住院病人和门诊病人在第一次两个COVID-19冬天季节,再度出现的呼吸道合胞体病毒在2021年底。控制措施可能发挥了重要作用暂时阻止呼吸道病毒的循环,但在放松之后,在2021年,我们经历了一场不同寻常的增加呼吸道合胞体病毒在冬季的开始。

1。介绍

流感是一种传染性疾病的人类流感病毒引起的呼吸道类型a, B (INF-A / B),或c .流感感染通常表现出季节性流行病传播强度之间的秋天和春天。这些年度流行构成一个重要的公共卫生问题和实质性的发病率和死亡率,和他们有一个相当大的经济影响1]。下呼吸道感染的另一个常见原因是呼吸道合胞体病毒(RSV),分为两种类型,RSV-A和- b。RSV负责很多住院的儿童在他们的第一年的生活,增加季节性负担医疗服务(2]。迄今为止,防止疾病RSV疫苗或治疗治疗选项不可用。

大流行的严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2 (SARS-CoV-2)在意大利和其他传播在2019 - 2020年的冬季北半球,继续循环甚至在本赛季2020/21和2021/22。1月31日圣2020年,世卫组织的建议后国际关注的突发公共卫生事件(3部长会议,宣布国家卫生突发事件由于SARS-CoV-2流行病。包含的流行病传播SARS-CoV-2、意大利引进药物干预(NPI),包括社会距离,面罩,手卫生,宣布第一个完全封锁2020年3月和5月之间的社交活动。

临床表现、传播途径和季节性SARS-CoV-2 INF-A / B的腿相似,和很难区分这两种感染。热带传染性疾病和微生物学(DITM) IRCCS Sacro库雷不卡拉布里亚医院,因此,实现诊断和常规测试所有人SARS-CoV-2测试请求,使用多路复用SARS-CoV-2分子试验,包括测试,INF-A / B和RSV-A / B。

在这里,我们描述的诊断产量正与RSV测试在我们的排水区自年初以来SARS-CoV-2大流行,并与意大利和我们比较数据全球病毒监测数据。

2。方法

2.1。研究设计

我们进行了回顾性观察分析INF-A / B和RSV-A / B分子诊断试验结果从患者称为IRCCS Sacro库雷不卡拉布里亚医院(意大利)。鼻咽拭子样品处理的常规诊断收集2019/2020赛季期间(从2020年46到2019年每周12),2020/2021(从2021年的2020年的47个每周17)和2021/2022(从2021年的42周星期4在2022年)。

2.2。研究人群

结果所有诊断和筛查INF-A / B和RSV-A / B测试(包括积极的和消极的结果)都是提取IRCCS实验室信息管理系统(LIMS)的数据库。检索到的数据清洗去除重复的测试结果。患者的年龄和性别也收集。

2.3。呼吸道病毒筛查

呼吸道标本筛查呼吸道病毒使用GeneXpert Xpress流感/ RSV(爱视宝;造父变星,CA)在2019/2020赛季,桑尼维尔和实时PCR SARS-CoV-2 /流感/ RSV面板工具包(土耳其安纳托利亚Geneworks或试剂盒,NeuMoDx,美国)在2020/2021和2021/2022赛季。流感的基因是由外包在帕多瓦大学的区域推荐实验室。

2.4。统计分析

描述性统计生成定义研究人群。比较是由一个未配对的双尾学生的t以及, 被定义为意义的水平。美国Graphpad (Graphpad软件)被用来执行统计分析。

2.5。道德声明

依照欧盟通用数据保护法规(GDPR)和良好的临床实践标准2016/679,敏感数据没有收集。每个观测数据集被确认完全由一个字母数字代码与病人识别。研究伦理许可协议获得伦理委员会主管的维罗纳和维琴察省份(Prot 25099/2021)。

3所示。结果

3.1。人口分布和特点

所有病人INF和RSV测试被纳入本研究。所有患者的人口统计学特征研究的三个流感季节是总结表1。32819呼吸道标本,167(0.5%)来自赛季2019/2020,2020/2021赛季18112(55.1%)和14540年(44.3%)从2021/2022赛季。患者的年龄分布季节之间的不同。在2019/2020赛季,团体经历和60 - 99岁是最好的代表(分别为37.7%和43.7%)。在2020/2021赛季,这些病人19-59岁(56.3%)和60 - 99 (34.8%)。在2021/2022赛季,年龄组19-59年占49.2%,60 - 99年研究人口的33.1%。

表1
研究人口的描述性统计。
3.2。患病率INF-A / B

我们检索呼吸道病毒PCR在2019/2020赛季我们网站上收集的数据,从46/2019至12/2020周。总体而言,167年的19日鼻咽拭子(11.3%)被发现INF-A阳性和/或INF-B病毒。样本的百分比INF-A阳性/ B是最高的8/2020(4.2%)和最低每周10/2020(1.2%)(图1(一))。观察INF-A / B感染的患病率最高的年龄段经历年(73.6%)和13 - 18岁的患者年最低(0%)(图1 (b))。应该注意的是,在10/2020周意大利开始全国性封锁措施,其中包括关闭学校(3月9日th,2020)。开始后的封锁(10周),一把锋利的和显著减少INF-A / B的情况下相比前几周观察(2.39% vs 0.29%, )。这是符合国家的数据监测网络InfluNet显示INF-A / B的发生率低于基线的第12周在意大利,报告是有纪录以来的最低INF-A / B患病率(4]。此外,我们的数据是符合FluNet报道的数据,全球流感病毒学监测的基于web的工具。FluNet显示一个不同寻常的季节性流感缺席活动北半球的温带与前几季相比,虽然零星的流感检测报告在亚洲南部和热带非洲的传播强度保持在interseasonal水平在所有国家在2020/2021 (5- - - - - -7]。在2020/2021赛季,non-SARS-CoV-2呼吸道病毒的总季节性流行在IRCCS-SC为所有标本测试是极低的。在整个意大利,没有呼吸样本阳性INF-A / B。

(一)
(一)
(b)
(b)
图1
(a) Laboratory-detected例流感a / B和RSV在2019/2020赛季在我们中心。竖线显示INF-A / B的比例和RSV阳性标本被周6-7/2020 11-12/2020 (B)的分布INF-A / B和RSV病例根据年龄段在2019/2020赛季。

然而,在2021/2022赛季(从45/2021到4/2022),10例流感检测到。十个里有八个2021/2022样本的基因分型和确认为流感A型;这些是H3N2亚型七,另一个是甲型H1N1流感。两个样品没有子类型由于低病毒载量。有趣的是,我们观察到一个合并感染的情况下,发现在星期2一位37岁的女性患者Ct为INF-A SARS-CoV-2 32和36。基因型结果/ H3N2。

InfluNet数据记录的低水平的流感病毒传播2021/2022赛季在意大利(直到4th一周的2022)。总的来说,55 INF-A和5 INF-B菌株已确定本赛季开始以来,与甲型流感/ H3N2亚型是最普遍的。在全球范围内,非常零星的和局部的流感疫情报告在同一时期,与地区甲型流感的爆发(H3N2)发生在南亚和东南亚,在中国流感B /维多利亚,西非甲型流感(H1N1)。

3.3。患病率RSV-A / B

在2019/2020赛季,我们发现17.3% RSV-A / B阳性样本。RSV-A / B检测是最普遍的经历年年龄段(77.7%)。我们还观察到一个下降的趋势在RSV-A / B的情况下实现国家封锁的星期后2020年10 (3.14% vs 0.89%, )(图1(一))。然而,随着观察流感,RSV-A / B的总体发病率在2020/2021赛季异乎寻常地低。我们没有发现任何情况下RSV-A / B的经历年年龄段。令人惊讶的是,在2021/2022赛季,经过前几季的极低RSV循环,大量增加RSV病例观察从42到每周2021年49,峰值在47周(17.1%,图2(一个)),预测其发行量约1个月。RSV检测是高一直岁儿童感染(53.6%)和最低利率在十三至十八岁(0.5%)年(图2 (b))。RSV感染的数量在2021/2022赛季明显高于发现记录在2019/2020赛季(2.30% vs 14.29%, )。来自美国和澳大利亚的数据显示一个inter-seasonal RSV感染的增加,恰逢取消封锁限制(8,9]。RSV的复苏可能检测在一个大的循环的病毒引起易感儿童人口,这导致了大幅增加RSV-related住院(10]。这些事件说明了需要一个有效的预防策略RSV的婴儿。

(一)
(一)
(b)
(b)
图2
(a) Laboratory-detected RSV的病例在2021/2022赛季早期在我们中心。竖线显示比例的RSV阳性标本被周42/2021到4/2022 (b) RSV的分布情况下根据年龄段在2021/2022赛季。
3.4。研究的局限性

这项研究有一些局限性。首先,由于回顾性研究设计,没有记录重要的临床特征。其次,本赛季的2019/2020,我们执行更少的流感测试2020/2021和2021/2022赛季相比,这可能导致低估了感染的患病率。

4所示。结论

总之,我们报道流感和RSV的趋势,在过去的三个流感季节,在COVID-19大流行,在我们的现实。观察异常患病率低INF-A / B在2020/2021赛季,奇怪的是,空前激增RSV病例被发现在过去的流感季节。这一发现与缓解策略,采用包含COVID-19大流行。我们的数据强烈支持这一概念,意大利和其他国家采取的公共卫生措施遏制SARS-CoV-2疫情修改了流行病学和其他呼吸道病毒的传播。迄今为止,NPI很难确定这是最有效的在限制的传播感染。因此,还需要进一步的调查来澄清之间的关联的公共卫生干预措施的强度及其对呼吸道病毒的基本生育数量的影响。

系统和连续监测non-SARS-CoV-2呼吸道病毒必须维护为了及时防止未来流行的旧或新的呼吸道病毒。此外,需要努力提高RSV监测网络。

数据可用性

的数据支持本研究的发现可以从相应的作者在合理的请求。

的利益冲突

作者宣称没有利益冲突。

确认

这项研究是由意大利卫生部“Fondi Ricerca Corrente,项目L1P6”为IRCCS Sacro库雷不卡拉布里亚医院。