隔离和表征从Amapaense亚马逊土壤菌之一gydF4y2Ba

文摘gydF4y2Ba

本研究的目的是执行筛选菌之一来自亚马逊Amapaense土壤。泛滥平原和高山林地土壤三个直辖市阿马帕州的隔离和标识。该菌在营养肉汤培养与橄榄油,根据下降崩溃及其提取物进行了评估,石油分散、乳化和表面张力测试。从三百一十八年隔离,43细菌被选择并确定16 s rDNA基因测序,表明存在三种不同的属gydF4y2Ba沙雷氏菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaPaenibacillusgydF4y2Ba,gydF4y2Ba枸橼酸杆菌属gydF4y2Ba。胞外生物表面活性剂的生产指出15高乳化能力(提供的最高效的细菌gydF4y2BaEgydF4y2Ba_24gydF4y2Ba> 48%)和稳定性(少于10%的下降在72 h)和巨大的潜力,以降低表面张力(从49.40变化到34.50 mN·mgydF4y2Ba^{−1gydF4y2Ba})。基因聚类分析分类相关隔离在不同的组,可以连接到或生物表面活性剂的量的差异。分离菌gydF4y2Ba沙雷氏菌属gydF4y2Ba属提出更好的乳化能力和生产更重要的表面张力下降,表明一个有前途的潜在的生物技术的应用程序。gydF4y2Ba

1。介绍gydF4y2Ba

微生物表面活性剂和生物表面活性剂的真菌和细菌细胞内或细胞外代谢产物(gydF4y2Ba1gydF4y2Ba)分为不同的结构和功能组:lipopeptides,糖脂,polysaccharide-protein复合物,磷脂,中性脂质、脂肪酸(gydF4y2Ba2gydF4y2Ba]。这些分子可以执行不同的自然角色在微生物的生长和繁殖gydF4y2Ba3gydF4y2Ba]。gydF4y2Ba

松山和中川(gydF4y2Ba4gydF4y2Ba观察到,gydF4y2Ba粘质沙雷氏菌gydF4y2Ba形成一个巨大的菌落琼脂培养基接种时一个星期(30°C)。相比之下,一个圆的殖民地被验证突变细菌有缺陷的润湿剂生产。他们证明,serrawettins发挥了至关重要的作用gydF4y2Ba美国marcescensgydF4y2Ba殖民地增长solid-air接口。为gydF4y2Ba枯草芽孢杆菌gydF4y2Ba,surfactin生产和鞭毛云集运动性(被发现是重要的合成gydF4y2Ba5gydF4y2Ba]。罗等。gydF4y2Ba6gydF4y2Ba)也报道称,surfactin bacillomycin l .敌对活动中扮演了重要的角色,群集的能动性gydF4y2Ba枯草芽孢杆菌gydF4y2Ba916年gydF4y2Bar .以上gydF4y2Ba通过生物膜的形成和殖民。产生的鼠李糖脂gydF4y2Ba铜绿假单胞菌gydF4y2Ba表现出抗菌活性对一些细菌和真菌种类(gydF4y2Ba7gydF4y2Ba]。他们坏死死因多形核白细胞,增强细胞毒性,减少吞噬作用敏感性[gydF4y2Ba8gydF4y2Ba]。为gydF4y2Ba铜绿假单胞菌gydF4y2Ba鼠李糖脂可以被认为是一个多功能的组件的机制控制微生物的基本元素(gydF4y2Ba9gydF4y2Ba]。gydF4y2Ba

亚马逊地区显示丰富的生物多样性,包括各种元素,如动物,植物,微生物物种。尽管密集的努力研究这个生态区和更大的知识对其特征、微生物多样性Amapaense亚马逊仍然是未知的。微生物在生态系统和生物圈维护发挥独特而重要的功能;因此,Amapaense亚马逊可以提供微生物生物技术感兴趣的发展所需的物质(gydF4y2Ba10gydF4y2Ba,gydF4y2Ba11gydF4y2Ba]。因此,本研究的目的是分离和筛选菌之一的Amapaense亚马逊,巴西。为了实现这个目标,高地的目标包括(1)选择——三个直辖市和floodplain-forest土壤使用一些定性和定量方法;(2)化学和物理特征孤立的土壤样品;(3)隔离堆肥菌株;(4)筛查生物表面活性剂生产;最后,(5)鉴定筛选堆肥16 s rDNA基因测序菌株。gydF4y2Ba

2。材料和方法gydF4y2Ba

2.1。收藏的网站gydF4y2Ba

亚马逊两个不同生态系统的土壤样本,高山林地(U)和floodplain-forest (F),在赤道森林形成、收集的三个直辖市阿马帕州,巴西(费雷拉戈梅斯(FG),波尔图格兰德(PG)和Mazagao (MZ)](图gydF4y2Ba1gydF4y2Ba)。集合地点的地理坐标如下:FGU (N 00 50°′07年7”;W 051°11′5日2”),FGF (00 49°49′, 6”;6 W 051°10′29日”),PGU (N 00 42°16′, 5”;23 W 051°15′, 2”), PGF (N 00°42′24日1”;18 W 051°23′, 3”), MZU (00 39°09′, 0”;5 W 051°21′14日”),和MZF (00′11°57, 8”;47 W 051°21′, 6”)。为每个集合地点,地面清洗去除植物和腐烂的有机物质。收集的土壤是在三个不同的点(在一个圆的直径500厘米,深度20厘米),均质获得约500 g的样本,并在无菌和冷藏条件下运到实验室。gydF4y2Ba

2.2。土壤样品的化学和物理特性gydF4y2Ba

土壤样品进行化学分析的土壤和植物生理学实验室Embrapa-Amapa,根据程序提出的巴西,巴西农业研究公司(表gydF4y2Ba1gydF4y2Ba)[gydF4y2Ba12gydF4y2Ba]。gydF4y2Ba

2.3。分离菌之一gydF4y2Ba

促进细菌生长,10 g的每一个均质土样悬在90毫升的蛋白胨生理盐水(0.85%氯化钠;0.1%蛋白胨;(w·vgydF4y2Ba^{−1gydF4y2Ba})]。暂停在30°C孵化一个小时使用一个轨道瓶(150 rpm),然后允许代表30分钟(gydF4y2Ba13gydF4y2Ba]。随后,上层的整除1毫升被添加到99毫升的营养肉汤(KASVI k25 - 610037,巴西)(1.0 g的肉汁,2.0 g的酵母提取物,细菌蛋白胨的5.0克,5.0克氯化钠,和4.0毫升的制霉菌素抗真菌剂每升蒸馏水;pH = 6.8±0.2)和孵化轨道摇(150 rpm) 30°C 72小时。gydF4y2Ba

孵化悬浊液连续稀释10gydF4y2Ba^{−1gydF4y2Ba}10gydF4y2Ba^{−8gydF4y2Ba},根据Ozkan和Adiguzel[描述的方法gydF4y2Ba14gydF4y2Ba]。然后,一个100整除gydF4y2BaμgydF4y2BaL(每个稀释接种在营养琼脂(1.0 g的肉汁,2.0 g的酵母提取物,细菌蛋白胨的5.0克,5.0克氯化钠,15.0 g的细菌的琼脂,和4.0毫升的制霉菌素抗真菌剂每升蒸馏水;pH = 6.8±0.2)和PIA (gydF4y2Ba假单胞菌琼脂隔离gydF4y2Ba细菌蛋白胨®)媒体(20.0克,1.4 g的氯化镁,硫酸钾的10.0克,0.025克Irgasan(汽巴)和13.6克每升琼脂蒸馏水;pH值7 0±0,20),旨在评估的发生gydF4y2Ba假单胞菌gydF4y2Ba属(gydF4y2Ba15gydF4y2Ba]。盘子被孵化BOD (QUIMIS Q 316 m4,巴西)室48小时30°C。细菌菌落数在10一式三份gydF4y2Ba^{−6gydF4y2Ba},10gydF4y2Ba^{−7gydF4y2Ba},10gydF4y2Ba^{−8gydF4y2Ba}稀释,结果表示菌落(CFU毫升gydF4y2Ba^{−1gydF4y2Ba})。gydF4y2Ba

细菌的表型性状(菌落形态特征)像大小、颜色、形状、边界类型和殖民地救援被认为是在分离过程中。隔离在冷冻保存(−12°C)在一个解决方案(v·vgydF4y2Ba^{−1gydF4y2Ba})50%的营养肉汤和50%无菌甘油为20%。gydF4y2Ba

2.4。生物表面活性剂的生产gydF4y2Ba

隔离在营养肉汤培养与1% (v·vgydF4y2Ba^{−1gydF4y2Ba})橄榄油为72小时30°C。孵化后,提取被下降崩溃,评估石油分散、乳化测试来确定堆肥隔离。隔离下注册代码A49223C国家基因遗传管理系统(SISGEN),推荐的巴西生物多样性法律(n 13.123/2015°),和沉积Johanna Dobereiner生物资源中心(“巴西农业研究公司”Agrobiologia)。gydF4y2Ba

2.5。筛选菌之一gydF4y2Ba

下面的选择标准是采用筛选菌之一:(i)至少两个隔离从每个集合网站和(2)隔离gydF4y2BaEgydF4y2Ba_24gydF4y2Ba≥50%。这些标准被选出的调查从所有研究微生物生态系统。gydF4y2Ba

崩溃的下降和石油分散进行了测试使用孤立的细胞培养。崩溃,下降10gydF4y2BaμgydF4y2BaL的燃烧润滑油是添加到每个站的96孔板,允许在室温下24小时。然后,10gydF4y2BaμgydF4y2BaL文化是添加到油的表面,和形状一分钟后观察孵化。油分散试验,培养皿满心蒸馏水(35毫升)和燃烧润滑油(100gydF4y2BaμgydF4y2BaL)添加到水面。随后,10gydF4y2BaμgydF4y2BaL细胞培养被加入到中心的油的表面(gydF4y2Ba16gydF4y2Ba,gydF4y2Ba17gydF4y2Ba]。在这两种情况下,积极的和消极的控制是实现1%的十二烷基硫酸钠(SDS)解决方案和蒸馏水,分别。结果被认为是积极的,当下降完全或部分分散和消极时保持不变(gydF4y2Ba16gydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2Ba18gydF4y2Ba]。的活动产生的生物表面活性剂分为弱(+),中等(+ +)和强(+ + +),显示在图gydF4y2Ba2gydF4y2Ba。gydF4y2Ba

乳化能力评估通过添加2.0毫升的商业煤油螺钉帽包含2.0毫升的细胞培养的试管,其次是积极混合在一个漩涡(通用混合器Kasvi K40,巴西)3000转2分钟(gydF4y2Ba19gydF4y2Ba]。进行测量后24、48和72小时在室温下。乳化指数gydF4y2BaEgydF4y2Ba_{24小时gydF4y2Ba}是由乳状液柱高度的比值计算24小时后和总列高度。列乳液的稳定性是决定考虑身高48和72小时后(gydF4y2BaEgydF4y2Ba_{48小时gydF4y2Ba}和gydF4y2BaEgydF4y2Ba_{72 hgydF4y2Ba}),分别。gydF4y2Ba

2.6。第二次筛选菌之一gydF4y2Ba

这种筛查评估选择微生物胞外生物表面活性剂的生产。细胞培养进行了如前所述,提取在6000转离心10分钟在4°C得到上层的游离gydF4y2Ba20.gydF4y2Ba]。上层清液乳化后测量24、48和72小时,如之前所述。gydF4y2Ba

以下选择标准是采用这种筛选:(i)至少一个隔离从每个选定的生态系统和(2)所有隔离表明乳化指数gydF4y2BaEgydF4y2Ba_24gydF4y2Ba≥48%,乳化稳定性(没有显示超过10%的下降后48和72小时)。这些标准建立了选择微生物与生物技术潜力的过程。gydF4y2Ba

考虑到细胞外的目标选择和确认隔离的潜在生产生物表面活性剂,他们培养了。浮在表面的游离是用来确定gydF4y2BaEgydF4y2Ba_24gydF4y2Ba和表面张力。表面张力测定使用(克鲁斯EASYDYN,德国)张力计,根据Kuyukina描述的方法et al。gydF4y2Ba15gydF4y2Ba]。在每个测试之前,DU NUOY环与蒸馏水消毒用本生灯和校准(70.4±0.1∼gydF4y2Ba米gydF4y2BaN·mgydF4y2Ba^{−1gydF4y2Ba}Du诺伊(提出),gydF4y2Ba21gydF4y2Ba]。gydF4y2Ba

获得的数据进行了分析使用单向方差分析(方差分析)和手段而意义图基测试的5%。主成分分析(PCA)和层次聚类分析(HCA)基于欧氏距离和完成链接方法使用一款统计软件进行gydF4y2Ba^®gydF4y2Ba19日软件和费雷拉等描述的方法。gydF4y2Ba22gydF4y2Ba]。主成分分析(PCA)基于欧氏距离和完整的链接方法应用于评价之间的相似性分析菌株利用表面张力(gydF4y2BaσgydF4y2Ba)和乳化索引(gydF4y2BaEgydF4y2Ba_24gydF4y2Ba,gydF4y2BaEgydF4y2Ba_48gydF4y2Ba,gydF4y2BaEgydF4y2Ba_{72年gydF4y2Ba}有和没有细胞)作为描述符。第一主成分分析后运行,基本描述符来描述方差保持,而相关的人被排除在外。表面张力(gydF4y2BaσgydF4y2Ba)和乳化索引(gydF4y2BaEgydF4y2Ba_24gydF4y2Ba有和没有细胞)被选中的描述符。层次聚类分析(HCA)基于欧氏距离和完整的连接方法也应用于微生物组基于表面张力和乳化索引(gydF4y2BaEgydF4y2Ba_24gydF4y2Ba有和没有细胞)。gydF4y2Ba

使用向导进行基因组DNA提取®基因组DNA工具包(WI Promega,麦迪逊,美国),遵循制造商的建议。DNA浓度的分光光度法测定260海里(NanoDrop热费希尔科学,沃尔瑟姆,妈,美国),和他们的完整性验证了在琼脂糖凝胶1% (w·vgydF4y2Ba^{−1gydF4y2Ba};60 V;1 h)。16 s rDNA基因扩增引物27 f 5′aga GTT TGA太极拳TGG CTC AG - 1492 r′和5′ggt TAC CTT GTT ACG条t - 3′。PCR实现热循环(应用生物系统公司™SimpliAmp)在下列条件:1.5 U Taq DNA聚合酶,1 x PCR缓冲(10 Tris-HCl pH值8毫米和50毫米的氯化钾),MgCl 1.75毫米gydF4y2Ba_2gydF4y2Ba,每个核苷酸的0.25毫米,0.2gydF4y2BaμgydF4y2BaM的底漆,1gydF4y2BaμgydF4y2BaL的DNA模板,总量的50gydF4y2BaμgydF4y2Bal .放大使用初始执行变性在94°C 3分钟,紧随其后的是29日周期的变性为1分钟94°C,退火在58°C 1分钟,在72°C扩展2分钟,和最后一个在72°C扩展7分钟。gydF4y2Ba

测序反应进行了使用DYEnamic™等染料终结者工具包(MegaBACE™)和一个自动MegaBACE 1000测序仪(通用电气医疗集团生命科学)。获得的序列沉积在NCBI基因库,登记入册数量MK156425-MK156460和MT252662-MT252668。然后获得的序列比较与国家生物技术信息中心数据库(gydF4y2Bahttp://www.ncbi.nlm.nih.govgydF4y2Ba)使用防爆工具gydF4y2Ba23gydF4y2Ba]。随后,使用集群W序列对齐的计划,和种系发生树建立了基于最大似然的方法(gydF4y2Ba24gydF4y2Ba)借助大型X软件(gydF4y2Ba25gydF4y2Ba]。最后,隔离的发展史进行了分析使用最大似然法和Tamura-Nei模型,包括引导分析基于1000复制gydF4y2Ba24gydF4y2Ba)树的拓扑估计的信心水平。gydF4y2Ba

3所示。结果gydF4y2Ba

亚马逊从两个不同的生态系统采集土壤样本显示大量的CFU。计算微生物的数量每毫升(CFU毫升gydF4y2Ba^{−1gydF4y2Ba})是3.96×10gydF4y2Ba^9gydF4y2Ba,2.25×10gydF4y2Ba^9gydF4y2Ba,1.67×10gydF4y2Ba^9gydF4y2Ba,1.69×10gydF4y2Ba^9gydF4y2Ba,2.41×10gydF4y2Ba^9gydF4y2Ba和4.95×10gydF4y2Ba^9gydF4y2BaFGU, FGF, PGU、PGF MZU,分别和MZF生态系统。总共有318个细菌隔离(表gydF4y2Ba2gydF4y2Ba)。Upland-forests (FGU PGU和MZU)显示细菌populational密度大于泛滥平原(FGF, PGF和MZF),分别为227年和91年的隔离。仅FGU提出138隔离,这对应于43岁的孤立的细菌总数的4%。gydF4y2Ba

减少破坏性试验,237,73,和8隔离呈现疲弱,温和,分别和强烈的活动。石油分散测试,204、113和1隔离了弱,温和,分别和强烈的活动。表gydF4y2Ba3gydF4y2Ba礼物的结果达到43细菌隔离选择在第一个筛选。gydF4y2Ba

总共15隔离第二个筛选(表中选择gydF4y2Ba2gydF4y2Ba)。关于生物表面活性剂的生产有或没有细胞,乳化结果MZU32和MZF02呈现显著差异,强调了细胞外评估(表的基本作用gydF4y2Ba3gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba

细菌中选择第一个筛选属于三个属:36gydF4y2Ba沙雷氏菌属gydF4y2Ba6从gydF4y2Ba枸橼酸杆菌属gydF4y2Ba,1gydF4y2BaPaenibacillusgydF4y2Ba(图gydF4y2Ba3gydF4y2Ba)。集团由PGF03 PGF04、PGF05 PGF34, PGF35, PGF46, PGU05, FGF07, FGF09, FGF12, FGF13, FGF15, FGF24, FGF26, FGU92, MZU14 MZU32, MZF01, MZF02高相似度(> 99.0%)gydF4y2Ba沙雷氏菌属surfactantfaciensgydF4y2BaYD25 (KM093865)压力。例如,16 s rDNA序列的身份FGF24 (MK156451)这一毒株是99.64%。系统发育分析还显示一组隔离(FGU12、FGU14 FGU83, FGU86, FGU94, FGU100, FGU101, FGU104, FGU113, FGU121, FGU125,和FGF17)密切相关gydF4y2Ba粘质沙雷氏菌gydF4y2BaJCM1239 (AB594756)应变,他们所有人身份> 99.0%。gydF4y2Ba枸橼酸杆菌属murliniaegydF4y2Ba疾病预防控制中心2970 - 59 (NR 028688)是最接近应变FGU 107 (MK156444),相似性为99.78%。分析FGU 109 (MT252663)附近的gydF4y2Ba枸橼酸杆菌属braakiigydF4y2BaCIP 104554 (KM515967), 99.57%的16 s rDNA序列的身份。FGF20 (MK156435)放置在附近的gydF4y2BaPaenibacillus favisporusgydF4y2BaGMP01 (NR029071)应变相似度为99.49%。gydF4y2Ba

15个细菌中选择第二个筛选再次培养,浮在表面的游离是用来确定乳化指数(gydF4y2BaEgydF4y2Ba_24gydF4y2Ba)和表面张力(gydF4y2BaσgydF4y2Ba)。显示显著差异(表的变量gydF4y2Ba4gydF4y2Ba),而使用图基测试(表gydF4y2Ba5gydF4y2Ba)。十一隔离了gydF4y2BaEgydF4y2Ba_24gydF4y2Ba> 48%,而表面张力从34.50到49.4不等gydF4y2Ba米gydF4y2BaN·mgydF4y2Ba^{−1gydF4y2Ba}。gydF4y2Ba

第一和第二组件的得分图显示五个不同组分离,分离gydF4y2BaGgydF4y2Ba1,gydF4y2BaGgydF4y2Ba2,gydF4y2BaGgydF4y2Ba3,gydF4y2BaGgydF4y2Ba4,gydF4y2BaGgydF4y2Ba5(图gydF4y2Ba4(一)gydF4y2Ba)。聚类结果作为隔离相似的函数图所示gydF4y2Ba4 (b)gydF4y2Ba。根据建立Fenon线(虚线),五个集群观察,繁殖模式中观察到PCA和高亮显示更详细的相似性在每组隔离。gydF4y2Ba

4所示。讨论gydF4y2Ba

本研究进行了隔离和屏幕从Amapaense亚马逊菌之一,巴西。它认为是高地,floodplain-forest土壤三个直辖市。费雷拉戈麦斯和波尔图格兰德市,泛滥平原土壤pH值高于旱地的。类似的结果是获得法等。gydF4y2Ba26gydF4y2Ba]分析了漫滩和亚马孙州的森林土壤。只有FGF和MZU样品有机质含量高(> 5%)。土壤微生物多样性和人口的变化可以影响不同的pH值等因素(土壤细菌多样性和丰富性的最佳预测值)(gydF4y2Ba27gydF4y2Ba)、空间的影响(gydF4y2Ba28gydF4y2Ba),和土壤有机质gydF4y2Ba29日gydF4y2Ba]。Delgado-Baquerizo et al。gydF4y2Ba30.gydF4y2Ba]表明,全碳量呈正相关的土壤细菌多样性和是最关键的因素之一。这些作者也建议如下:(i)细菌多样性随海拔陆地生态系统;(2)极端气候条件的主要因素是海拔高度影响;和(iii)贫穷南半球土壤细菌多样性可以与低碳相关的内容和微生物流动率。另一方面,Wieder et al。gydF4y2Ba31日gydF4y2Ba)表明,细菌多样性很低碳条件下可能是有限的。细菌生物多样性的分析超出了第一个筛选的范围Amapaense亚马逊土壤。尽管如此,土壤样本的特征可能有助于未来的研究。gydF4y2Ba

FGU101和FGF17隔离高乳化索引但显示强和弱活动定性测试,分别为(表gydF4y2Ba3gydF4y2Ba)。这种比较说明下降崩溃和石油分散测试,用于这项工作,有利于堆肥隔离的识别,但不允许一个一致的评级隔离的潜力。另一方面,乳化指数(定量)允许菌之一的检测,提供了一个更加一致的评级的孤立的微生物(表gydF4y2Ba3gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba

一些研究报道的重要性不同筛选方法应用到前景堆肥微生物(gydF4y2Ba16gydF4y2Ba,gydF4y2Ba32gydF4y2Ba]。在目前的工作,两个定性方法(下降和石油分散崩溃)和一个定量(乳化)应用。此外,耆那教等。gydF4y2Ba17gydF4y2Ba)确认定性下降破坏性试验与表面张力有高度的相关性,由于生物表面活性剂的能力破坏液体液滴表面上的油。与此同时,Ariech和Guechi [gydF4y2Ba16gydF4y2Ba)也报道几个孤立的微生物,呈现高,温和,和弱油性表面崩溃的能力。关于定性油分散试验,中央明确区域的直径驱油表明生物表面活性剂产生的有效性。此外,它有一个线性关系产生的生物表面活性剂的量(gydF4y2Ba19gydF4y2Ba,gydF4y2Ba32gydF4y2Ba]。各种研究人员建议,定性的方法更可靠的勘探堆肥微生物(gydF4y2Ba16gydF4y2Ba,gydF4y2Ba18gydF4y2Ba]。gydF4y2Ba

乳化试验是一个简单的量化方法的前景堆肥微生物(gydF4y2Ba16gydF4y2Ba]。一种乳化指数(gydF4y2BaEgydF4y2Ba_24gydF4y2Ba)高于50%已经被用作标准选择堆肥隔离。有关疏水化合物在不同的筛选过程,煤油是应用最广泛的一个(gydF4y2Ba20.gydF4y2Ba,gydF4y2Ba33gydF4y2Ba]。gydF4y2Ba

乳化能力严重地影响生产的代谢物,也取决于细菌属和生产者应变(gydF4y2Ba34gydF4y2Ba]。选择这项工作属于细菌gydF4y2Ba沙雷氏菌属gydF4y2Ba,gydF4y2Ba枸橼酸杆菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaPaenibacillusgydF4y2Ba属,它可以产生不同的代谢物。gydF4y2Ba沙雷氏菌属gydF4y2Ba兼性厌氧的革兰氏阴性细菌,属于肠杆菌科的家人和Gammaproteobacteria类(gydF4y2Ba35gydF4y2Ba]。隔离属于该属能产生脂肪酶(gydF4y2Ba沙雷氏菌属gydF4y2Basp。W3)、prodigiosin (gydF4y2Ba粘质沙雷氏菌gydF4y2BaFZSF02) [gydF4y2Ba36gydF4y2Ba,gydF4y2Ba37gydF4y2Ba),和生物表面活性剂gydF4y2Ba38gydF4y2Ba]。此外,他们可以促进植物生长,增溶的磷酸盐(gydF4y2Ba39gydF4y2Ba]。gydF4y2Ba枸橼酸杆菌属gydF4y2Ba属也属于肠杆菌科的家人和Gammaproteobacteria类,可以归类为兼性厌氧non-lactose-fermenting革兰氏阴性细菌(gydF4y2Ba40gydF4y2Ba]。gydF4y2BaPaenibacillusgydF4y2Ba属属于Paenibacillaceae家人和杆菌类。他们的殖民地是光滑,半透明的,颜色从浅棕色到白色,兼性厌氧的革兰氏阳性,或严格的有氧gydF4y2Ba41gydF4y2Ba]。一些研究还报告生物表面活性剂的生产gydF4y2BaPaenibacillus alveigydF4y2Ba(gydF4y2Ba42gydF4y2Ba),gydF4y2BaPaenibacillusgydF4y2Basp。gydF4y2Ba43gydF4y2Ba),gydF4y2Ba枸橼酸杆菌属murliniaegydF4y2Ba(gydF4y2Ba44gydF4y2Ba),而gydF4y2Ba枸橼酸杆菌属freundiigydF4y2Ba(gydF4y2Ba45gydF4y2Ba]。gydF4y2Ba

降低表面张力的测定细菌培养中被推荐确认隔离的能力生产生物表面活性剂(gydF4y2Ba46gydF4y2Ba,gydF4y2Ba47gydF4y2Ba]。微生物能够降低表面张力20gydF4y2Ba米gydF4y2BaN·mgydF4y2Ba^{−1gydF4y2Ba}与蒸馏水相比,分类Willumsen和卡尔森(gydF4y2Ba48gydF4y2Ba有前途的生物表面活性剂生产商。所有选择的15株肉汤表面张力降低了优于最小值确定。较高和较低的表面张力降低35.9gydF4y2Ba米gydF4y2BaN·mgydF4y2Ba^{−1gydF4y2Ba}(MZF02)和21.0gydF4y2Ba米gydF4y2BaN·mgydF4y2Ba^{−1gydF4y2Ba}(分别为FGF19)(表gydF4y2Ba5gydF4y2Ba)。gydF4y2Ba

前两个主成分(PC1和PC2)分析菌株中解释的总方差的78.9%。PC1轴,乳化索引(gydF4y2BaEgydF4y2Ba_24gydF4y2Ba有和没有细胞)显示负载系数略高于表面张力,但这三个选择描述符的分离群体有了积极的贡献。关于PC2,gydF4y2BaσgydF4y2Ba提出了一个负面的和相对较高的负载和是最重要的变量分离图垂直隔离。PCA分析并没有显示异常值,证明数据是在可接受的地区。gydF4y2BaGgydF4y2Ba1代表隔离生产生物表面活性剂乳化能力高,可显著降低栽培介质的表面张力。细菌gydF4y2BaGgydF4y2Ba2非常相似gydF4y2BaGgydF4y2Ba1但乳化能力略低。gydF4y2BaGgydF4y2Ba3组代表微生物,促进了最低表面张力降低,不属于gydF4y2Ba沙雷氏菌属gydF4y2Ba属。最后,隔离来自gydF4y2BaGgydF4y2Ba4和gydF4y2BaGgydF4y2Ba5组呈现低乳化能力和生产中、高表面张力下降,分别。在每个集群系统树图描述符变化没有显示定义的模式,可能是由于分离株之间的差异。一个分支系统树图底代表一个样本,而分支长度连接两个集群与他们的相似之处gydF4y2Ba22gydF4y2Ba]。分支是越短,相似度越高。系统树图的左边组(gydF4y2BaGgydF4y2Ba1,gydF4y2BaGgydF4y2Ba2)由细菌产生的代谢物与高乳化能力大大降低了介质表面张力(图gydF4y2Ba4 (b)gydF4y2Ba)。MZF02分支长度显示低相似性隔离生产生物表面活性剂比别人的潜力。PCA和HCA结果显示差异的生物表面活性剂或由每组细菌表面活性的化合物,表明进一步理解观察到的模式特征可能是有用的。gydF4y2Ba

5。结论gydF4y2Ba

生物表面活性剂的使用一直在增加在各工业部门由于对环保材料不断增长的需求。在这项工作中,我们孤立和特点从泛滥平原和高地Amapaense亚马逊土壤菌之一,巴西。隔离的提取物进行评估使用下降崩溃,石油分散、乳化、和表面张力测试,和选择的微生物被16 s rDNA基因测序鉴定。43菌之一属于gydF4y2Ba沙雷氏菌属gydF4y2Ba,gydF4y2BaPaenibacillusgydF4y2Ba,gydF4y2Ba枸橼酸杆菌属gydF4y2Ba属被确定。在这些分离株中,选择15由于较高的乳化能力和潜在的降低表面张力。费雷拉戈麦斯直辖市集中大部分的隔离,沙雷氏菌属菌株达到显著提高乳化索引和降低表面张力的测试条件。进一步的研究需要产生的代谢物鉴定这些隔离和优化生物表面活性剂的生产。gydF4y2Ba

数据可用性gydF4y2Ba

使用的实验数据来支持本研究的结果包括在本文中。gydF4y2Ba

的利益冲突gydF4y2Ba

作者宣称他们没有利益冲突或人际关系可能出现影响工作报告。gydF4y2Ba

确认gydF4y2Ba

作者感谢研究生项目在生物多样性和生物技术(忠告Bionorte),阿马帕州立大学(UEAP),巴西农业研究公司Embrapa阿马帕和Embrapa Agrobiologia)的分析和设施。gydF4y2Ba

引用gydF4y2Ba

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