文摘
一个新物种,Saksenaea dorisiae(Mucoromycotina毛霉菌目),隔绝水样本来自一个私人在Manastirica Petrovac,在塞尔维亚共和国(欧洲),进行描述和演示。茎新分类单元都是十分支持的系统发育分析,包括内部转录间隔区(ITS)地区,域D1和D2的28 s rRNA基因(路易斯安那州立大学),和翻译延伸因子- 1α基因(tef-1α),它是解决进化枝中美国oblongispora和美国trapezispora。这种真菌的特点是其适度增长缓慢15岁和37°C,稀疏的假根,圆锥形的孢子囊,短圆柱孢囊。Saksenaea dorisiae是一种机会性致病病毒属的常常卷入严重的人类和动物mucormycoses遇到在热带和亚热带地区。尽管灵敏度数(terbinafine和ciclopirox)常规抗真菌治疗,临床真菌可以唤起挑战性的感染。这是第一个小说属的分类单元Saksenaea描述了从欧洲的适度大陆性气候区。
1。介绍
属Saksenaeas . b . Saksena mucoralean微观真菌(Mucoromycotina、毛霉菌目Saksenaeaceae)组成的物种常常导致严重的人类和动物皮肤mucormycoses免疫力低下和免疫活性的主机(1,2]。属首次描述了1953年在印度森林土。Saksenaea vasiformiss . b . Saksena唯一属的物种(现在被认为是美国vasiformis物种复杂)的50多年报道土壤,漂流木,和谷物1]。中断的皮肤完整性,如针棒、昆虫叮咬或蜘蛛咬伤,和燃烧事故伤口(95%的病例),代表了这种真菌感染最常见的模式从受污染的土壤或水2- - - - - -4]。除了这些创伤植入、感染通过吸入的孢子和留置导管的使用已报告(5]。在这个属物种负责皮肤感染和特点是迅速发展和侵犯邻近组织。感染的Saksenaea种虫害诊断通过angioinvasion导致组织坏死皮肤和皮下参与。此外,rhino-orbito-cerebral和传播感染已报告(1,2]。经典的感染管理网站通常包括广泛的结合,积极和重复外科清创术(这可能导致截肢),和长期的系统性与适当的抗真菌治疗,最好是脂质体两性霉素B和/或泊沙康唑(6- - - - - -9]。抗真菌治疗孤独似乎不足以控制感染(2]。
最近修订阿尔瓦雷斯et al。1)和Crous et al。10,11茎]应用多相的方法,其中包括(路易斯安那州立大学,它和tef-1α),显示单型的属Saksenaea是基因异构和包含更多的物种,即美国erythrospora,美国loutrophoriformis,美国oblongispora,美国trapezispora,美国vasiformis配合物(假定的神秘的物种)。到目前为止,这些物种(除了美国oblongispora)已报告在世界范围内从人类和动物临床病例。他们遇到了从非洲热带和亚热带气候和已报告(突尼斯),澳大利亚,印度,中东地区(伊拉克、以色列和沙特阿拉伯),新西兰、斯里兰卡、南美(哥伦比亚、厄瓜多尔和法属圭亚那),泰国和美国(1,12,13]。在欧洲,只有少数情况下可用的报告发表美国vasiformis感染,例如,从西班牙3,14- - - - - -16)、法国(1,13),和希腊(2]。到目前为止,大约有45例的主要是皮肤感染Saksenaea已报道,在全球范围内(2,4,5,10,11,13),虽然临床病例的实际数字可能低估了(4]。尽管协会在严重感染人类,这仍然是一个研究很少mucoralean属,属孢子形成的主要是由于缺乏真菌学的培养基(如Sabouraud葡萄糖琼脂,麦芽提取琼脂和玉米粉琼脂)经常用于临床实验室(1]。
水样的微生物调查期间,一个快速增长的nonsporulating mucoralean真菌被恢复假单胞菌选择性琼脂板样本来自一个私人在农村地区的Manastirica(塞尔维亚)2018年10月。这种隔离是指定BiMM-F232和进一步的形态学特征,生理、分子系统学、抗真菌敏感性。过去的信息序列得到从三个位点,即。,internal transcribed spacer region including 5.8S rDNA (ITS), domains D1 and D2 of the 28S rRNA gene (LSU), and the translation elongation factor-1α轨迹(tef-1α)。总的来说,结果数据显示,这个隔离代表小说机会性致病属的物种Saksenaea在这里,描述和演示Saksenaea dorisiaesp. 11月。
2。材料和方法
2.1。样本收集和隔离的真菌
单个样品的水从一个私人在Manastirica Petrovac(塞尔维亚共和国、欧洲)收集了2018年10月。一个100毫升的整除无菌过滤滤纸片(0.45μm, 47毫米直径,GN-6 Metricel,镀笼罩,墨西哥)假单胞菌选择性琼脂修订为1% v / v甘油(德国卡尔罗斯)和培养3天在37°C (±0.2°C)在黑暗中。
2.2。培养的菌株,媒体,和形态分析
表型鉴定的菌株被转移(琼脂块生长在自保”,ca 5×5毫米,在中间)在马铃薯葡萄糖琼脂(PDA、丙烯酰胺),麦芽提取琼脂(MEA,默克公司),玉米粉琼脂(CMA Oxoid) Sabouraud 4%葡萄糖琼脂(SDA VWR),水琼脂1% (WA),燕麦琼脂(OA),合成贫瘠琼脂(SNA) Czapek琼脂(CZA), Czapek酵母提取物琼脂(自保”),蔗糖和酵母提取物(是的)琼脂作为描述参孙et al。17),在黑暗中培养5 - 30天25°C。菌落大小(毫米),群落结构,特征被发现后四天。然而,培养长期3个月所有媒体为了观察和记录殖民地的色素的变化,以及确定孢子囊的发病和接合孢子的形成。孢子囊质的发展建议琼脂块漂浮在酵母中提取水的方法根据namrata和Ajello [18)是用于这项研究。为了确定最优和最小/最大温度的增长,压力是孵化在四个不同的媒体(CZA、自保”、PDA和MEA) 12、15、20、25、30、35岁,37岁,39岁,40岁,和42°C (±0.1 - -0.2°C)。测量菌落直径4th天的培养。比较宏观和微观特征的描述,使用CZA根据阿尔瓦雷斯et al。1)和Crous et al。10,11]。
能力的三种不同的营养形式的真菌生长或生长在更极端的温度被孵化评估在5±0.3°C 1到50天或40±0.1°C 24至48小时。对这些测试应用下列步骤:(a)孢子:100μL孢子悬液(4.0×105CFU /毫升生理解决方案)来自CZA(6天30°C)是应用于MEA板(在37°C)在定义的时间间隔(1、2、3、4、7、14、21、28日,42岁和50 d);(b)菌丝体的小球:一个个独立王国的ca 50 - 200μ米直径(2.0×10∼4/毫升)后10 - 12 d孵化淹没是的5%,140 rpm, 25°C, 100μL(颗粒悬浮液应用于MEA板(在37°C);(c)菌丝体:nonsporulating菌落生长在MEA板4 d后孵化(37°c)。孢子和颗粒暴露在5°C在生理或是的肉汤液体,分别,然后转移(100μL)到一个盘子在37°C。暴露在40°C,他们直接应用到盘子和24和48小时后转移到新的板块和进一步孵化37°C。孢子萌发的决心原位在低放大率(50 - 100 - x)。
干标本正模标本的标本存放标本的真菌学的部门,国家博物馆,布拉格,捷克共和国(人口、难民和移民事务局);ex-type文化沉积在具有生物活性的微生物代谢产物(BiMM),真菌收集、UFT-Tulln(在)和真菌的菌种保藏(CCF),布拉格(CZ)。
测定微观特征,CZA第6 - 14天后使用。孢囊梗结构观察和孢子囊的形成原位在低放大率(50 - 100 - x)。孢囊梗的细节、孢子囊孢子等微观结构,如菌丝的宽度,观察在坐骑乳酚蓝(文化、诊断)。孢囊水以防止其变形。25菌丝宽度,测量,表示为最大价值μm。对孢囊柄长度和宽度和孢子囊质的长度(包括小柱和颈部),60测量完成,他们表示为(最小),典型的范围和最大价值μ孢子囊质的文特尔m。,包括小柱(宽度),一系列的主要测量值与最大文特宽度代表的价值。孢子囊质的脖子(长度和宽度),测量表示为一系列的最小和最大价值。孢囊70测量完成,他们表示为(最小),典型的范围(最大)值,包括平均值和标准偏差。
除了CZA,孢子囊的形成没有观察到,在任何其他媒体使用8天的培养。对于这些媒体潜伏期延长3个月,盘子每隔5天被检查的孢子囊生产。显微照片拍摄使用Motic BA310显微镜与Motic形象+ 3.0软件。乳酚蓝被用作媒介缩微摄影。最终的微观照片是黑白颠倒。殖民地的照片被索尼DSC-RX100。
2.3。抗真菌敏感性测试
一个50μL整除的孢子悬液(4.0×105CFU /毫升)的Saksenaea应变BiMM-F232(来自CZA增长30°C 14天到生理的解决方案)是均匀分布在rpmi - 1640(σ)介质板。除了孢子,50μL整除悬挂的菌丝体的颗粒大小(一个个独立王国大约50 - 200μ米直径从是的收集5%的液体培养基中生长在25°C, 150转10天后)接种密度为2.0×104/毫升RPMI板上以同样的方式。应用抗真菌抗真菌敏感性测试是由光盘10和15μg两性霉素B, 10μg灰黄霉素、5μg caspofungin, 1μg结合氟胞嘧啶使用,100 IU制霉菌素,10μg益康唑,25 - 100μg氟康唑、1μg伏立康唑,10和15μ克酮康唑、5μ10 g泊沙康唑,μg咪康唑,8 - 50μg伊曲康唑,50μg克霉唑(抗真菌光盘,Liofilchem Diagnostici通过Scozia,意大利)和50μg ciclopirox和30μg terbinafine (Neo-Sensitabs Rosco Diagnostica Taastrup,丹麦)直接在盘子上。MIC值测量与两性霉素B通过麦克风测试条,结合氟胞嘧啶使用,caspofungin,酮康唑、泊沙康唑、伊曲康唑、伏立康唑浓度范围为0.002 -32μg,氟康唑浓度范围为0.016 -256μg(抗真菌光盘Liofilchem Diagnostici通过Scozia,意大利)。一个麦克风测试条每板应用,而4 - 6盘每板和孵化申请3 - 7天37°C。
2.4。DNA提取、PCR扩增和测序
DNA提取使用标准cetyltrimethyl溴化铵(CTAB)过程,如前所述[19]。内部转录间隔区(ITS)地区引物ITS1-F [20.]和ITS4 [21)与聚合酶放大。部分翻译延长因子(tef-1α基因与引物983 f(放大)22)和2218 r (23]。的D1、D2域large-subunit(28)核糖体rna基因放大和使用引物测序对ITS1 / TW14 [21,24]。所有反应都表现在埃普多夫梯度MasterCycler(埃普多夫,汉堡)。放大的条件和D1、D2域:95°C 5分钟;35周期95°C的30年代,54°C 30年代,90年代和72°C;最后5分钟在72°C。着陆的放大tef-1α执行如下:95°C 5分钟;9的周期30年代在95°C, 30年代在66°C(每周期−1°C),在72°C和1分钟;其次是30周期30年代在95°C, 30年代56°C,在72°C和1分钟;和最后一个伸长的7分钟在72°C。
PCR产物测序有相同的引物用于PCR扩增(Microsynth AG)、Balgach、瑞士)。这一研究获得的序列都是沉积在基因库。本研究中使用的真菌菌株的信息见下表1。此表为其提供基因库加入数字,tef-1α和D1、D2域28 s rRNA基因(路易斯安那州立大学)为所有接受物种属序列Saksenaea。
2.5。系统发育分析
系统发育分析、序列与Clustal X [25]。系统发育分析完成了海景4.6 [26)软件。系统发育树构建使用最大似然(ML)方法与Kimura-2海景和遗传距离计算参数(K2P)模型。引导分析与1000毫升引导复制。Apophysomyces线虫ex-type应变CBS 476.78被选为外群系统评估。
3所示。结果
3.1。系统发育分析
基于搜索NCBI的基因库核苷酸数据库,使用序列是最近的热门美国trapezispora(UTHSC DI 15 - 1;基因库:NR_147690;身份= 601/644(93%),23/644(3%)和空缺美国oblongispora(哥伦比亚广播公司(CBS) 133.90;基因库:NR_137569;身份= 595/652(91%)、空白35/652 (5%))。使用tef-1α序列,最近的打击美国oblongispora(哥伦比亚广播公司(CBS) 133.90;基因库:HM776687;身份= 473/476(99%),无间隙)美国trapezispora(UTHSC DI 15 - 1;基因库:LT607408;身份= 467/476(98%),无缺口))。28 s rRNA的一个区域包含D1和D2地区(路易斯安那州立大学)显示最高的相似之处美国trapezispora(基因库NG_060019;身份= 704/720(98%),1/720(0%)和空缺美国oblongispora(基因库NG_057868;身份= 702/719(98%),无间隙)。
构建的系统发育树相结合,路易斯安那州立大学,tef-1α(图1)表明,隔离代表一个新物种,被接近美国trapezispora。
3.2。分类
Saksenaea dorisiaer . Labuda a . Bernreiter c .舒乐问j . Strauss & m .瓦格纳sp. 11月。(数据2- - - - - -4)。MycoBank MB 830072词源:拉丁,dorisiae=多丽丝Hochenauer命名的,孤立的真菌。
(一)
(b)
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(c)
3.3。文化特征(图2)
殖民地达到25 - 30毫米直径4 d后孵化CZA 37°C,白色,非常稀缺(cobweb-like)气生菌丝体,无色的逆转。殖民地在37°C MEA、自保”PDA、CMA、SDA更丰富的被丛卷毛的,适度菌丝体生长缓慢(30 - 65毫米)4天后,剩下无色反向,无菌(没有孢子形成)。
CZA生长的最适温度是20到35°C(48 - 60毫米直径),减少增长被观察到15°C(15 - 20毫米直径),和37°C(25 - 30毫米直径)。最低增长是观察到12°C(3 - 4毫米直径),和增长的最高温度是39°C(0.5 1毫米直径)。真菌没有增长40°C的媒体使用(CZA、自保”意味着,PDA)。整体增长自保”,意味着,PDA是大约20 - 25%速度在最佳温度下经过4天的孵化CZA相比(图S1)。孢子的萌发和生长能力、菌丝的丸,和菌丝体,曝光后5°C和40°C提出了表S1和S2。
3.4。微观形态学(图3和4)
菌丝主要合胞体的(non-septate)、分支、透明,光滑和薄壁,22岁μ米宽。孢囊梗直立,通常单独产生,分枝,棕色,(75 -)85 - 100 (-130)×(6 -)7 - 10 (-12)μm,略有特殊疣的(asperulate)覆盖着杆状的凸起,终止为半球形columellae (15 35μ米宽),分布稀疏,假根(root-like结构)。孢子囊终端,multispored,透明,瓶形的(vasiform),略以独特的疣的(asperulate), (70 -) 90 - 160 (-190)μ米长,到期锥形文特55μ米宽(主要是40 - 50μ米),逐步缩小成一个长长的脖子(70 - 100年μm×6 - 10μm)和一个圆形先端(封闭粘液栓)在小孢子囊(数字3(f) -3(h))、截断和到期了。孢子囊观察5天后在CZA最丰富30°C(30 - 50 /板),那么在25岁和35°C每板(10),虽然20岁和37°C。孢子囊的形成在殖民地的中心附近或琼脂块用于接种。孢子在发展和成熟(4 - 8天)主要短圆柱(胶囊包裹的)圆形结束,几也或多或少的梯形在横向看来,光滑,薄壁,透明,(4.5 -)5.0 - -5.5 (6.0−)×(2.0 -)2.5 - -3.0 (-3.5)μ米(平均= 5.1±0.4×2.8±0.3μ米,n= 70)。根黴没有观察到。
的主要区别新物种的表型特征与其他属的分类单元Saksenaea表中列出了吗2。正模标本。塞尔维亚共和国Manastirica (Petrovac)私人隔绝,65米深井水样本(代码DOO33) 08年。10。2018年,多丽丝Hochenauer孤立;人口、难民和移民事务局951593(正模标本、干文化)。Ex-Type应变。中国人民志愿军的BiMM-F232 = 6174。DNA序列。基因库MK559697(它),基因库MK569515 (tef-1α),基因库MK570305(路易斯安那州立大学)。
3.5。在体外抗真菌敏感性测试
用于麦克风测试条有八个抗真菌治疗Saksenaea应变BiMM-F232灵敏度测试表明,真菌对酮康唑敏感,泊沙康唑、伊曲康唑和相当高的浓度,即。,3.0,2.0,和4.0μ分别g / mL。真菌caspofungin显示阻力,结合氟胞嘧啶使用伏立康唑(MIC > 32μg / mL),以及氟康唑(> 256μg / mL)。两性霉素B的MIC值还不清楚,没有明确的抑制区形成(图5)。额外的应用程序定义的15个抗真菌浓度每盘显示灵敏度的应变对ciclopirox区50岁(25毫米μg)、克霉唑(25毫米区50岁μg)、益康唑(15毫米区10点μg), terbinafine区30(25毫米μg),抗生素光盘包含两性霉素B(10到20μg)、氟康唑(20 - 100μ结合氟胞嘧啶使用(1 g)μ灰黄霉素(10 g)μg)、咪康唑(10μg)和伏立康唑(1μg)显示有限公司(8毫米)或任何活动(表3)。带所有抗真菌治疗和/或光盘,除了terbinafine和ciclopirox杂草丛生的孵化后5天(37°C)。相同类型的multiresistance (terbinafine除外)向所有抗真菌治疗真菌的菌丝球时也被观察到在本研究被用于抗真菌敏感性测试。
(一)
(b)
(c)
(d)
(e)
(f)
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(h)
(我)
4所示。讨论
新物种的表型,美国dorisiae不同于其他属的分类单元Saksenaeas . b . Saksena(毛霉菌目,Saksenaeaceae)的结合以下功能:(1)不增长40°C和缓慢温和增长15岁和37°C(分别为15 - 20毫米和25 - 30毫米),(2)锥形孢子囊质的文特尔,(3)孢子的形态(短圆柱,av。= 5.0×3.0μ米),(4)稀疏假根。孢子囊和孢子的形状非常独特,呈现美国dorisiae很容易可认识的从其他属的迄今为止已知的物种。系统发育分析的结合,路易斯安那州立大学,tef-1α序列显示,新物种聚集美国oblongispora和美国trapezispora后来,是最接近物种(图1)。所有三个物种不增长42°C,相比其他Saksenaea物种(1,11]。在这项研究中,属Saksenaea包含6种,包括新的分类单元。他们每个人都是由一个特定组合的特征形态特征(主要是形态学孢子囊孢子)。因此,他们很容易区别美国dorisiae表型。圆锥形的孢子囊,稀疏的假根以及胶囊包裹的孢子形成的新物种非常独特,形态分离这种真菌属里的其他人。自孢子囊的形成是必要的隔离的表型鉴定到属和/或物种水平,孵化CZA在30°C是孢子形成的有利条件。所有种类的Saksenaea著称的快速增长对传统微生物媒体(例如,SAB、PDA、MEA和WA)但没有孢子形成。刺激孢子形成,namrata Ajello [18]建议漂浮在水琼脂块酵母提取物,但是我们不能复制这种方法美国dorisiae。9的媒体使用,只有CZA有效刺激孢子囊开发4 - 5天内,在30°C。这种介质用于所有已知物种的形态描述Saksenaea(1,10,11]。
相比过去的接近美国trapezispora(10),这个新物种生长慢在CZA 15°C和37°C后4天(15 - 20毫米和35 - 45毫米和25 - 30毫米和35 - 40毫米,分别)。相比美国dorisiae,美国trapezispora孢囊梗长(230μ与130μ米),球形锥形孢子囊,而是丰富的假根和稀疏的,和大大大梯形孢子(av = 7×3.5μ米)和胶囊包裹的(av。= 5×3μ米)。美国trapezispora,经济增长是相似的美国dorisiaeCZA在最佳温度(- 35°C)经过4天的孵化。另一个Saksenaea物种生长非常快在这个媒介及其菌丝体完全覆盖了9厘米培养皿4天后孵化的最佳温度。
除了生长特性,形状和大小孢子形态特征的区别很重要的属(1,10,11]。孢囊的美国lautrophoriformis和美国vasiformis物种复杂很长,圆柱(杆状的),和7×3.5μ米大。在美国erythrospora他们是两面凹的(erythrocyte-like) 5.5×3μ米大,美国oblongispora椭圆形到长圆形,6.5×4.5μ米大,而在美国trapezispora他们是梯形,8×4μ米大。大多数新物种形成短圆柱(胶囊包裹的)孢子6×3μ米大。
最近的过去的物种,美国oblongispora(1),美国trapezispora(10),而美国dorisiae,为只有一个压力。Saksenaea oblongispora133.90应变CBS被隔绝在巴西森林土,美国trapezispora应变UTHSC DI 15 - 1从膝盖的伤口孤立的一个士兵在德克萨斯州,美国。
Mucormycoses造成的Saksenaea很难治疗。我们分析了抗真菌药物敏感性和发现美国dorisiaeovergrew的(除了和ciclopirox)条和光盘使用所有抗真菌治疗后长期孵化(5天在37°C)。测试15个抗真菌治疗,terbinafine显示稳定的活动对菌丝体的形式(从菌丝体的颗粒增长)的真菌即使长期孵化。有趣的是,两性霉素B的药物是治疗的首选mucormycoses [2),包括那些引起的Saksenaea物种(例如6 - 9),活动很弱美国dorisiae。在这项研究中,使用的唑类伊曲康唑、酮康唑、泊沙康唑显示,活动疲弱,而最低有效浓度高,3.0,2.0和4.0μ分别g / mL。唑类,如泊沙康唑,已经被提议作为二线药物对毛霉菌病或替代两性霉素B的情况下当检测到高毒性的两性霉素B (2]。显示在这里在体外测试,以防潜在的感染所致美国dorisiae,传统的抗生素疗法的两性霉素B和泊沙康唑可能不是最佳的治疗策略。类似地,在他的评论Saksenaea,Dannaoui [13)表示,这些真菌似乎比其他接合菌纲两性霉素B的影响较小。值得注意,我们发现真菌无法增长40°C和迅速灭活在这个温度。后1天暴露在40°C没有增长或孢子萌发观察和进一步培养在最佳温度下证明这个热处理真菌没能活下来。这种真菌的生理限制可能被用作辅助治疗策略,以及建议terbinafine和/或ciclopirox疗法。
尽管美国dorisiae已经从一个孤立的水样的私人位于农村地区的塞尔维亚共和国(Manastirica村的),没有明确的证据证明在其连接水作为主要的栖息地。最有可能的是真菌起源于周围土壤中污染了地下水。事实上,土壤的主要栖息地Saksenaea和一个已知的感染源通常看到后皮肤破裂和随后的接触受污染的土壤3,13,27)或受污染的水2,4]。尽管的存在Saksenaea真菌(如美国vasiformis)与土壤环境中已经很少报道,真菌被发现在世界的不同部分,建议广泛分布(13]。这种属的物种被隔离在粘壤土土泰米尔纳德邦(印度),从森林树木苗圃土壤在乔治亚州(美国),土壤在科罗拉多州的巴罗岛(巴拿马),和在Nancite海龟筑巢沙海滩(哥斯达黎加)。此外,他们从土壤banana-producing地区已报告在议会省(洪都拉斯),以色列花生田的土壤,土壤样本宜兰县(台湾),菠萝场土壤在冲绳(日本),也在非洲从潮间带浮木发现Mitsiua(埃塞俄比亚)。与水或水环境相关的感染人类和动物(海豚和虎鲸)也被报道之前(3,4,28]。
细菌学的调查结果(未发表的数据)的水样本显示高水平enterococci和其他污染粪便细菌物种表明微生物质量差的这口井的水是不适合消费。值得注意的是真菌被隔离的区域为适度大陆性气候的典型特征是寒冷的冬天。有趣的是,我们发现真菌的菌丝,菌丝的小球(一个个独立王国在液体培养基中)没有生存在5°C以上2和7天,分别。然而,孢子在低温悬浮在水中是可行的50天。因此,尤其是在寒冷季节时期,这种真菌的孢子对传播和生存至关重要。
到目前为止,所有已知的Saksenaea欧洲以外的物种,被描述,即,美国vasiformis(印度):NRRL 2443),美国lautrophoriformis(美国:UTHSC 08 - 379和印度:M-1012/15),美国erythrospora(美国:UTHSC 08 - 3606和中东:UTHSC 06 - 576),美国oblongispora(巴西:CBS - 133.90)美国trapezispora(美国:UTHSC DI 15 - 1)。我们所知,报告处理Saksenaea真菌从欧洲一直只与相关联美国vasiformis。这些报告在临床情况下仅限于西班牙地中海气候区(3,14- - - - - -16)、希腊(2),法国(1,13]。因此,美国dorisiae代表第一本属种类的描述来自欧洲适度大陆性气候区。这是第一个临床前报告的发生Saksenaea属欧洲环境。
5。结论
这项研究描述了一个新颖的机会性致病属的物种Saksenaea(美国dorisiae),从环境样品分离(水从一个私人)2018年10月在塞尔维亚共和国。多相的方法,其中包括茎(路易斯安那州立大学,它和tef-1α)分析表明,小说分类单元密切相关美国trapezispora和美国oblongispora。尽管它对几种常规抗真菌,真菌可以唤起临床具有挑战性的感染。Saksenaea dorisiae代表了第一本小说描述的分类单元属来自欧洲。
数据可用性
序列数据用于支持这项研究的结果已经存入NCBI基因库库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/)。新物种的描述(注册)数据用于支持这项研究的结果已经存入Mycobank库(http://mycobank.org/)。
的利益冲突
作者宣称没有利益冲突有关的出版。
确认
作者感谢斯蒂芬勃拉克(AQA GmbH,维也纳,奥地利)提供的数据样本来源。具有生物活性的微生物代谢产物(BiMM)研究平台支持赠款k3 - g 2/026 - 2013和小巴士/ LS16005由下奥地利州科学与教育基金(负反馈)。
补充材料
补充表S1:低温效应(5±0.2°C)的可行性Saksenaea dorisiae(BiMM-F232)。表S2:影响高温(40±0.1°C)的可行性Saksenaea dorisiae(BiMM-F232)。图S1:温度依赖的增长Saksenaea dorisiae(BiMM-F232)。(补充材料)