文摘
从1997年到2009年,1862年皮肤科、妇科和儿科(文章)相关临床酵母分离分析物种出现,标本来源和类型,(多)耐药模式和测试周期。孤立的前七DGP-associated物种保持一样的总医疗病房相比,白色念珠菌(45%)为最常见的病原体。然而,文章和文章icu病房显示特有的资料;即物种分布门诊专门相似,但是不同比例从病房,病房。通过应用“一个真菌一个名字”原则,分别适当的当前分类物种教派,它已被证明,没有趋势新兴物种从1998年到2008年能被检测出来。尤其是经常孤立的非白色念珠菌物种隔离在文章部门在1997年或之前已经被发现。酵母是皮肤的微生物群的一部分,发挥着重要的作用作为表面的感染机会致病菌,正确识别隔离根据新的命名法认为是对于特定的和计算的抗真菌治疗类酵母菌DGP-related传染性病原体。
1。介绍
浅表真菌感染通常是慢性和复发。据估计,大约15%的人口有皮肤真菌感染(脚癣或脚气)或指甲(甲癣)或脚。这些感染是常见的在年龄较大的儿童和成年人1]。近端,远端指甲下的指甲下的,和白色的表面onychomycoses通常是由真菌引起的,但是假丝酵母种虫害可能出现在所有类型在不到1%的情况下(2]。在过去,酵母被认为是简单的皮肤污染物(3];然而,酵母和nondermatophyte模具也可能导致脚趾甲甲癣(4- - - - - -8]。更高比例的酵母通常是发现在甲真菌病,真菌(68%),酵母(29%),和模具(3%)是最诱发真菌病原体(9]。一些假丝酵母种虫害导致甲真菌病报告部分耐药口服抗真菌药物(阿)。慢性患者黏膜与皮肤的感染,病原体主要酵母假丝酵母(C。)白色的,但c . tropicalis,C parapsilosis,Issatchenkia(我。)胶,Meyerozyma(米。)guilliermondii也可能有助于这些感染(10]。
它已经被克莱顿和高贵的建议11],酵母在医院病房的传播的传播发生在一个类似的方法金黄色葡萄球菌。此外,马车的酵母在住院病人皮肤似乎高于nonhospital人口(11]。因为皮肤的网站可以作为常见的感染来源,病人传播细菌和酵母的能力在更大程度上是由于皮肤的殖民化,以及这类病人解放更多的颗粒的比人临床正常皮肤(12]。与白念珠菌,非-白念珠菌假丝酵母(NCAC)感染在276 NCAC 1972 (14%)假丝酵母隔离,据萨默维尔市(13),导致大量的医院获得感染。
不是——物种分布假丝酵母酵母(NCY),例如,毛孢子菌属spp,新兴的亚洲国家(14),可能会强烈影响抗真菌剂使用[15]。平行于皮肤感染的增加率由NCAC和NCY物种,这些通常机会致病菌(越来越多的14,16- - - - - -19是孤立的危重患者(20.,21),从口腔22,23),肺部感染(24),从皮肤(擦烂的,paronychianous)和黏膜与皮肤的(vulvovaginal balanitinous)感染(25- - - - - -27[],泌尿生殖系统感染28,29日,在重症监护室30.]。最常见的真菌感染婴儿和儿童的黏膜与皮肤的念珠菌病,糠疹癣、体癣、脚癣、头癣[27]。假丝酵母殖民儿科和新生儿患者有相当大的发病率(31日- - - - - -35]。早产新生儿儿科ICU中除了阴道分娩,低出生体重,和较低的妊娠,年龄可以视为殖民(风险因素36]。口咽念珠菌病(鹅口疮)可能早在出生后7天开始,在5%到10%的婴儿发病率根据人口研究[31日,37,38]。
除了古典和流行病学变化的新兴人类真菌感染(39),特应性皮炎(AD)的发生率,一种多因素疾病,遗传和环境因素发挥作用,一直在增加。全球流行的广告是10% -3% -20%的儿童和1%的成年人(40- - - - - -42]。在总共241个样本在立陶宛诊所的患者临床诊断的广告恶化,最孤立的属是27.4%假丝酵母,6.6%的细胞死亡,2.9%的红酵母mucilaginosa。物种最频繁孤立的儿童和成人组Debaromyces hansenii,c . pelliculosa,c . parapsilosis,细胞死亡头皮屑(42- - - - - -44]。
因此,精确的应变识别和流行病学的知识假丝酵母和南汽物种是至关重要的,在决策和优化治疗的优势,特别是在预期的隔离的系统发育关系45另外考虑。
重命名后重新评估的目的,根据当前有效分类隔离教派,是评估相关酵母物种的分布和出现率,皮肤病隔绝,妇科,儿科病人(文章)。通过使用“新术语”这项研究应该建立一个有效的依据最近的比较和未来真菌流行病学调查。实际的磁化率剖面及其可能的变化在隔离期间(1998 - 2008)的1862名临床DGP-yeast隔离,测试在这一领域常用的唑类抗真菌药物,给出了相应的论文(46]。
2。材料和方法
1862年临床酵母分离物(表1)来自皮肤科、妇科和儿科病房从德国大学医院在柏林(查利特)、德累斯顿,莱比锡,明斯特和慕尼黑(Ludwig-Maximilians-Universitat慕尼黑,慕尼黑技术大学)从1997年年底开始,直到2009年2月,在4多中心研究的框架(MCS) [49- - - - - -51]。菌株的几个数字()1997年和2009年被添加到这些隔离的1998年和2008年,分别。因此,时间在本文引用1998年到2008年。此外,由于没有执行MCS从2005年到2007年,分别没有文章诊所参加;因此隔离从这个时期失踪。另外比较和识别可能的趋势,对隔离,两个相似的测试期(1998 - 2001和2002 - 2008)建立了整个研究期间。
识别和隔离分化进行使用方法通常采用在微生物学/真菌学实验室参与的考试中心。确认标识是为不寻常或没有确定物种通过红外光谱和/或在适当的参考实验室PCR个人的多中心研究。“一个真菌一个名字”原则是有效的(自2013年以来52,53),当前有效的名称相应的物种被应用在本文发表在SpeciesFungorum [47),分别在MycoBank [48]。
敏感性测试的隔离是由采用对相关唑抗真菌制剂,所述相应的论文(46]。
缓解的评估和设置表等危险因子的临床专业(不同的病房),来源和类型的标本被合并和包含在大组,例如,吸入物从穿刺(transtracheal、边缘、材料,例如,脓肿、囊,心包,胸膜,直肠,和脓);导管(留置、血管、性病、港口和麻醉管);无菌液体(无菌体液、酒、透析液、落下帷幕,气管的秘密,胸膜,泪腺,滑膜,血清,血液和尿液除外);固体(无菌)材料(组织/肺组织、骨髓、喉咙放电/痰、脓肿、脾、骨骼、肝脏、胃、和耳);设备(隐形眼镜、人工关节、透析,血液透析移植,心脏设备,如心脏瓣膜、心脏起搏器、接口控制文件,监督,中枢神经系统设备,阴茎植入,阴道海绵、横隔膜,和子宫内的设备);皮肤材料(皮肤差点崩溃,指甲/指甲屑,拔头发,头皮屑、和尺度);妇科的材料(被刮削下的碎屑,生殖器,前列腺的秘密,射精),尿液(中途、强调和导管);外部(外部诊所,医生办公室,外部实验室);一般内科(变态反应学、血管学、支气管镜检查、透析、内分泌学、胃肠病学,老年病学,内科,急诊室,内分泌学、肾脏学,肺病学,门诊部,精神病学,风湿病,康复中心,标准治疗,艾滋病毒中心,和热带医学);拭子(表面,所有身体部位,伤口,皮肤,气孔,耳朵,和骨骼),手术(腹部、审美、通用、心脏、塑料、血管、神经外科)。
3所示。结果与讨论
3.1。物种分布
根据临床的隔离频率分布假丝酵母和NCY物种隔离的MCS从1998年到2008年期间突变患者如表所示1。假丝酵母和NCY物种经常显示在图中恢复过来1其分布的孤立。“一个真菌一个名字”原则是有效的从2013年初51),当前有效分类教派属物种(47,53)在平行于上市报道物种由考试中心(表名称1)。“新”在本文属/物种的名字被使用。作为species-renaming的后果,大量减少物种分配给属”假丝酵母”和提高“新物种”。因此,的假丝酵母进化枝(37)19假丝酵母物种报道,9个(47%)被重命名,不仅局限于名称更改假丝酵母物种。“新”(“新兴”)的分类单元,部分叫做“不——之前白色念珠菌假丝酵母”、“not-Candida酵母”或“神秘的“病原体(16- - - - - -18,34,54- - - - - -58),已经开始广泛出现在整个德国,发现多中心研究[49- - - - - -51]。
尽管“新”分类,假丝酵母物种仍然是最常见的病原体c . glabrata,c . parapsilosis,c . tropicalis,c . inconspicua上,白念珠菌,导致文章的大部分真菌感染区域(25,35]。虽然最流行的物种在所有三个病房(文章)白念珠菌,出现不同的百分比显著(表2)。‧krusei和C。guilliermondii,这也属于8最常见的类药物引起真菌感染,现在发现在分类名称Issatchenkia胶和Meyerozyma guilliermondii。临床酵母的分离率相比,从总医疗病房隔离(表1;调查2008),孤立DGP-related物种的排名有所不同;然而,前七的孤立的物种保持不变,也显示相应的数据来自皮肤科病房最近的一项调查(表1)。有趣的是,10年的物种分布类似于2008年的调查研究为广大酵母分布在德国(表1),而真菌的分布从1998年到2008年(表2调查从2003年到2011年)类似于皮肤内单位(表1)。酵母的优势在调查和研究与其他研究同意执行其他地方(10,59),与c . parapsilosis第二常见的皮肤病相关病原体。作为全国/国际(IFD)和侵入性真菌疾病的报道假丝酵母血流感染(54,55,58- - - - - -64年),隔离频率的主要病原体从文章病房(表1和2)随后IFD的变化在欧洲65年),反映不断变化的事件假丝酵母和NCY菌株。因此,“有效的”假丝酵母物种中最普遍的突变菌株总数的76.5%隔离(表1和2),包括白色念珠菌(59%;隔离总额的45%),其次是子囊菌类的NCY物种(17%),和basidiomycetous酵母的3%。除了白念珠菌G (D: 22%: 56%, P: 47%),唯一物种孤立的文章还从所有病房及其icuc . tropicalis(2%、3%、12%)Clavispora(Cl。)lusitaniae(1%,1%,2%)。
尽管不均匀分布和低检测率的一些临床分离株在整个研究期间,隔离率表现出轻微的,统计上不显著增加NCY物种(图1)。不过,文章还在病房,NCA菌株的增加之后发现在其他医疗专业15,16,20.,21,26,29日,34,54,55,61年,64年,66年]。的分布的摘要假丝酵母物种在流行病学调查的最后几十年了66年- - - - - -68年]。从所有文章icu(最常见的隔离)白念珠菌(54%),c . glabrata(18%),c . tropicalis(12%),一、胶(8%),c . parapsilosis(3%),Cl。lusitaniae(3%),酿酒(年代。)酵母(1%),c的缘故,克鲁维酵母菌属(K。)marxianus,m . guilliermondii(各占0.7%)。不同的隔离率报告icu菌株在法国68年)和土耳其(69年),ICU分离(法国/土耳其)占57% / 14%白念珠菌,17% / 4%c . glabrata,8% / 28%c . parapsilosis,5% / 4%一、胶,5% / 14%c . tropicalis在土耳其只有3%k . marxianus,2%的Wickerhamomyces anomalus,1%的m . guilliermondii,1%的c . dubliniensis,0.6%的Debaromyces(D。)hansenii,0.3%的Clavispora lusitaniae。
据报道,c . parapsilosis最经常从年轻的病人,减少随着年龄的增长,虽然c . glabrata随着年龄的增长而发生(70年]。而的频率c . parapsilosis文章还在病房和文章icu(皮肤病icu除外)(D)被发现在16%,6% (P)、2% (G), G-ICU 8%,和3%的P-ICU,c . tropicalis被发现在12% (P), 3% (G), 2% (D), 20% (D-ICU) G-ICU P-ICU 12%,在8%(表吗2)。
除了白念珠菌,发现患病率最高c . glabrata(D) (G) 17%, 14%, 9% (P)、38% (G-ICU)和17% (P-ICU)。在德国的一个Hospital-Infection-Surveillance-Study [71年)评估在ICU院内感染,白念珠菌被发现是最常见的病原体引起血管导管脓毒症相关(5.6%的icu, 2.8%在儿科icu),和第四大代理尿导管相关感染泌尿道感染(8.7%)。酵母物种的分布在土耳其儿科ICU 2% / 4% / 1%白念珠菌,c . parapsilosis,d . hansenii。没有其他物种从ICU报道。尽管candidemia稳定超过10年的发病率(0.5每年发作病人/ 10.000天),这是五倍比其它外科icu病房在瑞士(72年]。然而,在最近的几十年的优势逐步转变白念珠菌(包括对NCAC / NCY物种c . glabrata和一、胶)据报道73年),与c . glabrata在大多数国家(占15% - -20%的感染74年- - - - - -76年]。这些差异最重要和经常出现的孤立的酵母物种研究的文章还在病房和icu中演示了表3。c . parapsilosis和m . guilliermondii最突出的只有在皮肤科病房(48% / 79%),发现显著较小程度上儿科单位(28% / 18%)但不是在妇科病房。而皮肤病学单位的水平白念珠菌和c . glabrata在妇科和儿科高出约30%,而c . parapsilosis发生在皮肤病学高出约30%,比妇科儿科病房。的发生c . tropicalis(表3在儿科病房)是最高(68%),显著降低在妇科(14%)和皮肤(5%)。
罗密欧与Criseo [77年发现8的11c . dubliniensis隔离来自口腔标本,只有2被发现在阴道,另一个在胃液体。的15c . dubliniensis菌株在这项研究中,一个是孤立的从血液,2从无菌体液,从儿科拭子5从皮肤和7。没有c . dubliniensis,c . inconspicua,d . hansenii文章还隔离来自icu(表2),这些菌株被发现在DGP-specimens,除了文章拭子(表2)。Gumral et al。78年)缺乏报道c . dubliniensis和c .非洲"菌株在土耳其和阴道白念珠菌隔离,同时Nnadi et al。79年发现在尼日利亚没有c . dubliniensis在vulvovaginal样本。三个c .非洲"隔离在柏林和两个出现在慕尼黑他们测试在MCS 2000年,一起从安哥拉和马达加斯加。虽然到目前为止只考虑作为一个新亚种白念珠菌,c .非洲"应该重新考虑作为单独的物种根据最初的提议Tietz et al。80年]。这是支持的结果Forche et al。81年]的rdn序列c . dubliniensis显著的不同白念珠菌这c .非洲"隔离系统不同。此外,c .非洲"可以通过傅立叶变换红外光谱(显然被分离82年),可能现在矩阵辅助Laser-Desorption /电离飞行时间质谱法(MALDITOF MS)c . dubliniensis(83年通过焦磷酸测序获得的),(84年),或与特定的分子描述方法(85年]。所有这些方法证明他们能够密切相关的物种之间的区别明显白念珠菌,c .非洲",c . dubliniensis。除了报道隔离在这项研究中,从阴道标本来自非洲80年,81年),没有出现在进一步德国/奥地利MCS,只有几株分离后在意大利77年,85年)、西班牙(86年)、尼日利亚(79年),英国(84年]。
Protothecosis sporotrichosis-like感染人类,在免疫力低下和免疫活性的病人,和动物。它是由achlorophyllic属藻类Prototheca,属于家庭Chloracellae和很少参与人类感染87年,88年]。属Prototheca(P)目前由6种:p . wickerhamii zopfii页,p . stagnora,p . ulmea,p . blaschkeae,p .皮肤。p . zopfii目前包含两个基因型(89年]。属的物种Prototheca存在于环境无处不在的碎石各种基质的居民和污染物。一般protothecosis是人类主要通过引起的p . wickerhamii和国内的动物p . zopfii。一般的症状是皮炎或牛乳腺炎,而致命的情况非常少见。p . wickerhamii和p . zopfii被孤立于1998年爆发在儿童单位MCS之一,这些生物从宠物动物传播到患者(82年]。
的十二种不同的细胞死亡(m)酵母描述(90年- - - - - -92年),m .头皮屑(14/0.2%),m . globosa(2/0.02%),m . obtusa(1/0.01%),m . pachydermatis(1/0.01%),m . sloofiae(1/0.01%),m . sympodialis(55/3%总量的72.3%米。spp)。在1998年和1999年被孤立在调查期间。这个相似的报告诗等。91年),m . sympodialis(72%)是最常见的孤立细胞死亡物种。此外,佩特里et al。91年)报道,背部和胸部的病人的病变是最常见的网站,也没有统计上的显著差异被发现物种之间的性别、年龄、或病变的持续时间92年]。细胞死亡强烈与头皮屑,头皮一个共同的障碍,尽管并不是所有的人细胞死亡在他们的皮肤产生头皮屑。除了细胞死亡spp,贡献了5%的人口dandruff-afflicted头皮,Filobasidium filoforme据报道是最孤立的担子菌类,而在健康的头皮呢隐球菌spp。(90%),一起红酵母mucilaginosa,可检测(92年]。同时在MCS 1998到2008新型隐球菌被孤立的7倍(隔离总额的0.4%),不是吗红酵母属种虫害感染在MCS观察。此外,由于MCS的有限的时间框架内研究,没有一个Exophiala,细胞死亡,Prototheca物种已经被隔离了德国/奥地利MCS 2009期间,除了e .皮炎这两个菌株的孤立的MCS 1999年和2000年,两个独立的爆发细胞死亡和Prototheca在1998/99(表种虫害1)。
投机取巧的酵母病原体毛孢子菌属(t) asahii,这是人类皮肤的真菌微生物群的一部分,被隔离偶尔从1998年到2008年(隔离)总额的0.2%。t . asahii可能是一个根深蒂固的路线trichosporonosis是后天获得的,而环境t . asahii不是与此相关感染(93年]。
DGP-species尿液样本的分布是不同的,这些孤立的调查从2003年到2004年从尿液标本的100名住院病人在土耳其一家医院院内candiduria [94年]。
有80%到95%,白念珠菌是主要的阴道殖民物种在绝经前和怀孕的渐近和健康女性急性吗假丝酵母阴道炎、慢性复发性vulvovaginal念珠菌病。NCAC-species,尤其是c . glabrata绝经后更加频繁,在糖尿病患者和免疫抑制女性,平行分布的地区差异假丝酵母物种(95年]。这项研究的结果表明,酵母在妇科病房谱及其icu没有显著变化。这是按照孟德尔发现,布拉奇(95年),报告至少在德国没有证据表明增加NCAC / NCY物种在急性或复发性阴道念珠菌病。
3.2。样本分布
样本的分布根据表中给出了它的起源2。根据不同的临床专业,标本类型及其数量不同于相应的icu(表2)。然而,排名和孤立的致病性酵母菌种的类型就像前五酵母病原体侵袭性真菌感染。只有白念珠菌被发现在所有列出的标本类型(表吗2),c . glabrata,c . parapsilosis,Issatchenkia胶被隔绝的大多数类型的标本在不同比例(白念珠菌:13% - -71%;c . glabrata:5% - -38%;c . parapsilosis:2% - -19%;c . tropicalis:2% - -20%;一、胶:2% - -7%)。所有其他物种不同归因于各种标本。从血培养(表最常见的隔离2)白念珠菌(48%),c . glabrata(21%)c . parapsilosis和c . tropicalis(9%,),一、胶(7%)和c . dubliniensis与相关的百分比(1%),每个孤立的8%,11%,11%,10%,9%,12%,和7%,分别。
如表所示2只有4个设备(0.2%)已经发送了相关的真菌的决心。三个设备来自皮肤科和一个设备从儿科病房。从其孤立的物种(白念珠菌,c . glabrata,Magnusiomyces菌capitatus),其中至少有两个属于众多假丝酵母物种(例如,c . glabrata,c . parapsilosis,c . tropicalis,c . dubliniensis和一、胶),据报道,形成生物膜,导管相关性丁点儿得罪,device-related感染(96年- - - - - -98年]。这不是强制性的在体外多中心研究报告详细的流行病学数据,主动收集数据不足以评估更多的危险因子。
4所示。结论
约20 - 25%的世界人口受到皮肤真菌病,因此被感染的最常见形式之一(99年]。皮肤真菌病的流行病学趋势全球平行变化院内和侵入性真菌感染。虽然感染的分布的一个重要转变导致代理是皮肤病学报道,妇科,儿科病房,除了一些地方发疹细胞死亡,Prototheca,Exophiala物种,所有在场的藏污纳垢之代理一直在和整个10年研究期间。除了显著差异文章病房的物种配置文件,这一趋势在DGP-species无法检测到的分布和总体病因学没有改变时间期间从1997年到2009年的多中心研究。但是,除了典型的皮肤病原体白念珠菌,c . glabrata,c . parapsilosis,c . tropicalis,c . dubliniensis,c . inconspicua感染非典型、稀有或“神秘”酵母隔离,所有已经存在的,例如Issatchenkia胶,酿酒酵母,Meyerozyma guilliermondii,克鲁维酵母菌属marxianus,Clavispora lusitaniae,Debaromyces hansenii,Yarrowia lipolytica,文章还往往也出现在病房和文章icu,分别报道其他病房。这可能是由分类变化明显放大,实现2013年年初以来,包括分类重新分类和伴随的各种物种的(部分)重命名根据“一个真菌一个名字”原则。然而,这部小说实践基于物种的系统发育映射可能允许在未来更好的不同或相似的病原体协会临床实体和特征。这也可能导致一个更好的和可靠的评估在体外敏感数据(在相应的文献[46]),它表示的基础不仅为特定的抗真菌治疗,但也特别计算(“经验”)抗真菌治疗。
利益冲突
作者宣称没有利益冲突。
承认
执行和报告这项研究没有财政支持制药或其他公司或接收从国家或国际资金来源。