识别和描述不同逆境应答R2R3 -RMYB转录因子的木槿sabdariffal

文摘

各种监管管理健康的蛋白质发挥根本性作用应力条件下植物生长。差异显示逆转录酶聚合酶链反应和随机扩增的cDNA结束(种族)被用来探索渗透逆境应答记录。我们识别和特征盐逆境应答R2R3 RMYB型转录因子木槿sabdariffa690 bp的开放阅读框,编码229个氨基酸长链。在硅片分析证实了守恒的R2和R3域以及NLS-1本地化网站。推导出氨基酸RMYB共享83年,81年,80年,79年,72年,71年,66%的同源性拟南芥,大豆,栽培稻,玉蜀黍属玉米,马吕斯有明显,杨树tremula×杨树阿尔巴,紫花苜蓿分别具体MYB家庭。我们观察到的基因upregulation茎、叶和根组织响应非生物压力。此外,RMYB基因被克隆植物表达载体在CaMV35S启动子和转换陆地棉:当地的棉花品种。过度的RMYB观察转基因植物在非生物胁迫中进一步表明其在应对压力条件下监管作用。转基因棉花作物的RMYB转录factor-overexpressing可能作为潜在的代理宽容的作物品种的发展压力。

1。介绍

干旱和盐碱是最具破坏性的环境压力,导致主要减少作物生产力和质量。在世界范围内,约占总数的20%和33%的耕地灌溉农田受到盐度为10%每年增加由于盐水供应以及糟糕的农业生产方式等(1]。这些数据使盐度的非生物胁迫因素限制了植物的生长尤其是根拍摄比由于光合作用有限,活动。理解盐渍化影响根组织是至关重要的,因为它直接承担过度的离子交换在周围地区不平衡和它也执行等许多重要功能的植物在土壤、水和养分吸收和离子体内平衡2]。基因表达调节盐度胁迫包括一系列广泛的机制,被植物用来或表达下调的生产产品(信使rna蛋白质)的特定基因。这些基因涉及三个主要类别:(i)那些参与信号级联转录控制(转录因子),如MyC,地图,紧急求救信号激酶磷脂和转录因子等HSF和CBF /含有DREBWRKY, MYB bZIp bHLH, NAC转录因子;(2)那些函数直接保护细胞膜和蛋白质,如热休克蛋白(热休克)和陪伴,晚期胚胎形成丰富的(LEA)蛋白质;和(3)那些参与水和离子运输如水通道蛋白和离子转运蛋白(3]。最重要的监管机构的基因和转录因子基因簇。他们的dna结合结构域被认为是分类成科和亚科。许多家庭喜欢bZIP, WRKY AP2,南汽,C₂H₂锌的手指,MYB TFs已经深入研究了在充满压力的环境中发挥监管作用。

MYB蛋白构成最大的TF组功能多样化,发现在所有的真核生物。目前,一些MYB蛋白已确定的拟南芥、大米(栽培稻)[4),玉米玉米),和棉花(陆地棉)基因组5]。大部分的植物MYB TFs属于R2R3-type和发挥积极作用(1)初级和次级代谢物,(2)细胞命运和身份,(3)发展过程,和(4)应对生物和非生物压力,而另一些人则喜欢R1/2-MYB蛋白质主要是参与调节生理节律。R1R2R3-MYB蛋白质参与b型细胞周期蛋白的形成,细胞循环控制、宽容和压力(4]。

在过去的十年中,不同的角色的成员MYB深入研究以应对不同的非生物应力条件。例如,AtMYB2 ABA-mediated干旱胁迫响应的功能拟南芥(6]。AtMYB102是发现一个关键的管理组件受伤,渗透和盐度压力,ABA的应用程序。此外,AtMYB96调节ABA信号以响应非生物压力拟南芥(7]。过度的AtMYB44已经观察到增强非生物压力通过保持耐性转基因的气孔关闭机制拟南芥(8]。

木槿sabdariffal .(英文名:红栗色,洛神葵;阿拉伯语名字:Karkade)属于锦葵科家族是一个基本的一年生植物染色体数目 ( )。它主要生长在非洲的热带和亚热带地区。其肉质花萼(萼片)是一个很好的来源的天然抗氧化剂(花青素和原儿茶酸),保护细胞膜免受自由基伤害尤其是脂质过氧化(9]。差异显示是一个可靠的技术主要是基于逆转录酶聚合酶链反应(10]。它已经被用于分离差异表达基因不同植物在非生物胁迫(11,12]。在这项研究中,我们报告一个小说nuclear-localized R2R3-type RMYB基因分离木槿sabdariffa盐胁迫下l。到目前为止,MYB TFs已确定从一些陆地植物和孤立,但这项研究由第一个报告关于MYB TFs的表征木槿sabdariffal .起源于应对盐胁迫。Overexpressing基因在转基因植物表明其假定的角色压力的监管宽容机制。

2。材料和方法

2.1。植物材料,压力治疗,隔离和RNA

的种子木槿sabdariffal .品种(散装Rahad)生长在塑料锅(25×30厘米)复合土壤混合物(泥炭、土壤和沙子)相等的比例(1:1:1)在温室25±2°C与相对湿度接近50% (9]。发芽后,一个月100毫米氯化钠应用于实验植物。对照组的植物浇水与正常的自来水也保持控制。压力应用程序后,治疗和控制植物的根系取样,立即冻结在液态氮和总RNA隔离是由使用phenol-based方法(13]。琼脂糖凝胶电泳(0.8%)是为了检查总RNA的完整性,并量化是通过使用Nanodrop, nd - 1000分光光度计(Nanodrop Technologies Inc。)。DNase1(σAMPD1-1KT)治疗是为了去除DNA污染。

2.2。RMYB基因鉴定

微分的mRNA进行如前所述[10),小的修改。总RNA (1μg)是反向转录与一个固定oligo-dT底漆用RevertAid™H -合成第一链cDNA工具包(Fermentas,伯灵顿)根据制造商的协议。差异显示进行了15任意随机引物结合11锚定引物(补充表可以在网上https://doi.org/10.1155/2017/2763259)在25μl包含2.5个单位体积(0.5)μl(聚合酶(表达载体),1μ每个引物(10皮摩尔),0.5毫米核苷酸,2.5μl 10×PCR缓冲,500 ng (1μl) cDNA, 1μl MgCl(50毫米)₂。循环条件是:初始变性在95°C 2分钟紧随其后35周期的变性在95°C 45 s,退火在42°C 1.30分钟,在72°C 45 s扩展,最终伸长步骤10分钟的72°C。放大产品运行在16%变性聚丙烯酰胺凝胶所提到Maqbool et al。3]。复制扩增子被克隆到pJET向量和测序用ABI棱镜染料终结者装备和ABI 3100型自动DNA测序器(应用生物系统公司,培育城市,CA),同源性研究是用在线爆炸工具(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)。结束的潜在扩增子进一步放大使用GeneRacer工具包(生命表达载体技术,卡尔斯巴德,CA)。总RNA (3μg)是用于生成竞赛准备第一链cDNA和转发gene-specific引物(5——GCAGGATCGAGACCTTGGCGTCTCA-3),反向引物(5——TCAGACATCCGCGGACGGTGCTTTA-3赛车),基因引物(5′-CGACTGGAGCACGAG-GACACTGA-35)被用来生成的基因。PCR概要文件被设置为初始变性和周期为2分钟在94°C,退火在67°C 30年代,在68°C和扩展了1分钟。每五后续周期后,退火温度下降了1°C到62°C实现温度和额外的30个循环退火温度为62°C进行了。PCR产品解决1% (w/v)琼脂糖geland预期大小的DNA片段被净化,克隆和测序。放大的种族生成完整的基因从基因组DNA是由使用引物RMYB-F(5TTACTCCCACCTTCTGCAATTT3)和RMYB-R(5GATTGAGTAGGCACCGAAGTTT3)然后克隆到pJET1.2向量和测序。

同源性的研究是由使用在线爆炸(基本局部比对搜索工具)和两两对齐算法(http://www.ebi.ac.uk/emboss/align)项目。外显子/内含子边界,未翻译区(utr)和多聚腺苷酸尾地区被softberry位于服务器(http://www.softberry.com/berry.phtml)。核苷酸序列的概念翻译是通过使用开放阅读框仪(ORF)项目(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html)。分子量和亚细胞定位在ExPASy服务器(http://expasy.org)。PSIPRED软件被用来预测RMYB基因的二级结构。计算了跨膜螺旋的RMYB MEMSAT3和MEMSATVSVM软件而PredictProtein服务器用于理解蛋白质的溶剂可及性。多重序列比对是由使用CLUSTALW使用默认参数通过EMBnet (http://www.ch.embnet.org/software/ClustalW.html)。系统发育关系是由使用CLC基因组工作台软件R2R3-MYB公开102年MYB-like氨基酸序列拟南芥(NP_567626)转录因子MYB39岁的栽培稻粳稻集团(XP_015645522),大豆MYB转录因子MYB77 (ABH02890),紫花苜蓿MYB转录因子(XP_003608268),MYBdna结合域总科的蛋白质玉米(DAA63102),马吕斯有明显(NP_001281023),MYB转录因子的杨树tremula×杨树阿尔巴(AAN05422)。结构建模是由同源建模服务器;Phyre2 (http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/html/page.cgi?id=index)、拼图(http://bmm.cancerresearchuk.org/ ~ 3 djigsaw /)、瑞士模式(http://swissmodel.expasy.org/interactive),I-Tasser (http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/)和RaptorX (http://raptorx.uchicago.edu/)。这些模型是进一步检查φ和ψ拉马钱德兰情节和3 d ID分数估计PROCHECK服务器(http://services.mbi.ucla.edu/SAVES/)。积极结合氨基酸残基在桑特域被在线预测metaDBSite数据库(14]。PyMOL-Educational软件(http://www.pymol.org/)被用来可视化三维结构的预测参数。图案扫描(http://myhits.isb-sib.ch/cgi-bin/motif_scanweb服务器是用于研究的主要MYB蛋白N-glycosylation网站等网站功能活跃,蛋白激酶网站,网站myristoylation和磷酸化。

2.3。实时PCR RMYB成绩单的表达分析

RMYB记录在组织水平的反应(根、叶和茎)研究了在干旱、盐,和冷应激的温室。Gene-specific引物RMYB- - - - - -F (5-CACATTCCAAGGCTGGATCT-3) RMYB-R (5-CAACCGGACCATCATCTTCT-3)被用于这一目的。盐胁迫是应用在前一节中所述;冷应激通过保持应用的植物在4°C,而干旱胁迫被停止应用水,同时保持控制植物没有任何压力治疗规范化的相对折叠数据。总RNA提取叶、茎和根组织的控制,像之前描述的那样强调植物。IQ5周期计(Bio-Rad大力神,CA)是使用智商™SYBR_Green Super-mix染料(Bio-Rad),而qPCR循环条件设置一个初始变性在95°C 5分钟紧随其后40周期在94°C的变性30年代,退火60°C 30年代在72°C扩展了40年代和72°C最终伸长了10分钟。融化曲线的分析是由连续监测荧光60°C和95°C之间0.5°C增加每30秒后。统计分析是由使用相对表达式搜索工具(REST) (http://rest - 2009. -基因quantification.info/)。β-Actin基因表达是用于数据规范化。方差分析(方差分析)是由使用STATISTICA 8.1数据分析软件来观察RMYB表达式的显著差异在不同的植物组织。

2.4。植物表达载体建设和遗传转化

全长序列引物Xho我限制网站(Xho如果5ggCTCGAGATGTCGAAACCTCCTCCTCCT-3 ,Xhoir 5ggCTCGAGTTACCTGGGACCGGAAAGC-35点)目的是用来放大RMYB成绩单的开放阅读框了Xho我限制网站内和下游的启动和停止密码子。放大产品和pcambia - 1301矢量双消化了Xho我单独过剩地区的发展和进一步的结扎通过使用T4 DNA连接酶(英杰公司)根据制造商的协议。克隆和定位RMYB记录被确认通过限制消化和取向引物。成熟的胚胎当地棉花品种的cim - 496用于RMYB基因的转换农杆菌属介导的转换方法(15)做了一些调整。是非植物保持控制。GUS-positive植物适应和转移到一个温室进行进一步分析。

2.5。强调宽容和转基因植物的表达分析

转基因植物筛选通过使用正向引物PCR的向量和反向gene-specific底漆。干旱、盐,和冷应激是应用于转基因植物以及nontransgenic 3周后将温室的植物。100毫米氯化钠压力申请5天,而植物脱水应用干旱胁迫5天。冷应激的转基因植物被保存在寒冷的房间在4°C 5 h(每个应力应用于另一组植物)。β-Actingene-specific引物,β-actin-F(5TGGGGCTACTCTCAAAGGGTTG3)和β-actin - r(5TGAGAAATTGCTGAAGCCGAAA3),被用作内部控制规范化数据。基因表达是计算成倍增加相对于相同的记录在控制条件下的比较Ct方法通过使用相对表达式搜索工具(REST)基于2^−Δct。标准偏差计算显示变化的复制。

3所示。结果

3.1。识别RMYB成绩单

不同的固定和任意引物组合差异显示后生成大量的记录。出的记录,只有5潜在的扩增子从200年到600年英国石油公司显示差异一直存在。因此,这些记录是孤立的,克隆、测序,分析,提交潜在salt-responsive est在NCBI数据库基因库加入数字[JK757799.1, JK757800.1, JK757801.1、JK757802.1 JZ152799.1]。爆炸显示显著的同源性与不同逆境应答基因等多种植物物种葡萄品种Danuta VINE-1重复元素,gag pol多蛋白基因,大豆盒蛋白质SKIP14-like,陆地棉信使核糖核酸的MYB蛋白质、假定的逆转录转座子copia,前者和转座子GORGE3-like。记录加入数量(基因库JZ152799):没有显示显著的同源性与任何功能的蛋白质。成绩单JK757801.1编码成髓细胞瘤蛋白质数量放大从5′和3′的种族,放大额外的435个基点核苷酸通过添加到前面的225个基点长EST。新生成的完整长度的扩增子被任命为RMYB编码长794 bp扩增子的cDNA模板(基因库:KC145282),当长690 bp扩增子从基因组DNA(图源1(一))。

3.2。序列分析

比较分析的基因组DNA和cDNA序列RMYB表明,转录产品基因内区自由。我们发现46 bp在3′UTR区域和58 bp在5′UTR区域下游终止密码子(TAA)。总9 bp包含多聚腺苷酸尾地区从785年到794年英国石油公司的3′末端互补脱氧核糖核酸模板。活跃的MYB /桑特域分析cDNA序列通过包含蛋白质数据库如图1 (b)。翻译RMYB基因的蛋白质是由229个氨基酸组成的5.13π和56.9 kDa。超过75%的观察序列相似性与不同植物物种包括裸子植物和被子植物与活跃MYBdna结合域(图1 (c))。PSIPRED二级结构预测循环显示螺旋的存在41%和59%的蛋白质序列RMYB基因(补充文件1 s1)。PredictProtein服务器预测72.49%的暴露面积和可访问的溶剂,7.2%在中间反应,而剩下的20.09%不反应的葬和溶剂(补充文件无法访问s2)。44 - 59之间的区域氨基酸生成ATP / GTP-binding网站主题47-54aa位置以及c端细胞外区域61 - 82氨基酸c端细胞外区域和胞质氨基端区域,分别为(补充文件s3)。此外,四个CK2_PHOSPHO_SITE caseine激酶二世在20,73 - 76位置,102 - 105,和162 - 165 aa观察通过PROSITE主题分析。有三个主题特定47-52 N-myristoylation站点,88 - 93,和159 - 164 aa的位置,两个网站PHOSPHO_SITE磷酸化蛋白激酶C在54-56,195 - 197 aa的位置,和一个在101年到109年为酪氨酸激酶磷酸化aa的位置。多序列比对算法由CLUSTALW显示66 - 83%的相似之处与其他植物物种,如氨基酸残基拟南芥(83%),大豆(81%),栽培稻(粳稻集团)(80%),玉蜀黍属玉米(79%),马吕斯有明显(72%),杨树tremula×杨树阿尔巴(71%)和紫花苜蓿(66%)(图2(一个))。系统发育研究显示密切相关MYB基因在大豆和玉米,而远亲Medicago truncatula和马吕斯有明显。这些特征与R2R3——RMYB指定它的关系MYB基因家族(图组2 (b))。

3.3。识别结构预测和活跃的绑定残渣

RMYB基因生成的三维结构模型通过使用不同的在线服务器补充文件所示(S3)。独立的一代的蛋白质结构基于同源性建模与我们观察到只有50%的同源性亩骶(家鼠)链结晶结构的C -MYBR2提供的蛋白质数据库(PDB)中推荐的得分开始独立的建模。生成的结构RaptorX服务器使用各种结构性验证和评估软件适合进一步研究基于拉马钱德兰情节和验证(图3 d程序3(一个))。教育版Pymol可视化生成的3 d结构和PROCHECK分析进一步证实了结构的稳定性(补充文件)。拉马钱德兰情节分析显示超过93%残留在最受欢迎的地区,允许地区的44%,而只有2.6%的离群值的区域(图3 (b))。没有一个氨基酸残基有φ和ψ角不允许地区表示生成的蛋白质结构的高稳定性。验证3 d验证程序还显示得分的可靠的IDRaptorX生成的模型。MetaDBSite服务器绑定关联分析dna结合域的氨基酸残基。总共39残留物被预测为核酸(图高亲和力3 (c))。其中,74.3%的残留在R2R3MYB绑定域名,其余变量c端地区(数字4(一)和4 (b))。

3.4。RMYB基因的表达木槿sabdariffal .响应非生物压力

120 bp的RMYB片段被实时PCR从cDNA放大木槿sabdariffal .基因表达是2.0、1.5和1.0倍,茎,叶,根,分别在盐胁迫下(图5(一个)),而表达式是8.0、5.0和3.0倍,以应对干旱、盐,和冷分别强调根(图5 (b))。基因表达与控制或相应的植物和数据标准化是由使用β肌动蛋白作为管家基因控制。

3.5。基因克隆和遗传转化

RMYB基因克隆的植物表达载体pCAMBIA 1301 (11.837 kb),和完整的引物扩增690个基点的完整编码序列插入的Xho我限制网站前后顺序启动和停止密码子(图6(一))。证实了结扎限制消化(图6 (b))。证实了插入的方向向量方向引物产生已知的片段的大小,进一步证实了测序数据,显示100% RMYB基因序列的同源性。完整的磁带的示意图表示向量和碎片如图6 (c)。完成转换过程可以从补充文件访问(S4)。组织化学的GUS化验检测交通GUS基因表达的转基因叶组织的蓝色,而没有颜色nontransgenic植物的叶子(图7(一))。PCR分析表明,转基因植物的基因组DNA扩增的基因利益(图7 (b))。在这个实验中,整体转换效率约为0.7%。图7 (c)显示了转基因植物转移到土壤和不同非生物应力对这些植物的影响。

3.6。RMYB基因的超表达转基因植物

变量响应基因的表达在转基因棉花作物在不同非生物压力。大约55 RMYB基因的表达检测下渗透压力和盐胁迫下41-fold是过表达。感兴趣的基因是15倍更表达了冷应激(图下7 (d))。这个超表达转基因植物与nontransgenic植物。

4所示。讨论

TFs发挥重要作用在调节植物的遗传反应,在非生物应力控制基因的级联。各种研究进行了识别和描述。MYB转录因子家族是一个很大的组蛋白,主要参与的数组函数关于成长和发展,主要和次要代谢,细胞命运的规定,和应对生物和非生物压力16]。差异显示分析是一种有效的技术来探索改变生长条件下的差异表达基因。这种技术的敏感性导致好检测的基因存在于低丰度(诱导或抑制),只有少量的原始材料是必需的(10,17]。一些生物和非生物逆境应答来自不同植物物种的成绩单已确定通过这种方法如西红柿、水稻、大麦、拟南芥、向日葵和棉花。然而,这种类型的调查还没有报道木槿sabdariffal . RMYB成绩单,我们已经确定了和孤立和MYB TF显示超过70%的同源性的基因家族。全身RMYB序列编码229个氨基酸长链一个开放阅读框被种族检索。在硅片分析显示守恒MYB dna结合域的存在从16至114 n端氨基酸残基。保守序列的递归域名是MYB TFs的特征(1 r R2R3 3 r, 4 r)基于它的命名法。RMYB基因发现其同源性R2R3类型MYB类的最大植物TFs [18]。R2R3被认为是R1R2R3-MYB基因的祖先的后代形成的损失R1重复基因家族和随后的扩张。MYB域被认为是高度保守的,而其他地区R2R3-MYB蛋白质的主要变量(6,19]。nonconserved不同序列在c端地区使这些因素获得更广泛的和不同的功能,如控制的发展,次生代谢,激素调节,和应对生物和非生物压力包括干旱、盐、受伤,寒冷,冻结。我们还观察到HTH其他MYBs类似的重复20.]。RMYB基因DNA结合域内具有NLS-1信号等运输蛋白质的核医学等其他MYB蛋白MYB阵线MYB44,GmMYB44(NLS1-KGRK),AtMYB59,AtMYB48(NLS2-RKKAQEKKR) [21- - - - - -23]。推导出翻译产品显示出显著的同源性与其他农作物拟南芥,玉米,栽培稻,大豆,紫花苜蓿。(4]。编码转录RMYB拥有一个高度保守的dna结合域内均匀分布的残留物“w”,这是重要的疏水核心和结构稳定性的MYB重复(24,25]。

系统发育分析MYB蛋白被广泛开展拟南芥,栽培稻,玉米和杨树,系统地研究了它们的进化关系24]。有分组的系统发育关系木槿sabdariffal与玉米和大豆具体MYB的家庭和显示差异拟南芥,因为一个小的子集R2R3 MYB蛋白,调节盐和脱水的基因(例如,AtMYB2)不包含第一个半胱氨酸残基这使得它不可能形成一个s键。因此,另一种可能的机制包括亚硝基化cysteine-S控制它的DNA结合活性。这些转录因子也进行泛素化附近的赖氨酸残基或转录激活域,从而创建一个转录活动产生积极的影响。磷酸化常常具有增强作用的转录活动MYBs,观察到拟南芥和烟草(25,26]。这种发散关系揭示了MYB家庭经历了快速扩张由于基因重复,序列偏差,整个进化和基因转换。这种不同的演化支可能已经失去了进化的拟南芥血统或获得以及血统rosid和海盘车的发展。近的子组表明,源于相同的基因重复事件。

保护功能是通过基因的聚类和守恒的主题以外的dna结合域帮助识别不同的功能守恒的图案。冗余观测MYB基因氨基酸序列水平,表明,微分/空间表达的基因使他们有类似的分子功能,然而,他们显示变量变异的生物学特性。所以,发育生物学不会导致冗余,相反,在进化过程中,基因密切相关的函数和保持在一起。单个基因是由多个因素来自同一基因家族传输信号通过相同的元素19,26,27]。表观遗传修饰和蛋白质的相互作用可以显著地影响MYB转录因子的调控潜力(4]。有一个单体的DNA结合潜在的观察在体外MYB蛋白中有两个或两个以上的MYB重复。他们充当共价结合二聚体,当他们接触的DNA。二聚负责这些蛋白的亲和力和特异性结合的DNA。这一结果多元化整体功能特征,以及序列同源性,环境响应和细胞定位(28]。

建模和交互研究metaDBSite分析进一步验证的功能交互RMYB域与核酸。> 76%的预测dna蛋白质活性绑定残留R2R3 dna结合域内被发现。天冬氨酸、精氨酸、赖氨酸、色氨酸和丝氨酸覆盖活动领域内残留的主要部分,可能被认为是参与活动的MYB基因(29日]。铸造的相对约束力的亲和力,R2R3——目标MYB域与kD值和错误率像ACCTAC ACCAAT, ACCAAA ACCATA。ACCAAC, ACCACA ACCACC,已经证实,首选绑定序列被发现ACCTAC [30.]。MYB转录因子的作用在各种生化的过程、代谢调节、控制细胞周期,并参与各种环境因素对生物和非生物的防御反应报道(31日]。变量但重要的诱导表达中检测出阀杆,盐胁迫下根、叶组织在细胞核中显示出其重要作用。的感应TaMYB1由光缺氧、盐胁迫和ABA和挂钩程序观察同样的小麦(32]。识别和描述小麦MYB基因的全长cDNA序列TaPIMP1利用rt - pcr对病原体感染、种族和超表达的转基因烟草干旱和盐胁迫下也被研究[33]。过度的GhMYB7在转基因拟南芥增强发展中纤维,监管次生细胞壁的生物合成,作为潜在的转录激活因子(34]。我们也观察到的反应RMYB基因对多个非生物压力和表达诱导针对干旱、盐,和较低的温度。这表明RMYB洛神葵的特遣部队参与调节响应低温盐胁迫的压力和干燥无论干旱和半干旱地区帮助缓解植物的生理同时将正常状态。为进一步说明MYB基因的活动,观察RMYB成绩单的超表达转基因棉花植物响应非生物压力。本研究将有助于应对不断变化的外部环境条件。我们的研究结果表明,基因表达和之前报道的发现是一致的(8,35]。描述的R2R3SbMYB44转录因子的单体型蓬子有腕门Roxb响应盐胁迫还进行了显示其参与多个非生物压力(24]。drought-specific标记基因的稳定表达OsLEA3,OsRab16A,OsDREB2A,在OsMYB2overexpressing转基因植物(36]。

总之,RMYB成绩单隔绝木槿sabdariffa盐胁迫下l是一种R2R3 MYB TF参与压力耐受机制。RMYB基因的超表达转基因陆地棉阐明了植物潜在作用来应对压力的环境条件。这些转基因植物可能是一个潜在的候选人育种和宽容/抗性品种的开发。

缩写

差异显示:	差异显示逆转录酶聚合酶链反应
种族:	随机扩增的cDNA结束
CaMV:	花椰菜花叶病毒
MYB:	成髓细胞瘤
TFs:	转录因子
爆炸:	基本的局部比对搜索工具
utr:	未翻译区
多聚腺苷酸:	腺苷酸的
方差分析:	方差分析
美国东部时间:	表达序列标签。

的利益冲突

作者声明,这项研究是在没有进行任何商业或财务关系可能被视为一个潜在的利益冲突。

作者的贡献

Bahaeldeen Babikar穆罕默德,穆罕默德Bilal萨瓦湿实验室进行实验而Zarnab Ahmad和Bushra拉希德进行了生物信息学分析。Bushra拉希德和Sameera哈桑起草了手稿。Bushra拉希德和塔亚布Husnain设计和监督项目。所有作者阅读和批准最终的手稿。

确认

也感谢作者穆罕默德Naveed舍希德博士和穆赫塔尔·艾哈迈德·技术帮助和支持。作者感谢世界科学院(TWAS)财政支持和博士Bahaeldeen Babiker默罕默德在前往巴基斯坦完成这项研究。

补充材料

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