), whereas cytokines were elevated in patients. No significant difference was observed in the concentration of TIMP-1 in patients and controls. Genotyping led to the identification of 3 SNPs (Val213Ala, Glu363Lys, and Glu376Asp) in α1AT gene. The novel SNP Glu363Lys of α1AT was found to be associated with asthma ( ). The analysis of TIMP-1 gene showed the occurrence of seven SNPs, including a novel intronic SNP at base G3774A. The allele frequency of G3774A and Phe124Phe was significantly higher in asthmatics as compared to controls. Thus, the SNP Glu363Lys of α1AT and G3774A and Phe124Phe of TIMP-1 could be important genetic markers for use in better management of the disease."> α1AT和TIMP-1基因多态性在哮喘的发展 - raybet雷竞app,雷竞技官网下载,雷电竞下载苹果

国际基因组学杂志

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国际基因组学杂志/2012年/文章

临床研究|开放获取

体积 2012年 |文章的ID 968267年 | https://doi.org/10.1155/2012/968267

Manish Kumar d . p . Bhadoria Koushik Dutta Mitesh Kumar F。,巴拉特辛格,Seema辛格,Anil k Chhillar,d . Behera,g·l·夏尔马, α1TIMP-1基因多态性在哮喘的发展”,国际基因组学杂志, 卷。2012年, 文章的ID968267年, 10 页面, 2012年 https://doi.org/10.1155/2012/968267

α1TIMP-1基因多态性在哮喘的发展

学术编辑器:g . Pesole
收到了 2012年8月02
接受 2012年10月13日
发表 2012年11月21日

文摘

哮喘是一种炎症性疾病伴有肺组织重构和protease-antiprotease失衡。的单核苷酸多态性alpha -抗胰蛋白酶(α1),组织抑制剂metalloproteinase-1(TIMP-1与哮喘)基因进行了研究。基因分型的α1TIMP-1202年基因进行哮喘患者和204名对照。血清水平的α1,TIMP-1和细胞因子估计发现如果基因型之间的相互作用和细胞生物标志物确定哮喘的发病机制。分析结果显示显著低水平的α1在哮喘患者的血清与控制( ),而细胞因子升高的患者。没有观察到显著差异的浓度TIMP-1病人和控制。基因分型鉴定了3个snp (Val213Ala、Glu363Lys Glu376Asp)α1基因。这部小说的SNP Glu363Lysα1被发现与哮喘相关( )。的分析TIMP-1基因显示七个SNP的发生,包括小说intronic G3774A SNP在基地。G3774A的等位基因频率和Phe124Phe明显高于在哮喘患者比控制。因此,苏格兰民族党Glu363Lysα1和G3774A Phe124PheTIMP-1可能是重要的遗传标记用于疾病的更好的管理。

1。介绍

哮喘病理生理学涉及广泛的肺组织结构的改造,和protease-antiprotease失衡一直被认为发挥重要作用在疾病的发病机理1]。中性粒细胞和肺泡巨噬细胞(AM)合成中性粒细胞弹性蛋白酶(NE)和基质金属蛋白酶(MMP),分别已突出的炎症活动期间释放蛋白水解酶(2]。东北是一种蛋白酶破坏肺泡壁的主要结构蛋白。由于表达和不需要的活动保持在检查肺结构和完整性的维护,一个antiprotease alpha -抗胰蛋白酶(α1在体内产生。的α1,主要由肝细胞合成,肺部变弱NE (3]。基质金属蛋白酶已经报告给发挥重要作用在调节多种细胞过程包括增殖、分化、迁移(附着力/分散),血管生成,宿主防御和细胞凋亡4,5]。MMP-9的活动,主要的肺组织中MMP的存在,保存在严格控制下的组织抑制剂metalloproteinase-1 (TIMP-1) [6]。据报道,MMP-9之间的平衡和TIMP-1干扰在哮喘患者的气道。有效浓度的增加MMP-9已被证明与FEV1下降(7]。

哮喘和之间的联系α1在不足已经证明主要是杂合子和pim PIMZ基因型的α1基因。患有严重哮喘的儿童有一个更大的频率Z杂合子的变种α1比nonsteroid-dependent哮喘和控制人口8]。哮喘被发现在PiMZ三组相比拨弦组(9]。从我们的laboratoty展示了PIM3等位基因的研究α1与慢性阻塞性肺病患者招募从印度北部平原10,11]。以来已经有明显的重叠在哮喘和COPD的发病机制和症状,我们认为这是有关寻找可能的作用α1基因在哮喘也。有一个缺乏信息TIMP-1哮喘病患者的地位及其单核苷酸多态性也尚未研究印度的人口。因此,当前的研究主要集中在调查的作用α1TIMP-1在基因和蛋白水平及其与炎症细胞因子,在哮喘的发展。

2。材料和方法

2.1。主题

二百零二例哮喘招募Lok Nayak呼吸道门诊的医院,新德里,印度,204年健康个体所有无关的北印度人也登记作为控制对象。被诊断为哮喘的基础上历史,体检,和肺量测定的数据,根据哮喘的全球倡议大会报告和指南出版于2008年,在“全球战略管理和预防哮喘。“研究协议Lok Nayak医院伦理委员会批准Maulana Azad医学院,新德里,印度,和CSIR-Institute基因组学和综合生物学、德里,印度。患者发热、活跃的呼吸道感染的证据,急性肾功能衰竭,活动性肝炎时访问或前4周内,支气管扩张、肺结核表示通过胸部x光和高分辨率CT扫描被排除在研究之外。受试者接受系统性皮质类固醇在前4周也被排除在外。书面知情同意了之前所有受试者参与研究。所有参与者的人口和吸烟流行细节通过问卷调查评估。的身体质量指数(BMI)和吸烟指数(SI)为每个主题都被记录下来。血液从健康个体以及患者(年龄≥13年)被诊断为哮喘。

2.2。基因分型

从外周血中提取出的DNA样本的标准方法(12)和50 ng / mL的DNA浓度用于pcr实验。先前描述的引物合成,用于放大α1TIMP-1基因(11]。PCR是在优化的条件下11)使用thermocycler(9700年基因Amp,应用生物系统公司,生活技术,新加坡)。放大PCR产物纯化,进行测序使用3730测序仪(美国ABI棱镜)。snp被首次发现完整的PCR产物测序几个主题和随后大批量样品分析的多态基因型多路复用设备(美国ABI棱镜)使用快照快照引物(表1)。单个核苷酸的山峰被确定使用ABI-Prism基因检测和基因型(ABI)来确定基因型。


多态性 基因 引物序列

Val213Ala 5′CTTCCACGTGGACCAGG3′
Glu363Lys 5′GGTTTGTTGAACTTGACCT3′
Glu376Asp 5′GTCTTCTTAATGATTGA3′
小说3770年 TIMP-1 5′CCCAATTTCAGTCTATCA3′
rs5953060 TIMP-1 5′CAGAAGGCCGGGCCTTTG3′
rs4898 TIMP-1 5′CATCACTACCTGCAGTTT3′
rs6609533 TIMP-1 5′GTCCAATACCGTGTGATC3′
rs11551797 TIMP-1 5′GTTTCCCTGTTTATCCAT3′
rs2070584 TIMP-1 5′GCTGACAAATCACTGCCT3′
rs6609534 TIMP-1 5′GATGCCCCATCCAAACAC3′

2.3。血清生化

的浓度α1,TIMP-1总IgE,和血清细胞因子测定如下所述。

的水平α1在血清中测量血清胰蛋白酶抑制能力(不现实)比色测定按前面描述的方法(13]。使用分光光度计测量吸光度是(光谱马克斯384 +,分子器件、美国)在410 nm和胰蛋白酶抑制的不现实被表示为毫克/毫升的aserum样本。

TIMP-1水平血清样本的研究对象是由标准基于ELISA microassay使用工具包(DuoSet ELISA开发系统目录。DY 970、研发系统,Inc .,明尼阿波利斯,MN,按前面描述的方法(美国)11]。板的吸光度的井被记录在450 nm使用分光光度计(光谱马克斯384 +,分子器件、美国)。TIMP-1决心使用标准曲线的浓度和表达为ng / mL。

血清总IgE是由一个三明治ELISA使用商用设备(Bethyl实验室USA Inc .)。ELISA是根据制造商提供的协议执行。井开发使用的颜色2,2′-azino-bis 3 ethylbenzthiazoline-6-sulphonic酸,在黑暗中为20分钟,反应停止通过添加50μL 2 n H2所以4井。吸光度的板被记录在405海里。总IgE水平决定使用标准曲线和表达为国际单位/毫升的血清样本。

细胞因子的水平,也就是说,il - 1β、il - 4、IL-5、il - 6、引发和il - 10在血清样本的主题是由标准基于ELISA microassay使用各自的包(DuoSet ELISA开发系统、研发系统、公司,明尼阿波利斯,锰、美国)按照制造商提供的协议(研发系统,Inc .,明尼阿波利斯,美国)。血清细胞因子的浓度是决定使用一个单独的标准曲线为每个细胞因子和结果表示为pg / mL的血清样本。所有的血清生化参数分析了复制和实验至少重复两次。

2.4。统计分析

哈迪温伯格平衡评估在个体基因座等位基因的拟合优度检验。的 测试进行了基因型和等位基因频率的比较α1TIMP-1多态性在哮喘患者和控制个体。比值比(或),95%可信区间(CI),“ “基因型值数据调整了混杂因素如年龄、性别、和SI。生化参数表示为均值±SE。组之间的差异进行了分析 以及平等的方差。在平等的方差的情况下,学生的t以及,用于不平等的方差,韦尔奇测试工作。所有测试使用软件进行,SPSS 12 (SPSS Inc .,芝加哥,伊利诺斯州,美国)和EPIINFO 6(美国佐治亚州亚特兰大的疾病控制中心)。各种参数的分析使用上述统计方法和软件,“ “价值≤0.05被认为是具有统计学意义。

3所示。结果

临床、生化和基因分型数据获得所有哮喘患者和对照组进行分析的哮喘患病率和发病机理。病人的人口和临床特点提供了表2。比较分析总IgE的控制和哮喘患者的血清样本ELISA证明有一个显著增加总IgE哮喘患者的血清比控制个人( )。的浓度α1在确定不现实被发现显著( )降低哮喘患者的血清与控制(表2)。TIMP-1的浓度在哮喘患者的血清也不到,在控制,但差异不显著(表2)。我们观察到的增加il - 1的水平β、il - 4、IL-5、il - 6、引发和il - 10在哮喘患者和控制(图1)。


参数 哮喘 控制 *P价值
(n= 202) (n= 204)

年龄(平均±SE)年 0.001
性别(男/女) - - - - - -
吸烟指数(均值±SE) 0.001
身体质量指数(平均±SE) 0.009
总IgE(均值±SE)国际单位/毫升 0.0001
不现实(均值±SE) mg胰蛋白酶抑制/毫升的样品 0.001
TIMP-1(平均±SE) ng / mL 0.27

*P获得的价值观”t以及使用SPSS 12”分析软件。

放大基因序列的分析展示了三个单核苷酸多态性即Val213Ala exon-III (T / C)和Glu376Asp (A / C)也被称为PIM3,和小说SNP Glu363Lys exon-V (G / A)的α1基因,和七个snp (C / G rs5953060 intron-IV, T / C rs4898 Phe124Phe exon-V, G / intron-V rs6609533, C / T Ile158Ile exon-VI,和G / T rs2070584以及A / G rs6609534在3′UTR和一种新型G多态性在基地位置G3774A intron-IV)TIMP-1基因。双方的所有单核苷酸多态性基因型频率α1TIMP-1基因与哈迪温伯格平衡一致。患者的基因型和等位基因频率数据以及控制个人调整了混杂因素,也就是说,年龄、体重指数、SI和纠正” “价值,比较控制的情况。

测序数据的分析α1基因显示没有显著差异的三个基因型的分布频率(TT、TC和CC) Val213Ala控制和患者的哮喘(表3)。exon-V的Glu376Asp SNP (PIM3)α1基因也没有表现出任何与哮喘的基因型和等位基因分布(表34)。基因型遗传算法和新颖的多态性Glu363Lys AAα1被发现与哮喘的患病率显著相关(表吗3)。小等位基因控制在9.80%,20.54%患者的哮喘,因此被认为是与疾病(表相关联4)。苏格兰民族党Glu363Lys没有任何联系α1哮喘患者的血清水平作为这三个基因型GG的病人,GA和AA有类似的水平α1(图2)。


单核苷酸多态性 病人 控制 *P价值 或(95%置信区间)__
等位基因 (n= 202) (n= 204)

Val213Ala ( )
(rs6647)
TT 152例(75.24%) 167例(81.80%) 1
TC 46 (22.77%) 34 (16.67%) 2。48 0.12 1.21 (0.97 - -1.51)
CC 4 (1.98%) 3 (1.40%) 0.25 0.62 1.20 (0.63 - -2.30)

Glu363Lys ( )
(小说)
GG 135例(66.83%) 171例(83.80%) 1
遗传算法 51 (25.24%) 26 (12.74%) 12.05 0.001 1.50 (1.23 - -1.84)
AA 16 (7.92%) 7 (3.43%) 5.58 0.02 1.58 (1.17 - -2.13)

Glu376Asp ( )
(rs1303)
AA 127例(62.87%) 140例(68.63%) 1
交流 54 (26.73%) 51 (25.00%) 0.45 0.50 1.08 (0.86 - -1.35)
CC 21 (10.39%) 13 (6.37%) 2.43 0.12 1.29 (0.97 - -1.74)

rs5953060 (TIMP-1)
CC 33 (30.27%) 26 (33.33%) 1
CG 43 (39.45%) 31 (39.74%) 0.06 0.80 1.04 (0.77 - -1.39)
GG 33 (30.27%) 21 (26.92%) 0.31 0.58 1.09 (0.80 - -1.49)
C 48 (51.61%) 71例(56.34%)
G 45 (48.38%) 55 (43.65%) 0.48 0.49 0.67 (0.43 - -1.07)

基地3774 (TIMP-1)
GG 80例(73.39%) 74例(94.87%) 1
遗传算法 23 (21.10%) 3 (3.84%) 12.12 0.001 1.70 (1.39 - -2.09)
AA 6 (5.50%) 1 (1.28%) 3.07 0.07 1.65 (1.18 - -2.32)
G 82例(88.17%) 120例(95.23%)
一个 11 (11.83%) 6 (4.76%) 3.73 0.05 1.59 (1.08 - -2.35)

rs4898 Phe124Phe (TIMP-1)
TT 37 (33.94%) 40 (51.28%) 1
TC 42 (38.53%) 29 (37.17%) 1.83 0.18 1.23 (0.91 - -1.66)
CC 30 (27.52%) 9 (11.53%) 8.84 0.002 1.60 (1.19 - -2.14)
T 49 (52.69%) 84例(63.49%)
C 44 (47.31%) 42 (33.33%) 4.57 0.03 1.39 (1.03 - -1.89)

rs6609533 (TIMP-1)
GG 46 (42.20%) 39 (50.00%) 1
遗传算法 35 (32.11%) 26 (33.33%) 0.15 0.69 1.06 (0.79 - -1.42)
AA 28 (25.69%) 13 (16.67%) 2.29 0.13 1.26 (0.95 - -1.68)
G 61例(65.60%) 85例(67.46%)
一个 32 (34.40%) 41 (32.53%) 0.08 0.77 1.05 (0.76 - -1.45)

rs11551797 Ile158Ile (TIMP-1)
CC 107例(98.16%) 74例(94.87%) 1
CT 2 (1.83%) 3 (3.84%) 0.73 0.39 0.68 (0.23 - -1.99)
TT 0 (0.00%) 1 (1.36%) N /一个
C 91例(97.84%) 121例(96.03%)
T 2 (2.15%) 5 (3.96%) 0.57 0.45 0.67 (0.20 - -2.17)

rs2070584 (TIMP-1)
GG 33 (30.27%) 33 (42.30%) 1
GT 46 (42.20%) 27 (34.61%) 2.39 0.12 1.26 (0.94 - -1.69)
TT 30 (27.52%) 18 (23.07%) 1.76 0.19 1.35 (0.86 - -2.12)
G 48 (51.61%) 78例(61.90%)
T 45 (48.38%) 48 (38.09%) 2.32 0.13 1.27 (0.94 - -1.73)

rs2070534 (TIMP-1)
AA 34 (31.19%) 27 (34.61%) 1
AG) 47 (43.12%) 34 (43.58%) 2.64 0.10 1.31 (0.94 - -1.84)
GG 28 (25.69%) 17 (21.79%) 3.35 0.07 1.41 (0.98 - -2.02)
一个 50 (53.76%) 81例(64.28%)
G 43 (46.23%) 45 (35.71%) 2.47 0.12 1.28 (0.94 - -1.74)

*P价值观得到调整后,随着年龄的增长,身体质量指数,如果使用SPSS 12软件回归分析。
__或(95% CI):比值比(95%置信区间)。雄性和雌性个体的基因型频率TIMP-1分别给出,因为只有单等位基因存在于雄性个体。

单核苷酸多态性 病人 控制 *P价值 或(95%置信区间)__
等位基因

Val213Ala ( )
T 350例(86.63%) 368例(90.19%)
C 54 (13.36%) 40 (9.80%) 0.44 0.51 1.15 (0.78 - -1.70)

Glu363Lys ( )
G 321例(79.45%) 368例(90.19%)
一个 83例(20.54%) 40 (9.80%) 17.78 0.001 2.98 (1.79 - -4.96)

Glu376Asp ( )
一个 308例(76.23%) 331例(81.12%)
C 96例(23.76%) 77例(18.87%) 0.74 0.39 1.15 (0.85 - -1.57)

rs5953060 (TIMP-1)
C 157例(50.48%) 154例(54.61%)
G 154例(49.52%) 128例(45.39%) 0.50 0.48 1.11 (0.84 - -1.46)

3774 (TIMP-1)
G 265例(85.21%) 271例(96.09%)
一个 46 (14.79%) 11 (3.91%) 7.04 0.008 1.68 (0.27 - -2.22)

rs4898 Phe124Phe (TIMP-1)
T 165例(53.05%) 192例(68.08%)
C 146例(46.95%) 90例(31.21%) 5.38 0.02 1.39 (1.06 - -1.82)

rs6609533 (TIMP-1)
G 188例(60.45%) 189例(67.02%)
一个 123例(39.55%) 93例(32.98%) 1.06 0.30 1.16 (0.88 - -1.53)

rs11551797 Ile158Ile (TIMP-1)
C 307例(98.71%) 272例(96.45%)
T 4 (1.29%) 10 (3.55%) 1.85 0.17 0.39 (0.07 - -2.28)

rs2070584 (TIMP-1)
G 160例(51.45%) 171例(60.64%)
T 151例(48.55%) 111例(39.36%) 2.03 0.15 1.22 (0.93 - -1.61)

rs2070534 (TIMP-1)
一个 165例(53.05%) 169例(59.93%)
G 146例(46.95%) 113例(40.07%) 0.99 0.32 1.15 (0.87 - -1.52)

*P价值观得到调整后,随着年龄的增长,身体质量指数,如果使用SPSS 12软件回归分析。__或(95% CI):比值比(95%置信区间)。

的基因分型数据TIMP-1隔离了男性和女性受试者(表吗3),如基因仍位于x染色体上。单核苷酸多态性,rs5953060 intron-IV, rs6609533 intron-V和Ile158Ile exon-VITIMP-1基因并没有显示任何与疾病性。单核苷酸多态性rs2070584以及rs6609534位于3′UTR,也没有找到参与哮喘的发展。然而,SNP Phe124Phe的分析TIMP-1基因之间的显著差异显示纯合子TT和CC的女性以及男性哮喘(T / C)和对照组( , ; , )。杂合的基因型频率的TC Phe124Phe没有统计学上不同的哮喘和控制女性( , )。小C等位基因控制在31.21%和46.95%的哮喘患者在雄性和雌性(表3)。这其实SNP等位基因分布Phe124Phe还发现在哮喘和控制个体(明显不同 )。这种模式Phe124Phe SNP等位基因分布表示一个强大的协会TIMP-1基因与哮喘在印度人口的发病率和发病机理。TIMP-1血清浓度在哮喘患者不同基因型(T, TT, TC, C和CC)的Phe124Phe互相之间没有显著性差异(图4),因此,没有交互之间可以建立antiprotease浓度和沉默的SNP Phe124Phe患者的哮喘。

的基因型分布rs2070584 rs6609534并没有表现出任何协会与哮喘明显的从表中所示的结果3

新颖的SNP G3774A的基因型分布TIMP-1基因决定对象的组。杂合的GA显著增加在哮喘雌性比控制(表3)。小等位基因控制在3.91%,14.79%的哮喘患者(表4)。SNP G3774A明显不同的等位基因频率在哮喘和对照组( )表明其与哮喘的风险的发展联系紧密。的血清浓度TIMP-1与小说的不同基因型多态性G3774A哮喘病患者没有发现明显不同(图3)。

4所示。讨论

本研究调查的状态α1在两个主要anti-protease TIMP-1,分子,在哮喘患者。可能的相互作用这两个基因的单核苷酸多态性(α1TIMP-1印度人口)及其与哮喘也探索。这是观察到的不现实哮喘病患者明显低于个人控制。不现实的正常价值在不同人群的健康个体已经报道的范围从1.0到2.1毫克的胰蛋白酶抑制/毫升的血清[14- - - - - -16]。早期的研究关联特性和哮喘α1水平显示变量的观察。Miravitlles等人进行的一项研究显示,22日的111个(19.8%)的哮喘病患者表型的不足α1基因的正常价值α1在[17]。时也没有发现显著差异α1值与每一个哮喘病人组分类根据严重程度标准(17]。伊甸园等人报告称,38%的被试者,与拨弦哮喘基因型,非常低的水平α1在他们的血清9]。Aderele et al。18)报道,血清水平的α1在控制哮喘儿童显著降低( )。我们观察到一个下降α1在患者的哮喘和这些活动与其他研究结果一致由不同的工人(9,17,18]。

TIMP-1的浓度在哮喘患者的血清不到控制,但这种差异不显著(表2)。高架TIMP-1已经发现高体重[有关19,20.)尽管BMI的患者明显低于控制个人;BMI是没有找到与血清TIMP-1水平(20.]。很少有研究报道,正常的化学计量比MMP-9 TIMP-1可能改变在哮喘气道支持MMP-9 [21]。目前尚不清楚是否患者哮喘TIMP-1水平依然没有改变或增加7]。Higashimoto et al。22)公布的浓度显著下降TIMP-1在哮喘患者作为Hoshino et al。23)发现MMP-9以及TIMP-1水平上升。然而,Cataldo et al。7)报道,TIMP-1水平保持不变的同时MMP-9在哮喘患者的增加,因此将平衡有利于蛋白酶(MMP-9)。TIMP-1呼气分析了凝析油的支气管扩张患儿通过Karakoc et al。24]他们报道TIMP-1没有统计上的显著差异水平患者和健康对照组。在当前的研究中获得的结果表明,血清水平的TIMP-1可能不是一个很好的诊断哮喘的标志,至少在印度的人口。

我们观察到的血清细胞因子水平的增加哮喘患者和控制(图1)。细胞因子的水平提出了一个从1型,2型细胞因子可能导致增强合成IgE的优势。的il - 1β也已被证明能够诱导芳基碳氢化合物受体在小鼠哮喘模型,在剂量和时间的方式25]。它可以打开引发基因的转录,从而导致增加释放引发的肺癌细胞cocultures [26]。野马肺泡灌洗(BAL)流体从吸烟者被报道含有更高水平的il - 1β从非吸烟者比BAL流体,il - 1的水平β已经与吸烟者的肺功能(27]。在我们的研究中也有一个上升的il - 1的水平β在病人与对照组( )。相关的细胞因子il - 4是一个Th2主机类型的免疫反应。il - 4的角色被描述在IgE生产、激活肥大细胞和嗜酸性粒细胞(28]。我们观察il - 4水平的增加显著的病人相比,哮喘控制。大桥等人分析了过敏性鼻炎患者血清il - 4和il - 4的浓度报道明显升高(29日]。他们还报告了相关性IgE,在病人的血清il - 4水平。因此我们的结果是按照先前的报道表明il - 4的角色的IgE抗体生产主机。IL-5嗜酸性粒细胞激活的关键中介,它的浓度在我们控制显著降低( 比病人)。增加IL-5 mRNA表达和IL-5蛋白质含量已经落下帷幕,据报道,增加痰,哮喘病患者的血清30.- - - - - -32]。IL-5报道引起嗜酸性粒细胞增多(33]。很明显从本研究的结果和文献中报道,IL-5扮演一个角色在哮喘和其他炎症介质相互作用。il - 6已经报道了促炎细胞因子刺激免疫反应介导的组织损伤导致炎症。我们的结果与先前的报告一致,和il - 6的作用影响其他白细胞介素(il - 1β和引发)也是显而易见的。是本研究中观察到的浓度引发哮喘病人的血清对照组相比显著增加。引发了调节中性粒细胞的趋化迁移和炎症通路的重要分子。我们发现超过4倍引发的浓度增加患者被发现是非常重要的( ),表明中性粒细胞在哮喘炎症的作用(图1)。这些观察强调这样一个事实,有一系列复杂的炎症活动在这个障碍,嗜酸性粒细胞,中性粒细胞发挥互动作用。细胞因子il - 10是一种抗炎和免疫调节和炎症有多效性的影响。此外,il - 10已经知道抑制淋巴因子生产Th1但不是Th2克隆和表达下调Th1细胞分化[34,35]。本研究的结果表明,il - 10的水平在哮喘患者显著增加( )相比,控制。有矛盾的报告文学在哮喘患者il - 10的水平。Takaashi等人在他们的研究在日本主题报道减少支气管哮喘痰和il - 10水平在正常健康吸烟者比不吸烟者(36]。研究由锡兰等。在血清il - 10和哮喘患者诱导痰是不变的(37]。我们发现增加哮喘的患者il - 10。高水平的血清il - 10的哮喘受试者表示增加2型活动通过il - 4的生产和IL-13可以促进IgE的同形像开关。因此,著名的转变从1型,2型患者细胞因子环境可能导致总IgE水平升高也展示了在我们的病人。

PIM3等位基因的α1据报道与COPD的患病率和减少不现实10,11,13]。我们不能建立任何协会的SNP与哮喘(PIM3),但看到一个新颖的多态性,Glu363Lys exon-V的α1上游PIM3,与支气管哮喘有关。因此,基因型Glu363Lysα1可以被认为是一个重要的哮喘易感性遗传标记。

的基因分型TIMP-1男性和女性受试者分别进行,这是一个性别相关基因。Hinterseher等人分析了编码区和启动子的选择部分TIMP-1基因研究多态地位对动脉瘤在白种人38]。他们识别和分析三个其实SNPs, C / T (rs1043428), T / C (rs4898),和一个小说344 C / T,但没有表现出任何关联这些snp和白种人患者的腹主动脉瘤。然而,一个沉默的SNP Phe124PheTIMP-1基因的报道与腹主动脉瘤有关女性(39]。澳大利亚妇女的一项研究结果显示,同义SNP Ile158IleTIMP-1基因与哮喘的患病率(40]。TIMP-1基因的单核苷酸多态性Phe124Phe和Ile158Ile先前研究在慢性阻塞性肺病(11与疾病相关联的),但没有但是在本文SNP Phe124Phe TIMP-1被发现在印度人口与哮喘有关。然而,范迪门斯地等人报道,snp Phe124Phe FEV Ile158Ile下降有关1男性白种人COPD受试者(41]。Phe124Phe等位基因分布在我们的模式对象表示强烈协会这个SNP与哮喘的患病率在印度人口。是同义突变可能对蛋白质功能和结构影响,然而,可能被认为是标记基因与哮喘。

我们探索的snp rs2070584和rs6609534TIMP-1特别是因为他们发现位于3′UTRTIMP-1基因,据报道,通过核相互作用的基因调控有重要作用。但是我们没有找到任何这两个协会的单核苷酸多态性与哮喘。然而,小说intronic SNP G3774A被发现与哮喘的发生密切相关;因此,它可以被视为一个重要的遗传标记。

基因分型的研究进一步证明了SNP Glu363Lysα1基因被发现与哮喘有关。虽然哮喘患者有显著降低不现实,这种多态性没有任何关联α1在哮喘患者的血清水平,病人有三个基因型GG, GA, AA几乎相似的水平α1在(图2)。在哮喘患者的血清浓度TIMP-1小说的不同基因型多态性G3774A没有发现明显不同(图3)。其实SNP Phe124PheTIMP-1被发现与哮喘的患病率在我们的研究中。TIMP-1血清浓度在哮喘患者不同基因型(T, TT, TC, C和CC)被发现相似(图4);因此可以建立antiprotease浓度之间没有联系,这沉默其实SNP。

总之这部小说snp, Glu363Lys的α1和3774 (G)TIMP-1基因与哮喘表现出强烈的联系。针对这些我们认为Glu363Lys的观察α1和G3774A rs4898TIMP-1基因可能是重要的遗传标记用于哮喘的更好的管理。我们的研究结果也显示,炎症介质合成的增加和减少的表达特定基因型的背景下antiproteases病人必须导致哮喘的发展。

确认

作者感谢CSIR基因组学研究所的主任和综合生物学研究所必要的研究设施和科学与工业研究理事会,印度政府提供金融援助。m·库马尔也感谢大学拨款委员会研究奖学金。

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