表观遗传重组和细胞分化的控制

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最近,许多跨学科的方法包括生物信息学的集成、表观遗传学、分子和细胞生物学已经开始阐明复杂的动态调节的细胞过程,如细胞具备干细胞,重组,和分化。第一个完成基因组测序的最近的高通量基因组和蛋白质组学方法,生成大量的信息来提高我们理解真核基因组是如何工作的启动和协调特定的基因表达程序。

这次审查的重点是提供一个概览的表观遗传调节机制控制至关重要的细胞命运的决定,尤其是在分化和重组。特别强调了骨胳肌细胞生成,因为它提供了一个可以在体外模型和体内研究。

y .伊藤等人在“一个系统方法和骨胳肌细胞生成”概述目前最常见的方法用于解决转录监管。他们讨论的深度测序和芯片方法,以细胞为基础的高通量分析,生成原位基因表达数据库作为基因表达的有力工具,解剖复杂网络。使用骨骼肌作为范例,他们强调的主要发现通过不同的方法和强调一个集成方法的优点获得细胞分化的全貌。

越来越多的研究表明表观遗传组成部分在许多人类疾病的发展。在评论文章”表观遗传改变肌肉失调,”c . Lanzuolo博士讨论如何改变表观遗传机制有助于人类病理学的发展和发展,特别是神经肌肉疾病。肌肉营养不良引起突变的蛋白质发挥作用在sarcolemma-the质膜包装的完整性的肌纤维骨骼肌肉或将细胞核内的障碍。c . Lanzuolo博士专注于所谓的核肌营养不良,她分析的可能贡献一群重要的表观遗传修饰符,这个polycomb-group (PcG)复合物,这些疾病的发病机理。的解剖异常的表观遗传概要文件相关的一些人类疾病导致了实验的设计与表观遗传治疗药物。

审查”解决骨骼肌细胞表观基因组的下一代测序时代r . Fittipaldi和g Caretti指向全基因组表观遗传修饰的研究的意义,在骨骼肌分化转录因子被激活。作者讨论的新的基因组技术监测的表观遗传景观特征myoblast-to-myotube转变为了获得创新的信息编排生物过程分子机制,这样的肌原性的分化。

的精细调节肌原性的基因等myogenin讨论了”打开myogenin肌肉:范式对于理解组织基因表达的机制“通过h . Faralli和f . j .:帝尔沃斯历史学。转录因子、代数余子式和表观遗传修饰导致在开发过程中调节基因表达阳性。特别是,作者强调一个组织因素如MyoD配合更广泛表达的蛋白质(Six4 Mef2, Pbx1)建立转录宽容的环境,以确保适当的时空myogenin表达式。

表观遗传学的当前的挑战是如何分析和从大量数据中提取生物知识与新的高通量技术生产。在这方面,美国的纸Althammer et al .,”从高通量表观基因组学数据预测模型的基因调控“描述了计算框架使用综合工具和机器学习算法,促进高通量测序的表观遗传数据的系统分析综合研究。他们的分析显示了不同的表观遗传代码intron-less和intron-containing基因的表达,更加突出差异基因GC含量较低(LGC)启动子,例如显示启动子区域的LGC intron-less基因,H3K36me3和H3K4me1是最信息标志,而在表达基因的聚腺苷酸化网站,H3K36me3信号弱得多比intron-containing基因。基于表观遗传数据,他们的模型预测两个条件之间强烈的基因表达;因此,这种方法可应用于研究基因表达在不同的发展阶段,疾病或治疗。

巨大的相关性的治疗潜力,可能操纵细胞的身份。在审查题为“诱导表观遗传程序的稳定性”,m . j . Barrero讨论了表观遗传变化发生在分化和细胞重编程在强调在薄多能和lineage-specific基因表达的调节,以确保正确的差异化在发展和成人的生活。

”的表观遗传调节B淋巴细胞分化,分化转移和重组”通过B Barneda-Zahonero等人的层次网络评论转录因子调节表观遗传签名调节B细胞中转录组发展。B淋巴细胞是高度专业化的终末分化细胞负责生成的高亲和性抗体,提供对病原体的体液免疫。每天人体产生数以百万计的B淋巴细胞前体造血干细胞的分化过程是一个严格监管。这多步分化过程中,至关重要的免疫力,结合连续表达特定的转录因子和相关的表观遗传变化限制淋巴祖细胞的发育潜力的B细胞通路抑制B-lineage-inappropriate基因,同时促进B细胞发展通过激活B-lymphoid-specific基因。

露西娅拉泰拉
丹妮拉帕拉西奥斯
索尼娅Forcales
码头洛伦佐宫

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