本地像素值集合点分割算法在二维凝胶电泳研究

文摘

二维凝胶电泳(2 de)图像显示几百的蛋白质的表达水平,每个蛋白质作为blob-shaped表示灰度级值。现场检测,分割过程必须是有效的,因为它是在凝胶处理的第一步。这样的信息的提取是一个非常复杂的任务。在本文中,我们提出一个新颖的位置检测器,基本上是一个morphology-based方法使用种子区域生长作为中心范式和依赖于现场相关信息。测试在我们的合成方法以及真正的凝胶与人类样本SWISS-2DPAGE(二维聚丙烯酰胺凝胶电泳)数据库。比较的结果用一种方法被称为像素值集合(PVC)。因为我们的算法有效地使用当地现货信息,段现场通过收集像素值及其与PVC的亲和力,我们将其命名为当地的像素值集合(LPVC)。结果表明,LPVC达到类似的分割结果PVC,但PVC要快得多。

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