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詹姆斯·j·坎帕内拉丹尼尔Larko,约翰·斯莫利, ”一个分子Phylogenomic ILR1-Like的IAA酰胺水解酶基因家族分析”,国际基因组学杂志, 卷。4, 文章的ID617982年, 17 页面, 2003年。 https://doi.org/10.1002/cfg.340
一个分子Phylogenomic ILR1-Like的IAA酰胺水解酶基因家族分析
文摘
水解酶基因的ILR1-like家庭最初是孤立的拟南芥,被认为有助于调节自由indole-3-acetic-acid的水平。我们已经调查了这个家族如何在双子叶植物进化,单子叶植物和裸子植物物种利用基因库和TIGR数据库检索直系同源基因。这些序列之间的关系进行了评估采用phylogenomic分析研究分子进化和发展史。ILR1-like家族的成员分析ILL1, ILL2, ILL3, ILL6, ILR1 IAR3。目前证据表明,IAR3至少经历了进化和是最保守的。这个结论是基于IAR3拥有最多的种间orthologues, orthologues同源物种和独一无二的。虽然不如IAR3守恒,DNA和蛋白质序列分析ILL1 ILR1表明,高保护。基于这一保护,IAR3, ILL1 ILR1可能有生理的主要角色的高等植物的进化。ILL3至少是守恒的,直向同源物种和orthologues最少。的单子叶植物的orthologues对于大多数家庭成员检查从双子叶植物进化成两个不同的分子演化支,表明积极的进化改变。 The monocotyledon clades are: (a) those possessing a putative endoplasmic reticulum localizing signal; and (b) those that are putative cytoplasmic hydrolases. IAR3, ILL1 and ILL6 are all highly orthologous to a gene in the gymnosperm松果体taeda,这表明一个古老的酶活性。orthologues无法被检测到衣藻、苔藓和蕨类植物数据库。
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