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研究文章|开放获取
Ilya Shmulevich, Ilya Gluhovsky,罗纳尔多f .桥本,爱德华·r·多尔蒂(音译), ”稳态分析概率基因调控网络模型的布尔网络”,国际基因组学杂志, 卷。4, 文章的ID131563年, 8 页面, 2003年。 https://doi.org/10.1002/cfg.342
稳态分析概率基因调控网络模型的布尔网络
收到了
2003年3月26日
修改后的
2003年9月22日
接受
2003年10月3日
文摘
概率布尔网络(pbn)最近推出了一个有前途的一类基因调控网络的模型。pbn的动态行为能在马尔可夫链的背景下进行分析。一个关键目标是稳态的决心(长期)的行为PBN通过分析相应的马尔可夫链。这允许一个计算的长期影响在另一个基因或一个基因决定的长期联合概率行为所选定的几个基因。因为依赖方法迅速成为禁止大型规模的网络,我们建议使用蒙特卡罗方法。然而,平稳分布的收敛速度成为一个核心问题。我们讨论几种方法确定达到收敛所需的迭代次数的马尔可夫链PBN对应。使用最近推出了方法基于两国马尔可夫链理论,我们说明了方法在子设计从人类神经胶质瘤基因表达数据和确定联合稳态概率几组基因。
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