不同的机制回收在真核细胞分子和细胞器。真核生物细胞内蛋白的降解系统主要有两种。一个是ubiquitin-proteasome系统占了最短暂的蛋白质的选择性降解。另一种是自噬,主要方式细胞质组分的溶酶体的降解。