研究文章

计算洞察蛋白酪氨酸磷酸酶1 b抑制:一个案例研究的结合配体和基于结构的方法

表4

AutoDock 4、XP和SP绑定分数(千卡每摩尔)对接的研究训练集。

配位体 AutoDock 4 SP GlideScore XP GlideScore
2 cma 2 qbp 2 cma 2 qbp 2 cma 2 qbp

1 −12.05 −9.83 −8.90 −4.71 −8.87 −7.28
2 −12.37 −10.34 −8.69 −4.05 −8.15 −5.23
3 −12.43 −11.33 −10.00 −4.05 −10.40 −5.03
4 −10.97 −9.84 −8.66 −4.26 −8.88 −6.94
5 −11.96 −11.17 −9.06 −5.36 −9.15 −6.98
6 −13.07 −11.98 −8.47 −4.54 −9.61 −5.96
7 −10.37 −11.74 −7.33 −4.24 −6.72 −9.22
8 −8.02 −9.06 −8.11 −8.82 −6.23 −7.06
9 −9.15 −11.23 −5.82 −8.39 −8.31 −11.10
10 −9.91 −12.24 −5.55 −9.16 −7.37 −10.33
11 −9.64 −10.67 −5.32 −8.11 −3.89 −9.72
12 −9.11 −10.64 −5.96 −9.28 −7.24 −9.97
13 −8.74 −10.51 −5.38 −8.68 −6.90 −10.54
14 −8.98 −10.73 −5.56 −8.70 −7.07 −10.27
15 −8.99 −10.61 −5.14 −8.87 −7.19 −10.02
16 −9.85 −12.29 −5.86 −9.13 −8.12 −9.23