研究文章

意味着水晶水分子在ALR2抑制剂具有约束力的活性部位

表3

5配合物的热力学的绑定使用MM-PBSA ALR2计算。

PDB标识 Δ Δ Δ Δ Δ Δ
(水) (无水)

1 t40 5.97 −48.31 14.96 −5.67 20.93 −25.24 −21.29
1 z89 −6.92 −44.85 36.83 −4.94 29.91 −53.71 −49.73
2 fz8 5.66 −51.96 21.49 −6.07 27.16 −18.77 −16.23
3 h4g 11.81 −45.37 17.53 −5.69 29.34 −44.16 −36.60
3 g5e 22.7 −46.89 4.79 −5.44 27.49 −17.55 −14.22

在薛定谔MM-GBSA项目主要模块的实现大师包中。