臀部家族蛋白质之间的相互作用(HIP1和HIP12/1R)和网格蛋白是内吞作用的基础。我们用圆二色性(CD)的稳定性研究HIP1 subfragment舒展开放(aa468 - 530)。乳糜泻热融化显示HIP1 468 - 530只在低温下是稳定的,但这HIP1片段包含一个结构单元,甚至在83年不融化
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。然后我们创建HIP1突变体探测我们的假设,一个简短的疏水性路径打开地区是网格蛋白轻链的结合位点。我们发现变异中心/ LCb敏感的绑定两个冷淡地分离基本残留物(K474和K494)。基本的补丁,K474 HIP12/1R K494是守恒的。缺乏保护sla2p(酵母),HIP1d .腹,HIP1 ZK370.3同系物秀丽隐杆线虫意味着HIP1绑定和HIP1同系物,网格蛋白轻链在这些生物可能不同。
1。介绍
Huntingtin-interacting蛋白1 (HIP1)及其相对HIP12/1R,出芽的clathrin-coated囊泡(闭路)[<一个href="#B1">1一个>,<一个href="#B2">2一个>]。酵母HIP1同族体,sla2p闭路的发展所需,是酵母(<一个href="#B3">3一个>,<一个href="#B4">4一个>]。有共享区域HIP1和HIP12/1R调解网格蛋白的结合,但也有网站每个髋关节特有的蛋白质。例如,HIP1,但不是HIP12/1R,网格蛋白框主题(
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)函数绑定氨基β螺旋桨域网格蛋白(<一个href="#B5">5一个>]。HIP1和HIP12/1R不与适配器蛋白2 (AP2)以同样的方式。的AP2-binding FXDXF和DPF图案(X表示任何氨基酸)只有在HIP1 [<一个href="#B5">5一个>]。HIP12/1R显然具有较高的亲和力f -肌动蛋白(<一个href="#B6">6一个>),这表明HIP1 HIP12/1R扮演不同的角色,闭路的形成。许多氨基酸(
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在DL
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KN地区)的卷曲螺旋域HIP1和HIP12/1R已确定影响绑定的网格蛋白轻链(CLC) [<一个href="#B7">7一个>),但我们不知道
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构成整个CLC约束力的决定因素在臀部的蛋白质。我们最近决定两个相邻的晶体结构片段的HIP1卷曲螺旋域(PDB文件:2 no2和2 qa7)跨网格蛋白光chain-binding地区(<一个href="#B8">8一个>,<一个href="#B9">9一个>]。DL的
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KN拉伸嵌入式舒展开放地区,我们首次发现在HIP1 482 - 586 (2 no2) [<一个href="#B8">8一个>),后来发现HIP1 371 - 481 (2 qa7) (<一个href="#B9">9一个>]。在本研究的信我们定义的固有稳定性包含了一段HIP1地区和问静电相互作用推动CLC的绑定。我们生成一个HIP1 subfragment (aa468 - 530)横贯开放地区的圆二色性(CD)实验来评估该域的内在稳定性。然后,我们研究了如果两个冷淡地间隔带正电的补丁打开地区CLC绑定中扮演任何角色。这里我们报告,468 - 530年HIP1构造是不稳定的,但矛盾的是在这个subfragment耐热结构单元存在。我们发现两个基本补丁的灵活的部分HIP1(集中在K474和K494)绑定的CLC至关重要。这些静电因素的一部分溶剂暴露疏水表面,我们以前认为是适合CLC。
2。结果与讨论
2.1。卷曲螺旋段HIP1,包括网格蛋白轻链的决定因素在本质上是不稳定的
绑定的CLC HIP1需要L486或R487 [<一个href="#B7">7一个>](人类HIP1编号(005329年加入许多NP),在HIP12/1R守恒)。我们最近位于L486和R487灵活段HIP1(位置2,图<一个href="//www.newsama.com/journals/bri/2009/256124/fig1/" target="_blank">1一个>),在S3中路径(<一个href="#B8">8一个>]。在这里我们使用CD探针的稳定性HIP1 468 - 530(图的灰色地带<一个href="//www.newsama.com/journals/bri/2009/256124/fig1/" target="_blank">1一个>Y468和R547)之间,S3的卷曲螺旋段路径。在
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由双CD概要文件是螺旋,表示最低在208和222海里(图<一个href="//www.newsama.com/journals/bri/2009/256124/fig2/" target="_blank">2一个>)。强度的比例在222年和208海里可以用来区分从孤立的螺旋线螺旋线圈(
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螺旋线圈和1
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0.86隔离螺旋线(<一个href="#B10">10一个>,<一个href="#B11">11一个>])。在图的比率值<一个href="//www.newsama.com/journals/bri/2009/256124/fig2/" target="_blank">2一个>表明HIP1 468 - 530年的变化从一个孤立的螺旋线和盘绕的混合物分离螺旋线圈在低温下
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。我们指出
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概要文件是几乎相同的
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扫描,这表明HIP1 468 - 530包含一个热稳定元素。我们目前做的核磁共振实验,绘制出热不稳定的程度部分HIP1 468 - 530。