研究文章
病毒RNA在鸟类多样性的研究样本使用新创设计多路复用Genus-Specific底漆面板
表3
鸟样品测序结果与以前的浓缩使用引物面板。病毒的数量读和读总数/相应的示例所示。三个样品(B11,B23,B24,以粗体突出显示)有一个特定的引物对面板的放大检测属。最近病毒同源染色体显示名称及其基因库id。
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| 鸟ID |
(最近的同系物)检测到病毒 |
主机
硬币 |
基因库IDs的检测到病毒 |
数量的病毒样本中读取 |
读取获得的样本总数 |
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| B11 |
Duck-dominant冠状病毒∣禽冠状病毒∣鸟粪冠状病毒 |
针叶林Bean鹅 |
AKQ98474.1、AKQ98475.1 APU51837.1、AIY51827.1 CAH69463.1 |
4342年 |
108833年 |
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| B23 |
Duck-dominant冠状病毒∣禽冠状病毒∣鸟粪冠状病毒 |
针叶林Bean鹅 |
AKQ98474.1、AKQ98475.1 APU51837.1、AIY51827.1 CAH69463.1 |
83730年 |
194156年 |
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| B24 |
Duck-dominant冠状病毒 |
针叶林Bean鹅 |
AKQ98474.1, AKQ98475.1 |
4554年 |
90430年 |
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| B27 |
三峡水黾病毒16 |
Temminck的阶段 |
YP_009337377.1 |
4062年 |
103488年 |
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| B27 |
鸟禽腺病毒C∣土耳其禽腺病毒B |
Temminck的阶段 |
ACL68145.1、ANB27700.1 ALY06332.1 ALY06333.1 |
54 |
103488年 |
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| B27 |
Cimodo病毒 |
Temminck的阶段 |
YP_009059075.1 |
160年 |
103488年 |
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| B46 |
豆瓣菜白脉病毒∣萝卜黄花叶病毒 |
针叶林Bean鹅 |
AFC95826.1, AMH40128.1 |
636年 |
28468年 |
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| B49 |
圆环病毒 |
针叶林Bean鹅 |
AEL87792.1 |
180年 |
149230年 |
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| B58 |
湖Sarah-associated圆形virus-32 |
针叶林Bean鹅 |
ALE29729.1 |
10 |
42348年 |
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| B66 |
鸭禽腺病毒B |
田鸫 |
YP_009047166.1 |
198年 |
159604年 |
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| 还 |
鸭腺病毒 |
常见的燕鸥 |
AGS11269.1, NP_044717.1 |
95872年 |
256549年 |
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| B69 |
突尼斯病毒 |
针叶林Bean鹅 |
AMT75434.1 |
16 |
126648年 |
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