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公司古生菌的代谢建模提供洞察代谢功能的多样性
表1
模型数据。公司代谢模型的基本单位是基因、代谢产物和反应。这些模型包括(1)代谢网络描述代谢物之间的连接通过反应(通常是由代谢子系统),(2)gene-protein-reaction反应的基因相关性规则,地图,和(3)连接通过交换交通环境的反应。
|
| 生物 |
模型 |
基因 |
代谢物 |
反应 |
运输 |
子系统 |
引用 |
|
| h . salinarum |
我OG490 |
490年 |
557年 |
711年 |
111年 |
NA |
(13] |
| 我OG478 |
478年 |
545年 |
664年 |
97年 |
NA |
(14] |
|
| m . acetivorans |
我VS941 |
941年 |
708年 |
705年 |
71年 |
60 |
(15] |
| 我MB745 |
745年 |
715年 |
818年 |
69年 |
30. |
(16] |
| 我MAC868 |
868年 |
707年 |
839年 |
91年 |
31日 |
(17] |
| 我ST807 |
807年 |
733年 |
759年 |
70年 |
30. |
(18] |
|
| m·巴氏细菌 |
我AF692 |
692年 |
558年 |
619年 |
88年 |
8 |
(19] |
| 我MG746 |
746年 |
718年 |
815年 |
74年 |
31日 |
(20.] |
|
| m . hungatei |
我Mhu428 |
428年 |
639年 |
721年 |
41 |
29日 |
(21] |
|
| m . jannaschii |
我TS436 |
436年 |
510年 |
609年 |
1 |
113年 |
(22] |
|
| m . maripaludis |
我MM518 |
518年 |
605年 |
570年 |
49 |
117年 |
(23] |
|
| m . mazei |
我SS85 |
NA |
74年 |
85年 |
5 |
NA |
(6] |
|
| m . smithii |
我Msi385 |
385年 |
582年 |
525年 |
35 |
NA |
(24] |
|
| n pharaonis |
我OG654 |
654年 |
597年 |
683年 |
88年 |
NA |
(25] |
|
| 美国solfataricus |
我TU515 |
515年 |
705年 |
718年 |
58 |
65年 |
(26] |
|
|