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公司古生菌的代谢建模提供洞察代谢功能的多样性
图5
保护的代谢反应。一个地图的程度保护的反应m . acetivorans模型我ST807(如编码gene-protein-reaction协会(GPRs)的模型)。节点代表一个代谢物或反应和边指示反应和代谢物之间的依赖关系。反应在光谱的蓝端通过酶是守恒的221年古细菌相对较少的数据库而反应在红了高度保守的酶。反应与薄灰线不与基因有关。db_evaluateReactionsFromGpr评估保护。py ITEP软件的功能(45使用了)。计算同源基因在每个反应的GPRs我ST807。ITEP函数被执行死刑”或“选项启用识别(或酶亚基)的酶是否标注为促进有机体的反应是编码。